7809 genes were found for organism Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 79    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BBta_0001  CDS  NC_009485  571  1998  +  1428  chromosomal replication initiation protein  YP_001236212  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0002  CDS  NC_009485  2294  3412  +  1119  DNA polymerase III subunit beta  YP_001236213  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0003  CDS  NC_009485  3484  3771  +  288  excinuclease ABC subunit C  YP_001236214  normal  0.164369  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0004  CDS  NC_009485  3835  4971  +  1137  recombination protein F  YP_001236215  normal  0.914523  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0005  CDS  NC_009485  5084  5455  +  372  putative transposase  YP_001236216  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0006  CDS  NC_009485  5491  5856  +  366  putative transposase  YP_001236217  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0007  CDS  NC_009485  5840  8083  +  2244  hypothetical protein  YP_001236218  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0008  CDS  NC_009485  8418  10856  +  2439  DNA gyrase subunit B  YP_001236219  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0009  CDS  NC_009485  10897  11634  +  738  hypothetical protein  YP_001236220  normal  0.0877665  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0010  CDS  NC_009485  11652  12029  -  378  hypothetical protein  YP_001236221  normal  0.256065  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0011  CDS  NC_009485  12179  13474  +  1296  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  YP_001236222  normal  0.245445  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0012  CDS  NC_009485  13615  14094  +  480  hypothetical protein  YP_001236223  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0013  CDS  NC_009485  14251  14688  -  438  GNAT family acetyltransferase  YP_001236224  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0014  CDS  NC_009485  15547  16929  +  1383  putative multidrug resistance protein norM  YP_001236225  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0015  CDS  NC_009485  16935  18077  -  1143  hypothetical protein  YP_001236226  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0016  CDS  NC_009485  18198  19568  +  1371  hypothetical protein  YP_001236227  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0017  CDS  NC_009485  19577  20983  -  1407  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  YP_001236228  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0018  CDS  NC_009485  21125  22201  -  1077  AraC family transcriptional regulator  YP_001236229  normal  1  normal  0.710124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0019  CDS  NC_009485  22342  23259  +  918  putative Pirin family protein  YP_001236230  normal  1  normal  0.495948  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0020  CDS  NC_009485  23302  24216  +  915  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  YP_001236231  normal  1  normal  0.397025  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0022  CDS  NC_009485  24573  24938  -  366  hypothetical protein  YP_001236232  normal  0.831793  normal  0.341515  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0023  CDS  NC_009485  25173  25652  +  480  AsnC family transcriptional regulator  YP_001236233  normal  0.28543  normal  0.347248  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0024  CDS  NC_009485  25872  26549  -  678  hypothetical protein  YP_001236234  normal  0.369937  normal  0.267873  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0025  CDS  NC_009485  26671  27330  -  660  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  YP_001236235  normal  0.412211  normal  0.132054  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0026  CDS  NC_009485  27393  28097  -  705  uridine kinase  YP_001236236  normal  0.777234  normal  0.135022  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0027  CDS  NC_009485  28209  29072  -  864  putative aspartate/ornithine carbamoyltransferase family protein  YP_001236237  normal  1  normal  0.0647604  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0028  CDS  NC_009485  29208  30296  +  1089  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  YP_001236238  normal  0.370595  normal  0.102793  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0029  CDS  NC_009485  30314  30943  -  630  putative glutathione S-transferase  YP_001236239  normal  0.0588223  normal  0.184572  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0030  CDS  NC_009485  31212  33416  +  2205  sulfate transporter  YP_001236240  normal  0.127752  normal  0.27039  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0031  CDS  NC_009485  33663  34253  +  591  hypothetical protein  YP_001236241  normal  0.0737399  normal  0.440902  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0032  CDS  NC_009485  34256  35752  -  1497  succinate semialdehyde dehydrogenase  YP_001236242  normal  0.105667  normal  0.227937  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0034  CDS  NC_009485  35921  36241  -  321  hypothetical protein  YP_001236243  normal  0.0738843  normal  0.33554  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0035  CDS  NC_009485  36589  37782  +  1194  putative beta-lactamase  YP_001236244  normal  0.172625  normal  0.414753  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0036  CDS  NC_009485  37936  38937  -  1002  pfkB family carbohydrate kinase  YP_001236245  normal  0.564268  normal  0.540344  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0037  CDS  NC_009485  39008  40564  +  1557  putative virulence factor MviN-like protein  YP_001236246  normal  0.236522  normal  0.272739  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0038  CDS  NC_009485  40614  41666  +  1053  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_001236247  normal  1  normal  0.344371  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0039  CDS  NC_009485  41799  42293  +  495  hypothetical protein  YP_001236248  normal  1  normal  0.389129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0040  CDS  NC_009485  42402  42971  +  570  putative nifU protein  YP_001236249  normal  0.15873  normal  0.567558  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0041  CDS  NC_009485  43038  43355  -  318  hypothetical protein  YP_001236250  normal  0.207552  normal  0.404272  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0042  CDS  NC_009485  43609  44310  +  702  putative glycoprotease family protein  YP_001236251  normal  0.5048  normal  0.440262  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0043  CDS  NC_009485  44307  44789  +  483  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, RimI-like protein  YP_001236252  normal  0.583173  normal  0.569351  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0044  CDS  NC_009485  44833  45285  +  453  ferric uptake regulator family protein  YP_001236253  normal  0.496747  normal  0.591839  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0045  CDS  NC_009485  45295  45993  +  699  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  YP_001236254  normal  0.605496  normal  0.617373  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0046  CDS  NC_009485  46049  47449  +  1401  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  YP_001236255  normal  0.655632  normal  0.954512  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0047  CDS  NC_009485  47454  48491  +  1038  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  YP_001236256  normal  1  normal  0.959569  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0048  CDS  NC_009485  48557  49066  +  510  hypothetical protein  YP_001236257  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0049  CDS  NC_009485  49069  50229  +  1161  transporter  YP_001236258  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0050  CDS  NC_009485  50226  51836  +  1611  apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001236259  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0051  CDS  NC_009485  52070  52486  +  417  XRE family transcriptional regulator  YP_001236260  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0052  CDS  NC_009485  52992  54122  +  1131  M20 family peptidase  YP_001236261  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0053  CDS  NC_009485  54119  54853  +  735  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_001236262  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0054  CDS  NC_009485  55461  56222  +  762  hypothetical protein  YP_001236263  normal  0.454767  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0055  CDS  NC_009485  56237  57850  +  1614  transcription elongation factor NusA  YP_001236264  normal  0.255127  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0056  CDS  NC_009485  57920  58633  +  714  hypothetical protein  YP_001236265  normal  0.955133  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0057  CDS  NC_009485  58710  61475  +  2766  translation initiation factor IF-2  YP_001236266  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0058  CDS  NC_009485  61638  62054  +  417  ribosome-binding factor A  YP_001236267  normal  0.649534  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0059  CDS  NC_009485  62054  63154  +  1101  tRNA pseudouridine synthase B  YP_001236268  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0060  CDS  NC_009485  63157  63426  +  270  30S ribosomal protein S15  YP_001236269  normal  0.624309  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0062  CDS  NC_009485  63789  65951  +  2163  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  YP_001236270  normal  0.733598  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0063  CDS  NC_009485  66159  66632  +  474  hypothetical protein  YP_001236271  normal  0.800795  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0064  CDS  NC_009485  66748  67587  +  840  hypothetical protein  YP_001236272  normal  0.322542  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0065  CDS  NC_009485  67655  68470  +  816  hypothetical protein  YP_001236273  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0066  CDS  NC_009485  68594  69394  -  801  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  YP_001236274  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0067  CDS  NC_009485  69449  69520  -  72  hypothetical protein  YP_001236275  normal  1  normal  0.691802  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0068  CDS  NC_009485  69536  70735  -  1200  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  YP_001236276  normal  1  normal  0.707372  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0069  CDS  NC_009485  70836  71357  -  522  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_001236277  normal  0.353039  normal  0.33952  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0071  CDS  NC_009485  71793  72290  +  498  ferric uptake regulator family protein  YP_001236278  normal  0.167395  normal  0.259956  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0072  CDS  NC_009485  72414  72827  -  414  hypothetical protein  YP_001236279  normal  0.237291  normal  0.464662  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0073  CDS  NC_009485  73301  74302  +  1002  putative glyoxylate reductase  YP_001236280  normal  1  normal  0.692518  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0074  CDS  NC_009485  74517  75320  -  804  putative molybdopterin biosynthesis protein moeB  YP_001236281  normal  1  normal  0.648958  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0075  CDS  NC_009485  75462  76841  +  1380  peptidoglycan binding domain-containing protein  YP_001236282  normal  1  normal  0.542735  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0076  CDS  NC_009485  76871  77656  +  786  hypothetical protein  YP_001236283  normal  1  normal  0.440819  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0077  CDS  NC_009485  78085  78888  +  804  hypothetical protein  YP_001236284  normal  1  normal  0.228977  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0078  CDS  NC_009485  79248  79997  +  750  hypothetical protein  YP_001236285  normal  1  normal  0.291271  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0079  CDS  NC_009485  79992  80501  -  510  hypothetical protein  YP_001236286  normal  1  normal  0.26747  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0080  CDS  NC_009485  80573  81454  -  882  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_001236287  normal  1  normal  0.364288  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0081  CDS  NC_009485  81560  82321  +  762  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  YP_001236288  normal  1  normal  0.345232  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0082  CDS  NC_009485  82318  83892  +  1575  2-octaprenylphenol hydroxylase  YP_001236289  normal  1  normal  0.590645  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0083  CDS  NC_009485  84088  85515  +  1428  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  YP_001236290  normal  1  normal  0.317145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0084  CDS  NC_009485  85512  85970  +  459  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  YP_001236291  normal  1  normal  0.462639  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0085  CDS  NC_009485  86159  88666  +  2508  putative sensor histidine kinase  YP_001236292  normal  1  normal  0.376568  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0086  CDS  NC_009485  88663  90192  +  1530  hypothetical protein  YP_001236293  normal  0.522913  normal  0.567075  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0087  CDS  NC_009485  90484  90789  +  306  hypothetical protein  YP_001236294  normal  0.423806  normal  0.428785  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0088  CDS  NC_009485  90938  91660  +  723  putative nucleotidyl transferase family protein  YP_001236295  normal  0.781518  normal  0.353316  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0089  CDS  NC_009485  91842  94988  +  3147  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  YP_001236296  normal  1  normal  0.476876  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0090  CDS  NC_009485  94985  98455  +  3471  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  YP_001236297  normal  0.195606  normal  0.386807  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0091  CDS  NC_009485  98557  98877  +  321  thioredoxin 1, redox factor  YP_001236298  normal  0.846581  normal  0.939622  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0092  CDS  NC_009485  99021  100034  +  1014  ATP-dependent DNA ligase  YP_001236299  normal  0.70122  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0093  CDS  NC_009485  100037  100777  -  741  hypothetical protein  YP_001236300  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0094  CDS  NC_009485  100790  102133  -  1344  putative folC protein  YP_001236301  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0095  CDS  NC_009485  102130  103068  -  939  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  YP_001236302  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0096  CDS  NC_009485  103163  103999  -  837  tryptophan synthase subunit alpha  YP_001236303  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0097  CDS  NC_009485  103996  105219  -  1224  tryptophan synthase subunit beta  YP_001236304  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0098  CDS  NC_009485  105216  105875  -  660  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  YP_001236305  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0099  CDS  NC_009485  105954  106346  -  393  hypothetical protein  YP_001236306  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0101  CDS  NC_009485  106425  106736  -  312  integration host factor subunit beta  YP_001236307  normal  1  normal  0.92315  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0102  CDS  NC_009485  106906  107886  -  981  S49 family peptidase  YP_001236308  normal  1  normal  1  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0103  CDS  NC_009485  108117  109826  -  1710  30S ribosomal protein S1  YP_001236309  normal  0.503388  normal  0.928701  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0104  CDS  NC_009485  110077  110715  -  639  cytidylate kinase  YP_001236310  normal  0.757727  normal  0.698804  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
BBta_0105  CDS  NC_009485  110712  112049  -  1338  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  YP_001236311  normal  1  normal  0.783241  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 79    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>