42 genes were found for organism Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Cla_a001  CDS  NC_012040  1  1317  +  1317  nickase/relaxase  YP_002576125  normal  0.0555425  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a002  CDS  NC_012040  1391  7195  -  5805  DNA methylase/helicase  YP_002576126  normal  0.0978124  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a003  CDS  NC_012040  7383  7985  -  603  site-specific recombinase/resolvase  YP_002576127  decreased coverage  0.0000421132  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a004  CDS  NC_012040  8107  8331  -  225  hypothetical protein  YP_002576128  decreased coverage  0.000609171  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a005  CDS  NC_012040  8336  9004  -  669  plasmid partitioning protein  YP_002576129  hitchhiker  0.00164324  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a006  CDS  NC_012040  9272  10090  -  819  hypothetical protein  YP_002576130  normal  0.136312  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a007  CDS  NC_012040  10559  10894  -  336  hypothetical protein  YP_002576131  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a008  CDS  NC_012040  11349  11609  +  261  attachment mediating protein TraC/VirB2  YP_002576132  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a009  CDS  NC_012040  11616  14390  +  2775  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  YP_002576133  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a010  CDS  NC_012040  14387  15379  +  993  conjugal transfer protein VirB5  YP_002576134  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a011  CDS  NC_012040  15393  15977  +  585  putative antirepressor, Rha family  YP_002576135  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a012  CDS  NC_012040  16476  16769  +  294  hypothetical protein  YP_002576136  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a013  CDS  NC_012040  16766  17317  +  552  putative antirepressor, BRO family  YP_002576137  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a014  CDS  NC_012040  17607  18617  +  1011  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  YP_002576138  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a015  CDS  NC_012040  18607  19068  +  462  hypothetical protein  YP_002576139  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a016  CDS  NC_012040  19359  19967  +  609  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  YP_002576140  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a017  CDS  NC_012040  19964  20899  +  936  conjugal transfer protein TraK/VirB9  YP_002576141  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a018  CDS  NC_012040  20896  22071  +  1176  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  YP_002576142  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a019  CDS  NC_012040  22071  23072  +  1002  conjugal transfer protein VirB11  YP_002576143  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a020  CDS  NC_012040  23062  23637  +  576  hypothetical protein  YP_002576144  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a021  CDS  NC_012040  23627  25423  +  1797  conjugal transfer protein TraG/VirD4  YP_002576145  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a022  CDS  NC_012040  25407  25844  +  438  conserved hypothetical protein, putative CagT  YP_002576146  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a023  CDS  NC_012040  25965  26642  +  678  TrbM mating pair formation protein-like protein  YP_002576147  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a024  CDS  NC_012040  26635  27504  +  870  hypothetical protein  YP_002576148  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a025  CDS  NC_012040  27588  28256  +  669  hypothetical protein  YP_002576149  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a026  CDS  NC_012040  28310  30340  +  2031  DNA topoisomerase III TraE  YP_002576150  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a027  CDS  NC_012040  30353  30763  +  411  single-stranded DNA binding protein  YP_002576151  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a028  CDS  NC_012040  30763  35142  +  4380  putative adhesin/invasin  YP_002576152  normal  1  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a029  CDS  NC_012040  35238  35627  -  390  hypothetical protein  YP_002576153  normal  0.438388  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a030  CDS  NC_012040  35704  36192  -  489  hypothetical protein  YP_002576154  normal  0.638953  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a031  CDS  NC_012040  36974  37609  +  636  site-specific recombinase/resolvase  YP_002576155  normal  0.0141681  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a032  CDS  NC_012040  37764  38405  +  642  putative DNA primase TraC  YP_002576156  hitchhiker  0.00688242  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a033  CDS  NC_012040  38494  38802  +  309  hypothetical protein  YP_002576157  normal  0.0861038  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a034  CDS  NC_012040  38950  40185  -  1236  DNA primase TraC  YP_002576158  decreased coverage  0.000906567  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a035  CDS  NC_012040  40274  40933  -  660  hypothetical protein  YP_002576159  hitchhiker  0.00112052  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a036  CDS  NC_012040  40992  41405  -  414  PIN domain protein  YP_002576160  hitchhiker  0.00103268  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a037  CDS  NC_012040  41402  42301  -  900  hypothetical protein  YP_002576161  normal  0.0177431  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a038  CDS  NC_012040  42863  43171  +  309  hypothetical protein  YP_002576162  hitchhiker  0.000432056  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a039  CDS  NC_012040  43319  44392  -  1074  DNA primase TraC  YP_002576163  hitchhiker  0.000000018393  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a040  CDS  NC_012040  44411  45121  -  711  hypothetical protein  YP_002576164  decreased coverage  0.0000000292209  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a041  CDS  NC_012040  45193  45465  -  273  hypothetical protein  YP_002576165  decreased coverage  0.00000000121125  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a042  CDS  NC_012040  45672  1  +  531  hypothetical protein  YP_002576124  hitchhiker  0.0000252846  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>