690 genes were found for organism Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PICST_1171  CDS  NC_009043  1272892  1275552  +  2661  predicted protein  XP_001383529  normal  0.0269052  normal  0.0478294  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13204  CDS  NC_009043  1689653  1690213  +  561  predicted protein  XP_001383610  normal  0.318772  normal  0.517646  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13887  CDS  NC_009043  385567  385857  +  291  predicted protein  XP_001383351  normal  1  normal  0.0943829  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_14509  CDS  NC_009043  469963  473379  -  3417  predicted protein  XP_001383724  normal  1  normal  0.644497  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_15404  CDS  NC_009043  970630  972252  +  1623  pyruvate decarboxylase regulator (PDC2)  XP_001383473  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16323  CDS  NC_009043  1024255  1026132  +  1878  Heat shock transcription factor  XP_001383484  normal  0.173191  normal  0.0871257  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16361  CDS  NC_009043  468409  469707  -  1299  predicted protein  XP_001383723  normal  0.898174  normal  0.978716  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16362  CDS  NC_009043  449626  451386  -  1761  Platinum sensitivity protein  XP_001383718  normal  0.792331  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_1703  CDS  NC_009043  1802006  1804021  +  2016  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  XP_001383630  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17338  CDS  NC_009043  1617197  1618621  -  1425  predicted protein  XP_001383932  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17706  CDS  NC_009043  53621  54757  +  1137  positive regulator of meiosis, MAPK related ser/thr protein kinase  XP_001383288  normal  1  normal  0.460781  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_18155  CDS  NC_009043  351585  352889  -  1305  predicted protein  XP_001383696  normal  0.969306  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_191  CDS  NC_009043  296834  300922  +  4089  Sterol 3-beta-glucosyltransferase (Autophagy-related protein 26) (UDP-glycosyltransferase 51)  XP_001383338  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19381  CDS  NC_009043  1216635  1217801  -  1167  predicted protein  XP_001383862  normal  0.797995  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19605  CDS  NC_009043  560565  561689  +  1125  predicted protein  XP_001383385  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19764  CDS  NC_009043  949483  950148  -  666  predicted protein  XP_001383811  normal  0.296451  normal  0.782052  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_2329  CDS  NC_009043  820437  822293  +  1857  nucleotide excision repair protein  XP_001383439  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_24771  CDS  NC_009043  1459424  1461247  -  1824  hypothetical protein MRS512-like protein  XP_001383899  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27034  CDS  NC_009043  1490820  1491575  +  756  predicted protein  XP_001383572  normal  0.64186  normal  0.132821  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_2758  CDS  NC_009043  417943  419226  -  1284  Serine/threonine protein kinase  XP_001383711  normal  0.669938  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_2999  CDS  NC_009043  45964  47589  +  1626  predicted protein  XP_001383284  normal  1  normal  0.851124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30434  CDS  NC_009043  49338  50843  -  1506  predicted protein  XP_001383650  normal  1  normal  0.500519  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30440  CDS  NC_009043  60625  61593  +  969  predicted protein  XP_001383292  normal  1  normal  0.395285  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30446  CDS  NC_009043  76216  77760  +  1545  predicted protein  XP_001383296  normal  1  normal  0.474759  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30447  CDS  NC_009043  78220  78873  +  654  predicted protein  XP_001383297  normal  1  normal  0.166327  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30449  CDS  NC_009043  82260  83477  -  1218  predicted protein  XP_001383651  normal  0.903908  normal  0.469416  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30456  CDS  NC_009043  111410  111832  -  423  predicted protein  XP_001383654  normal  1  normal  0.170844  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30458  CDS  NC_009043  114745  115983  -  1239  predicted protein  XP_001383655  normal  0.775066  normal  0.183024  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30460  CDS  NC_009043  118225  121506  -  3282  structural maintenance of chromosomes protein  XP_001383656  normal  1  normal  0.157057  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30461  CDS  NC_009043  121966  122531  +  566  predicted protein  XP_001383303  normal  1  normal  0.431532  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30470  CDS  NC_009043  135600  136088  +  489  predicted protein  XP_001383310  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30471  CDS  NC_009043  137458  138399  +  942  GTP cyclohydrolase II  XP_001383311  normal  0.746726  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30477  CDS  NC_009043  151813  153651  +  1839  predicted protein  XP_001383314  normal  0.0533584  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30480  CDS  NC_009043  161254  161753  -  500  predicted protein  XP_001383662  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30484  CDS  NC_009043  173801  174403  +  603  predicted protein  XP_001383319  normal  0.0430346  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30495  CDS  NC_009043  210344  210907  -  564  predicted protein  XP_001383668  normal  1  normal  0.0621124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30498  CDS  NC_009043  215967  217025  -  1059  nonribosomal protein of the nucleolus and coiled bodies  XP_001383670  normal  1  normal  0.206018  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30500  CDS  NC_009043  219272  220444  -  1173  predicted protein  XP_001383672  normal  1  normal  0.363686  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30503  CDS  NC_009043  227195  227860  +  666  predicted protein  XP_001383327  normal  1  normal  0.222252  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30506  CDS  NC_009043  231362  232264  -  903  predicted protein  XP_001383675  normal  1  normal  0.256246  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30511  CDS  NC_009043  250525  251889  -  1365  predicted protein  XP_001383678  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30513  CDS  NC_009043  255591  256358  +  768  predicted protein  XP_001383330  normal  0.800594  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30516  CDS  NC_009043  260780  262297  +  1518  conserved hypothetical protein  XP_001383332  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30524  CDS  NC_009043  280626  282068  -  1443  predicted protein  XP_001383686  decreased coverage  0.000419629  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30527  CDS  NC_009043  288662  289504  +  843  predicted protein  XP_001383335  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30528  CDS  NC_009043  289711  290760  +  1050  predicted protein  XP_001383336  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30535  CDS  NC_009043  311824  313386  +  1563  SWI5-like zinc finger protein  XP_001383341  normal  0.688222  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30537  CDS  NC_009043  316912  317823  +  912  predicted protein  XP_001383342  normal  0.833687  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30556  CDS  NC_009043  377397  377990  +  594  predicted protein  XP_001383349  normal  0.0863571  normal  0.011318  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30557  CDS  NC_009043  378662  379171  +  510  predicted protein  XP_001383350  normal  1  decreased coverage  0.00983902  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30558  CDS  NC_009043  379292  381100  -  1809  predicted protein  XP_001383701  normal  1  normal  0.0158618  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30564  CDS  NC_009043  392365  392982  -  618  predicted protein  XP_001383705  normal  1  normal  0.272017  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30566  CDS  NC_009043  400949  401524  -  576  predicted protein  XP_001383706  normal  0.457475  normal  0.687293  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30567  CDS  NC_009043  402610  403437  +  828  predicted protein  XP_001383354  normal  0.800594  normal  0.92709  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30568  CDS  NC_009043  403822  404352  +  531  predicted protein  XP_001383355  normal  0.109772  normal  0.869225  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30582  CDS  NC_009043  433101  434699  +  1599  predicted protein  XP_001383361  normal  1  normal  0.640618  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30587  CDS  NC_009043  445403  446509  -  1107  Zn finger-containing GTPase- Activating Protein for ARF  XP_001383716  normal  0.930878  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30591  CDS  NC_009043  453836  454192  +  357  predicted protein  XP_001383365  normal  0.618171  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30592  CDS  NC_009043  454479  454814  -  336  predicted protein  XP_001383720  normal  0.39185  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30611  CDS  NC_009043  506887  507501  +  615  predicted protein  XP_001383370  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30616  CDS  NC_009043  516492  517220  -  729  predicted protein  XP_001383734  normal  0.0141932  normal  0.411701  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30617  CDS  NC_009043  519625  520875  -  1251  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  XP_001383735  normal  1  normal  0.995284  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30629  CDS  NC_009043  548729  550309  -  1581  predicted protein  XP_001383740  normal  0.555507  normal  0.773072  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30636  CDS  NC_009043  565684  567384  +  1701  predicted protein  XP_001383387  normal  0.931484  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30641  CDS  NC_009043  575254  575745  +  492  predicted protein  XP_001383391  normal  0.35993  normal  0.660884  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30643  CDS  NC_009043  578210  579955  -  1746  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  XP_001383743  normal  0.104467  normal  0.893568  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30650  CDS  NC_009043  594225  595286  -  1062  Protein necessary for structural stability of L-A double-stranded RNA-containing particles  XP_001383747  normal  0.0154701  normal  0.395285  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30658  CDS  NC_009043  619123  619977  +  855  DNA-directed DNA polymerase epsilon, subunit C  XP_001383399  normal  0.35532  normal  0.692022  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30659  CDS  NC_009043  620139  623759  -  3621  predicted protein  XP_001383751  normal  0.498733  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30663  CDS  NC_009043  628117  629253  -  1137  predicted protein  XP_001383753  normal  1  normal  0.357019  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30665  CDS  NC_009043  630277  631377  -  1101  predicted protein  XP_001383754  normal  0.522798  normal  0.228547  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30667  CDS  NC_009043  634717  635271  +  555  predicted protein  XP_001383403  normal  0.88289  normal  0.188715  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30672  CDS  NC_009043  645252  647837  -  2586  ATP-binding transporter  XP_001383758  normal  0.104543  normal  0.0203456  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30674  CDS  NC_009043  650884  651963  +  1080  predicted protein  XP_001383406  normal  1  normal  0.0133378  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30676  CDS  NC_009043  654706  656874  -  2169  predicted protein  XP_001383760  normal  0.105769  normal  0.0372054  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30681  CDS  NC_009043  665254  667623  +  2370  predicted protein  XP_001383410  normal  1  normal  0.0209542  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30682  CDS  NC_009043  668510  669529  +  1020  predicted protein  XP_001383411  normal  0.673385  normal  0.0672265  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30683  CDS  NC_009043  669597  671498  -  1902  predicted protein  XP_001383763  normal  0.562242  normal  0.0808418  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30685  CDS  NC_009043  673488  675215  +  1728  allantoin transport  XP_001383412  normal  1  normal  0.22109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30689  CDS  NC_009043  683021  685348  -  2328  predicted protein  XP_001383766  decreased coverage  0.00144758  normal  0.461418  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30690  CDS  NC_009043  685816  690564  +  4749  predicted protein  XP_001383415  normal  0.781261  normal  0.243077  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30692  CDS  NC_009043  695847  698048  +  2202  predicted protein  XP_001383417  normal  0.371781  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30704  CDS  NC_009043  727829  729559  -  1731  predicted protein  XP_001383772  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30705  CDS  NC_009043  732064  733437  +  1374  predicted protein  XP_001383422  normal  1  normal  0.967273  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30707  CDS  NC_009043  736825  737991  -  1167  predicted protein  XP_001383773  normal  0.0439015  normal  0.801143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30713  CDS  NC_009043  752420  754699  -  2280  predicted protein  XP_001383776  normal  0.0712065  normal  0.618003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30714  CDS  NC_009043  756286  757350  +  1065  predicted protein  XP_001383427  hitchhiker  0.00434268  normal  0.747519  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30715  CDS  NC_009043  757666  760452  -  2787  predicted protein  XP_001383777  normal  0.925422  normal  0.424834  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30716  CDS  NC_009043  761096  763185  +  2090  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  XP_001383428  normal  0.0409155  normal  0.593065  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30719  CDS  NC_009043  767354  768889  -  1536  predicted protein  XP_001383780  normal  0.119081  normal  0.810962  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30725  CDS  NC_009043  783096  783548  -  453  predicted protein  XP_001383785  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30726  CDS  NC_009043  783667  784565  -  899  predicted protein  XP_001383786  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30727  CDS  NC_009043  785165  785644  +  480  predicted protein  XP_001383430  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30730  CDS  NC_009043  793552  794625  +  1074  hypothetical protein  XP_001383433  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30734  CDS  NC_009043  805268  806446  -  1179  cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  XP_001383788  normal  0.207324  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30736  CDS  NC_009043  811709  812869  -  1161  predicted protein  XP_001383789  normal  0.227681  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30737  CDS  NC_009043  813087  813647  +  561  predicted protein  XP_001383437  normal  0.19351  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30747  CDS  NC_009043  842572  843288  -  717  predicted protein  XP_001383793  normal  0.0200364  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30748  CDS  NC_009043  843586  843960  +  375  predicted protein  XP_001383443  decreased coverage  0.00321059  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_30756  CDS  NC_009043  863835  865568  -  1734  hypothetical protein  XP_001383797  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>