2008 genes were found for organism Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
STER_0001  CDS  NC_008532  101  1465  +  1365  chromosomal replication initiation protein  YP_819592  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0002  CDS  NC_008532  1620  2756  +  1137  DNA polymerase III subunit beta  YP_819593  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0003  CDS  NC_008532  2825  4081  -  1257  transposase  YP_819594  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0004  CDS  NC_008532  4226  4417  +  192  hypothetical protein  YP_819595  normal  0.0935522  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0005  CDS  NC_008532  4630  5745  +  1116  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_819596  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0006  CDS  NC_008532  5818  6387  +  570  peptidyl-tRNA hydrolase  YP_819597  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0007  CDS  NC_008532  6380  9886  +  3507  transcription-repair coupling factor  YP_819598  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0008  CDS  NC_008532  10072  10347  +  276  S4 domain-containing protein  YP_819599  normal  0.340534  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0009  CDS  NC_008532  10331  10702  +  372  cell-cycle protein, MesJ/Ycf62 family, putative  YP_819600  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0010  CDS  NC_008532  10702  10833  +  132  hypothetical protein  YP_819601  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0011  CDS  NC_008532  10830  12122  +  1293  hypothetical protein  YP_819602  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0012  CDS  NC_008532  12122  13387  +  1266  putative cell-cycle protein, MesJ/Ycf62 family  YP_819603  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0013  CDS  NC_008532  13469  14011  +  543  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  YP_819604  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0014  CDS  NC_008532  14027  15994  +  1968  cell division protein  YP_819605  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0015  CDS  NC_008532  16037  16936  -  900  transposase  YP_819606  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0016  CDS  NC_008532  17393  17929  +  537  transposase  YP_819607  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0017    NC_008532  17905  18243  +  339      normal  0.159602  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0018  CDS  NC_008532  18257  18745  +  489  transposase  YP_819608  normal  0.163137  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0040  CDS  NC_008532  25595  26425  +  831  rod shape-determining protein MreC  YP_819609  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0041  CDS  NC_008532  26427  26951  +  525  rod shape-determining protein MreD  YP_819610  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0042  CDS  NC_008532  27036  28403  +  1368  glucan binding protein  YP_819611  normal  0.634979  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0043  CDS  NC_008532  28617  29582  +  966  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_819612  normal  0.270111  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0044    NC_008532  29660  30314  -  655      normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0045  CDS  NC_008532  30689  31864  +  1176  aromatic amino acid aminotransferase  YP_819613  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0046  CDS  NC_008532  31851  32624  +  774  DNA repair protein RecO  YP_819614  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0047  CDS  NC_008532  32842  33846  +  1005  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX  YP_819615  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0048  CDS  NC_008532  33846  34091  +  246  acyl carrier protein  YP_819616  normal  0.858481  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0049  CDS  NC_008532  34376  35083  +  708  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  YP_819617  normal  0.074199  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0050  CDS  NC_008532  35139  38864  +  3726  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  YP_819618  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0051  CDS  NC_008532  39033  40472  +  1440  amidophosphoribosyltransferase  YP_819619  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0052  CDS  NC_008532  40503  41522  +  1020  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  YP_819620  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0053  CDS  NC_008532  41522  42076  +  555  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  YP_819621  normal  0.243956  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0054  CDS  NC_008532  42145  43692  +  1548  bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  YP_819622  normal  0.191385  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0055  CDS  NC_008532  43864  44382  +  519  IS861, transposase (orf1), IS3 family, truncated  YP_819623  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0056    NC_008532  44376  44984  +  609      normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0057  CDS  NC_008532  45089  45928  -  840  cell wall protein precursor, choline binding protein  YP_819624  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0058  CDS  NC_008532  46237  47499  +  1263  phosphoribosylamine--glycine ligase  YP_819625  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0059  CDS  NC_008532  47833  48333  +  501  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase catalytic subunit  YP_819626  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0060  CDS  NC_008532  48320  49411  +  1092  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  YP_819627  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0061    NC_008532  49604  50359  +  756      normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0062  CDS  NC_008532  50368  50427  +  60  hypothetical protein  YP_819628  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0063  CDS  NC_008532  50431  50595  +  165  hypothetical protein  YP_819629  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0064  CDS  NC_008532  50874  52172  +  1299  adenylosuccinate lyase  YP_819630  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0065  CDS  NC_008532  53036  54727  -  1692  arginyl-tRNA synthetase  YP_819631  normal  0.079588  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0066  CDS  NC_008532  54885  55310  +  426  arginine repressor  YP_819632  normal  0.558575  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0067  CDS  NC_008532  55310  55669  +  360  hypothetical protein  YP_819633  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0068  CDS  NC_008532  55662  58220  +  2559  DNA mismatch repair protein MutS  YP_819634  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0069  CDS  NC_008532  58254  58709  -  456  hypothetical protein  YP_819635  hitchhiker  0.00773804  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0070  CDS  NC_008532  58723  59097  -  375  response regulator  YP_819636  hitchhiker  0.000561493  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0071  CDS  NC_008532  59333  59626  +  294  hypothetical protein  YP_819637  hitchhiker  0.00000181924  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0072  CDS  NC_008532  59678  61621  +  1944  DNA mismatch repair protein  YP_819638  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0073  CDS  NC_008532  61751  61972  +  222  hypothetical protein  YP_819639  normal  0.0142004  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0074  CDS  NC_008532  62124  62714  +  591  Holliday junction DNA helicase RuvA  YP_819640  hitchhiker  0.000176454  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0075  CDS  NC_008532  62721  63275  +  555  3-methyladenine DNA glycosylase  YP_819641  decreased coverage  0.00000223645  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0076  CDS  NC_008532  63371  64642  +  1272  competence damage-inducible protein A  YP_819642  normal  0.0110549  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0077  CDS  NC_008532  64678  65817  +  1140  recombinase A  YP_819643  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0078  CDS  NC_008532  65994  66392  +  399  transcriptional regulator Spx  YP_819644  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0095  CDS  NC_008532  72798  77192  +  4395  DNA polymerase III PolC  YP_819645  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0096  CDS  NC_008532  77356  78597  +  1242  aminopeptidase PepS  YP_819646  normal  0.216815  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0097  CDS  NC_008532  78617  78847  +  231  hypothetical protein  YP_819647  normal  0.126932  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0098  CDS  NC_008532  78980  79066  +  87  hypothetical protein  YP_819648  normal  0.0614034  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0099    NC_008532  79050  79379  +  330      normal  0.0527216  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0100  CDS  NC_008532  79497  80048  +  552  hypothetical protein  YP_819649  hitchhiker  0.000132763  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0101  CDS  NC_008532  80098  80586  -  489  transposase  YP_819650  normal  0.163137  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0102    NC_008532  80600  80863  -  264      normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0103    NC_008532  81478  82368  -  891      normal  0.320965  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0105  CDS  NC_008532  82956  83723  +  768  30S ribosomal protein S2  YP_819651  hitchhiker  0.000131996  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0106  CDS  NC_008532  83841  84881  +  1041  elongation factor Ts  YP_819652  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0107  CDS  NC_008532  84991  85461  -  471  hypothetical protein  YP_819653  decreased coverage  0.00969269  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0108  CDS  NC_008532  85705  86160  +  456  class III stress gene transcriptional regulator  YP_819654  hitchhiker  0.00387323  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0109  CDS  NC_008532  86161  88611  +  2451  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  YP_819655  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0110    NC_008532  88739  89971  -  1233      normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0111  CDS  NC_008532  90195  90881  +  687  transposase  YP_819656  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0112  CDS  NC_008532  90896  91765  +  870  transposase  YP_819657  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0113  CDS  NC_008532  91828  93081  -  1254  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, penicillin-binding protein  YP_819658  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0114  CDS  NC_008532  93284  95509  +  2226  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  YP_819659  normal  0.613671  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0115  CDS  NC_008532  95518  96288  +  771  hypothetical protein  YP_819660  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0116  CDS  NC_008532  96361  96981  +  621  serine acetyltransferase  YP_819661  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0117  CDS  NC_008532  97363  98706  +  1344  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_819662  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0118  CDS  NC_008532  98699  99100  +  402  hypothetical protein  YP_819663  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0119  CDS  NC_008532  99382  99537  +  156  hypothetical protein  YP_819664  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0120  CDS  NC_008532  99613  99801  +  189  hypothetical protein  YP_819665  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0121  CDS  NC_008532  99872  100114  +  243  hypothetical protein  YP_819666  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0122  CDS  NC_008532  100162  100905  +  744  tRNA/rRNA methyltransferase  YP_819667  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0123  CDS  NC_008532  100944  101423  +  480  RNA-binding protein  YP_819668  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0124  CDS  NC_008532  101432  102292  +  861  hypothetical protein  YP_819669  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0125  CDS  NC_008532  102593  103093  +  501  hypothetical protein  YP_819670  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0126  CDS  NC_008532  103241  104197  +  957  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_819671  hitchhiker  0.00267865  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0127  CDS  NC_008532  104406  104852  +  447  50S ribosomal protein L13  YP_819672  unclonable  0.0000000749109  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0128  CDS  NC_008532  104880  105272  +  393  30S ribosomal protein S9  YP_819673  hitchhiker  0.000000606121  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0129    NC_008532  105786  106010  +  225      hitchhiker  0.00000215968  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0130  CDS  NC_008532  106260  106364  +  105  hypothetical protein  YP_819674  hitchhiker  0.000000780681  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0131  CDS  NC_008532  106407  108122  +  1716  hypothetical protein  YP_819675  normal  0.416084  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0132    NC_008532  108266  109441  -  1176      normal  0.0586413  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0133    NC_008532  109545  109934  +  390      decreased coverage  0.000000490253  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0134  CDS  NC_008532  109965  110810  +  846  hypothetical protein  YP_819676  hitchhiker  0.00520082  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0135  CDS  NC_008532  110820  110987  +  168  hypothetical protein  YP_819677  normal  0.0399924  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0136  CDS  NC_008532  111038  111550  +  513  transcription regulator  YP_819678  normal  0.0628959  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0137  CDS  NC_008532  111672  111776  +  105  hypothetical protein  YP_819679  normal  0.0547702  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0138  CDS  NC_008532  111876  113132  -  1257  transposase  YP_819680  normal  1  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>