341 genes were found for organism Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bpro_4909  CDS  NC_007949  1226  1774  +  549  hypothetical protein  YP_551683  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4910  CDS  NC_007949  1833  2609  -  777  hypothetical protein  YP_551684  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4911  CDS  NC_007949  3079  3357  +  279  hypothetical protein  YP_551685  normal  0.174307  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4912  CDS  NC_007949  3347  3634  +  288  hypothetical protein  YP_551686  normal  0.381947  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4913  CDS  NC_007949  3719  4123  +  405  hypothetical protein  YP_551687  normal  0.354642  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4914  CDS  NC_007949  4358  9478  +  5121  helicase  YP_551688  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4915  CDS  NC_007949  9839  10534  +  696  LuxR family transcriptional regulator  YP_551689  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4916    NC_007949  10623  11156  -  534      normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4917    NC_007949  11159  11491  -  333      normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4918  CDS  NC_007949  11627  12829  -  1203  hypothetical protein  YP_551690  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4919  CDS  NC_007949  12841  13158  -  318  hypothetical protein  YP_551691  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4920  CDS  NC_007949  13182  14570  -  1389  cytochrome P450  YP_551692  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4921  CDS  NC_007949  14567  15787  -  1221  hypothetical protein  YP_551693  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4922  CDS  NC_007949  15784  17091  -  1308  glycosyl transferase family protein  YP_551694  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4923  CDS  NC_007949  17109  18176  -  1068  capsule polysaccharide biosynthesis  YP_551695  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4924  CDS  NC_007949  18173  19333  -  1161  glycosyl transferase, group 1  YP_551696  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4925  CDS  NC_007949  19595  20824  -  1230  glycosyl transferase, group 1  YP_551697  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4926  CDS  NC_007949  20821  22104  -  1284  Type I secretion outer membrane protein, TolC  YP_551698  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4927  CDS  NC_007949  22142  23191  -  1050  secretion protein HlyD  YP_551699  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4928  CDS  NC_007949  23188  24945  -  1758  Type I secretion system ATPase, PrtD  YP_551700  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4929  CDS  NC_007949  25140  31433  +  6294  hemolysin-type calcium-binding region  YP_551701  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4930  CDS  NC_007949  31491  32330  +  840  hypothetical protein  YP_551702  normal  0.13299  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4931  CDS  NC_007949  33203  34024  +  822  hypothetical protein  YP_551703  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4932  CDS  NC_007949  34017  35894  +  1878  hypothetical protein  YP_551704  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4933  CDS  NC_007949  36091  36354  +  264  TPR repeat-containing protein  YP_551705  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4934  CDS  NC_007949  37235  37663  +  429  hypothetical protein  YP_551706  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4935  CDS  NC_007949  37767  38927  -  1161  hypothetical protein  YP_551707  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4936  CDS  NC_007949  39032  40363  -  1332  glycosyl transferase, group 1  YP_551708  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4937  CDS  NC_007949  40366  42456  -  2091  hypothetical protein  YP_551709  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4938  CDS  NC_007949  42925  44736  -  1812  polysaccharide export protein  YP_551710  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4939  CDS  NC_007949  44740  45903  -  1164  lipopolysaccharide biosynthesis  YP_551711  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4940  CDS  NC_007949  45896  46588  -  693  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  YP_551712  normal  0.687059  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4941  CDS  NC_007949  46594  47397  -  804  hypothetical protein  YP_551713  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4942  CDS  NC_007949  47520  48932  -  1413  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  YP_551714  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4943  CDS  NC_007949  48966  50282  -  1317  capsule polysaccharide biosynthesis  YP_551715  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4944    NC_007949  50376  50768  -  393      normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4945  CDS  NC_007949  50752  51243  -  492  transposase  YP_551716  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4946  CDS  NC_007949  51436  51915  -  480  hypothetical protein  YP_551717  normal  0.771585  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4947  CDS  NC_007949  52188  53528  -  1341  hypothetical protein  YP_551718  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4948  CDS  NC_007949  54163  54795  +  633  hypothetical protein  YP_551719  normal  0.532748  normal  0.968316  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4949  CDS  NC_007949  54770  56020  +  1251  hypothetical protein  YP_551720  normal  0.284652  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4950  CDS  NC_007949  56125  56598  +  474  hypothetical protein  YP_551721  normal  0.11633  normal  0.964253  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4951  CDS  NC_007949  56985  57524  +  540  hypothetical protein  YP_551722  normal  0.0559636  normal  0.997243  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4952  CDS  NC_007949  57521  57793  +  273  hypothetical protein  YP_551723  normal  0.0307871  normal  0.989225  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4953  CDS  NC_007949  58200  58817  +  618  hypothetical protein  YP_551724  normal  0.055704  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4954  CDS  NC_007949  59035  59421  +  387  hypothetical protein  YP_551725  normal  0.0606766  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4955  CDS  NC_007949  59358  59720  -  363  hypothetical protein  YP_551726  normal  0.0299287  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4956  CDS  NC_007949  59833  60126  -  294  hypothetical protein  YP_551727  normal  0.114914  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4957  CDS  NC_007949  60276  60608  -  333  hypothetical protein  YP_551728  normal  0.184613  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4958  CDS  NC_007949  60741  61052  -  312  histone-like DNA-binding protein  YP_551729  normal  0.674818  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4959  CDS  NC_007949  61232  61585  -  354  hypothetical protein  YP_551730  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4960  CDS  NC_007949  61600  62784  -  1185  hypothetical protein  YP_551731  normal  1  normal  0.763146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4961  CDS  NC_007949  62997  63515  -  519  hypothetical protein  YP_551732  normal  0.910632  normal  0.265254  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4962  CDS  NC_007949  64368  65831  +  1464  hypothetical protein  YP_551733  normal  1  normal  0.160649  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4963    NC_007949  66074  66442  -  369      normal  1  normal  0.0787725  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4964  CDS  NC_007949  66450  66941  -  492  transposase  YP_551734  normal  1  normal  0.0783623  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4965  CDS  NC_007949  67068  67898  +  831  hypothetical protein  YP_551735  normal  1  normal  0.0879544  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4966  CDS  NC_007949  67926  68366  +  441  hypothetical protein  YP_551736  normal  1  normal  0.0843129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4967  CDS  NC_007949  68516  69223  +  708  hypothetical protein  YP_551737  normal  0.758138  normal  0.0411566  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4968  CDS  NC_007949  69459  70118  +  660  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  YP_551738  normal  0.134103  normal  0.0409016  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4969  CDS  NC_007949  70102  70377  +  276  hypothetical protein  YP_551739  normal  0.167082  normal  0.0374794  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4970  CDS  NC_007949  70582  71115  +  534  hypothetical protein  YP_551740  normal  0.339538  normal  0.0379158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4971  CDS  NC_007949  71146  72111  +  966  hypothetical protein  YP_551741  normal  0.131647  normal  0.0388171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4972  CDS  NC_007949  72242  72589  +  348  hypothetical protein  YP_551742  normal  0.0748637  normal  0.0343532  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4973  CDS  NC_007949  73122  73463  +  342  hypothetical protein  YP_551743  normal  0.0454297  normal  0.0353854  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4974  CDS  NC_007949  73680  75593  +  1914  hypothetical protein  YP_551744  normal  0.0757129  hitchhiker  0.00813651  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4975  CDS  NC_007949  75925  76257  +  333  hypothetical protein  YP_551745  normal  0.273111  hitchhiker  0.00482072  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4976  CDS  NC_007949  76350  78098  -  1749  hypothetical protein  YP_551746  normal  0.78715  hitchhiker  0.00687482  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4977  CDS  NC_007949  78150  79235  -  1086  hypothetical protein  YP_551747  normal  0.669934  hitchhiker  0.00180549  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4978  CDS  NC_007949  79725  80474  -  750  hypothetical protein  YP_551748  normal  0.886774  hitchhiker  0.00153264  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4979  CDS  NC_007949  80553  81050  -  498  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  YP_551749  normal  1  hitchhiker  0.000257887  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4980  CDS  NC_007949  81150  81392  +  243  hypothetical protein  YP_551750  normal  1  hitchhiker  0.000240546  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4981  CDS  NC_007949  81514  82701  -  1188  hypothetical protein  YP_551751  normal  1  unclonable  0.00000297045  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4982  CDS  NC_007949  82831  83271  +  441  SOS mutagenesis protein UmuD  YP_551752  normal  0.865075  unclonable  0.00000215009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4983  CDS  NC_007949  83282  84580  +  1299  UMUC-like DNA-repair protein  YP_551753  normal  1  unclonable  0.00000315583  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4984  CDS  NC_007949  84769  85563  +  795  hypothetical protein  YP_551754  normal  1  hitchhiker  0.0000362486  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4985  CDS  NC_007949  85765  86187  +  423  hypothetical protein  YP_551755  normal  1  hitchhiker  0.000028714  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4986  CDS  NC_007949  86476  90180  +  3705  hypothetical protein  YP_551756  normal  1  hitchhiker  0.0000850423  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4987  CDS  NC_007949  90167  90841  +  675  hypothetical protein  YP_551757  normal  1  hitchhiker  0.00101659  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4988  CDS  NC_007949  90838  92061  +  1224  hypothetical protein  YP_551758  normal  1  hitchhiker  0.00100842  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4989  CDS  NC_007949  92058  92858  +  801  hypothetical protein  YP_551759  normal  0.481711  hitchhiker  0.000874376  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4990  CDS  NC_007949  92999  93346  -  348  hypothetical protein  YP_551760  normal  0.325163  hitchhiker  0.000751535  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4991  CDS  NC_007949  93559  95028  +  1470  hypothetical protein  YP_551761  normal  0.354735  hitchhiker  0.00100031  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4992  CDS  NC_007949  95184  95624  +  441  hypothetical protein  YP_551762  normal  0.536213  normal  0.0456371  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4993  CDS  NC_007949  95662  96069  +  408  hypothetical protein  YP_551763  normal  0.37273  normal  0.0451267  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4994  CDS  NC_007949  96152  96709  +  558  hypothetical protein  YP_551764  normal  0.467707  normal  0.045377  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4995  CDS  NC_007949  96726  97931  -  1206  hypothetical protein  YP_551765  normal  0.585588  normal  0.0490152  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4996  CDS  NC_007949  98163  98672  -  510  hypothetical protein  YP_551766  normal  0.602071  normal  0.0422432  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4997  CDS  NC_007949  99159  100022  -  864  hypothetical protein  YP_551767  normal  1  normal  0.042724  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4998  CDS  NC_007949  100368  101834  -  1467  hypothetical protein  YP_551768  normal  1  normal  0.0474339  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_4999  CDS  NC_007949  102359  102892  +  534  hypothetical protein  YP_551769  normal  1  normal  0.152694  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5000  CDS  NC_007949  103216  103587  +  372  hypothetical protein  YP_551770  normal  1  normal  0.156358  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5001  CDS  NC_007949  103766  104062  +  297  hypothetical protein  YP_551771  normal  1  normal  0.153427  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5002  CDS  NC_007949  104358  104663  +  306  hypothetical protein  YP_551772  normal  1  normal  0.14638  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5003  CDS  NC_007949  104668  105039  +  372  hypothetical protein  YP_551773  normal  1  normal  0.143816  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5004  CDS  NC_007949  105273  105674  +  402  hypothetical protein  YP_551774  normal  1  normal  0.612103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5005  CDS  NC_007949  105760  106467  +  708  hypothetical protein  YP_551775  normal  1  normal  0.645527  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5006  CDS  NC_007949  106553  107170  +  618  hypothetical protein  YP_551776  normal  1  normal  0.614735  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5007  CDS  NC_007949  107359  107670  +  312  hypothetical protein  YP_551777  normal  1  normal  0.881506  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5008  CDS  NC_007949  107843  108070  +  228  hypothetical protein  YP_551778  normal  1  normal  0.855895  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>