3260 genes were found for organism Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Fosmid unclonability p-value
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PanDaTox homologs
Experimental validation
Sala_0001  CDS  NC_008048  173  1534  +  1362  chromosomal replication initiation protein  YP_615060  normal  1  normal  0.115024  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0002  CDS  NC_008048  1682  2353  -  672  glutathione S-transferase-like protein  YP_615061  normal  1  normal  0.0515777  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0003  CDS  NC_008048  2549  3208  -  660  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  YP_615062  normal  1  normal  0.0524165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0004  CDS  NC_008048  3205  4959  -  1755  putative inner membrane protein translocase component YidC  YP_615063  normal  1  normal  0.0662479  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0005  CDS  NC_008048  5006  5218  -  213  hypothetical protein  YP_615064  normal  1  normal  0.0470636  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0006  CDS  NC_008048  5439  6161  -  723  ribonuclease P protein component  YP_615065  normal  1  normal  0.0503027  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0007  CDS  NC_008048  6361  6693  +  333  entericidin EcnAB  YP_615066  normal  1  normal  0.0467379  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0008  CDS  NC_008048  6735  7511  -  777  hydrolase, alpha/beta fold family protein  YP_615067  normal  1  normal  0.0509198  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0009  CDS  NC_008048  7591  8253  -  663  glutathione S-transferase-like protein  YP_615068  normal  0.607663  normal  0.0509198  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0010  CDS  NC_008048  8250  8702  -  453  hypothetical protein  YP_615069  normal  0.278315  normal  0.04733  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0011  CDS  NC_008048  8689  9192  -  504  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  YP_615070  normal  0.448662  normal  0.0489572  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0012  CDS  NC_008048  9228  10031  -  804  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_615071  normal  0.688447  normal  0.0527448  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0013  CDS  NC_008048  10071  10370  -  300  hypothetical protein  YP_615072  normal  0.431415  normal  0.0213778  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0014  CDS  NC_008048  10373  11044  -  672  glutathione S-transferase-like protein  YP_615073  normal  0.198681  normal  0.0539534  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0015  CDS  NC_008048  11093  11815  -  723  hypothetical protein  YP_615074  normal  0.229573  normal  0.0524165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0016  CDS  NC_008048  11849  12523  -  675  glutathione S-transferase-like protein  YP_615075  normal  1  normal  0.0486825  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0017  CDS  NC_008048  12546  13529  -  984  alpha/beta hydrolase fold  YP_615076  normal  1  normal  0.0512561  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0018  CDS  NC_008048  13559  13777  -  219  hypothetical protein  YP_615077  normal  1  normal  0.041485  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0019  CDS  NC_008048  13851  14285  -  435  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_615078  normal  1  normal  0.0454203  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0020  CDS  NC_008048  14357  15097  -  741  TetR family transcriptional regulator  YP_615079  normal  0.390674  normal  0.0209926  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0021  CDS  NC_008048  15206  16714  +  1509  Mg chelatase-related protein  YP_615080  normal  0.253404  normal  0.0270376  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0022  CDS  NC_008048  16724  17023  +  300  hypothetical protein  YP_615081  normal  0.354886  normal  0.0215122  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0023  CDS  NC_008048  17078  18832  +  1755  diguanylate cyclase  YP_615082  normal  1  normal  0.0108472  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0024  CDS  NC_008048  18852  19247  -  396  hypothetical protein  YP_615083  normal  1  normal  0.0202286  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0025  CDS  NC_008048  19249  20457  -  1209  peptidase M23B  YP_615084  normal  1  normal  0.025775  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0026  CDS  NC_008048  20688  22094  +  1407  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  YP_615085  normal  1  normal  0.0270376  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0027  CDS  NC_008048  22212  24476  -  2265  TonB-dependent receptor  YP_615086  normal  0.634145  normal  0.0299657  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0028  CDS  NC_008048  24779  25867  -  1089  PepSY-associated TM helix  YP_615087  normal  0.522005  normal  0.11263  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0029  CDS  NC_008048  25868  28018  -  2151  TonB-dependent receptor  YP_615088  normal  0.241491  normal  0.0713753  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0030  CDS  NC_008048  28222  30534  +  2313  patatin  YP_615089  normal  0.491773  normal  0.0729626  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0031  CDS  NC_008048  30847  31545  -  699  ThiJ/PfpI  YP_615090  normal  1  normal  0.0533722  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0032  CDS  NC_008048  31966  32262  -  297  entericidin EcnAB  YP_615091  normal  1  normal  0.0503027  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0033  CDS  NC_008048  32447  32764  -  318  outer membrane protein  YP_615092  normal  1  normal  0.0545403  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0034  CDS  NC_008048  32993  33979  +  987  ArsR family transcriptional regulator  YP_615093  normal  1  normal  0.0629975  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0035  CDS  NC_008048  33976  34914  +  939  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  YP_615094  normal  1  normal  0.116198  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0036  CDS  NC_008048  34911  35978  +  1068  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  YP_615095  normal  1  normal  0.20807  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0037  CDS  NC_008048  36101  38722  +  2622  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  YP_615096  normal  0.0357424  normal  0.645269  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0038  CDS  NC_008048  38833  39786  +  954  hypothetical protein  YP_615097  normal  0.200907  normal  0.793531  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0039  CDS  NC_008048  39789  40247  -  459  hypothetical protein  YP_615098  normal  0.158376  normal  0.484774  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0040  CDS  NC_008048  40437  40757  -  321  hypothetical protein  YP_615099  normal  0.180106  normal  0.479768  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0041  CDS  NC_008048  40793  41344  -  552  TspO and MBR like proteins  YP_615100  normal  0.195212  normal  0.762036  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0042  CDS  NC_008048  41406  42146  -  741  hemolysin A  YP_615101  normal  0.0545179  normal  0.765072  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0043  CDS  NC_008048  42262  44322  -  2061  thiol:disulfide interchange protein  YP_615102  normal  1  normal  0.391259  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0044  CDS  NC_008048  44414  46099  +  1686  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  YP_615103  normal  1  normal  0.360147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0045  CDS  NC_008048  46087  46947  +  861  pyrroline-5-carboxylate reductase  YP_615104  normal  1  normal  0.318936  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0046  CDS  NC_008048  46964  47527  -  564  MarR family transcriptional regulator  YP_615105  normal  1  normal  0.283785  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0047  CDS  NC_008048  47553  48638  +  1086  branched-chain amino acid aminotransferase  YP_615106  normal  1  normal  0.311118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0048  CDS  NC_008048  48884  50962  +  2079  phage integrase  YP_615107  normal  1  normal  0.404651  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0049  CDS  NC_008048  51177  54644  -  3468  hypothetical protein  YP_615108  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0050  CDS  NC_008048  54644  55894  -  1251  metallophosphoesterase  YP_615109  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0051  CDS  NC_008048  55994  57361  -  1368  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold containing protein  YP_615110  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0052  CDS  NC_008048  57375  57854  -  480  hypothetical protein  YP_615111  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0053  CDS  NC_008048  57838  58296  -  459  hypothetical protein  YP_615112  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0054  CDS  NC_008048  58298  58759  -  462  hypothetical protein  YP_615113  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0055  CDS  NC_008048  58843  62181  -  3339  UvrD/REP helicase  YP_615114  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0056  CDS  NC_008048  62186  62770  -  585  hypothetical protein  YP_615115  normal  0.434807  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0057  CDS  NC_008048  62767  63480  -  714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_615116  normal  0.357881  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0058  CDS  NC_008048  63977  64852  +  876  hypothetical protein  YP_615117  normal  0.20737  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0059  CDS  NC_008048  65272  67644  +  2373  hypothetical protein  YP_615118  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0060  CDS  NC_008048  68024  69100  +  1077  amidohydrolase 2  YP_615119  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0061  CDS  NC_008048  69196  69759  +  564  hypothetical protein  YP_615120  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0062  CDS  NC_008048  69756  70496  +  741  hypothetical protein  YP_615121  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0063  CDS  NC_008048  70663  71181  +  519  hypothetical protein  YP_615122  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0064  CDS  NC_008048  71489  72214  +  726  hypothetical protein  YP_615123  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0065  CDS  NC_008048  72355  72810  +  456  17 kDa surface antigen  YP_615124  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0066  CDS  NC_008048  72897  73181  -  285  hypothetical protein  YP_615125  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0067  CDS  NC_008048  73686  74876  -  1191  putative transposase  YP_615126  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0068  CDS  NC_008048  74882  75790  -  909  phage integrase  YP_615127  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0069  CDS  NC_008048  75977  76849  -  873  hypothetical protein  YP_615128  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0070  CDS  NC_008048  76846  77403  -  558  hypothetical protein  YP_615129  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0071  CDS  NC_008048  77512  78048  +  537  hypothetical protein  YP_615130  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0072  CDS  NC_008048  78229  79272  -  1044  beta-lactamase-like protein  YP_615131  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0073  CDS  NC_008048  79659  79934  -  276  hypothetical protein  YP_615132  normal  0.317144  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0074  CDS  NC_008048  80291  81436  -  1146  thioredoxin-like protein  YP_615133  normal  0.246531  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0075  CDS  NC_008048  81527  82579  -  1053  twin-arginine translocation pathway signal  YP_615134  normal  0.229261  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0076  CDS  NC_008048  82625  83080  -  456  hypothetical protein  YP_615135  normal  0.757291  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0077  CDS  NC_008048  83189  83740  -  552  TetR family transcriptional regulator  YP_615136  normal  0.234691  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0078  CDS  NC_008048  83846  84697  +  852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_615137  normal  0.406068  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0079  CDS  NC_008048  84803  85024  -  222  hypothetical protein  YP_615138  normal  0.669144  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0080  CDS  NC_008048  85075  85491  -  417  OsmC-like protein  YP_615139  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0081  CDS  NC_008048  85527  86873  -  1347  epoxide hydrolase-like protein  YP_615140  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0082  CDS  NC_008048  86908  87717  -  810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_615141  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0083  CDS  NC_008048  87851  88753  -  903  LysR family transcriptional regulator  YP_615142  normal  0.670509  normal  0.78955  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0084  CDS  NC_008048  89025  89618  -  594  TetR family transcriptional regulator  YP_615143  normal  0.382504  normal  0.519853  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0085  CDS  NC_008048  89692  90405  +  714  oxidoreductase  YP_615144  normal  0.689145  normal  0.340405  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0086  CDS  NC_008048  90499  90834  -  336  hypothetical protein  YP_615145  normal  0.421423  normal  0.335863  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0087  CDS  NC_008048  90958  91749  -  792  hypothetical protein  YP_615146  normal  0.255574  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0088  CDS  NC_008048  91752  92687  -  936  hypothetical protein  YP_615147  normal  0.145194  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0089  CDS  NC_008048  93158  93844  +  687  ribose 5-phosphate isomerase  YP_615148  normal  0.0309119  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0090  CDS  NC_008048  94088  94663  +  576  MarR family transcriptional regulator  YP_615149  normal  0.0236682  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0091  CDS  NC_008048  94707  95270  -  564  TetR family transcriptional regulator  YP_615150  normal  0.0611138  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0092  CDS  NC_008048  95423  95848  +  426  hypothetical protein  YP_615151  normal  0.125559  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0093  CDS  NC_008048  95841  96686  +  846  NmrA-like protein  YP_615152  normal  0.409257  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0094  CDS  NC_008048  96726  97007  +  282  hypothetical protein  YP_615153  normal  0.218262  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0095  CDS  NC_008048  97276  98235  +  960  LysR family transcriptional regulator  YP_615154  normal  0.768666  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0096    NC_008048  98380  99364  +  985      normal  0.511395  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0097  CDS  NC_008048  99504  100208  +  705  glutathione S-transferase-like protein  YP_615155  normal  0.303692  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0098  CDS  NC_008048  100205  101173  +  969  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  YP_615156  normal  0.194887  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0099  CDS  NC_008048  101270  101842  +  573  hypothetical protein  YP_615157  normal  0.821307  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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Sala_0100  CDS  NC_008048  101928  102380  +  453  hypothetical protein  YP_615158  normal  1  normal  1  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
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