679 genes were found for organism Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PICST_14247  CDS  NC_009045  341936  345118  -  3183  mitochondrial DNA polymerase catalytic subunit  XP_001385083  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_15102  CDS  NC_009045  1384858  1387284  -  2427  helicase  XP_001385272  normal  1  hitchhiker  0.00429974  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_15651  CDS  NC_009045  1280146  1282428  +  2283  serine-threonine protein kinase, PKA suppressor  XP_001384935  normal  0.0134219  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16647  CDS  NC_009045  1274890  1276605  +  1716  predicted protein  XP_001384933  normal  0.0247353  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_167  CDS  NC_009045  289565  294076  +  4512  predicted protein  XP_001384716  normal  0.0272368  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17702  CDS  NC_009045  1396779  1398056  +  1278  predicted protein  XP_001384956  normal  1  normal  0.257016  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17775  CDS  NC_009045  35163  36662  +  1500  Probable sucrose utilization protein (SUC1) or maltose fermentation regulatory protein (MAL13)  XP_001384659  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_18300  CDS  NC_009045  47354  48739  -  1386  Regulator of Ty1 Transposition  XP_001385033  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19389  CDS  NC_009045  1360673  1361836  -  1164  predicted protein  XP_001385267  normal  1  hitchhiker  0.000708555  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21178  CDS  NC_009045  1596282  1597442  +  1161  predicted protein  XP_001385001  normal  1  normal  0.132821  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22565  CDS  NC_009045  602707  603201  +  495  predicted protein  XP_001384783  decreased coverage  0.0043227  normal  0.0742578  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23467  CDS  NC_009045  277397  277729  +  333  predicted protein  XP_001384712  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_25248  CDS  NC_009045  1338016  1339722  +  1707  predicted protein  XP_001384946  normal  1  hitchhiker  0.00727478  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_26508  CDS  NC_009045  769096  770322  +  1227  predicted protein  XP_001384810  normal  1  normal  0.589163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27631  CDS  NC_009045  208717  209136  +  420  conserved hypothetical protein  XP_001384698  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27661  CDS  NC_009045  1723628  1724086  +  459  predicted protein  XP_001385021  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31838  CDS  NC_009045  4662  6419  -  1758  maltose permease  XP_001385023  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31841  CDS  NC_009045  18138  22013  -  3876  Floculation protein FLO1  XP_001385025  normal  0.29209  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31848  CDS  NC_009045  40089  41738  -  1650  predicted protein  XP_001385030  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31853  CDS  NC_009045  49135  50205  +  1071  predicted protein  XP_001384662  normal  0.437055  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31861  CDS  NC_009045  67625  68953  +  1329  predicted protein  XP_001384665  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31862  CDS  NC_009045  70494  71813  +  1320  predicted protein  XP_001384666  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31865  CDS  NC_009045  74572  76980  +  2409  predicted protein  XP_001384668  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31869  CDS  NC_009045  92815  94662  +  1848  predicted protein  XP_001384672  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31875  CDS  NC_009045  110204  112492  -  2289  predicted protein  XP_001385042  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31881  CDS  NC_009045  125991  127322  -  1332  predicted protein  XP_001385044  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31893  CDS  NC_009045  157235  158584  +  1350  member of triose phosphate translocator family  XP_001384683  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31907  CDS  NC_009045  185143  187767  -  2625  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  XP_001385054  normal  0.953528  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31908  CDS  NC_009045  188251  189909  +  1659  tyrosyl-tRNA synthetase  XP_001384692  normal  0.483177  normal  0.847897  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31917  CDS  NC_009045  209591  210319  -  729  hypothetical protein  XP_001385057  normal  0.98867  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31918  CDS  NC_009045  211168  212229  -  1062  hypothetical protein  XP_001385058  normal  0.386059  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31924  CDS  NC_009045  234010  236634  +  2625  predicted protein  XP_001384701  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31932  CDS  NC_009045  251157  253076  -  1920  predicted protein  XP_001385065  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31938  CDS  NC_009045  264786  265398  +  613  cofilin/tropomyosin-type actin-binding protein  XP_001384708  normal  1  normal  0.448427  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31954  CDS  NC_009045  309288  309890  -  603  predicted protein  XP_001385075  normal  1  normal  0.0958096  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31956  CDS  NC_009045  312185  313093  +  909  predicted protein  XP_001384721  normal  1  normal  0.0602966  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31957  CDS  NC_009045  313251  314468  -  1218  NADPH dehydrogenase  XP_001385076  normal  1  normal  0.113274  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31958  CDS  NC_009045  314798  316009  -  1212  NAPDH dehydrogenase (old yellow enzyme), isoform 2  XP_001385077  normal  1  normal  0.19959  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31961  CDS  NC_009045  320035  321159  -  1125  dnaJ homolog in endoplasmic reticulum  XP_001385080  normal  1  normal  0.108543  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31966  CDS  NC_009045  335340  336950  +  1611  predicted protein  XP_001384724  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31980  CDS  NC_009045  388400  390511  +  2112  predicted protein  XP_001384732  normal  1  normal  0.25184  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31981  CDS  NC_009045  390560  391483  -  924  protein involved in bud site selection  XP_001385089  normal  1  normal  0.294425  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31983  CDS  NC_009045  395624  397093  +  1470  DNA repair protein and ATPase  XP_001384734  normal  1  normal  0.812011  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31986  CDS  NC_009045  402608  403261  -  654  predicted protein  XP_001385090  hitchhiker  0.00722102  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31989  CDS  NC_009045  408717  409244  +  528  predicted protein  XP_001384739  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31991  CDS  NC_009045  412502  413344  +  843  3,4-dihydroxy-5-hexaprenylbenzoate methyltransferase  XP_001384740  normal  0.751734  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31994  CDS  NC_009045  417244  418659  +  1416  predicted protein  XP_001384742  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32001  CDS  NC_009045  439395  441869  +  2475  hypothetical protein  XP_001384748  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32006  CDS  NC_009045  448715  449818  -  1104  WD domain protein  XP_001385098  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32017  CDS  NC_009045  479427  480281  -  855  Mitochondrial carnitine carrier  XP_001385105  normal  0.0367083  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32024  CDS  NC_009045  501244  504423  -  3180  highly conserved hypothetical protein Predicted RNA-binding  XP_001385110  normal  0.873906  normal  0.425602  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32025  CDS  NC_009045  504939  505919  +  981  putative histone deacetylase-like protein  XP_001384758  normal  0.822239  normal  0.176883  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32027  CDS  NC_009045  508100  508693  -  594  predicted protein  XP_001385112  normal  1  normal  0.0981795  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32028  CDS  NC_009045  509532  509993  +  462  predicted protein  XP_001384759  normal  0.310329  normal  0.0938629  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32035  CDS  NC_009045  522726  523475  -  750  hypothetical protein  XP_001385116  normal  0.0211397  normal  0.429741  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32045  CDS  NC_009045  548046  549098  -  1053  predicted protein  XP_001385118  normal  0.621842  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32048  CDS  NC_009045  556192  557304  +  1113  Dihydroorotase  XP_001384770  normal  0.898174  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32054  CDS  NC_009045  569801  570920  +  1120  predicted protein  XP_001384773  normal  0.685578  normal  0.890765  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32059  CDS  NC_009045  583529  583915  +  387  predicted protein  XP_001384776  normal  0.0687711  normal  0.0606081  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32069  CDS  NC_009045  609304  611148  +  1845  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  XP_001384784  normal  1  normal  0.28283  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32075  CDS  NC_009045  624197  626905  -  2709  predicted protein  XP_001385127  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32081  CDS  NC_009045  638241  639398  +  1158  predicted protein  XP_001384791  normal  0.555096  normal  0.0738823  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32082  CDS  NC_009045  639479  640522  -  1044  predicted protein  XP_001385129  normal  0.249288  normal  0.130559  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32083  CDS  NC_009045  640696  643194  +  2499  AAA ATPase  XP_001384792  normal  1  normal  0.190339  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32085  CDS  NC_009045  646334  646810  -  477  predicted protein  XP_001385130  normal  1  normal  0.208592  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32086  CDS  NC_009045  648587  652652  +  4066  predicted protein  XP_001384793  normal  1  normal  0.0401498  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32112  CDS  NC_009045  708002  708535  -  534  predicted protein  XP_001385144  normal  0.587542  normal  0.339031  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32113  CDS  NC_009045  709379  710551  -  1173  predicted protein  XP_001385145  normal  1  normal  0.384882  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32114  CDS  NC_009045  711120  711725  +  606  predicted protein  XP_001384803  normal  0.223556  normal  0.54599  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32115  CDS  NC_009045  713581  715227  +  1647  predicted protein  XP_001384804  normal  0.027619  normal  0.674411  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32120  CDS  NC_009045  725973  727508  -  1536  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  XP_001385149  normal  0.506951  normal  0.0756506  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32122  CDS  NC_009045  731411  732028  -  618  predicted protein  XP_001385151  normal  0.0871319  normal  0.0658183  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32124  CDS  NC_009045  734452  735725  +  1274  predicted protein  XP_001384807  normal  0.099626  normal  0.0197604  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32127  CDS  NC_009045  739442  746536  +  7095  cell cycle checkpoint protein  XP_001384809  normal  1  decreased coverage  0.00191937  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32134  CDS  NC_009045  771184  772911  +  1728  predicted protein  XP_001384811  normal  0.0739683  normal  0.893568  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32142  CDS  NC_009045  792958  793707  -  750  predicted protein  XP_001385161  normal  0.552303  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32146  CDS  NC_009045  802922  803818  +  897  aldolase  XP_001384816  normal  1  normal  0.943174  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32150  CDS  NC_009045  808068  808559  +  492  Set1C component SDC1 (Suppressor of CDC25 protein 1)  XP_001384818  normal  0.212987  normal  0.16474  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32155  CDS  NC_009045  818472  819107  +  636  predicted protein  XP_001384823  hitchhiker  0.00298421  normal  0.251125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32156  CDS  NC_009045  819684  820166  +  483  predicted protein  XP_001384824  normal  0.0990853  normal  0.265133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32162  CDS  NC_009045  830329  831207  +  879  predicted protein  XP_001384828  normal  1  normal  0.520141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32169  CDS  NC_009045  850294  853455  +  3162  predicted protein  XP_001384830  normal  0.390072  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32179  CDS  NC_009045  874532  875390  +  859  predicted protein  XP_001384836  normal  1  normal  0.036369  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32180  CDS  NC_009045  875498  877162  -  1665  general amino acid permease  XP_001385176  normal  0.279338  normal  0.0497012  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32181  CDS  NC_009045  877677  878504  -  828  predicted protein  XP_001385177  normal  1  normal  0.0219438  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32185  CDS  NC_009045  888395  889192  +  798  predicted protein  XP_001384838  normal  0.431259  normal  0.818237  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32194  CDS  NC_009045  912203  914275  -  2073  predicted protein  XP_001385185  normal  0.707923  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32199  CDS  NC_009045  925298  928618  +  3321  predicted protein  XP_001384845  normal  0.0441712  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32201  CDS  NC_009045  931295  933544  +  2250  predicted protein  XP_001384846  normal  0.214118  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32202  CDS  NC_009045  934992  936659  +  1668  predicted protein  XP_001384847  normal  0.0105358  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32205  CDS  NC_009045  941185  942057  +  873  hypothetical protein  XP_001384850  normal  0.631885  normal  0.749696  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32210  CDS  NC_009045  952463  953518  +  1056  phospholipid scramblase 1  XP_001384852  normal  1  normal  0.0648042  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32212  CDS  NC_009045  955304  956023  +  720  predicted protein  XP_001384853  normal  1  normal  0.0297098  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32213  CDS  NC_009045  957577  958509  +  933  predicted protein  XP_001384854  normal  1  normal  0.0281124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32216  CDS  NC_009045  961258  963015  -  1758  predicted protein  XP_001385194  normal  0.668968  normal  0.0292274  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32218  CDS  NC_009045  966002  966490  -  489  predicted protein  XP_001385196  normal  0.495303  normal  0.150728  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32223  CDS  NC_009045  977632  978636  -  1005  predicted protein  XP_001385198  normal  1  normal  0.398719  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32224  CDS  NC_009045  978911  979822  +  912  predicted protein  XP_001384858  normal  0.706321  normal  0.413427  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32230  CDS  NC_009045  998997  1000353  +  1357  predicted protein  XP_001384861  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_32232  CDS  NC_009045  1002366  1003217  -  852  component of a pre-mRNA polyadenylation factor  XP_001385203  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>