39 genes were found for organism Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
LACR_D01  CDS  NC_008506  105  1811  -  1707  cellobiose-specific PTS system IIC component  YP_796530  normal  0.142649  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D02  CDS  NC_008506  1815  2132  -  318  cellobiose-specific PTS system IIA component  YP_796531  hitchhiker  0.0000740082  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D03  CDS  NC_008506  2160  3140  -  981  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  YP_796532  decreased coverage  0.000270283  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D04  CDS  NC_008506  3143  4003  -  861  tagatose-6-phosphate kinase  YP_796533  normal  0.0175284  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D05  CDS  NC_008506  4086  4601  -  516  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  YP_796534  normal  0.305214  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D06  CDS  NC_008506  4618  4992  -  375  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacA  YP_796535  normal  0.230058  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D07  CDS  NC_008506  5532  6299  +  768  lactose transport regulator  YP_796536  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D08  CDS  NC_008506  6798  7379  -  582  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  YP_796537  normal  0.942713  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D09  CDS  NC_008506  7472  7732  +  261  transposase  YP_796538  normal  0.874823  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D10    NC_008506  7729  8058  +  330      normal  0.694181  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D11    NC_008506  7949  8110  -  162      normal  0.499999  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D12  CDS  NC_008506  8113  9927  -  1815  oligopeptidase F  YP_796539  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D13  CDS  NC_008506  10533  11243  +  711  transposase  YP_796540  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D14  CDS  NC_008506  11636  13990  +  2355  carbon starvation protein, membrane protein  YP_796541  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D15  CDS  NC_008506  14556  15110  +  555  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  YP_796542  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D16  CDS  NC_008506  16259  18142  -  1884  oligopeptidase O1  YP_796543  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D17  CDS  NC_008506  18267  20069  -  1803  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  YP_796544  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D18  CDS  NC_008506  20179  21063  -  885  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  YP_796545  normal  0.618821  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D19  CDS  NC_008506  21073  22032  -  960  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  YP_796546  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D20  CDS  NC_008506  22013  22972  -  960  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  YP_796547  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D21  CDS  NC_008506  22969  23985  -  1017  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  YP_796548  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D22  CDS  NC_008506  24263  25153  +  891  transposase  YP_796549  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D23  CDS  NC_008506  25430  26584  +  1155  replication initiator protein  YP_796550  decreased coverage  0.000665285  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D24  CDS  NC_008506  26730  27539  +  810  ATPase for chromosome partitioning  YP_796551  normal  0.0126425  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D25    NC_008506  28025  28963  -  939      normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D26  CDS  NC_008506  31189  31572  -  384  hypothetical protein  YP_796552  normal  0.0342281  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D27  CDS  NC_008506  31578  31859  -  282  hypothetical protein  YP_796553  normal  0.025283  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D28  CDS  NC_008506  32107  34128  +  2022  hypothetical protein  YP_796554  unclonable  0.00718795  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D29  CDS  NC_008506  34184  34864  -  681  transposase  YP_796555  decreased coverage  0.0000656405  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D30  CDS  NC_008506  35324  36901  +  1578  manganese transporter NRAMP  YP_796556  unclonable  0.000755311  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D31  CDS  NC_008506  36910  37347  +  438  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  YP_796557  normal  0.575009  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D32  CDS  NC_008506  37460  38140  -  681  transposase  YP_796558  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D33  CDS  NC_008506  38635  39465  -  831  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  YP_796559  normal  0.327178  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D34  CDS  NC_008506  39548  40438  -  891  transposase  YP_796560  normal  0.0159286  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D35  CDS  NC_008506  40727  41698  -  972  tellurite resistance protein related permease  YP_796561  normal  0.0741739  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D36  CDS  NC_008506  41817  42671  -  855  transposase  YP_796562  normal  0.0652132  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D37    NC_008506  43388  43567  -  180      normal  0.121239  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D38  CDS  NC_008506  44611  45516  -  906  galactose mutarotase-like protein  YP_796563  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_D39  CDS  NC_008506  45802  47208  -  1407  6-phospho-beta-galactosidase  YP_796564  normal  1  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>