4492 genes were found for organism Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 45    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
RPD_0001  CDS  NC_007958  649  2067  +  1419  chromosomal replication initiation protein  YP_567142  normal  0.206184  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0002  CDS  NC_007958  2329  3447  +  1119  DNA polymerase III subunit beta  YP_567143  normal  0.120269  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0003  CDS  NC_007958  3622  4758  +  1137  recombination protein F  YP_567144  normal  0.552608  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0004  CDS  NC_007958  4985  7426  +  2442  DNA gyrase subunit B  YP_567145  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0005  CDS  NC_007958  7691  8461  -  771  hypothetical protein  YP_567146  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0006  CDS  NC_007958  8475  8738  -  264  hypothetical protein  YP_567147  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0007  CDS  NC_007958  8751  9092  -  342  hypothetical protein  YP_567148  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0008  CDS  NC_007958  9267  10505  -  1239  divergent AAA region  YP_567149  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0009  CDS  NC_007958  10961  11476  +  516  hypothetical protein  YP_567150  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0010  CDS  NC_007958  11481  12173  +  693  hypothetical protein  YP_567151  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0011  CDS  NC_007958  12201  13025  -  825  hypothetical protein  YP_567152  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0012  CDS  NC_007958  13025  15799  -  2775  helicase-like protein  YP_567153  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0013  CDS  NC_007958  15807  18746  -  2940  DNA methylase containing a Zn-ribbon  YP_567154  normal  0.607191  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0014  CDS  NC_007958  18758  19339  -  582  hypothetical protein  YP_567155  normal  0.378202  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0015  CDS  NC_007958  19336  22488  -  3153  hypothetical protein  YP_567156  normal  0.195292  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0016  CDS  NC_007958  22544  22762  -  219  hypothetical protein  YP_567157  normal  0.0509509  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0017  CDS  NC_007958  23030  23581  +  552  hypothetical protein  YP_567158  normal  0.131831  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0018  CDS  NC_007958  23793  24572  +  780  metallophosphoesterase  YP_567159  normal  0.275783  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0019  CDS  NC_007958  24633  25244  +  612  hypothetical protein  YP_567160  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0020  CDS  NC_007958  25241  27334  +  2094  AAA ATPase, central region  YP_567161  normal  0.25118  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0021  CDS  NC_007958  27411  27716  +  306  hypothetical protein  YP_567162  normal  0.604321  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0022  CDS  NC_007958  27805  28395  +  591  hypothetical protein  YP_567163  normal  0.842797  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0023  CDS  NC_007958  28823  29248  +  426  hypothetical protein  YP_567164  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0024  CDS  NC_007958  29308  29997  +  690  hypothetical protein  YP_567165  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0025  CDS  NC_007958  29997  32429  +  2433  integrase catalytic subunit  YP_567166  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0026  CDS  NC_007958  32426  33565  +  1140  hypothetical protein  YP_567167  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0027  CDS  NC_007958  33552  35345  +  1794  hypothetical protein  YP_567168  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0028  CDS  NC_007958  35342  37240  +  1899  hypothetical protein  YP_567169  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0029  CDS  NC_007958  37353  37691  +  339  hypothetical protein  YP_567170  normal  0.901771  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0030  CDS  NC_007958  37697  38431  -  735  hypothetical protein  YP_567171  normal  0.878438  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0031  CDS  NC_007958  38412  38798  -  387  hypothetical protein  YP_567172  normal  0.829328  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0032  CDS  NC_007958  38941  39660  +  720  hypothetical protein  YP_567173  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0033  CDS  NC_007958  39653  40090  +  438  hypothetical protein  YP_567174  normal  0.345056  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0034  CDS  NC_007958  40087  40557  +  471  hypothetical protein  YP_567175  normal  0.184247  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0035  CDS  NC_007958  40554  41921  +  1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  YP_567176  normal  0.292167  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0036  CDS  NC_007958  42301  44961  +  2661  hypothetical protein  YP_567177  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0037  CDS  NC_007958  44958  48305  +  3348  UvrD/REP helicase  YP_567178  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0038  CDS  NC_007958  48319  49446  +  1128  hypothetical protein  YP_567179  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0039  CDS  NC_007958  49431  49802  -  372  hypothetical protein  YP_567180  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0040  CDS  NC_007958  50548  51813  -  1266  thiolase  YP_567181  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0041  CDS  NC_007958  51851  53074  -  1224  cytochrome P450  YP_567182  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0042  CDS  NC_007958  53163  55085  -  1923  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_567183  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0043  CDS  NC_007958  55237  55872  +  636  regulatory protein, TetR  YP_567184  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0044  CDS  NC_007958  56111  56848  -  738  pentapeptide repeat-containing protein  YP_567185  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0045  CDS  NC_007958  57042  57812  -  771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_567186  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0046  CDS  NC_007958  57862  58605  -  744  regulatory protein GntR, HTH  YP_567187  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0047  CDS  NC_007958  58602  60155  -  1554  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_567188  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0048  CDS  NC_007958  60305  61537  -  1233  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  YP_567189  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0049  CDS  NC_007958  61605  63122  -  1518  betaine-aldehyde dehydrogenase  YP_567190  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0050  CDS  NC_007958  63145  63843  -  699  ABC transporter related  YP_567191  normal  0.906419  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0051  CDS  NC_007958  63836  64612  -  777  ABC transporter related  YP_567192  normal  0.454909  normal  0.935977  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0052  CDS  NC_007958  64609  65649  -  1041  inner-membrane translocator  YP_567193  normal  0.460999  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0053  CDS  NC_007958  65655  66530  -  876  inner-membrane translocator  YP_567194  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0054  CDS  NC_007958  66611  67423  -  813  enoyl-CoA hydratase  YP_567195  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0055  CDS  NC_007958  67486  67848  -  363  hypothetical protein  YP_567196  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0056  CDS  NC_007958  68026  69015  +  990  integral membrane protein TerC  YP_567197  normal  1  normal  0.963752  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0057  CDS  NC_007958  69012  69314  +  303  hypothetical protein  YP_567198  normal  1  normal  0.594903  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0058  CDS  NC_007958  69369  69836  +  468  tellurite resistance protein-like  YP_567199  normal  1  normal  0.606644  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0059  CDS  NC_007958  70113  70730  +  618  hypothetical protein  YP_567200  normal  1  normal  0.611189  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0060  CDS  NC_007958  70717  71097  +  381  regulatory protein, ArsR  YP_567201  normal  1  normal  0.384966  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0061  CDS  NC_007958  71131  71868  +  738  undecaprenyl pyrophosphate synthase  YP_567202  normal  1  normal  0.261711  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0062  CDS  NC_007958  71985  73535  +  1551  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  YP_567203  normal  1  normal  0.302719  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0063  CDS  NC_007958  73673  74686  +  1014  hypothetical protein  YP_567204  normal  1  normal  0.171106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0064  CDS  NC_007958  75240  76196  -  957  helix-turn-helix, AraC type  YP_567205  normal  0.585972  normal  0.173321  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0065  CDS  NC_007958  76970  79036  +  2067  chemotaxis sensory transducer  YP_567206  normal  1  normal  0.0714339  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0066  CDS  NC_007958  79164  81395  +  2232  GGDEF domain-containing protein  YP_567207  normal  0.928161  normal  0.0154172  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0067  CDS  NC_007958  82163  83650  -  1488  ATP-binding region, ATPase-like  YP_567208  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0068  CDS  NC_007958  83786  84514  +  729  ribonuclease P protein component  YP_567209  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0069  CDS  NC_007958  84531  86396  +  1866  putative inner membrane protein translocase component YidC  YP_567210  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0070  CDS  NC_007958  86689  87342  +  654  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  YP_567211  normal  1  decreased coverage  0.00462713  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0071  CDS  NC_007958  87339  87707  +  369  hypothetical protein  YP_567212  normal  1  decreased coverage  0.00440778  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0072  CDS  NC_007958  87920  88816  +  897  acetylglutamate kinase  YP_567213  normal  1  decreased coverage  0.00499393  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0073  CDS  NC_007958  88816  89970  +  1155  peptidoglycan binding domain-containing protein  YP_567214  normal  1  decreased coverage  0.00557733  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0074  CDS  NC_007958  89967  90668  +  702  pyrimidine 5-nucleotidase  YP_567215  normal  1  normal  0.0135144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0075  CDS  NC_007958  90762  91607  +  846  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate N-succinyltransferase  YP_567216  normal  1  normal  0.0131794  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0076  CDS  NC_007958  91810  92097  +  288  hypothetical protein  YP_567217  normal  1  normal  0.0115223  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0077  CDS  NC_007958  92115  93281  +  1167  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  YP_567218  normal  1  normal  0.0144823  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0078  CDS  NC_007958  93536  94498  -  963  transposase, IS4  YP_567219  normal  0.512756  normal  0.0332159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0079  CDS  NC_007958  94698  95435  -  738  tRNA pseudouridine synthase A  YP_567220  normal  0.594696  normal  0.0632026  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0080  CDS  NC_007958  95609  96541  -  933  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_567221  normal  0.450016  normal  0.0632026  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0081  CDS  NC_007958  96621  97148  -  528  peptide deformylase  YP_567222  normal  0.364538  normal  0.0628749  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0082  CDS  NC_007958  97298  98515  +  1218  hypothetical protein  YP_567223  normal  0.552116  normal  0.0373517  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0083  CDS  NC_007958  98724  100097  +  1374  major facilitator transporter  YP_567224  normal  1  normal  0.0365182  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0084  CDS  NC_007958  100126  100554  -  429  hypothetical protein  YP_567225  normal  0.441837  normal  0.0126856  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0085  CDS  NC_007958  100574  101179  -  606  recombination protein RecR  YP_567226  normal  0.344272  normal  0.0328355  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0086  CDS  NC_007958  101293  101613  -  321  hypothetical protein  YP_567227  normal  0.643504  normal  0.0317187  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0087  CDS  NC_007958  101648  103522  -  1875  DNA polymerase III subunits gamma and tau  YP_567228  normal  0.818033  normal  0.0455941  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0088  CDS  NC_007958  103996  104481  +  486  histidine triad (HIT) protein  YP_567229  normal  0.348291  normal  0.0668606  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0089  CDS  NC_007958  104486  105418  +  933  NUDIX hydrolase  YP_567230  normal  1  normal  0.0736249  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0090  CDS  NC_007958  105415  106344  +  930  PfkB  YP_567231  normal  1  normal  0.125237  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0091  CDS  NC_007958  106399  107100  -  702  hypothetical protein  YP_567232  normal  1  normal  0.121116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0092  CDS  NC_007958  107176  107604  -  429  hypothetical protein  YP_567233  normal  0.965626  normal  0.113138  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0093  CDS  NC_007958  107613  108380  -  768  hydroxyacylglutathione hydrolase  YP_567234  normal  1  normal  0.117082  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0094  CDS  NC_007958  108557  109321  +  765  methyltransferase type 11  YP_567235  normal  1  normal  0.116481  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0095  CDS  NC_007958  109382  110107  -  726  hypothetical protein  YP_567236  normal  1  normal  0.201224  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0096  CDS  NC_007958  110600  111478  -  879  HemK family modification methylase  YP_567237  normal  1  normal  0.202928  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0097  CDS  NC_007958  111521  112606  -  1086  peptide chain release factor 1  YP_567238  normal  1  normal  0.208503  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0098  CDS  NC_007958  112658  114925  -  2268  PTSINtr with GAF domain, PtsP  YP_567239  normal  0.529028  normal  0.250641  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0099  CDS  NC_007958  115231  116484  -  1254  aspartate kinase  YP_567240  normal  1  normal  0.211168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
RPD_0100  CDS  NC_007958  116843  117604  +  762  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  YP_567241  normal  1  normal  0.294916  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 45    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>