5559 genes were found for organism Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 56    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Avi_0001  CDS  NC_011989  203  1024  +  822  hypothetical protein  YP_002547973  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0002  CDS  NC_011989  1056  1655  +  600  septum formation inhibitor protein  YP_002547974  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0004  CDS  NC_011989  1648  2508  +  861  shikimate 5-dehydrogenase  YP_002547975  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0005  CDS  NC_011989  2505  3092  +  588  dephospho-CoA kinase  YP_002547976  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0006  CDS  NC_011989  3187  3897  +  711  DNA polymerase III subunit epsilon  YP_002547977  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0007  CDS  NC_011989  3977  4438  -  462  preprotein translocase subunit SecB  YP_002547978  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0008  CDS  NC_011989  4528  5061  -  534  hypothetical protein  YP_002547979  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0009  CDS  NC_011989  5183  5881  +  699  Membrane associated transporter protein  YP_002547980  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0010  CDS  NC_011989  5878  7023  +  1146  membrane-bound lytic murein transglycosylase  YP_002547981  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0011  CDS  NC_011989  7062  7601  +  540  DNA repair protein  YP_002547982  normal  0.27196  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0012  CDS  NC_011989  7598  7993  +  396  transcriptional regulator  YP_002547983  normal  0.388282  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0013  CDS  NC_011989  8119  10554  +  2436  DNA gyrase subunit B  YP_002547984  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0014  CDS  NC_011989  10715  11311  -  597  nitroreductase family protein  YP_002547985  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0016  CDS  NC_011989  11732  13027  +  1296  intracellular PHB depolymerase  YP_002547986  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0017  CDS  NC_011989  13165  13611  +  447  hypothetical protein  YP_002547987  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0018  CDS  NC_011989  13722  14486  +  765  hypothetical protein  YP_002547988  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0019  CDS  NC_011989  14528  15202  +  675  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  YP_002547989  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0020  CDS  NC_011989  15199  16419  +  1221  tryptophan synthase subunit beta  YP_002547990  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0021  CDS  NC_011989  16421  17260  +  840  tryptophan synthase subunit alpha  YP_002547991  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0022  CDS  NC_011989  17395  18315  +  921  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  YP_002547992  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0024  CDS  NC_011989  18355  19767  +  1413  folylpolyglutamate synthase  YP_002547993  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0025  CDS  NC_011989  20263  20913  +  651  hypothetical protein  YP_002547994  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0027  CDS  NC_011989  21148  22152  +  1005  hypothetical protein  YP_002547995  normal  0.715875  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0028  CDS  NC_011989  22379  22699  -  321  thioredoxin  YP_002547996  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0030  CDS  NC_011989  22899  23855  -  957  hypothetical protein  YP_002547997  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0031  CDS  NC_011989  24029  25336  -  1308  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  YP_002547998  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0032  CDS  NC_011989  25374  25934  -  561  ATP-dependent protease peptidase subunit  YP_002547999  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0033  CDS  NC_011989  26129  26725  +  597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  YP_002548000  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0035  CDS  NC_011989  26753  27403  +  651  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH  YP_002548001  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0036  CDS  NC_011989  27428  28162  +  735  1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5- phosphoribosylamino)methylideneamino] imidazole-4-carboxamide isomerase  YP_002548002  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0037  CDS  NC_011989  28176  28970  +  795  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  YP_002548003  normal  0.981941  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0038  CDS  NC_011989  28983  29297  +  315  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  YP_002548004  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0039  CDS  NC_011989  29303  30295  +  993  pantothenate kinase  YP_002548005  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0040  CDS  NC_011989  30362  30940  +  579  hypothetical protein  YP_002548006  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0041  CDS  NC_011989  30977  31411  -  435  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  YP_002548007  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0042  CDS  NC_011989  31588  33198  -  1611  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_002548008  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0044  CDS  NC_011989  33554  34276  +  723  two component response regulator  YP_002548009  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0045  CDS  NC_011989  34514  36286  +  1773  two-component sensor histidine kinase protein  YP_002548010  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0046  CDS  NC_011989  36283  36741  +  459  hypothetical protein  YP_002548011  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0047  CDS  NC_011989  37102  37503  +  402  PTS system IIA component  YP_002548012  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0048  CDS  NC_011989  37518  37793  +  276  phosphocarrier protein HPr  YP_002548013  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0049  CDS  NC_011989  37838  39367  +  1530  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  YP_002548014  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0050  CDS  NC_011989  39579  42314  +  2736  two component sensor kinase  YP_002548015  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0051  CDS  NC_011989  42311  43819  +  1509  hypothetical protein  YP_002548016  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0053  CDS  NC_011989  43973  44686  +  714  nucleotidyltransferase protein  YP_002548017  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0055  CDS  NC_011989  44683  47871  +  3189  double-strand break repair protein AddB  YP_002548018  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0056  CDS  NC_011989  47864  51412  +  3549  ATP-dependant DNA helicase  YP_002548019  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0057  CDS  NC_011989  51760  53940  +  2181  malate synthase G  YP_002548020  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0061  CDS  NC_011989  54130  54828  -  699  hypothetical protein  YP_002548021  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0062  CDS  NC_011989  54930  55490  +  561  hypothetical protein  YP_002548022  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0063  CDS  NC_011989  55510  56085  -  576  two component response regulator  YP_002548023  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0064  CDS  NC_011989  56244  57548  -  1305  two component sensor kinase  YP_002548024  normal  0.0839262  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0067  CDS  NC_011989  57585  60047  -  2463  DEAD box-like helicase  YP_002548025  normal  0.0419076  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0068  CDS  NC_011989  60130  61086  -  957  ornithine cyclodeaminase  YP_002548026  normal  0.783844  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0069    NC_011989  68122  68226  +  105      normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0070  CDS  NC_011989  68353  69735  -  1383  MFS permease  YP_002548027  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0071  CDS  NC_011989  70056  71003  -  948  dihydrodipicolinate synthase  YP_002548028  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0072  CDS  NC_011989  71167  72198  +  1032  transcriptional regulator LacI family  YP_002548029  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0073  CDS  NC_011989  72244  73248  -  1005  hypothetical protein  YP_002548030  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0074  CDS  NC_011989  73476  74465  -  990  myo-inositol 2-dehydrogenase  YP_002548031  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0075  CDS  NC_011989  74678  75511  +  834  transcriptional regulator RpiR family  YP_002548032  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0076  CDS  NC_011989  75639  77543  +  1905  myo-inositol catabolism IolC protein  YP_002548033  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0077  CDS  NC_011989  77675  79498  +  1824  acetolactate synthase  YP_002548034  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0078  CDS  NC_011989  79500  80402  +  903  hypothetical protein  YP_002548035  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0079  CDS  NC_011989  80511  80717  +  207  hypothetical protein  YP_002548036  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0080  CDS  NC_011989  80714  81532  +  819  hypothetical protein  YP_002548037  normal  0.76914  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0081  CDS  NC_011989  81529  82008  -  480  hypothetical protein  YP_002548038  normal  0.711911  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0082  CDS  NC_011989  82022  82423  -  402  hypothetical protein  YP_002548039  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0083  CDS  NC_011989  82554  83252  +  699  C factor  YP_002548040  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0084  CDS  NC_011989  83320  83874  +  555  hypothetical protein  YP_002548041  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0085  CDS  NC_011989  83874  84644  +  771  gluconate 5-dehydrogenase  YP_002548042  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0086  CDS  NC_011989  84714  85928  -  1215  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  YP_002548043  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0087  CDS  NC_011989  85925  86728  -  804  hypothetical protein  YP_002548044  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0088  CDS  NC_011989  86725  88032  -  1308  amine oxidase flavin-containing  YP_002548045  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0089  CDS  NC_011989  88139  88897  +  759  RNA polymerase sigma subunit protein  YP_002548046  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0090  CDS  NC_011989  88897  89589  +  693  anti sigma factor protein  YP_002548047  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0091  CDS  NC_011989  89617  90018  +  402  hypothetical protein  YP_002548048  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0092  CDS  NC_011989  90102  90872  +  771  transcriptional regulator DeoR family  YP_002548049  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0094  CDS  NC_011989  90949  92499  +  1551  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_002548050  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0095  CDS  NC_011989  92657  93760  +  1104  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  YP_002548051  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0096  CDS  NC_011989  93764  94858  +  1095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  YP_002548052  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0097  CDS  NC_011989  94855  95742  +  888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  YP_002548053  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0098  CDS  NC_011989  95833  96558  +  726  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  YP_002548054  normal  0.152339  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0099  CDS  NC_011989  96572  96853  +  282  hypothetical protein  YP_002548055  decreased coverage  0.00804392  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0100  CDS  NC_011989  96896  98620  +  1725  hypothetical protein  YP_002548056  normal  0.0356789  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0102  CDS  NC_011989  98774  99331  -  558  cytochrome c  YP_002548057  normal  0.108181  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0103  CDS  NC_011989  99408  100238  +  831  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  YP_002548058  normal  0.0796909  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0105  CDS  NC_011989  100306  101103  +  798  prephenate dehydratase  YP_002548059  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0107  CDS  NC_011989  101152  103122  -  1971  beta-glucosidase protein  YP_002548060  normal  0.0734039  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0108  CDS  NC_011989  103412  104377  -  966  mutT/nudix family protein  YP_002548061  normal  0.579129  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0109  CDS  NC_011989  104374  104817  -  444  hypothetical protein  YP_002548062  normal  0.648306  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0110  CDS  NC_011989  105085  106980  +  1896  DNA polymerase III subunits gamma and tau  YP_002548063  normal  0.801093  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0111  CDS  NC_011989  107080  107403  +  324  hypothetical protein  YP_002548064  normal  0.452353  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0112  CDS  NC_011989  107440  107763  -  324  hypothetical protein  YP_002548065  normal  0.647233  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0113  CDS  NC_011989  107934  108122  +  189  hypothetical protein  YP_002548066  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0114  CDS  NC_011989  108172  108696  -  525  acetyltransferase protein  YP_002548067  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0115  CDS  NC_011989  108713  109297  -  585  transcriptional regulatory protein  YP_002548068  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0116  CDS  NC_011989  109515  110468  +  954  cell division protein FtsZ  YP_002548069  normal  0.138095  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0118  CDS  NC_011989  110502  112379  +  1878  GTP-binding protein LepA  YP_002548070  normal  0.0702827  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0120  CDS  NC_011989  112465  113091  -  627  ribonuclease D  YP_002548071  normal  0.818192  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 56    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>