314 genes were found for organism Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Nham_4041  CDS  NC_007959  99  1436  +  1338  transposase, IS4  YP_571539  normal  0.923218  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4042    NC_007959  1510  2088  -  579      normal  0.617841  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4043  CDS  NC_007959  2346  2672  +  327  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  YP_571540  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4044  CDS  NC_007959  2613  3593  -  981  LysR family transcriptional regulator  YP_571541  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4045    NC_007959  3655  3944  -  290      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4046  CDS  NC_007959  4067  5104  +  1038  fructose-1,6-bisphosphatase  YP_571542  normal  0.360967  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4047  CDS  NC_007959  5125  5997  +  873  phosphoribulokinase/uridine kinase  YP_571543  normal  0.762728  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4048  CDS  NC_007959  6119  7204  +  1086  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  YP_571544  normal  0.729421  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4049  CDS  NC_007959  7266  8732  +  1467  ribulose bisophosphate carboxylase  YP_571545  normal  0.542382  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4050  CDS  NC_007959  8746  9171  +  426  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  YP_571546  normal  0.184894  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4051  CDS  NC_007959  9324  10238  +  915  AAA ATPase, central region  YP_571547  normal  0.16821  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4052  CDS  NC_007959  12046  12357  +  312  XRE family transcriptional regulator  YP_571548  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4053  CDS  NC_007959  12595  12999  +  405  hypothetical protein  YP_571549  normal  0.58003  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4054  CDS  NC_007959  13284  16784  -  3501  hypothetical protein  YP_571550  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4055    NC_007959  18062  18735  -  674      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4056  CDS  NC_007959  19058  20899  -  1842  HipA-like  YP_571551  normal  0.970389  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4057  CDS  NC_007959  21080  22096  +  1017  hypothetical protein  YP_571552  normal  0.308656  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4058  CDS  NC_007959  22196  23470  -  1275  transposase, mutator type  YP_571553  normal  0.0906986  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4059    NC_007959  23768  23947  -  180      normal  0.203412  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4060  CDS  NC_007959  24401  25291  -  891  hypothetical protein  YP_571554  normal  0.350704  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4061    NC_007959  25333  25536  -  204      normal  0.47305  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4062    NC_007959  25759  25914  -  156      normal  0.628616  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4063    NC_007959  25916  26359  +  444      normal  0.931395  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4064    NC_007959  26332  26877  +  546      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4065  CDS  NC_007959  27131  27364  -  234  hypothetical protein  YP_571555  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4066  CDS  NC_007959  27394  27909  +  516  hypothetical protein  YP_571556  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4067  CDS  NC_007959  28065  28751  -  687  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_571557  normal  0.687437  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4068  CDS  NC_007959  28935  30254  +  1320  major facilitator superfamily permease  YP_571558  normal  0.200514  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4069    NC_007959  30350  30490  +  141      normal  0.0857466  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4070    NC_007959  30766  32270  -  1505      normal  0.243919  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4071  CDS  NC_007959  32442  32696  -  255  hypothetical protein  YP_571559  normal  0.514212  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4072  CDS  NC_007959  33953  35374  +  1422  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  YP_571560  normal  0.508302  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4073  CDS  NC_007959  35378  36388  +  1011  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  YP_571561  normal  0.889217  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4074  CDS  NC_007959  36763  37200  +  438  hypothetical protein  YP_571562  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4075    NC_007959  37347  37487  -  141      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4076  CDS  NC_007959  37862  38227  +  366  PRC-barrel  YP_571563  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4077  CDS  NC_007959  38670  39788  +  1119  hypothetical protein  YP_571564  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4078  CDS  NC_007959  39970  40446  +  477  Ferritin and Dps  YP_571565  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4079  CDS  NC_007959  40531  43485  +  2955  aconitate hydratase 1  YP_571566  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4080  CDS  NC_007959  43501  43971  +  471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_571567  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4081  CDS  NC_007959  44217  45602  +  1386  twin-arginine translocation pathway signal  YP_571568  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4082  CDS  NC_007959  45608  45973  +  366  hypothetical protein  YP_571569  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4083    NC_007959  47255  47785  -  531      normal  0.366289  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4084    NC_007959  47801  48800  +  1000      normal  0.336456  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4085  CDS  NC_007959  48858  49952  +  1095  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  YP_571570  normal  0.508946  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4086  CDS  NC_007959  50075  50698  -  624  hypothetical protein  YP_571571  normal  0.396271  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4087  CDS  NC_007959  50727  51122  +  396  hypothetical protein  YP_571572  normal  0.179508  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4088    NC_007959  51261  51428  -  168      normal  0.31819  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4089  CDS  NC_007959  51496  51960  +  465  hypothetical protein  YP_571573  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4090  CDS  NC_007959  52170  52322  -  153  hypothetical protein  YP_571574  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4091  CDS  NC_007959  52324  52605  -  282  hypothetical protein  YP_571575  normal  0.652752  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4092  CDS  NC_007959  53683  54978  +  1296  integrase catalytic subunit  YP_571576  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4093  CDS  NC_007959  55228  55992  -  765  transposase, IS4  YP_571577  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4094    NC_007959  56203  56752  +  550      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4095    NC_007959  56802  57275  -  474      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4096    NC_007959  58366  59519  -  1154      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4097  CDS  NC_007959  59805  60113  +  309  hypothetical protein  YP_571578  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4098    NC_007959  60822  61085  +  264      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4099    NC_007959  61184  61891  -  708      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4100    NC_007959  62705  63969  -  1265      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4101  CDS  NC_007959  64068  64772  +  705  hypothetical protein  YP_571579  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4102  CDS  NC_007959  65770  66132  +  363  PRC-barrel  YP_571580  normal  0.997072  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4103  CDS  NC_007959  66461  66712  -  252  hypothetical protein  YP_571581  normal  0.372748  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4104  CDS  NC_007959  66725  67234  -  510  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  YP_571582  normal  0.346459  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4105  CDS  NC_007959  67231  68415  -  1185  chalcone and stilbene synthases-like  YP_571583  normal  0.137291  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4106  CDS  NC_007959  68424  68915  -  492  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  YP_571584  normal  0.318371  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4107  CDS  NC_007959  69075  69317  -  243  hypothetical protein  YP_571585  normal  0.771391  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4108    NC_007959  69576  69818  -  243      normal  0.233947  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4109  CDS  NC_007959  70218  70475  +  258  hypothetical protein  YP_571586  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4110  CDS  NC_007959  70445  71398  +  954  cation diffusion facilitator family transporter  YP_571587  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4111  CDS  NC_007959  71561  72025  -  465  hypothetical protein  YP_571588  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4112  CDS  NC_007959  72006  72449  -  444  hypothetical protein  YP_571589  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4113  CDS  NC_007959  72563  72934  -  372  protein of unknown function DUF883, ElaB  YP_571590  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4114  CDS  NC_007959  72935  73768  -  834  hypothetical protein  YP_571591  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4115  CDS  NC_007959  73771  74031  +  261  transposase  YP_571592  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4116  CDS  NC_007959  74464  74946  +  483  hypothetical protein  YP_571593  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4117  CDS  NC_007959  75034  75471  -  438  transposase, IS4  YP_571594  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4118  CDS  NC_007959  75542  76864  -  1323  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  YP_571595  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4119  CDS  NC_007959  77293  77769  -  477  transposase (IS12528)  YP_571596  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4120  CDS  NC_007959  77856  78980  +  1125  transposase IS116/IS110/IS902  YP_571597  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4121  CDS  NC_007959  79502  79672  -  171  hypothetical protein  YP_571598  normal  0.888422  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4122  CDS  NC_007959  80231  81343  -  1113  putative transposase  YP_571599  normal  0.758649  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4123    NC_007959  81422  82179  -  758      normal  0.445197  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4124  CDS  NC_007959  82237  82773  +  537  hypothetical protein  YP_571600  normal  0.693301  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4125    NC_007959  82809  83039  +  231      normal  0.976237  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4126  CDS  NC_007959  83063  83356  +  294  hypothetical protein  YP_571601  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4127    NC_007959  84422  84589  +  168      normal  0.900976  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4128  CDS  NC_007959  85101  85646  -  546  hypothetical protein  YP_571602  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4129  CDS  NC_007959  86335  86757  +  423  PRC-barrel  YP_571603  normal  0.674584  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4130  CDS  NC_007959  86971  88041  +  1071  putative transposase  YP_571604  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4131  CDS  NC_007959  88120  89232  +  1113  putative transposase  YP_571605  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4132  CDS  NC_007959  89882  91117  +  1236  transposase IS116/IS110/IS902  YP_571606  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4133    NC_007959  91136  92237  -  1102      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4134    NC_007959  92331  92465  -  135      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4135    NC_007959  93137  93646  -  510      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4136  CDS  NC_007959  94080  94928  -  849  hypothetical protein  YP_571607  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4137    NC_007959  95279  96236  -  958      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4138  CDS  NC_007959  96722  97702  -  981  integrase catalytic subunit  YP_571608  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4139  CDS  NC_007959  97804  98853  +  1050  transposase IS116/IS110/IS902  YP_571609  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4140  CDS  NC_007959  99034  99435  -  402  transposase IS3/IS911  YP_571610  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>