1046 genes were found for organism Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 11    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PICST_10913  CDS  NC_009042  801233  803161  -  1929  Fungal specific transcription factor  XP_001382926  normal  0.0760081  normal  0.897103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11039  CDS  NC_009042  1460977  1462530  -  1554  general amino acid permease  XP_001383050  normal  1  normal  0.154814  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12788  CDS  NC_009042  1599527  1600318  +  792  predicted protein  XP_001382530  normal  1  normal  0.837038  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12827  CDS  NC_009042  2640309  2641082  +  774  predicted protein  XP_001382739  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12953  CDS  NC_009042  2176483  2177205  -  723  predicted protein  XP_001383180  decreased coverage  0.000550926  normal  0.10545  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13387  CDS  NC_009042  2057570  2058076  -  507  predicted protein  XP_001383160  normal  1  normal  0.618265  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13503  CDS  NC_009042  1378832  1379218  +  387  Rhodanese-related sulfurtransferase  XP_001382487  normal  0.258058  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13665  CDS  NC_009042  537981  538364  +  384  Class 2 transcription repressor NC2, beta subunit (Dr1)  XP_001382339  normal  0.379904  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_15898  CDS  NC_009042  1062829  1064931  -  2103  predicted protein  XP_001382982  normal  0.062814  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16270  CDS  NC_009042  2486946  2488982  +  2037  conserved hypothetical protein  XP_001382705  decreased coverage  0.000103062  normal  0.0590596  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_18667  CDS  NC_009042  566978  568315  +  1338  RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN7  XP_001382346  normal  0.143542  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_20287  CDS  NC_009042  460275  461207  +  933  predicted protein  XP_001382324  unclonable  0.0000000360095  normal  0.0368137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21871  CDS  NC_009042  2558048  2558587  +  540  predicted protein  XP_001382725  normal  0.0734787  normal  0.41286  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21982  CDS  NC_009042  574445  575029  +  585  predicted protein  XP_001382349  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_24789  CDS  NC_009042  1344233  1345738  -  1506  Predicted E3 ubiquitin ligase  XP_001383023  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_25321  CDS  NC_009042  607936  609480  -  1545  predicted protein  XP_001382880  normal  0.394545  normal  0.233867  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27932  CDS  NC_009042  167178  167399  -  222  ATPase stabilizing factor 15 kDa protein  XP_001382794  normal  0.162533  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27939  CDS  NC_009042  585391  585570  +  180  predicted protein  XP_001382350  normal  0.4979  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27980  CDS  NC_009042  2393643  2395271  -  1629  alcohol dehydrogenase  XP_001383210  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29330  CDS  NC_009042  23735  24820  +  1086  oxidoreductase (Bacterial)  XP_001382229  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29331  CDS  NC_009042  25150  25944  +  795  predicted protein  XP_001382230  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29338  CDS  NC_009042  35193  36515  +  1323  predicted protein  XP_001382232  normal  0.196261  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29340  CDS  NC_009042  37778  38379  -  602  predicted protein  XP_001382768  normal  0.588348  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29351  CDS  NC_009042  54820  55865  +  1046  Vesicle coat complex AP-3  XP_001382240  normal  1  normal  0.637046  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29356  CDS  NC_009042  63241  65522  +  2282  Triglyceride lipase-cholesterol esterase  XP_001382242  normal  1  normal  0.215088  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29359  CDS  NC_009042  73696  75078  -  1383  possible Polyadenylate-binding protein (RRM superfamily)  XP_001382775  normal  0.115134  normal  0.0214952  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29369  CDS  NC_009042  96738  97232  +  495  predicted protein  XP_001382250  normal  0.0183419  hitchhiker  0.00530546  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29375  CDS  NC_009042  112509  112892  +  384  predicted protein  XP_001382251  normal  0.744138  normal  0.395144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29380  CDS  NC_009042  124146  125417  +  1272  predicted protein  XP_001382253  unclonable  0.0000000817876  normal  0.405165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29382  CDS  NC_009042  128468  129820  +  1353  predicted protein  XP_001382254  normal  0.0408162  normal  0.272017  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29392  CDS  NC_009042  158959  159648  -  690  coiled-coil membrane protein  XP_001382792  normal  0.130064  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29400  CDS  NC_009042  169767  171416  -  1650  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  XP_001382795  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29408  CDS  NC_009042  185485  186699  -  1215  mitochondrial carrier protein  XP_001382799  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29411  CDS  NC_009042  194000  194587  -  588  predicted protein  XP_001382801  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29419  CDS  NC_009042  212707  213969  -  1263  predicted protein  XP_001382805  normal  1  normal  0.106431  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29434  CDS  NC_009042  252396  253012  +  617  predicted protein  XP_001382283  normal  1  normal  0.628267  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29444  CDS  NC_009042  274723  278130  -  3408  Fungal specific transcription factor  XP_001382818  normal  1  normal  0.746145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29459  CDS  NC_009042  321950  323042  -  1093  predicted protein  XP_001382826  normal  0.238257  normal  0.497082  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29461  CDS  NC_009042  325342  325968  +  627  adenine phosphoribosyltransferase  XP_001382293  normal  0.268301  normal  0.53722  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29464  CDS  NC_009042  328765  330902  +  2138  C2H2 zinc finger protein  XP_001382294  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29465  CDS  NC_009042  331038  332705  -  1668  Thiamine Metabolism  XP_001382829  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29467  CDS  NC_009042  337254  338312  -  1059  predicted protein  XP_001382830  normal  0.188898  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29472  CDS  NC_009042  353249  354775  -  1527  predicted protein  XP_001382831  normal  0.208524  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29473  CDS  NC_009042  355197  356027  -  831  predicted protein  XP_001382832  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29483  CDS  NC_009042  381226  383175  -  1950  predicted protein  XP_001382834  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29486  CDS  NC_009042  387794  388207  +  414  predicted protein  XP_001382309  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29495  CDS  NC_009042  406979  408199  -  1221  predicted protein  XP_001382839  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29498  CDS  NC_009042  411172  413658  +  2487  protein required for mother cell-specific HO expression  XP_001382314  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29516  CDS  NC_009042  451650  452294  -  645  predicted protein  XP_001382849  normal  1  normal  0.130222  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29522  CDS  NC_009042  478194  479615  +  1422  predicted protein  XP_001382327  normal  0.182383  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29524  CDS  NC_009042  484829  487021  +  2193  predicted protein  XP_001382329  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29525  CDS  NC_009042  487416  489737  +  2322  predicted protein  XP_001382330  normal  0.197874  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29528  CDS  NC_009042  493868  495139  -  1272  predicted protein  XP_001382853  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29560  CDS  NC_009042  564213  565094  +  882  predicted protein  XP_001382345  normal  0.820311  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29563  CDS  NC_009042  570211  571698  +  1488  Aldehyde dehydrogenase  XP_001382347  normal  0.161421  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29570  CDS  NC_009042  588077  589405  +  1329  hypothetical protein  XP_001382351  normal  0.797759  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29573  CDS  NC_009042  594209  594877  -  669  predicted protein  XP_001382876  normal  0.566988  normal  0.797019  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29579  CDS  NC_009042  610014  613070  -  3057  predicted protein  XP_001382881  normal  1  normal  0.198917  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29581  CDS  NC_009042  615524  617065  +  1542  predicted protein  XP_001382354  normal  0.506059  normal  0.0902033  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29587  CDS  NC_009042  631618  632403  +  786  predicted protein  XP_001382361  normal  1  normal  0.0263058  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29588  CDS  NC_009042  633139  633789  -  651  predicted protein  XP_001382883  normal  1  hitchhiker  0.00486066  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29591  CDS  NC_009042  641620  642693  -  1074  predicted protein  XP_001382885  normal  0.374721  normal  0.109445  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29596  CDS  NC_009042  653766  654329  +  564  predicted protein  XP_001382365  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29603  CDS  NC_009042  664807  665715  +  909  predicted protein  XP_001382369  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29610  CDS  NC_009042  681155  683047  -  1893  predicted protein  XP_001382895  normal  0.926539  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29618  CDS  NC_009042  700842  701180  +  339  predicted protein  XP_001382374  normal  0.715931  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29620  CDS  NC_009042  709003  709794  -  792  predicted protein  XP_001382900  normal  0.0397636  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29627  CDS  NC_009042  726842  728206  -  1365  PF1 P-type ATPase  XP_001382904  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29635  CDS  NC_009042  746186  747910  -  1725  predicted protein  XP_001382910  normal  1  normal  0.889255  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29639  CDS  NC_009042  755442  757187  +  1746  maltose permease  XP_001382383  normal  1  normal  0.175573  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29640  CDS  NC_009042  757822  758481  -  660  predicted protein  XP_001382913  normal  1  normal  0.0837783  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29641  CDS  NC_009042  759025  759705  +  681  predicted protein  XP_001382384  normal  1  normal  0.143642  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29646  CDS  NC_009042  766101  767994  -  1894  predicted protein  XP_001382917  normal  1  normal  0.0379511  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29648  CDS  NC_009042  771797  774121  +  2325  predicted protein  XP_001382386  normal  1  normal  0.26394  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29649  CDS  NC_009042  774447  776049  +  1603  predicted protein  XP_001382387  normal  1  normal  0.405165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29656  CDS  NC_009042  789401  791065  -  1665  glycosyl phosphatidylinositol (GPI) synthesis  XP_001382923  normal  0.222882  normal  0.851818  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29665  CDS  NC_009042  815021  815958  -  938  predicted protein  XP_001382929  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29666  CDS  NC_009042  816664  817680  -  1017  short-chain alcohol dehydrogenase  XP_001382930  normal  1  normal  0.62197  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29675  CDS  NC_009042  845148  846086  +  939  predicted protein  XP_001382398  normal  1  normal  0.110363  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29677  CDS  NC_009042  848108  849007  +  900  predicted protein  XP_001382399  normal  1  normal  0.0628991  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29686  CDS  NC_009042  872114  873478  -  1365  predicted protein  XP_001382939  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29697  CDS  NC_009042  898383  899285  +  903  predicted protein  XP_001382410  normal  0.121562  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29702  CDS  NC_009042  909282  909947  +  666  predicted protein  XP_001382413  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29703  CDS  NC_009042  911666  912313  +  648  predicted protein  XP_001382414  normal  0.102312  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29704  CDS  NC_009042  914089  914796  +  708  predicted protein  XP_001382415  normal  0.566988  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29712  CDS  NC_009042  937285  940041  -  2757  Putative serine proteinase inhibitor (KU family) with thrombospondin repeats  XP_001382950  normal  0.355589  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29713  CDS  NC_009042  941537  943930  -  2394  predicted protein  XP_001382951  normal  1  normal  0.585457  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29721  CDS  NC_009042  962964  964914  -  1951  predicted protein  XP_001382957  normal  0.0361578  normal  0.688101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29725  CDS  NC_009042  972266  972646  +  381  predicted protein  XP_001382419  normal  1  normal  0.707903  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29727  CDS  NC_009042  976966  978501  -  1536  predicted protein  XP_001382962  normal  0.990942  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29730  CDS  NC_009042  986144  986776  -  633  predicted protein  XP_001382964  normal  0.114015  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29736  CDS  NC_009042  1000679  1004638  -  3960  5-oxoprolinase  XP_001382968  normal  0.434949  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29740  CDS  NC_009042  1022656  1024251  +  1596  allantoate permease  XP_001382424  normal  0.895789  normal  0.954692  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29755  CDS  NC_009042  1058843  1059569  -  727  predicted protein  XP_001382981  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29756  CDS  NC_009042  1060073  1062541  +  2469  predicted protein  XP_001382428  normal  0.500789  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29762  CDS  NC_009042  1080152  1082227  -  2076  hypothetical protein  XP_001382983  normal  0.700207  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29770  CDS  NC_009042  1108636  1110966  -  2331  ubiquitin ligase (cullin) of SCF involved in cell cycle control  XP_001382990  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29773  CDS  NC_009042  1116475  1117824  +  1350  predicted protein  XP_001382435  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29775  CDS  NC_009042  1122328  1122912  -  585  predicted protein  XP_001382993  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_29791  CDS  NC_009042  1176015  1176587  -  573  predicted protein  XP_001383002  normal  0.294319  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 11    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>