2799 genes were found for organism Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Cpha266_0001  CDS  NC_008639  1  1473  +  1473  chromosomal replication initiation protein  YP_910502  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0002  CDS  NC_008639  1895  3025  +  1131  DNA polymerase III, beta subunit  YP_910503  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0003  CDS  NC_008639  3303  4400  +  1098  DNA replication and repair protein RecF  YP_910504  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0004  CDS  NC_008639  4411  4704  +  294  hypothetical protein  YP_910505  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0005    NC_008639  4906  5004  -  99      normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0006  CDS  NC_008639  5093  6328  +  1236  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  YP_910506  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0007  CDS  NC_008639  6323  6733  -  411  hypothetical protein  YP_910507  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0008  CDS  NC_008639  6781  8352  +  1572  integrase catalytic subunit  YP_910508  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0009  CDS  NC_008639  8358  9194  +  837  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_910509  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0010    NC_008639  9259  9387  -  129      normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0011  CDS  NC_008639  9405  9935  -  531  hypothetical protein  YP_910510  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0012    NC_008639  10031  10336  +  306      normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0013  CDS  NC_008639  10369  11061  -  693  transposase  YP_910511  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0014  CDS  NC_008639  11058  11600  -  543  hypothetical protein  YP_910512  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0015  CDS  NC_008639  11704  12462  +  759  transposase, IS4 family protein  YP_910513  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0016    NC_008639  12481  12588  -  108      normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0017  CDS  NC_008639  12686  14092  +  1407  transposase, IS4 family protein  YP_910514  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0018  CDS  NC_008639  14359  15489  -  1131  transposase  YP_910515  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0019  CDS  NC_008639  16159  17565  +  1407  transposase, IS4 family protein  YP_910516  normal  0.148263  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0020  CDS  NC_008639  17769  18017  +  249  hypothetical protein  YP_910517  normal  0.373254  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0021  CDS  NC_008639  18030  18560  +  531  hypothetical protein  YP_910518  normal  0.193693  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0022    NC_008639  19639  19869  -  231      normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0023    NC_008639  19873  20707  -  835      normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0024  CDS  NC_008639  20845  22209  -  1365  transposase  YP_910519  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0025    NC_008639  22578  22913  -  336      normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0026  CDS  NC_008639  23043  24266  -  1224  beta-lactamase domain-containing protein  YP_910520  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0027  CDS  NC_008639  24550  26940  -  2391  DNA polymerase B region  YP_910521  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0028  CDS  NC_008639  27338  29203  -  1866  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_910522  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0029  CDS  NC_008639  29664  30065  +  402  thiosulfate-binding protein SoxY  YP_910523  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0030  CDS  NC_008639  30107  30403  +  297  sulfur oxidation protein SoxZ  YP_910524  normal  0.938219  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0031  CDS  NC_008639  30479  30859  +  381  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  YP_910525  normal  0.214026  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0032  CDS  NC_008639  30874  32166  +  1293  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  YP_910526  normal  0.067608  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0033  CDS  NC_008639  32395  34254  +  1860  preprotein translocase subunit SecD  YP_910527  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0034  CDS  NC_008639  34277  35212  +  936  preprotein translocase subunit SecF  YP_910528  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0035  CDS  NC_008639  35469  36785  +  1317  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_910529  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0036  CDS  NC_008639  36774  38705  -  1932  DNA gyrase subunit B  YP_910530  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0037  CDS  NC_008639  38787  39170  -  384  hypothetical protein  YP_910531  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0038  CDS  NC_008639  39180  39797  -  618  ribonuclease HII  YP_910532  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0039  CDS  NC_008639  39830  40219  -  390  hypothetical protein  YP_910533  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0040  CDS  NC_008639  40727  42424  +  1698  ribonuclease  YP_910534  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0041  CDS  NC_008639  42441  43304  +  864  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate N-succinyltransferase  YP_910535  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0042  CDS  NC_008639  43349  45067  +  1719  C-terminal processing peptidase-3  YP_910536  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0043  CDS  NC_008639  45059  45778  -  720  hypothetical protein  YP_910537  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0044  CDS  NC_008639  45810  46952  -  1143  geranylgeranyl reductase  YP_910538  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0045  CDS  NC_008639  46993  48462  -  1470  glycyl-tRNA synthetase  YP_910539  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0046  CDS  NC_008639  48703  49020  -  318  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  YP_910540  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0047  CDS  NC_008639  49083  50054  -  972  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  YP_910541  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0048  CDS  NC_008639  50094  50360  -  267  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  YP_910542  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0049  CDS  NC_008639  50376  51764  -  1389  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_910543  normal  0.534709  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0050  CDS  NC_008639  52157  52699  +  543  redoxin domain-containing protein  YP_910544  normal  0.577845  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0051  CDS  NC_008639  52835  54700  +  1866  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_910545  normal  0.564446  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0052  CDS  NC_008639  54772  55500  +  729  hypothetical protein  YP_910546  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0053  CDS  NC_008639  55586  57445  -  1860  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_910547  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0054  CDS  NC_008639  59048  59395  -  348  hypothetical protein  YP_910548  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0055  CDS  NC_008639  59403  60692  -  1290  radical SAM domain-containing protein  YP_910549  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0056  CDS  NC_008639  60768  62186  -  1419  peptidase M12A, astacin  YP_910550  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0057  CDS  NC_008639  62761  65244  +  2484  hypothetical protein  YP_910551  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0058  CDS  NC_008639  65249  66577  +  1329  protein of unknown function DUF900, hydrolase family protein  YP_910552  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0059  CDS  NC_008639  66590  67027  -  438  SH3 type 3 domain-containing protein  YP_910553  normal  0.740277  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0060  CDS  NC_008639  67352  68095  +  744  TetR family transcriptional regulator  YP_910554  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0061  CDS  NC_008639  68108  68572  +  465  putative transmembrane protein  YP_910555  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0062  CDS  NC_008639  68569  69876  +  1308  NADPH-dependent FMN reductase  YP_910556  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0063  CDS  NC_008639  70230  72956  +  2727  hypothetical protein  YP_910557  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0064  CDS  NC_008639  73902  74390  +  489  hypothetical protein  YP_910558  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0065  CDS  NC_008639  74997  75524  +  528  hypothetical protein  YP_910559  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0066  CDS  NC_008639  75533  76708  +  1176  hypothetical protein  YP_910560  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0067  CDS  NC_008639  76875  77174  +  300  hypothetical protein  YP_910561  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0068  CDS  NC_008639  77474  81076  -  3603  hypothetical protein  YP_910562  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0069  CDS  NC_008639  81122  81469  -  348  hypothetical protein  YP_910563  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0070  CDS  NC_008639  81714  81941  +  228  CopG family protein  YP_910564  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0071  CDS  NC_008639  82008  83015  -  1008  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_910565  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0072  CDS  NC_008639  82993  83373  -  381  hypothetical protein  YP_910566  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0073  CDS  NC_008639  83897  85186  +  1290  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  YP_910567  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0074  CDS  NC_008639  85239  85511  -  273  hypothetical protein  YP_910568  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0075  CDS  NC_008639  85805  86278  -  474  hypothetical protein  YP_910569  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0076  CDS  NC_008639  86782  88353  +  1572  integrase catalytic subunit  YP_910570  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0077  CDS  NC_008639  88359  89195  +  837  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_910571  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0078  CDS  NC_008639  89710  91446  -  1737  hypothetical protein  YP_910572  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0079  CDS  NC_008639  91430  94393  -  2964  histidine kinase  YP_910573  normal  0.217254  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0080  CDS  NC_008639  94386  95501  -  1116  DNA-cytosine methyltransferase  YP_910574  normal  0.35686  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0081  CDS  NC_008639  95816  97117  -  1302  hypothetical protein  YP_910575  normal  0.725699  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0082  CDS  NC_008639  97065  97595  -  531  T/G mismatch-specific endonuclease  YP_910576  normal  0.199273  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0083  CDS  NC_008639  97588  98865  -  1278  DNA-cytosine methyltransferase  YP_910577  normal  0.817279  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0084  CDS  NC_008639  99268  100713  -  1446  hypothetical protein  YP_910578  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0085  CDS  NC_008639  100871  101596  -  726  4'-phosphopantetheinyl transferase  YP_910579  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0086  CDS  NC_008639  102059  102997  -  939  hypothetical protein  YP_910580  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0087  CDS  NC_008639  103347  104657  +  1311  major facilitator transporter  YP_910581  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0088  CDS  NC_008639  104732  105310  -  579  hypothetical protein  YP_910582  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0089  CDS  NC_008639  105373  105780  -  408  Gifsy-1 prophage protein  YP_910583  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0090  CDS  NC_008639  106136  106678  +  543  methionine-R-sulfoxide reductase  YP_910584  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0091  CDS  NC_008639  106689  107087  -  399  PilT domain-containing protein  YP_910585  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0092  CDS  NC_008639  107084  107362  -  279  virulence associated protein B  YP_910586  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0093  CDS  NC_008639  107423  108994  -  1572  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_910587  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0094  CDS  NC_008639  109147  110133  -  987  secretion protein HlyD family protein  YP_910588  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0095  CDS  NC_008639  110135  110608  -  474  UspA domain-containing protein  YP_910589  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0096  CDS  NC_008639  110611  111936  -  1326  outer membrane efflux protein  YP_910590  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0097  CDS  NC_008639  112186  114285  +  2100  Fis family transcriptional regulator  YP_910591  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0098  CDS  NC_008639  114296  115678  -  1383  hypothetical protein  YP_910592  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0099  CDS  NC_008639  115662  115976  -  315  hypothetical protein  YP_910593  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0100  CDS  NC_008639  116027  116800  -  774  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  YP_910594  normal  1  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>