98 genes were found for organism Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
RSP_4138  CDS  NC_007490  436  1011  +  576  hypothetical protein  YP_345349  hitchhiker  0.000136425  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4139  CDS  NC_007490  3166  3891  +  726  partition parA like-protein  YP_345350  normal  0.71144  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4144  CDS  NC_007490  7210  7881  +  672  hypothetical protein  YP_345351  normal  0.0352175  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4148  CDS  NC_007490  9512  10957  -  1446  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  YP_345354  normal  0.948867  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4149  CDS  NC_007490  11008  11403  -  396  hypothetical protein  YP_345355  normal  0.0348915  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4150  CDS  NC_007490  11721  12386  +  666  hypothetical protein  YP_345356  normal  0.038459  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4151  CDS  NC_007490  12450  12770  +  321  posible transposase  YP_345357  normal  0.0115322  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4153  CDS  NC_007490  13510  14601  -  1092  hypothetical protein  YP_345359  normal  0.989771  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4154  CDS  NC_007490  15008  15538  -  531  putative transposase  YP_345360  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4156  CDS  NC_007490  15885  16175  -  291  transposase, IS66 Orf2  YP_345361  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4157  CDS  NC_007490  16517  17587  +  1071  radical SAM superfamily protein  YP_345362  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4158  CDS  NC_007490  17721  18647  +  927  Generic methyltransferase  YP_345363  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4159  CDS  NC_007490  18722  19732  +  1011  isopropylmalate/homocitrate synthase  YP_345364  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4160  CDS  NC_007490  19807  20175  +  369  hypothetical protein  YP_345365  normal  0.113649  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4161  CDS  NC_007490  20168  21490  +  1323  O-acetylhomoserine sulfhydrylase  YP_345366  normal  0.0908424  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4162  CDS  NC_007490  21526  22302  +  777  hypothetical protein  YP_345367  normal  0.0167714  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4165  CDS  NC_007490  24336  25907  -  1572  transposase IS66  YP_345369  normal  0.699531  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4166  CDS  NC_007490  25976  26329  -  354  transposase IS66  YP_345370  normal  0.0244741  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4167  CDS  NC_007490  26326  26748  -  423  IS3 family transposase  YP_345371  normal  0.0827165  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4168    NC_007490  26991  27248  -  258      normal  0.313293  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4170    NC_007490  27549  27764  +  216      normal  0.292465  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4171  CDS  NC_007490  28133  28960  +  828  hypothetical protein  YP_345372  normal  0.712487  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4172  CDS  NC_007490  29003  29380  -  378  hypothetical protein  YP_345373  normal  0.0785699  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4178  CDS  NC_007490  31798  32106  +  309  putative transposase, ISRm14  YP_345374  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4179    NC_007490  32103  32222  +  120      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4180    NC_007490  32232  32408  +  177      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4181  CDS  NC_007490  32571  32870  +  300  hypothetical protein  YP_345375  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4182  CDS  NC_007490  32931  33932  +  1002  transposase IS66  YP_345376  normal  0.445979  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4183    NC_007490  33947  34093  +  147      normal  0.300351  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4185  CDS  NC_007490  36007  36993  -  987  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  YP_345378  normal  0.324966  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4186  CDS  NC_007490  36993  38177  -  1185  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  YP_345379  normal  0.04151  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4188  CDS  NC_007490  38609  39004  +  396  hypothetical protein  YP_345381  normal  0.199772  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4189  CDS  NC_007490  39084  39968  -  885  TonB-dependent receptor protein  YP_345382  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4190  CDS  NC_007490  40681  41274  +  594  Heme oxygenase  YP_345383  normal  0.449894  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4191  CDS  NC_007490  41195  44137  +  2943  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  YP_345384  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4192    NC_007490  44315  44536  -  222      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4193  CDS  NC_007490  44599  45153  +  555  hypothetical protein  YP_345385  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4194  CDS  NC_007490  45153  46187  +  1035  ATPase-like/sensor kinase  YP_345386  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4195  CDS  NC_007490  46184  46648  +  465  response regulator receiver protein  YP_345387  normal  0.81513  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4197  CDS  NC_007490  47658  49148  +  1491  antisigma-factor antagonist, STAS  YP_345389  normal  0.291756  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4198    NC_007490  49668  50009  +  342      normal  0.125947  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4199  CDS  NC_007490  50016  50351  +  336  hypothetical protein  YP_345390  normal  0.124455  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4200  CDS  NC_007490  50383  51633  +  1251  major facilitator transporter  YP_345391  normal  0.279328  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4201  CDS  NC_007490  51804  52088  +  285  ArsR family transcriptional regulator  YP_345392  normal  0.314782  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4202  CDS  NC_007490  52085  53143  +  1059  transporter  YP_345393  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4203  CDS  NC_007490  53156  53386  +  231  putative glutaredoxin family protein/Thio-disulfide isomerase  YP_345394  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4204  CDS  NC_007490  53383  53700  +  318  hypothetical protein  YP_345395  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4206    NC_007490  53957  54379  +  423      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4207  CDS  NC_007490  55012  56139  +  1128  glycosyl transferase, group 1  YP_345396  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4209  CDS  NC_007490  56604  57782  -  1179  acyltransferase  YP_345398  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4210  CDS  NC_007490  58192  59004  +  813  ArsR family transcriptional regulator  YP_345399  normal  0.54133  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4211  CDS  NC_007490  59004  60011  +  1008  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  YP_345400  normal  0.130636  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4212  CDS  NC_007490  60055  61293  +  1239  putative multidrug-efflux transporter  YP_345401  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4213    NC_007490  61700  61960  -  261      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4215  CDS  NC_007490  63080  63451  -  372  ISxcd1 transposase  YP_345403  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4219  CDS  NC_007490  67218  67568  +  351  hypothetical protein  YP_345405  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4220  CDS  NC_007490  67635  67925  +  291  hypothetical protein  YP_345406  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4221  CDS  NC_007490  67925  68479  +  555  hypothetical protein  YP_345407  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4222  CDS  NC_007490  68476  69195  +  720  hypothetical protein  YP_345408  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4224  CDS  NC_007490  69195  70448  +  1254  putative conjugative transfer factor, TraB  YP_345409  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4225  CDS  NC_007490  70445  70873  +  429  hypothetical protein  YP_345410  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4226  CDS  NC_007490  70870  73353  +  2484  hypothetical protein  YP_345411  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4227  CDS  NC_007490  73350  73667  +  318  hypothetical protein  YP_345412  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4228  CDS  NC_007490  73645  74004  +  360  sex-pilus assembly protein  YP_345413  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4229  CDS  NC_007490  74001  74531  +  531  signal peptidase I  YP_345414  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4230  CDS  NC_007490  74507  75145  +  639  hypothetical protein  YP_345415  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4231  CDS  NC_007490  75142  76128  +  987  hypothetical protein  YP_345416  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4232  CDS  NC_007490  76089  76841  +  753  TrbC, sex pilus assembly and mating pair formation protein  YP_345417  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4233  CDS  NC_007490  76838  78946  +  2109  hypothetical protein  YP_345418  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4234  CDS  NC_007490  78948  79346  +  399  thioredoxin domain-containing protein  YP_345419  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4235  CDS  NC_007490  79339  80172  +  834  hypothetical protein  YP_345420  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4236  CDS  NC_007490  80180  80425  +  246  hypothetical protein  YP_345421  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4237  CDS  NC_007490  80436  81833  +  1398  hypothetical protein  YP_345422  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4238  CDS  NC_007490  81837  85247  +  3411  hypothetical protein  YP_345423  normal  0.192526  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4242  CDS  NC_007490  87069  91703  +  4635  hemolysin-type calcium-binding protein  YP_345425  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4244  CDS  NC_007490  93277  94062  -  786  hypothetical protein  YP_345427  normal  0.200113  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4245  CDS  NC_007490  94487  95056  -  570  hypothetical protein  YP_345428  normal  0.0121178  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4246  CDS  NC_007490  95209  95487  +  279  putative SinR-like protein  YP_345429  normal  0.0629018  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4247  CDS  NC_007490  96830  97312  +  483  hypothetical protein  YP_345431  normal  0.356623  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4248  CDS  NC_007490  97293  98483  +  1191  hypothetical protein  YP_345432  normal  0.0344938  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4251  CDS  NC_007490  99220  99777  -  558  hypothetical protein  YP_345434  hitchhiker  0.00586984  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4252  CDS  NC_007490  99779  100270  -  492  hypothetical protein  YP_345435  hitchhiker  0.0000039728  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7273    NC_007490  31496  31603  +  108      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7280  CDS  NC_007490  38392  38619  +  228  SpoVT/AbrB-like cell growth regulatory protein  YP_345380  normal  0.11675  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7300  CDS  NC_007490  62195  62572  +  378  putative transposase  YP_345402  normal  0.675476  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7322  CDS  NC_007490  95592  96833  +  1242  hypothetical protein  YP_345430  normal  0.33936  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7332  CDS  NC_007490  56211  56366  -  156  hypothetical protein  YP_345397  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7383  CDS  NC_007490  8156  8569  +  414  hypothetical protein  YP_345352  normal  0.64126  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7384  CDS  NC_007490  8711  9229  +  519  hypothetical protein  YP_345353  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7385  CDS  NC_007490  12853  13503  -  651  putative threonine efflux protein  YP_345358  normal  0.0325259  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7386  CDS  NC_007490  22311  24074  +  1764  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  YP_345368  normal  0.397626  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7387  CDS  NC_007490  34613  35824  -  1212  replication initiation protein RepC  YP_345377  normal  0.0522109  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7388  CDS  NC_007490  46985  47521  +  537  transposase  YP_345388  normal  0.648182  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7389    NC_007490  49160  49672  +  513      normal  0.296263  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7390  CDS  NC_007490  63999  65216  -  1218  transposase  YP_345404  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7391  CDS  NC_007490  85998  86510  +  513  hypothetical protein  YP_345424  normal  0.327991  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7392  CDS  NC_007490  92138  92410  -  273  hypothetical protein  YP_345426  normal  0.0339543  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7393  CDS  NC_007490  98706  98876  -  171  hypothetical protein  YP_345433  normal  0.0131877  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>