5016 genes were found for organism Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
RPC_0001  CDS  NC_007925  758  2179  +  1422  chromosomal replication initiation protein  YP_529899  normal  1  normal  0.884369  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0002  CDS  NC_007925  2475  3593  +  1119  DNA polymerase III subunit beta  YP_529900  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0003  CDS  NC_007925  3768  4907  +  1140  recombination protein F  YP_529901  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0004  CDS  NC_007925  5106  6350  +  1245  hypothetical protein  YP_529902  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0005  CDS  NC_007925  6602  9043  +  2442  DNA gyrase subunit B  YP_529903  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0006  CDS  NC_007925  9075  9695  -  621  hypothetical protein  YP_529904  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0007  CDS  NC_007925  9960  10469  -  510  AsnC family transcriptional regulator  YP_529905  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0008  CDS  NC_007925  11386  11565  -  180  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  YP_529906  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0009  CDS  NC_007925  11556  13763  -  2208  copper-translocating P-type ATPase  YP_529907  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0010  CDS  NC_007925  13773  14273  -  501  FixH  YP_529908  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0011  CDS  NC_007925  14295  15752  -  1458  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_529909  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0012  CDS  NC_007925  15869  16750  -  882  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  YP_529910  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0013  CDS  NC_007925  16757  16921  -  165  Cbb3-type cytochrome oxidase component  YP_529911  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0014  CDS  NC_007925  16931  17668  -  738  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II  YP_529912  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0015  CDS  NC_007925  17680  19332  -  1653  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  YP_529913  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0016  CDS  NC_007925  19586  20509  -  924  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_529914  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0017  CDS  NC_007925  20585  21322  -  738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_529915  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0018  CDS  NC_007925  21556  22167  -  612  DSBA oxidoreductase  YP_529916  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0019  CDS  NC_007925  22380  23048  +  669  glutathione S-transferase-like  YP_529917  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0020  CDS  NC_007925  23282  24178  -  897  short chain dehydrogenase  YP_529918  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0021  CDS  NC_007925  24297  26057  -  1761  gamma-glutamyltransferase  YP_529919  normal  0.546306  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0022  CDS  NC_007925  26145  27536  +  1392  major facilitator transporter  YP_529920  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0023  CDS  NC_007925  27674  29266  -  1593  bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  YP_529921  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0024  CDS  NC_007925  29426  31204  -  1779  heparinase II/III-like  YP_529922  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0025  CDS  NC_007925  31482  32834  -  1353  Fmu (Sun)  YP_529923  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0026  CDS  NC_007925  33124  33357  +  234  hypothetical protein  YP_529924  normal  0.0588676  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0027  CDS  NC_007925  33376  33642  -  267  addiction module toxin, Txe/YoeB  YP_529925  normal  0.0189649  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0028  CDS  NC_007925  33653  33913  -  261  prevent-host-death protein  YP_529926  normal  0.0227799  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0029  CDS  NC_007925  34034  34624  +  591  nuclease (SNase-like)  YP_529927  normal  0.139234  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0030  CDS  NC_007925  34627  36375  -  1749  alkaline phosphatase  YP_529928  normal  0.152567  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0031  CDS  NC_007925  36651  37988  -  1338  argininosuccinate synthase  YP_529929  normal  0.394017  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0032  CDS  NC_007925  38093  38875  -  783  phosphoesterase, PA-phosphatase related  YP_529930  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0033  CDS  NC_007925  39025  39498  -  474  hypothetical protein  YP_529931  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0034  CDS  NC_007925  39498  40097  -  600  metal dependent phosphohydrolase  YP_529932  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0035  CDS  NC_007925  40102  41301  -  1200  hypothetical protein  YP_529933  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0036  CDS  NC_007925  41502  42131  -  630  hypothetical protein  YP_529934  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0037  CDS  NC_007925  42455  43429  +  975  zinc-binding alcohol dehydrogenase  YP_529935  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0038  CDS  NC_007925  43530  44771  +  1242  amine oxidase  YP_529936  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0039  CDS  NC_007925  44907  45449  +  543  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_529937  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0040  CDS  NC_007925  45530  46075  +  546  inorganic pyrophosphatase  YP_529938  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0041  CDS  NC_007925  46115  47596  +  1482  hypothetical protein  YP_529939  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0042  CDS  NC_007925  47972  49915  -  1944  acetyl-CoA synthetase  YP_529940  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0043  CDS  NC_007925  50514  51212  -  699  hypothetical protein  YP_529941  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0044  CDS  NC_007925  51255  51668  -  414  hypothetical protein  YP_529942  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0045  CDS  NC_007925  51672  52661  -  990  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_529943  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0046  CDS  NC_007925  52957  54102  -  1146  putative DNA-binding/iron metalloprotein/AP endonuclease  YP_529944  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0047  CDS  NC_007925  54230  54976  +  747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  YP_529945  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0048  CDS  NC_007925  55033  56424  +  1392  hypothetical protein  YP_529946  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0049  CDS  NC_007925  56432  58117  +  1686  HemY-like  YP_529947  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0050  CDS  NC_007925  58569  58793  +  225  hypothetical protein  YP_529948  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0051  CDS  NC_007925  59017  60405  +  1389  cytochrome P450  YP_529949  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0052  CDS  NC_007925  60413  61858  +  1446  adenylate/guanylate cyclase  YP_529950  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0053  CDS  NC_007925  61914  62219  -  306  hypothetical protein  YP_529951  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0054  CDS  NC_007925  62585  63097  +  513  hypothetical protein  YP_529952  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0055  CDS  NC_007925  63376  64155  +  780  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_529953  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0056  CDS  NC_007925  64314  65096  +  783  glutamine amidotransferase  YP_529954  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0057  CDS  NC_007925  65569  65859  +  291  protein of unknown function YGGT  YP_529955  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0058  CDS  NC_007925  65902  66225  +  324  hypothetical protein  YP_529956  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0059  CDS  NC_007925  66341  67228  +  888  bifunctional 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/ 5,10-methylene-tetrahydrofolate cyclohydrolase  YP_529957  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0060  CDS  NC_007925  67811  68326  +  516  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  YP_529958  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0061  CDS  NC_007925  68518  70542  +  2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_529959  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0062  CDS  NC_007925  70622  71644  +  1023  hypothetical protein  YP_529960  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0063  CDS  NC_007925  71641  72627  +  987  sulfate adenylyltransferase subunit 2  YP_529961  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0064  CDS  NC_007925  72627  74480  +  1854  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  YP_529962  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0065  CDS  NC_007925  74563  76416  -  1854  OmpA/MotB  YP_529963  normal  0.656472  normal  0.842902  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0066  CDS  NC_007925  76623  76880  -  258  hypothetical protein  YP_529964  normal  0.4502  normal  0.684444  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0067  CDS  NC_007925  76880  77371  -  492  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  YP_529965  normal  0.663335  normal  0.459209  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0068  CDS  NC_007925  77632  78414  -  783  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  YP_529966  normal  0.450062  normal  0.500614  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0069  CDS  NC_007925  78418  78957  -  540  hypothetical protein  YP_529967  normal  0.676557  normal  0.722398  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0070  CDS  NC_007925  78963  80786  -  1824  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  YP_529968  normal  1  normal  0.563767  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0071  CDS  NC_007925  80790  81212  -  423  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  YP_529969  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0072  CDS  NC_007925  81209  81607  -  399  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  YP_529970  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0073  CDS  NC_007925  81984  82973  +  990  cation diffusion facilitator family transporter  YP_529971  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0074  CDS  NC_007925  83053  84252  +  1200  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  YP_529972  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0075  CDS  NC_007925  84336  84773  -  438  hypothetical protein  YP_529973  normal  0.298872  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0076  CDS  NC_007925  84752  85234  -  483  flavodoxin FldA  YP_529974  normal  0.326568  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0077  CDS  NC_007925  86477  86869  -  393  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  YP_529975  normal  0.292967  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0078  CDS  NC_007925  86951  87991  -  1041  hypothetical protein  YP_529976  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0079  CDS  NC_007925  88026  90491  -  2466  hypothetical protein  YP_529977  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0080  CDS  NC_007925  90488  91141  -  654  ABC transporter related  YP_529978  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0081  CDS  NC_007925  91347  92603  +  1257  hypothetical protein  YP_529979  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0082  CDS  NC_007925  92978  93220  +  243  hypothetical protein  YP_529980  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0083  CDS  NC_007925  93491  93958  -  468  hypothetical protein  YP_529981  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0084  CDS  NC_007925  94303  96318  -  2016  TonB-dependent receptor, plug  YP_529982  normal  0.380129  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0085  CDS  NC_007925  96784  97833  +  1050  transport system permease protein  YP_529983  normal  0.813583  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0086  CDS  NC_007925  97830  98612  +  783  ABC transporter related  YP_529984  normal  0.363839  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0087  CDS  NC_007925  98624  99442  +  819  periplasmic binding protein  YP_529985  normal  0.419639  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0088  CDS  NC_007925  99734  100405  +  672  hypothetical protein  YP_529986  normal  0.498901  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0089  CDS  NC_007925  100508  101728  +  1221  major facilitator transporter  YP_529987  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0090  CDS  NC_007925  101910  102044  -  135  hypothetical protein  YP_529988  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0091  CDS  NC_007925  102041  103057  -  1017  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  YP_529989  normal  0.243968  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0092  CDS  NC_007925  103057  104466  -  1410  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  YP_529990  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0093  CDS  NC_007925  105246  105857  -  612  RNA polymerase sigma factor  YP_529991  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0094  CDS  NC_007925  106054  106794  -  741  two component transcriptional regulator  YP_529992  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0095  CDS  NC_007925  106791  108539  -  1749  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  YP_529993  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0096  CDS  NC_007925  108509  110587  -  2079  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_529994  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0097  CDS  NC_007925  110786  112090  +  1305  extracellular solute-binding protein  YP_529995  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0098  CDS  NC_007925  112119  113036  -  918  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  YP_529996  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0099  CDS  NC_007925  113163  114008  -  846  carboxylesterase  YP_529997  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_0100  CDS  NC_007925  114221  114790  -  570  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  YP_529998  normal  1  normal  1  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>