383 genes were found for organism Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PICST_1028  CDS  NC_009047  718579  721659  -  3081  Fungal Zn2Cys6 Cluster domain  XP_001386333  normal  1  normal  0.580079  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_14132  CDS  NC_009047  987596  992392  +  4797  negative regulator of early meiotic expression  XP_001386202  normal  0.0438243  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_14352  CDS  NC_009047  272888  273466  -  579  predicted protein  XP_001386258  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_14973  CDS  NC_009047  169255  171975  +  2721  predicted protein  XP_001386048  normal  0.251561  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_15419  CDS  NC_009047  723959  726199  -  2241  predicted protein  XP_001386334  normal  0.0198581  normal  0.726976  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17369  CDS  NC_009047  157023  158198  +  1176  hyphally regulated cell wall protein Exo-alpha-sialidase  XP_001386047  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_18070  CDS  NC_009047  656897  658375  -  1479  predicted protein  XP_001386319  normal  0.235503  normal  0.132963  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19189  CDS  NC_009047  941845  943029  -  1185  predicted protein  XP_001386369  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_1946  CDS  NC_009047  1034396  1036966  +  2571  predicted protein  XP_001386206  normal  0.136034  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_20558  CDS  NC_009047  57261  58244  +  984  predicted protein  XP_001386027  normal  0.0845057  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_20969  CDS  NC_009047  1083126  1084070  -  945  pH-regulated antigen precursor  XP_001386401  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23459  CDS  NC_009047  881149  881331  -  183  predicted protein  XP_001386358  normal  0.466482  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_2520  CDS  NC_009047  597481  598722  -  1242  predicted protein  XP_001386310  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33212  CDS  NC_009047  1855  8187  +  6333  ATP-dependent DNA helicase  XP_001386021  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33213  CDS  NC_009047  8418  9097  +  680  predicted protein  XP_001386022  normal  0.906365  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33214  CDS  NC_009047  10475  11830  +  1356  predicted protein  XP_001386023  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33215  CDS  NC_009047  12367  18837  -  6471  hypothetical serine rich protein  XP_001386217  normal  0.963879  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33220  CDS  NC_009047  42907  46395  +  3489  hypothetical protein  XP_001386026  unclonable  0.00248788  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33225  CDS  NC_009047  59230  60912  -  1683  Acetyl-CoA transporter  XP_001386224  normal  0.568918  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33229  CDS  NC_009047  70597  71532  -  936  predicted protein  XP_001386227  normal  0.841869  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33231  CDS  NC_009047  73045  73536  +  492  predicted protein  XP_001386029  normal  1  normal  0.281696  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33238  CDS  NC_009047  94377  95543  -  1167  conserved hypothetical protein  XP_001386231  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33243  CDS  NC_009047  105337  106446  +  1110  predicted protein  XP_001386035  normal  0.0434678  normal  0.79491  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33244  CDS  NC_009047  107211  108296  +  1086  predicted protein  XP_001386036  normal  0.500627  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33245  CDS  NC_009047  108372  109337  -  966  predicted protein  XP_001386235  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33265  CDS  NC_009047  146999  148945  -  1947  protein kinase  XP_001386243  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33268  CDS  NC_009047  164892  166529  -  1638  nuclear architecture related protein  XP_001386245  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33273  CDS  NC_009047  184654  187227  +  2574  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  XP_001386050  normal  0.0974911  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33275  CDS  NC_009047  189957  192086  +  2130  predicted protein  XP_001386052  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33276  CDS  NC_009047  192162  193775  -  1614  predicted protein  XP_001386249  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33279  CDS  NC_009047  204660  205625  +  966  predicted protein  XP_001386055  normal  1  normal  0.236513  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33287  CDS  NC_009047  218651  219112  -  462  predicted protein  XP_001386252  normal  1  normal  0.678319  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33291  CDS  NC_009047  228544  229632  +  1089  predicted protein  XP_001386061  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33298  CDS  NC_009047  245526  247823  +  2298  predicted protein  XP_001386067  normal  0.113893  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33302  CDS  NC_009047  255444  258135  -  2692  predicted protein  XP_001386257  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33305  CDS  NC_009047  268360  269503  +  1144  retrotransposon  XP_001386071  decreased coverage  0.000145871  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33311  CDS  NC_009047  299534  301525  -  1992  predicted protein  XP_001386260  normal  0.567773  normal  0.0126253  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33314  CDS  NC_009047  305721  308363  -  2643  predicted protein  XP_001386261  normal  0.137938  normal  0.0154769  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33319  CDS  NC_009047  316805  324031  -  7227  predicted protein  XP_001386263  normal  1  normal  0.302213  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33327  CDS  NC_009047  342632  343246  -  615  predicted protein  XP_001386268  normal  1  normal  0.573681  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33329  CDS  NC_009047  345185  346771  +  1587  hypothetical protein  XP_001386082  normal  0.302191  normal  0.455803  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33333  CDS  NC_009047  358237  359199  +  963  predicted protein  XP_001386083  normal  1  normal  0.281696  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33338  CDS  NC_009047  363928  364842  +  915  predicted protein  XP_001386084  normal  0.171512  normal  0.943174  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33355  CDS  NC_009047  399988  402255  +  2268  predicted protein  XP_001386094  normal  1  normal  0.0714809  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33357  CDS  NC_009047  405241  407370  -  2130  predicted protein  XP_001386279  normal  0.344504  normal  0.306168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33358  CDS  NC_009047  407631  412271  -  4641  predicted protein  XP_001386280  normal  1  normal  0.176236  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33361  CDS  NC_009047  421661  422887  +  1227  protein serine/threonine kinase activity  XP_001386096  normal  1  normal  0.814262  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33363  CDS  NC_009047  424746  425294  -  549  predicted protein  XP_001386282  normal  1  normal  0.488397  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33377  CDS  NC_009047  458902  459951  +  1050  predicted protein  XP_001386105  normal  1  hitchhiker  0.00254544  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33379  CDS  NC_009047  462546  463814  -  1269  predicted protein  XP_001386290  normal  1  hitchhiker  0.00101834  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33381  CDS  NC_009047  466998  467405  +  408  predicted protein  XP_001386108  normal  1  decreased coverage  0.000249322  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33382  CDS  NC_009047  469743  470558  -  816  predicted protein  XP_001386291  normal  0.578635  hitchhiker  0.00106349  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33383  CDS  NC_009047  471737  472261  +  525  predicted protein  XP_001386109  normal  0.0607976  hitchhiker  0.00299039  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33386  CDS  NC_009047  477351  477875  -  525  predicted protein  XP_001386293  normal  0.330096  hitchhiker  0.00339265  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33387  CDS  NC_009047  479054  479869  +  816  predicted protein  XP_001386111  normal  0.274486  decreased coverage  0.000361715  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33409  CDS  NC_009047  548339  548971  -  633  predicted protein  XP_001386301  normal  0.306188  normal  0.51353  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33410  CDS  NC_009047  550039  551076  -  1038  predicted protein  XP_001386302  normal  0.841869  normal  0.225834  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33418  CDS  NC_009047  589050  590234  -  1185  predicted protein  XP_001386308  normal  1  normal  0.265783  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33419  CDS  NC_009047  591080  592927  +  1848  predicted protein  XP_001386125  normal  1  normal  0.307671  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33428  CDS  NC_009047  628798  630627  +  1830  MDR transporter  XP_001386129  normal  0.153237  normal  0.442314  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33429  CDS  NC_009047  631297  633180  +  1884  MDR transporter  XP_001386130  normal  0.0921867  normal  0.433771  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33431  CDS  NC_009047  635382  636530  +  1149  hypothetical multicopy protein  XP_001386131  normal  1  normal  0.613875  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33443  CDS  NC_009047  658513  659826  -  1314  predicted protein  XP_001386320  normal  0.137532  normal  0.0676408  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33450  CDS  NC_009047  673373  675403  +  2031  5'-3' exonuclease  XP_001386143  normal  1  normal  0.167856  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33452  CDS  NC_009047  676529  677959  +  1431  Uncharacterized conserved protein  XP_001386144  normal  1  normal  0.242751  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33458  CDS  NC_009047  693506  695365  -  1860  predicted protein  XP_001386326  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33459  CDS  NC_009047  695765  698155  -  2391  F-box protein: endocytic membrane traffic, recycling ReCYcling 1  XP_001386327  normal  0.0219779  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33460  CDS  NC_009047  698987  701440  +  2454  predicted protein  XP_001386147  normal  0.242264  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33461  CDS  NC_009047  701469  701994  -  526  Homeodomain protein  XP_001386328  normal  0.0624259  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33462  CDS  NC_009047  702293  702973  -  681  mating locus regulatory protein  XP_001386329  normal  0.778845  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33473  CDS  NC_009047  731201  731848  +  648  predicted protein  XP_001386152  normal  0.191098  normal  0.13999  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33476  CDS  NC_009047  735541  737679  +  2139  predicted protein  XP_001386153  normal  0.50882  normal  0.174506  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33477  CDS  NC_009047  737974  739731  +  1758  DRAP deaminase  XP_001386154  normal  1  normal  0.261571  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33482  CDS  NC_009047  748776  750005  -  1230  predicted protein  XP_001386340  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33494  CDS  NC_009047  784032  784889  +  858  holocytochrome-c synthase  XP_001386161  normal  1  normal  0.0169467  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33495  CDS  NC_009047  785147  787372  -  2226  hypothetical protein  XP_001386346  normal  0.375404  normal  0.0265895  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33508  CDS  NC_009047  824548  825924  -  1377  predicted protein  XP_001386351  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33511  CDS  NC_009047  837074  838024  -  951  predicted protein  XP_001386352  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33517  CDS  NC_009047  846915  848100  +  1186  D-aspartate oxidase  XP_001386174  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33523  CDS  NC_009047  859633  860166  +  534  predicted protein  XP_001386179  normal  0.0759685  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33525  CDS  NC_009047  862199  864136  -  1938  predicted protein  XP_001386355  normal  0.209647  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33532  CDS  NC_009047  887320  888429  -  1110  dihydrouridine synthase  XP_001386359  normal  0.056699  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33544  CDS  NC_009047  925507  927063  -  1557  Glycosyl Phosphatidyl Inositol 17  XP_001386366  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33547  CDS  NC_009047  934449  935258  +  810  predicted protein  XP_001386189  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33555  CDS  NC_009047  946233  948277  -  2045  predicted protein  XP_001386370  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33560  CDS  NC_009047  958087  958573  +  487  predicted protein  XP_001386196  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33561  CDS  NC_009047  958705  962094  +  3390  membrane-spanning Ca-ATPase (P- type)  XP_001386197  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33562  CDS  NC_009047  962402  963979  +  1578  predicted protein  XP_001386198  normal  0.884137  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33564  CDS  NC_009047  970006  971231  -  1226  predicted protein  XP_001386374  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33566  CDS  NC_009047  974745  975563  -  819  predicted protein  XP_001386376  normal  0.578635  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33568  CDS  NC_009047  980471  981727  +  1257  predicted protein  XP_001386201  normal  0.0922684  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33573  CDS  NC_009047  996148  997128  +  981  predicted protein  XP_001386204  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33591  CDS  NC_009047  1052484  1053209  -  726  predicted protein  XP_001386392  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33593  CDS  NC_009047  1055288  1058566  -  3279  hypothetical protein  XP_001386394  normal  1  normal  0.271146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33594  CDS  NC_009047  1059319  1060602  +  1284  predicted protein  XP_001386208  normal  1  normal  0.258342  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33598  CDS  NC_009047  1063648  1064374  -  727  predicted protein  XP_001386397  normal  1  normal  0.213062  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33600  CDS  NC_009047  1071670  1072743  -  1074  predicted protein  XP_001386398  normal  1  normal  0.0247334  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33612  CDS  NC_009047  1106224  1112574  -  6351  Vesicle coat complex AP-3  XP_001386403  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_36916  CDS  NC_009047  188526  189350  -  825  predicted protein  XP_001386248  normal  0.0905779  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_36928  CDS  NC_009047  249453  250028  +  576  predicted protein  XP_001386069  decreased coverage  0.000829707  normal  0.878601  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>