66 genes were found for organism Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
LACR_C01  CDS  NC_008505  254  1645  +  1392  putative multicopper oxidase  YP_796469  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C02  CDS  NC_008505  1917  2621  -  705  transposase  YP_796470  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C03  CDS  NC_008505  2783  3058  -  276  transposase  YP_796471  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C04  CDS  NC_008505  3229  4266  +  1038  hypothetical protein  YP_796472  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C05  CDS  NC_008505  4785  5675  +  891  transposase  YP_796473  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C06  CDS  NC_008505  6029  6610  +  582  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  YP_796474  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C07  CDS  NC_008505  6615  8540  +  1926  anthranilate/para-aminobenzoate synthase component I  YP_796475  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C08  CDS  NC_008505  8636  9133  -  498  acetyltransferase  YP_796476  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C09  CDS  NC_008505  9313  9777  -  465  transcription activator effector binding domain-containing protein  YP_796477  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C10  CDS  NC_008505  10270  11511  +  1242  major facilitator superfamily permease  YP_796478  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C11  CDS  NC_008505  11776  12351  -  576  glycopeptide antibiotics resistance protein  YP_796479  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C12  CDS  NC_008505  12446  13126  -  681  transposase  YP_796480  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C13  CDS  NC_008505  13286  14416  +  1131  cell surface protein  YP_796481  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C14  CDS  NC_008505  14652  15368  +  717  cell surface protein  YP_796482  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C15  CDS  NC_008505  15458  18214  +  2757  hypothetical protein  YP_796483  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C16  CDS  NC_008505  19197  20363  +  1167  replication initiator protein  YP_796484  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C17  CDS  NC_008505  20356  20880  +  525  RepB family protein  YP_796485  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C18  CDS  NC_008505  21461  22165  -  705  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  YP_796486  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C19  CDS  NC_008505  22727  24526  -  1800  maturase MatR  YP_796487  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C20  CDS  NC_008505  25064  25471  -  408  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  YP_796488  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C21  CDS  NC_008505  25476  25844  -  369  MobC, mobilisation protein (MobC)  YP_796489  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C22  CDS  NC_008505  26139  26405  -  267  hypothetical protein  YP_796490  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C23  CDS  NC_008505  26424  26675  -  252  hypothetical protein  YP_796491  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C24  CDS  NC_008505  27663  28298  -  636  exopolysaccharide biosynthesis protein  YP_796492  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C25    NC_008505  29938  30303  -  366      n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C26  CDS  NC_008505  30431  30727  -  297  hypothetical protein  YP_796493  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C27  CDS  NC_008505  31440  32087  -  648  pyrrolidone-carboxylate peptidase  YP_796494  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C28  CDS  NC_008505  32461  33066  -  606  dienelactone hydrolase family protein  YP_796495  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C29  CDS  NC_008505  33333  33677  -  345  hypothetical protein  YP_796496  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C30  CDS  NC_008505  34197  35147  -  951  Mg2+ and Co2+ transporter  YP_796497  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C31  CDS  NC_008505  35278  35436  -  159  hypothetical protein  YP_796498  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C32  CDS  NC_008505  35678  36358  -  681  transposase  YP_796499  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C33  CDS  NC_008505  36638  38317  +  1680  D-lactate dehydrogenase  YP_796500  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C34  CDS  NC_008505  38405  39301  -  897  transposase  YP_796501  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C35  CDS  NC_008505  40077  41426  -  1350  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  YP_796502  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C36  CDS  NC_008505  41564  42187  -  624  amidase  YP_796503  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C37  CDS  NC_008505  42453  43028  -  576  transcriptional regulator  YP_796504  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C38  CDS  NC_008505  43173  43442  -  270  hypothetical protein  YP_796505  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C39  CDS  NC_008505  43629  43991  -  363  hypothetical protein  YP_796506  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C40  CDS  NC_008505  44001  44231  -  231  hypothetical protein  YP_796507  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C41  CDS  NC_008505  44401  45081  +  681  transposase  YP_796508  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C42  CDS  NC_008505  45329  51217  -  5889  lactocepin I  YP_796509  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C43  CDS  NC_008505  51542  52441  +  900  peptidylprolyl isomerase  YP_796510  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C44  CDS  NC_008505  52591  53271  +  681  transposase  YP_796511  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C45  CDS  NC_008505  54743  55633  +  891  transposase  YP_796512  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C46  CDS  NC_008505  55779  56075  -  297  hypothetical protein  YP_796513  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C47  CDS  NC_008505  57994  58194  -  201  cold-shock DNA-binding protein family protein  YP_796514  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C48  CDS  NC_008505  58471  58671  -  201  cold-shock DNA-binding protein family protein  YP_796515  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C49  CDS  NC_008505  58802  59002  -  201  hypothetical protein  YP_796516  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C51  CDS  NC_008505  59980  60660  +  681  transposase  YP_796517  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C52    NC_008505  61058  61390  -  333      n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C53    NC_008505  62032  63497  +  1466      n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C54  CDS  NC_008505  63487  63837  +  351  hypothetical protein  YP_796518  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C55  CDS  NC_008505  64050  64892  +  843  ATPase for chromosome partitioning  YP_796519  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C56  CDS  NC_008505  64969  65172  +  204  hypothetical protein  YP_796520  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C57  CDS  NC_008505  65569  66561  +  993  hypothetical protein  YP_796521  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C58  CDS  NC_008505  67032  67265  +  234  transposase  YP_796522  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C59  CDS  NC_008505  67432  68136  +  705  transposase  YP_796523  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C60  CDS  NC_008505  68247  69320  -  1074  transposase  YP_796524  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C61  CDS  NC_008505  69850  70518  +  669  DNA-binding response regulator  YP_796525  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C62  CDS  NC_008505  70506  71900  +  1395  Signal transduction histidine kinase  YP_796526  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C63  CDS  NC_008505  72084  72890  +  807  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  YP_796527  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C64  CDS  NC_008505  72895  73110  +  216  hypothetical protein  YP_796528  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_C65  CDS  NC_008505  73366  74670  +  1305  surface antigen  YP_796529  n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_Ct50  tRNA  NC_008505  59561  59634  -  74  tRNA-Met    n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_r1  rRNA  NC_008505  26984  27611  -  628  16S ribosomal RNA    n/a    n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>