432 genes were found for organism Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Saro_3401  CDS  NC_009427  52  1395  +  1344  major facilitator transporter  YP_001165787  normal  0.189557  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3402  CDS  NC_009427  1392  2579  +  1188  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  YP_001165788  normal  0.762536  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3403  CDS  NC_009427  2678  4873  +  2196  TonB-dependent receptor  YP_001165789  normal  0.181941  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3404  CDS  NC_009427  4890  6392  +  1503  hypothetical protein  YP_001165790  normal  0.552289  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3405  CDS  NC_009427  6389  7174  +  786  hypothetical protein  YP_001165791  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3406  CDS  NC_009427  7434  8309  +  876  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_001165792  normal  0.786122  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3407  CDS  NC_009427  8357  8833  -  477  ybaK/ebsC protein  YP_001165793  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3408  CDS  NC_009427  8931  9386  +  456  GreA/GreB family elongation factor  YP_001165794  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3409  CDS  NC_009427  9375  10742  -  1368  MmgE/PrpD family protein  YP_001165795  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3410  CDS  NC_009427  10794  11822  -  1029  hypothetical protein  YP_001165796  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3411  CDS  NC_009427  11819  12940  -  1122  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  YP_001165797  normal  0.784569  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3412  CDS  NC_009427  13126  14343  +  1218  amidohydrolase  YP_001165798  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3413  CDS  NC_009427  14340  15851  +  1512  monooxygenase, FAD-binding  YP_001165799  normal  0.0619698  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3414  CDS  NC_009427  15848  16276  +  429  hypothetical protein  YP_001165800  decreased coverage  0.00846619  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3415  CDS  NC_009427  16273  17175  +  903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001165801  normal  0.0259566  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3416  CDS  NC_009427  17280  18113  +  834  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  YP_001165802  normal  0.0103954  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3417  CDS  NC_009427  18126  18983  +  858  esterase/lipase-like protein  YP_001165803  normal  0.0214076  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3418  CDS  NC_009427  18961  19914  -  954  rhodanese domain-containing protein  YP_001165804  normal  0.0529326  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3419  CDS  NC_009427  19955  21139  -  1185  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001165805  normal  0.0350417  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3420  CDS  NC_009427  21234  21992  -  759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001165806  normal  0.264483  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3421  CDS  NC_009427  21989  22504  -  516  cupin 2 domain-containing protein  YP_001165807  normal  0.357216  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3422  CDS  NC_009427  22501  23445  -  945  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  YP_001165808  normal  0.247714  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3423  CDS  NC_009427  23612  24943  +  1332  histidinol dehydrogenase  YP_001165809  normal  0.542405  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3424  CDS  NC_009427  24940  25698  +  759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001165810  normal  0.686314  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3425  CDS  NC_009427  25710  26873  +  1164  hypothetical protein  YP_001165811  normal  0.4734  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3426  CDS  NC_009427  26878  27285  +  408  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001165812  normal  0.386923  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3427  CDS  NC_009427  27314  28402  -  1089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001165813  normal  0.631827  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3428  CDS  NC_009427  28502  29620  -  1119  monooxygenase, FAD-binding  YP_001165814  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3429  CDS  NC_009427  29634  30656  -  1023  hypothetical protein  YP_001165815  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3430  CDS  NC_009427  30778  31011  -  234  hypothetical protein  YP_001165816  normal  0.528495  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3431  CDS  NC_009427  31008  32597  -  1590  amine oxidase  YP_001165817  normal  0.478071  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3432  CDS  NC_009427  32599  33408  -  810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001165818  normal  0.115705  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3433  CDS  NC_009427  33510  33935  +  426  HxlR family transcriptional regulator  YP_001165819  normal  0.24132  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3434  CDS  NC_009427  33942  34943  -  1002  LysR family transcriptional regulator  YP_001165820  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3435  CDS  NC_009427  34962  35879  -  918  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001165821  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3436  CDS  NC_009427  35890  37278  -  1389  sulfatase  YP_001165822  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3437  CDS  NC_009427  37354  39792  -  2439  TonB-dependent receptor  YP_001165823  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3438  CDS  NC_009427  39873  41072  +  1200  monooxygenase, FAD-binding  YP_001165824  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3439  CDS  NC_009427  41088  41801  -  714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001165825  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3440  CDS  NC_009427  41794  43002  -  1209  major facilitator transporter  YP_001165826  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3441  CDS  NC_009427  43148  43807  -  660  maleylacetoacetate isomerase  YP_001165827  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3442  CDS  NC_009427  43947  45128  +  1182  aminotransferase  YP_001165828  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3443  CDS  NC_009427  45115  46083  -  969  3-carboxymuconate cyclase-like protein  YP_001165829  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3444  CDS  NC_009427  46456  46725  +  270  hypothetical protein  YP_001165830  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3445  CDS  NC_009427  46771  48534  -  1764  TrkA domain-containing protein  YP_001165831  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3446  CDS  NC_009427  48577  49164  -  588  hypothetical protein  YP_001165832  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3447  CDS  NC_009427  49359  50144  -  786  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_001165833  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3448  CDS  NC_009427  50211  50978  -  768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001165834  normal  0.799292  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3449  CDS  NC_009427  51091  51720  +  630  TetR family transcriptional regulator  YP_001165835  normal  0.772262  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3450  CDS  NC_009427  51877  52557  +  681  phosphoribosyltransferase  YP_001165836  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3451  CDS  NC_009427  52681  53124  +  444  thioredoxin  YP_001165837  normal  0.560369  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3452  CDS  NC_009427  53192  55759  +  2568  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  YP_001165838  normal  0.213738  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3453  CDS  NC_009427  55829  58399  -  2571  TonB-dependent receptor  YP_001165839  normal  0.0426513  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3454  CDS  NC_009427  58470  58976  +  507  MarR family transcriptional regulator  YP_001165840  normal  0.947902  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3455  CDS  NC_009427  59040  60017  +  978  alcohol dehydrogenase  YP_001165841  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3456  CDS  NC_009427  60051  60383  -  333  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  YP_001165842  normal  0.926443  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3457  CDS  NC_009427  60453  61202  -  750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_001165843  normal  0.735617  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3458  CDS  NC_009427  61275  61688  -  414  hypothetical protein  YP_001165844  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3459  CDS  NC_009427  61797  62816  +  1020  alcohol dehydrogenase  YP_001165845  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3460  CDS  NC_009427  62816  63553  +  738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001165846  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3461  CDS  NC_009427  63550  64083  +  534  hypothetical protein  YP_001165847  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3462  CDS  NC_009427  64095  64445  +  351  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001165848  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3463  CDS  NC_009427  64456  65460  -  1005  alcohol dehydrogenase  YP_001165849  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3464  CDS  NC_009427  65627  66055  +  429  hypothetical protein  YP_001165850  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3465  CDS  NC_009427  66068  67132  -  1065  arsenical-resistance protein  YP_001165851  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3466  CDS  NC_009427  67132  67638  -  507  protein tyrosine phosphatase  YP_001165852  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3467  CDS  NC_009427  67635  68108  -  474  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001165853  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3468  CDS  NC_009427  68105  68449  -  345  ArsR family transcriptional regulator  YP_001165854  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3469  CDS  NC_009427  68576  71050  -  2475  TonB-dependent receptor  YP_001165855  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3470  CDS  NC_009427  71196  72206  +  1011  alcohol dehydrogenase  YP_001165856  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3471  CDS  NC_009427  72206  73006  +  801  hypothetical protein  YP_001165857  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3472  CDS  NC_009427  73027  73791  -  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001165858  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3473  CDS  NC_009427  73888  76248  -  2361  TonB-dependent receptor  YP_001165859  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3474  CDS  NC_009427  76401  77423  +  1023  alcohol dehydrogenase  YP_001165860  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3475  CDS  NC_009427  77413  78129  +  717  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001165861  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3476  CDS  NC_009427  78137  79759  -  1623  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  YP_001165862  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3477  CDS  NC_009427  80103  80477  +  375  hypothetical protein  YP_001165863  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3478  CDS  NC_009427  80474  80815  +  342  hypothetical protein  YP_001165864  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3479  CDS  NC_009427  80834  82414  +  1581  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  YP_001165865  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3480  CDS  NC_009427  82436  82819  +  384  cytochrome c, class I  YP_001165866  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3481  CDS  NC_009427  82831  84285  +  1455  aldehyde dehydrogenase  YP_001165867  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3482  CDS  NC_009427  84392  85348  +  957  meta-pathway phenol degradation-like protein  YP_001165868  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3483  CDS  NC_009427  85445  86629  -  1185  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001165869  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3484  CDS  NC_009427  86640  88049  -  1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001165870  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3485  CDS  NC_009427  88214  88741  -  528  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001165871  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3486  CDS  NC_009427  88758  89519  -  762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001165872  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3487  CDS  NC_009427  89664  90482  +  819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001165873  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3488  CDS  NC_009427  90487  91962  +  1476  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  YP_001165874  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3489  CDS  NC_009427  91970  93592  -  1623  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001165875  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3490  CDS  NC_009427  93740  94918  +  1179  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001165876  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3491  CDS  NC_009427  94932  95723  +  792  xylose isomerase domain-containing protein  YP_001165877  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3492  CDS  NC_009427  95720  96079  +  360  hypothetical protein  YP_001165878  normal  0.662132  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3493  CDS  NC_009427  96177  101525  +  5349  GAF sensor hybrid histidine kinase  YP_001165879  normal  0.0298684  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3494  CDS  NC_009427  101629  103527  +  1899  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_001165880  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3495  CDS  NC_009427  103570  103947  +  378  hypothetical protein  YP_001165881  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3496  CDS  NC_009427  103944  104216  +  273  hypothetical protein  YP_001165882  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3497  CDS  NC_009427  104216  104482  +  267  hypothetical protein  YP_001165883  normal  0.985331  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3498  CDS  NC_009427  104486  105886  -  1401  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_001165884  normal  0.916304  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3499  CDS  NC_009427  105883  106860  -  978  secretion protein HlyD family protein  YP_001165885  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3500  CDS  NC_009427  106857  107075  -  219  hypothetical protein  YP_001165886  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>