685 genes were found for organism Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PICST_11073  CDS  NC_009046  715416  716609  +  1194  predicted protein  XP_001385491  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11314  CDS  NC_009046  1708541  1709968  +  1428  possible hexose transporter  XP_001385684  normal  0.96677  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12169  CDS  NC_009046  581701  582861  +  1161  predicted protein  XP_001385458  normal  0.68712  normal  0.32837  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16322  CDS  NC_009046  785792  787546  +  1755  protein for resistance to o-dinitrobenzene, calcium, and zinc  XP_001385511  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16565  CDS  NC_009046  121896  123662  +  1767  predicted protein  XP_001385353  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17474  CDS  NC_009046  990088  994134  -  4047  hyphally regulated cell wall protein  XP_001385882  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19145  CDS  NC_009046  496192  497157  -  966  predicted protein  XP_001385785  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19671  CDS  NC_009046  1484152  1485354  +  1203  Box C/D snoRNA accumulation  XP_001385634  normal  0.19013  normal  0.236513  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21007  CDS  NC_009046  142039  142587  -  549  predicted protein  XP_001385721  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22479  CDS  NC_009046  219423  219890  +  468  predicted protein  XP_001385379  normal  1  normal  0.125717  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22975  CDS  NC_009046  1305707  1306069  +  363  predicted protein  XP_001385602  normal  1  normal  0.984982  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23026  CDS  NC_009046  338989  339426  +  438  predicted protein  XP_001385410  normal  0.996662  normal  0.0237859  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23784  CDS  NC_009046  64304  64522  -  219  predicted protein  XP_001385701  normal  0.0444134  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_24259  CDS  NC_009046  944174  946942  -  2769  Fungal specific transcription factor  XP_001385874  normal  0.44757  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_25346  CDS  NC_009046  864869  866407  +  1539  predicted protein  XP_001385530  normal  1  normal  0.0929212  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_26987  CDS  NC_009046  1194625  1195386  -  762  predicted protein  XP_001385925  normal  0.181208  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27944  CDS  NC_009046  823411  823584  -  174  predicted protein  XP_001385857  normal  0.994294  normal  0.0184604  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27984  CDS  NC_009046  1713364  1716809  -  3446  Sugar UpTake (tentative)  XP_001386019  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32520  CDS  NC_009046  1198  3875  -  2678  Urea active transport protein  XP_001385686  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32526  CDS  NC_009046  16507  18159  -  1653  hexokinase I  XP_001385689  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32528  CDS  NC_009046  23043  24041  -  999  Electron transfer flavoprotein alpha-subunit  XP_001385691  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32530  CDS  NC_009046  28472  30943  -  2472  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  XP_001385692  normal  0.725216  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32531  CDS  NC_009046  31705  33234  +  1530  maltose permease  XP_001385340  normal  0.931484  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32535  CDS  NC_009046  45623  48268  +  2646  Putative sulfate transporter  XP_001385342  normal  1  normal  0.162178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32538  CDS  NC_009046  51795  52745  -  951  aldose reductase  XP_001385695  normal  1  normal  0.169433  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32542  CDS  NC_009046  58544  59482  +  939  multicatalytic endopeptidase  XP_001385344  normal  1  normal  0.0971418  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32544  CDS  NC_009046  61492  62252  -  761  predicted protein  XP_001385699  normal  1  normal  0.593065  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32546  CDS  NC_009046  64842  67091  -  2250  predicted protein  XP_001385702  normal  0.035619  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32560  CDS  NC_009046  94711  96249  -  1539  Monocarboxylate transporter  XP_001385711  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32562  CDS  NC_009046  100574  101458  +  885  predicted protein  XP_001385351  normal  1  normal  0.182141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32563  CDS  NC_009046  101707  104892  -  3186  transcription activator involved in proline utilization potential fungal Zn(2)-Cys(6) binuclear cluster domain  XP_001385712  normal  1  normal  0.165172  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32564  CDS  NC_009046  105795  107873  +  2079  predicted protein  XP_001385352  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32567  CDS  NC_009046  114081  119129  -  5049  predicted protein  XP_001385716  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32571  CDS  NC_009046  125939  129805  -  3867  ABC transporter family protein  XP_001385718  normal  0.318533  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32574  CDS  NC_009046  135370  138315  +  2946  predicted protein  XP_001385355  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32587  CDS  NC_009046  171315  172454  +  1140  GATA-family of DNA binding protein-like protein  XP_001385365  normal  0.527498  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32591  CDS  NC_009046  180765  181259  -  495  predicted protein  XP_001385727  normal  1  normal  0.24055  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32593  CDS  NC_009046  185023  186012  +  990  acid phosphatase  XP_001385367  normal  1  normal  0.390425  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32596  CDS  NC_009046  194855  195985  +  1131  predicted protein  XP_001385370  normal  1  normal  0.26747  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32597  CDS  NC_009046  197027  197647  +  621  predicted protein  XP_001385371  normal  1  normal  0.360349  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32611  CDS  NC_009046  224019  226130  +  2112  hypothetical protein  XP_001385381  normal  0.574358  normal  0.0281124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32612  CDS  NC_009046  226242  228311  -  2070  Mitochondrial Translation Optimization  XP_001385733  normal  1  normal  0.0981795  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32615  CDS  NC_009046  232641  233549  +  909  hypothetical protein  XP_001385383  normal  1  normal  0.044191  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32617  CDS  NC_009046  235086  238049  -  2964  CAS specific exportin for Srp1p required for accurate mitotic chromosome segregation  XP_001385735  normal  0.127348  normal  0.079976  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32623  CDS  NC_009046  254003  254419  +  417  predicted protein  XP_001385387  hitchhiker  0.00673859  normal  0.0439327  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32625  CDS  NC_009046  256893  257783  -  891  predicted protein  XP_001385741  normal  0.425894  normal  0.0226158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32630  CDS  NC_009046  274767  276587  +  1821  predicted protein  XP_001385391  decreased coverage  0.000222385  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32634  CDS  NC_009046  281772  283595  +  1824  multidrug-resistance transporte  XP_001385394  decreased coverage  0.0035637  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32638  CDS  NC_009046  293451  294263  +  813  predicted protein  XP_001385397  normal  0.682182  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32640  CDS  NC_009046  296949  299264  +  2316  predicted protein  XP_001385399  normal  0.622568  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32655  CDS  NC_009046  333956  334765  +  810  predicted protein  XP_001385407  normal  0.351809  normal  0.0198714  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32663  CDS  NC_009046  349209  350168  +  960  predicted protein  XP_001385415  normal  1  normal  0.011178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32667  CDS  NC_009046  357941  359487  +  1547  predicted protein  XP_001385418  normal  1  normal  0.0357822  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32671  CDS  NC_009046  367591  368376  +  786  GTP-binding protein  XP_001385421  normal  1  normal  0.0460468  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32672  CDS  NC_009046  368658  369353  -  696  predicted protein  XP_001385755  normal  1  normal  0.0439327  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32673  CDS  NC_009046  370409  372649  -  2241  Tuftelin-interacting protein TIP39, contains G-patch domain  XP_001385756  normal  0.541012  normal  0.0285832  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32678  CDS  NC_009046  379625  381436  -  1812  Mitochondrial distribution and morphology protein 31, mitochondrial precursor  XP_001385759  normal  1  normal  0.0835589  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32690  CDS  NC_009046  408113  408781  +  669  Vacuolar sorting protein SNF7 (Vacuolar protein sorting-associated protein VPS32)  XP_001385432  decreased coverage  0.00479925  normal  0.0750139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32693  CDS  NC_009046  414989  416743  -  1755  phosphatidylserine decarboxylase  XP_001385764  normal  0.0477743  normal  0.0244579  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32696  CDS  NC_009046  426001  428654  +  2654  possible mannoprotein  XP_001385434  normal  0.313677  normal  0.600944  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32703  CDS  NC_009046  447250  449281  -  2032  predicted protein  XP_001385771  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32705  CDS  NC_009046  453852  456524  +  2673  WAR1; transcription factor activity  XP_001385437  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32723  CDS  NC_009046  499987  501015  +  1029  predicted protein  XP_001385442  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32724  CDS  NC_009046  501951  503660  -  1710  predicted protein  XP_001385786  normal  0.375638  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32737  CDS  NC_009046  531444  532365  -  922  predicted protein  XP_001385790  normal  0.447394  normal  0.724831  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32740  CDS  NC_009046  537373  540540  -  3168  histone methyltransferase involved in gene regulation  XP_001385792  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32745  CDS  NC_009046  550605  551258  -  654  predicted protein  XP_001385795  normal  0.718016  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32748  CDS  NC_009046  559912  560739  +  828  predicted protein  XP_001385457  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32751  CDS  NC_009046  565333  565863  -  531  peptidylprolyl cis/trans isomerase  XP_001385799  normal  0.24175  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32752  CDS  NC_009046  567988  569849  -  1862  putative RNA directed DNA polymerase  XP_001385800  normal  0.765101  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32753  CDS  NC_009046  570393  571637  -  1245  Hypothetical multicopy protein  XP_001385801  normal  0.0429839  normal  0.804403  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32760  CDS  NC_009046  586479  587984  +  1506  predicted protein  XP_001385460  normal  0.251439  normal  0.0851814  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32763  CDS  NC_009046  591735  593507  -  1773  predicted protein  XP_001385808  normal  0.305093  normal  0.172264  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32767  CDS  NC_009046  600284  601648  -  1365  predicted protein  XP_001385811  normal  1  normal  0.401981  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32772  CDS  NC_009046  610125  612215  +  2091  hypothetical protein  XP_001385465  normal  1  normal  0.635098  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32773  CDS  NC_009046  613083  614111  +  1029  predicted protein  XP_001385466  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32780  CDS  NC_009046  623052  624320  -  1269  predicted protein  XP_001385817  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32786  CDS  NC_009046  637844  638398  -  555  predicted protein  XP_001385823  normal  0.333376  normal  0.784272  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32792  CDS  NC_009046  648024  650330  +  2307  predicted protein  XP_001385474  normal  0.980986  normal  0.0911162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32795  CDS  NC_009046  652782  653544  -  763  predicted protein  XP_001385828  normal  1  normal  0.128685  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32799  CDS  NC_009046  661167  662355  +  1189  Geranylgeranyl transferase type II alpha subunit  XP_001385477  normal  0.193653  normal  0.546499  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32802  CDS  NC_009046  666771  668906  +  2136  predicted protein  XP_001385479  normal  0.955784  normal  0.581511  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32818  CDS  NC_009046  707461  708344  +  884  predicted protein  XP_001385489  normal  0.179933  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32827  CDS  NC_009046  721672  722745  +  1074  predicted protein  XP_001385493  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32828  CDS  NC_009046  722905  723771  -  867  predicted protein  XP_001385842  normal  0.206529  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32829  CDS  NC_009046  724408  725970  +  1563  predicted protein  XP_001385494  normal  0.474469  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32831  CDS  NC_009046  727868  728914  +  1047  hypothetical protein  XP_001385495  normal  0.168677  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32834  CDS  NC_009046  736424  737479  -  1056  predicted protein  XP_001385845  normal  1  normal  0.571907  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32835  CDS  NC_009046  738956  739399  +  444  conserved hypothetical protein  XP_001385498  normal  0.805601  normal  0.755477  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32838  CDS  NC_009046  743748  745220  +  1473  putative Nucleolar GTPase/ATPase  XP_001385500  normal  1  normal  0.23779  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32842  CDS  NC_009046  752161  753945  +  1785  hypothetical leucine rich repeat protein  XP_001385504  normal  1  normal  0.548353  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32843  CDS  NC_009046  753989  755794  -  1806  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  XP_001385847  normal  1  normal  0.334682  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32846  CDS  NC_009046  762575  764002  -  1428  enoyl-CoA hydratase, mitochondrial  XP_001385849  normal  0.726842  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32861  CDS  NC_009046  806332  807735  -  1404  COQ6 monooxygenase, coenzyme Q biosynthesis  XP_001385853  normal  1  normal  0.500519  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32865  CDS  NC_009046  813810  815108  -  1299  G-protein beta subunit-like protein containing WD repeats  XP_001385855  normal  0.780213  normal  0.0258453  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32867  CDS  NC_009046  818478  820295  +  1818  hypothetical protein  XP_001385520  normal  1  normal  0.0113876  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32870  CDS  NC_009046  826690  827301  +  612  predicted protein  XP_001385521  normal  0.389187  normal  0.0414767  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32871  CDS  NC_009046  827573  828631  +  1059  predicted protein  XP_001385522  normal  0.566775  normal  0.0222325  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32878  CDS  NC_009046  848275  848973  -  699  predicted protein  XP_001385861  normal  1  normal  0.0100817  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32879  CDS  NC_009046  852198  854054  -  1857  predicted protein  XP_001385862  normal  0.134484  decreased coverage  0.00551311  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>