5223 genes were found for organism Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 53    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
AVIN_0  rRNA  NC_012560  606851  609752  +  2902  23S ribosomal RNA    unclonable  0.0050285  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00010  CDS  NC_012560  101  1537  +  1437  chromosomal replication initiation protein  YP_002797244  normal  0.499294  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00020  CDS  NC_012560  1566  2669  +  1104  DNA polymerase III subunit beta  YP_002797245  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00030  CDS  NC_012560  2688  3785  +  1098  recombination protein F  YP_002797246  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00040  CDS  NC_012560  3791  6211  +  2421  DNA gyrase subunit B  YP_002797247  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00050  CDS  NC_012560  6462  6767  +  306  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  YP_002797248  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00060  CDS  NC_012560  6877  7758  -  882  Dyp-type peroxidase protein  YP_002797249  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00070  CDS  NC_012560  7876  8835  -  960  hypothetical protein  YP_002797250  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00080  CDS  NC_012560  9136  9864  -  729  LPA acyltransferase protein  YP_002797251  normal  0.729238  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00090  CDS  NC_012560  9904  10446  -  543  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIIA  YP_002797252  normal  0.271074  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00100  CDS  NC_012560  10450  12507  -  2058  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_002797253  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00110  CDS  NC_012560  12504  13460  -  957  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_002797254  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00120  CDS  NC_012560  13536  14120  +  585  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_002797255  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00130  CDS  NC_012560  14340  16055  +  1716  5-nucleotidase/phosphoesterase  YP_002797256  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00140  CDS  NC_012560  16096  17469  -  1374  potassium transporter peripheral membrane component  YP_002797257  normal  0.35944  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00150  CDS  NC_012560  17483  18814  -  1332  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  YP_002797258  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00160  CDS  NC_012560  18811  19788  -  978  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_002797259  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00170  CDS  NC_012560  19812  20318  -  507  peptide deformylase  YP_002797260  normal  0.221595  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00180  CDS  NC_012560  20470  21495  +  1026  peptidoglycan-binding LysM protein  YP_002797261  normal  0.0309659  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00190  CDS  NC_012560  21561  22661  +  1101  DNA processing protein, DprA (SMF family)  YP_002797262  normal  0.0224115  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00200  CDS  NC_012560  22722  23279  +  558  RNA binding yrdC protein  YP_002797263  hitchhiker  0.0077597  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00210  CDS  NC_012560  23545  24522  -  978  NADH-quinone oxidoreductase  YP_002797264  normal  0.336084  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00220  CDS  NC_012560  24677  25606  +  930  coproporphyrinogen III oxidase  YP_002797265  normal  0.333342  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00230  CDS  NC_012560  25683  26495  +  813  shikimate 5-dehydrogenase  YP_002797266  normal  0.677963  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00240  CDS  NC_012560  27249  27581  -  333  hypothetical protein  YP_002797267  normal  0.287877  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00250  CDS  NC_012560  27796  29661  +  1866  Copper-resistance protein A precursor CopA family  YP_002797268  normal  0.0267708  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00270  CDS  NC_012560  29658  30629  +  972  Copper resistance B precursor  YP_002797269  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00280  CDS  NC_012560  30726  31199  -  474  transporter, MgtC/SapB family  YP_002797270  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00290  CDS  NC_012560  31365  31589  +  225  hypothetical protein  YP_002797271  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00300  CDS  NC_012560  31683  32156  -  474  hemerythrin HHE cation binding protein  YP_002797272  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00310  CDS  NC_012560  32186  32332  -  147  hypothetical protein  YP_002797273  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00320  CDS  NC_012560  32369  33484  +  1116  hypothetical protein  YP_002797274  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00330  CDS  NC_012560  33471  34217  +  747  hypothetical protein  YP_002797275  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00340  CDS  NC_012560  34310  35026  -  717  hypothetical protein  YP_002797276  normal  0.115218  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00350  CDS  NC_012560  35450  35884  -  435  hypothetical protein  YP_002797277  normal  0.134491  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00360  CDS  NC_012560  36134  36448  +  315  Cytochrome c-551  YP_002797278  normal  0.66895  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00370  CDS  NC_012560  36540  38129  -  1590  hypothetical protein with C-terminal GGDEF motif  YP_002797279  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00380  CDS  NC_012560  38404  39000  -  597  TrpR binding protein WrbA  YP_002797280  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00390  CDS  NC_012560  39108  40337  +  1230  hypothetical protein  YP_002797281  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00400  CDS  NC_012560  40354  40761  -  408  hypothetical protein  YP_002797282  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00410  CDS  NC_012560  40989  41318  +  330  hypothetical protein  YP_002797283  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00420  CDS  NC_012560  41764  43158  +  1395  GGDEF domain protein  YP_002797284  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00430  CDS  NC_012560  43206  44060  -  855  Tim44-like domain protein  YP_002797285  normal  0.924994  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00440  CDS  NC_012560  44213  44779  -  567  Transcriptional regulatory protein TetR family  YP_002797286  normal  0.152406  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00450  CDS  NC_012560  45090  46118  +  1029  ABC transporter, periplasmic binding protein  YP_002797287  normal  0.123713  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00460  CDS  NC_012560  46115  47116  +  1002  hypothetical protein  YP_002797288  normal  0.131155  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00470  CDS  NC_012560  47113  47835  +  723  nickel incorporation protein  YP_002797289  normal  0.146336  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00480  CDS  NC_012560  47832  48815  +  984  ABC transporter, ATP binding component  YP_002797290  normal  0.446207  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00490  CDS  NC_012560  48879  49601  -  723  hypothetical protein  YP_002797291  normal  0.239892  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00500  CDS  NC_012560  49840  50436  +  597  Adenylylsulfate kinase, C-terminal domain protein  YP_002797292  normal  0.413176  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00510  CDS  NC_012560  50665  51180  -  516  hypothetical protein  YP_002797293  normal  0.177196  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00520  CDS  NC_012560  51366  53546  -  2181  DNA-dependent helicase II  YP_002797294  normal  0.851543  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00530  CDS  NC_012560  53662  55821  +  2160  hypothetical protein with two C-terminal GGDEF motifs  YP_002797295  normal  0.409537  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00540  CDS  NC_012560  55825  57186  -  1362  Peptidase, U32 family  YP_002797296  normal  0.210117  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00550  CDS  NC_012560  57262  57348  +  87  hypothetical protein  YP_002797297  normal  0.0272323  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00560  CDS  NC_012560  57562  57870  +  309  hypothetical protein  YP_002797298  normal  0.304131  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00570  CDS  NC_012560  58244  58642  +  399  hypothetical protein  YP_002797299  normal  0.452089  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00580  CDS  NC_012560  59016  60125  -  1110  ABC-2 type transport system permease protein  YP_002797300  normal  0.0449353  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00590  CDS  NC_012560  60137  61279  -  1143  ABC-2 type transport system hypothetical protein  YP_002797301  normal  0.0115211  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00600  CDS  NC_012560  61276  63057  -  1782  ABC transporter, ATP binding component  YP_002797302  normal  0.248095  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00610  CDS  NC_012560  63054  64073  -  1020  Type I secretion protein, HlyD family  YP_002797303  normal  0.211465  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00620  CDS  NC_012560  64166  64849  +  684  Transcriptional regulatory protein, TetR family  YP_002797304  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00630  CDS  NC_012560  65145  67871  -  2727  DNA polymerase I  YP_002797305  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00640  CDS  NC_012560  67947  68234  +  288  hypothetical protein  YP_002797306  normal  0.860448  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00650  CDS  NC_012560  68251  69201  +  951  homoserine kinase  YP_002797307  normal  0.362782  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00660  CDS  NC_012560  69288  70130  -  843  Alpha/beta hydrolase fold protein  YP_002797308  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00670  CDS  NC_012560  70281  70649  -  369  hypothetical protein  YP_002797309  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00680  CDS  NC_012560  70908  70997  -  90  hypothetical protein  YP_002797310  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00690  CDS  NC_012560  71048  71809  +  762  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  YP_002797311  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00700  CDS  NC_012560  72291  72932  -  642  transposase  YP_002797312  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00710  CDS  NC_012560  73344  73478  +  135  hypothetical protein  YP_002797313  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00720  CDS  NC_012560  73847  74155  -  309  acetyltransferase, GNAT family  YP_002797314  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00730  CDS  NC_012560  75091  75177  +  87  hypothetical protein  YP_002797315  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00740  CDS  NC_012560  75358  75630  -  273  multidrug efflux SMR transporter  YP_002797316  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00750  CDS  NC_012560  76032  77243  -  1212  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  YP_002797317  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00760  CDS  NC_012560  77521  77961  -  441  hypothetical protein  YP_002797318  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00770  CDS  NC_012560  78132  78530  -  399  hypothetical protein  YP_002797319  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00780  CDS  NC_012560  78918  79103  -  186  hypothetical protein  YP_002797320  normal  0.801409  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00790  CDS  NC_012560  80124  80687  -  564  Isochorismatase hydrolase  YP_002797321  normal  0.339277  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00800  CDS  NC_012560  80924  81607  -  684  hypothetical protein  YP_002797322  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00810  CDS  NC_012560  81671  83812  -  2142  ribonucleotide-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  YP_002797323  normal  0.693852  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00820  CDS  NC_012560  83843  84784  -  942  Transglutaminase-like Super Family Protein  YP_002797324  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00830  CDS  NC_012560  84913  85806  -  894  ABC transporter, periplasmic binding protein  YP_002797325  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00840  CDS  NC_012560  85869  86354  +  486  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  YP_002797326  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00850  CDS  NC_012560  86351  87124  +  774  zinc ABC transporter, ATP binding protein  YP_002797327  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00860  CDS  NC_012560  87117  87905  +  789  zinc ABC transporter, permease protein  YP_002797328  normal  0.952452  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00870  CDS  NC_012560  87993  88379  +  387  lipoprotein  YP_002797329  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00880  CDS  NC_012560  88532  89515  -  984  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  YP_002797330  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00890  CDS  NC_012560  89998  90708  +  711  gluconate dehydrogenase small subunit  YP_002797331  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00900  CDS  NC_012560  90711  92486  +  1776  gluconate dehydrogenase flavoprotein subunit  YP_002797332  normal  0.687718  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00910  CDS  NC_012560  92498  93817  +  1320  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  YP_002797333  normal  0.367446  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00920  CDS  NC_012560  93967  95238  +  1272  OprD family outer membrane porin  YP_002797334  normal  0.696381  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00930  CDS  NC_012560  95257  95892  -  636  Electron transport protein SCO1/SenC  YP_002797335  normal  0.330102  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00940  CDS  NC_012560  96177  97076  -  900  protoheme IX farnesyltransferase  YP_002797336  normal  0.110139  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00950  CDS  NC_012560  97163  98233  -  1071  Cytochrome oxidase assembly protein  YP_002797337  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00960  CDS  NC_012560  98274  98861  -  588  hypothetical protein  YP_002797338  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00970  CDS  NC_012560  98836  99603  -  768  surfeit locus 1-like protein  YP_002797339  normal  0.90584  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00980  CDS  NC_012560  99633  99839  +  207  hypothetical protein  YP_002797340  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_00990  CDS  NC_012560  100003  100893  -  891  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  YP_002797341  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Avin_01000  CDS  NC_012560  100908  101462  -  555  cytochrome C oxidase assembly protein  YP_002797342  normal  1  n/a    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 53    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>