4772 genes were found for organism Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 48    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
RPB_0001  CDS  NC_007778  676  2094  +  1419  chromosomal replication initiation protein  YP_483624  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0002  CDS  NC_007778  2356  3474  +  1119  DNA polymerase III subunit beta  YP_483625  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0003  CDS  NC_007778  3640  4011  +  372  hypothetical protein  YP_483626  normal  0.747297  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0004  CDS  NC_007778  4098  5234  +  1137  recombination protein F  YP_483627  normal  0.949729  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0005  CDS  NC_007778  5462  7903  +  2442  DNA gyrase subunit B  YP_483628  normal  1  normal  0.974369  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0006  CDS  NC_007778  7925  9004  -  1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_483629  normal  0.906877  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0007  CDS  NC_007778  9197  9706  -  510  AsnC family transcriptional regulator  YP_483630  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0008  CDS  NC_007778  9854  10132  -  279  hypothetical protein  YP_483631  normal  0.791262  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0009  CDS  NC_007778  10273  10476  -  204  hypothetical protein  YP_483632  normal  0.560567  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0010  CDS  NC_007778  10492  10656  -  165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  YP_483633  normal  0.529923  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0011  CDS  NC_007778  10656  12851  -  2196  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_483634  normal  0.399414  normal  0.898775  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0012  CDS  NC_007778  12887  13387  -  501  FixH  YP_483635  normal  0.747297  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0013  CDS  NC_007778  13407  14954  -  1548  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  YP_483636  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0014  CDS  NC_007778  14983  15864  -  882  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  YP_483637  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0015  CDS  NC_007778  15872  16036  -  165  Cbb3-type cytochrome oxidase component  YP_483638  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0016  CDS  NC_007778  16046  16780  -  735  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II  YP_483639  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0017  CDS  NC_007778  16792  18438  -  1647  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  YP_483640  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0018  CDS  NC_007778  18787  19707  -  921  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_483641  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0019  CDS  NC_007778  19785  20522  -  738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_483642  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0020  CDS  NC_007778  20675  21277  -  603  DSBA oxidoreductase  YP_483643  normal  0.901494  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0021  CDS  NC_007778  21526  22194  +  669  glutathione S-transferase-like protein  YP_483644  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0022  CDS  NC_007778  22420  23301  -  882  short chain dehydrogenase  YP_483645  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0023  CDS  NC_007778  23383  23877  -  495  hypothetical protein  YP_483646  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0024  CDS  NC_007778  23874  24752  -  879  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_483647  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0025  CDS  NC_007778  24749  25024  -  276  glutaredoxin GrxC  YP_483648  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0026  CDS  NC_007778  25063  25827  -  765  phosphoribosyltransferase  YP_483649  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0027  CDS  NC_007778  25947  26294  +  348  hypothetical protein  YP_483650  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0028  CDS  NC_007778  26356  27189  +  834  hypothetical protein  YP_483651  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0029  CDS  NC_007778  27426  27839  -  414  NUDIX hydrolase  YP_483652  normal  1  normal  0.999066  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0030  CDS  NC_007778  27958  29199  -  1242  bifunctional ornithine acetyltransferase/N-acetylglutamate synthase protein  YP_483653  normal  1  normal  0.708351  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0031  CDS  NC_007778  29453  29962  -  510  OsmC-like protein  YP_483654  normal  1  normal  0.975846  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0032  CDS  NC_007778  30131  32929  +  2799  PII uridylyl-transferase  YP_483655  normal  0.968292  normal  0.957944  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0033  CDS  NC_007778  33043  33582  +  540  MarR family transcriptional regulator  YP_483656  normal  0.674408  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0034  CDS  NC_007778  33579  34025  +  447  hypothetical protein  YP_483657  normal  0.26926  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0035  CDS  NC_007778  34035  36800  -  2766  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_483658  normal  0.233169  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0036  CDS  NC_007778  36947  37375  -  429  hypothetical protein  YP_483659  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0037  CDS  NC_007778  37459  37827  +  369  hypothetical protein  YP_483660  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0038  CDS  NC_007778  37966  39186  +  1221  extracellular ligand-binding receptor  YP_483661  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0039  CDS  NC_007778  39440  39697  +  258  hypothetical protein  YP_483662  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0040  CDS  NC_007778  39741  39992  -  252  hypothetical protein  YP_483663  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0041  CDS  NC_007778  40187  42394  +  2208  penicillin-binding protein 1A  YP_483664  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0042  CDS  NC_007778  42525  42956  -  432  hypothetical protein  YP_483665  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0043  CDS  NC_007778  43356  43556  +  201  50S ribosomal protein L35  YP_483666  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0044  CDS  NC_007778  43644  44003  +  360  50S ribosomal protein L20  YP_483667  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0045  CDS  NC_007778  44142  45266  +  1125  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_483668  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0046  CDS  NC_007778  45527  46018  +  492  hypothetical protein  YP_483669  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0047  CDS  NC_007778  46160  48568  +  2409  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_483670  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0048  CDS  NC_007778  48751  50181  -  1431  twin-arginine translocation pathway signal  YP_483671  normal  0.708369  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0049  CDS  NC_007778  50507  51430  +  924  hypothetical protein  YP_483672  normal  0.981822  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0050  CDS  NC_007778  51434  53662  -  2229  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_483673  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0051  CDS  NC_007778  54035  54991  +  957  penicillin-insensitive murein endopeptidase  YP_483674  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0052  CDS  NC_007778  55011  55415  -  405  hypothetical protein  YP_483675  normal  0.550193  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0053  CDS  NC_007778  55477  55956  -  480  hypothetical protein  YP_483676  normal  0.468166  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0054  CDS  NC_007778  56021  56614  -  594  hypothetical protein  YP_483677  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0055  CDS  NC_007778  56695  57093  -  399  hypothetical protein  YP_483678  normal  0.516856  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0056  CDS  NC_007778  57528  59321  -  1794  potassium/proton antiporter  YP_483679  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0057  CDS  NC_007778  59695  61008  +  1314  MscS mechanosensitive ion channel  YP_483680  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0058  CDS  NC_007778  61107  61931  +  825  methionine aminopeptidase, type I  YP_483681  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0059  CDS  NC_007778  62130  62684  -  555  two component Fis family transcriptional regulator  YP_483682  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0060  CDS  NC_007778  62851  64173  -  1323  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_483683  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0061  CDS  NC_007778  64282  65091  +  810  ABC transporter related  YP_483684  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0062  CDS  NC_007778  65088  65918  +  831  hypothetical protein  YP_483685  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0063  CDS  NC_007778  66038  67363  +  1326  polyhydroxyalkanoate depolymerase, intracellular  YP_483686  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0064  CDS  NC_007778  67630  68466  +  837  hypothetical protein  YP_483687  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0065  CDS  NC_007778  68769  69206  -  438  translation initiation factor IF-3  YP_483688  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0066  CDS  NC_007778  69327  69650  +  324  hypothetical protein  YP_483689  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0067  CDS  NC_007778  69647  70441  +  795  hypothetical protein  YP_483690  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0068  CDS  NC_007778  70581  71018  -  438  hypothetical protein  YP_483691  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0069  CDS  NC_007778  71018  71785  -  768  hydroxyacylglutathione hydrolase  YP_483692  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0070  CDS  NC_007778  71962  72726  +  765  methyltransferase type 11  YP_483693  normal  1  normal  0.90869  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0071  CDS  NC_007778  72806  73540  -  735  hypothetical protein  YP_483694  normal  0.878621  normal  0.643653  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0072  CDS  NC_007778  74067  74936  -  870  HemK family modification methylase  YP_483695  normal  0.794826  normal  0.684454  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0073  CDS  NC_007778  74942  75721  -  780  hypothetical protein  YP_483696  normal  0.203643  normal  0.4338  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0074  CDS  NC_007778  75693  76202  -  510  hypothetical protein  YP_483697  normal  0.760664  normal  0.265321  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0075  CDS  NC_007778  76273  77358  -  1086  peptide chain release factor 1  YP_483698  normal  0.439429  normal  0.176298  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0076  CDS  NC_007778  77432  79699  -  2268  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  YP_483699  normal  0.48505  normal  0.113243  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0077  CDS  NC_007778  80003  81256  -  1254  aspartate kinase  YP_483700  normal  0.216369  normal  0.0840427  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0078  CDS  NC_007778  81424  81900  +  477  hypothetical protein  YP_483701  normal  1  normal  0.0745922  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0079  CDS  NC_007778  81916  82677  +  762  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  YP_483702  normal  1  normal  0.0762202  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0080  CDS  NC_007778  82852  83667  -  816  hypothetical protein  YP_483703  normal  1  normal  0.141952  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0081  CDS  NC_007778  83751  84722  +  972  DMT family permease  YP_483704  normal  1  normal  0.24055  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0082  CDS  NC_007778  84920  86704  -  1785  gamma-glutamyltransferase  YP_483705  normal  1  normal  0.437082  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0083  CDS  NC_007778  86769  88157  +  1389  major facilitator transporter  YP_483706  normal  0.339646  normal  0.26187  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0084  CDS  NC_007778  88475  90067  -  1593  bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  YP_483707  normal  0.309239  normal  0.165447  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0085  CDS  NC_007778  90170  91924  -  1755  heparinase II/III-like  YP_483708  normal  0.265496  normal  0.158685  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0086  CDS  NC_007778  92238  93590  -  1353  RNA methyltransferase  YP_483709  normal  1  normal  0.247728  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0087  CDS  NC_007778  93756  93977  +  222  hypothetical protein  YP_483710  normal  0.41867  normal  0.216691  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0088  CDS  NC_007778  94073  94651  +  579  SNase-like nuclease  YP_483711  normal  1  normal  0.227871  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0089  CDS  NC_007778  94763  96517  -  1755  alkaline phosphatase  YP_483712  normal  1  normal  0.456079  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0090  CDS  NC_007778  96815  98152  -  1338  argininosuccinate synthase  YP_483713  normal  1  normal  0.698151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0091  CDS  NC_007778  98256  99044  -  789  phosphoesterase, PA-phosphatase related  YP_483714  normal  1  normal  0.412824  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0092  CDS  NC_007778  99087  99578  -  492  hypothetical protein  YP_483715  normal  1  normal  0.921002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0093  CDS  NC_007778  99721  100920  -  1200  hypothetical protein  YP_483716  normal  0.82991  normal  0.435247  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0094  CDS  NC_007778  101152  101751  -  600  hypothetical protein  YP_483717  normal  0.156875  normal  0.385071  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0095  CDS  NC_007778  102027  103001  +  975  alcohol dehydrogenase  YP_483718  normal  1  normal  0.414698  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0096  CDS  NC_007778  103097  105265  -  2169  FAD dependent oxidoreductase  YP_483719  normal  1  normal  0.490674  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0097  CDS  NC_007778  105431  106054  +  624  TetR family transcriptional regulator  YP_483720  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0098  CDS  NC_007778  106070  106444  -  375  hypothetical protein  YP_483721  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0099  CDS  NC_007778  106532  106837  -  306  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  YP_483722  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
RPB_0100  CDS  NC_007778  107004  108446  +  1443  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  YP_483723  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 48    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>