5049 genes were found for organism Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dhaf_0001  CDS  NC_011830  93  1442  +  1350  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_002456507  hitchhiker  0.0000000141272  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0002  CDS  NC_011830  1698  2801  +  1104  DNA polymerase III, beta subunit  YP_002456508  normal  0.150547  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0003  CDS  NC_011830  2816  3913  +  1098  DNA replication and repair protein RecF  YP_002456509  normal  0.390569  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0004  CDS  NC_011830  3917  4174  +  258  hypothetical protein  YP_002456510  normal  0.0832363  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0005  CDS  NC_011830  4326  6260  +  1935  DNA gyrase, B subunit  YP_002456511  decreased coverage  0.00336478  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0006  CDS  NC_011830  6274  8760  +  2487  DNA gyrase, A subunit  YP_002456512  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0007  CDS  NC_011830  8875  9447  +  573  SNO glutamine amidotransferase  YP_002456513  normal  0.789249  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0008  CDS  NC_011830  9478  10743  +  1266  seryl-tRNA synthetase  YP_002456514  hitchhiker  0.00944776  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0009  CDS  NC_011830  11110  11556  +  447  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  YP_002456515  hitchhiker  0.00000000143091  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0010    NC_011830  12020  12602  +  583      hitchhiker  0.00000000510463  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0011  CDS  NC_011830  12608  13465  -  858  transcriptional regulator, AraC family  YP_002456516  hitchhiker  0.00000000871788  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0012  CDS  NC_011830  13703  14269  +  567  hypothetical protein  YP_002456517  hitchhiker  0.00000000000475591  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0013  CDS  NC_011830  14401  14706  -  306  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  YP_002456518  hitchhiker  0.00000000000622147  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0014  CDS  NC_011830  14830  15195  +  366  transcriptional regulator, HxlR family  YP_002456519  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0015  CDS  NC_011830  15361  15546  +  186  hypothetical protein  YP_002456520  hitchhiker  0.0000000549892  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0016  CDS  NC_011830  15560  15808  +  249  Coat F domain protein  YP_002456521  hitchhiker  0.0000242337  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0017  CDS  NC_011830  16151  17281  +  1131  diguanylate cyclase  YP_002456522  normal  0.156955  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0018  CDS  NC_011830  17386  18852  -  1467  ABC transporter related  YP_002456523  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0019  CDS  NC_011830  19308  19514  +  207  transcriptional regulator, XRE family  YP_002456524  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0020  CDS  NC_011830  19511  19975  +  465  hypothetical protein  YP_002456525  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0021  CDS  NC_011830  20015  21352  +  1338  Radical SAM domain protein  YP_002456526  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0022  CDS  NC_011830  21535  21849  +  315  hypothetical protein  YP_002456527  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0023  CDS  NC_011830  22069  22524  +  456  transcriptional regulator, TrmB  YP_002456528  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0024  CDS  NC_011830  22549  22956  +  408  protein of unknown function UPF0066  YP_002456529  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0025  CDS  NC_011830  23310  24863  +  1554  FMN-binding domain protein  YP_002456530  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0026  CDS  NC_011830  25046  26041  +  996  transport system permease protein  YP_002456531  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0027  CDS  NC_011830  26041  26835  +  795  ABC transporter related  YP_002456532  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0028  CDS  NC_011830  26891  27706  -  816  hypothetical protein  YP_002456533  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0029  CDS  NC_011830  27879  28382  -  504  iron dependent repressor  YP_002456534  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0030  CDS  NC_011830  28525  29466  +  942  periplasmic solute binding protein  YP_002456535  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0031  CDS  NC_011830  29478  30233  +  756  ABC transporter related  YP_002456536  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0032  CDS  NC_011830  30235  31158  +  924  ABC-3 protein  YP_002456537  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0033  CDS  NC_011830  31142  32245  +  1104  ABC-3 protein  YP_002456538  normal  0.042942  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0034  CDS  NC_011830  32272  32412  +  141  hypothetical protein  YP_002456539  hitchhiker  0.0000017936  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0035  CDS  NC_011830  32886  34526  +  1641  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002456540  hitchhiker  0.000000195087  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0036  CDS  NC_011830  34646  35623  +  978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002456541  normal  0.0122528  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0037  CDS  NC_011830  35617  36486  +  870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002456542  hitchhiker  0.00200044  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0038  CDS  NC_011830  36499  37311  +  813  ABC transporter related  YP_002456543  normal  0.0193183  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0039  CDS  NC_011830  37311  37919  +  609  ABC transporter related  YP_002456544  normal  0.118925  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0040  CDS  NC_011830  37970  39280  -  1311  histidine kinase  YP_002456545  hitchhiker  0.00046406  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0041  CDS  NC_011830  39273  39968  -  696  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002456546  hitchhiker  0.00000000251177  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0042  CDS  NC_011830  40149  41147  +  999  periplasmic solute binding protein  YP_002456547  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0043  CDS  NC_011830  41158  41901  +  744  ABC transporter related  YP_002456548  unclonable  0.0000000000000016055  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0044  CDS  NC_011830  41873  42706  +  834  ABC-3 protein  YP_002456549  unclonable  0.00000000000000363337  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0045  CDS  NC_011830  42774  43187  +  414  ferric uptake regulator, Fur family  YP_002456550  unclonable  3.4921e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0046  CDS  NC_011830  43274  44311  +  1038  cobalamin synthesis protein P47K  YP_002456551  hitchhiker  0.000000000730504  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0047  CDS  NC_011830  44316  45890  +  1575  permease  YP_002456552  hitchhiker  0.000000000898812  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0048  CDS  NC_011830  45892  46755  +  864  Protein of unknown function DUF1980  YP_002456553  hitchhiker  0.000000000161282  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0049  CDS  NC_011830  46803  47033  +  231  hypothetical protein  YP_002456554  hitchhiker  0.000000000000679469  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0050  CDS  NC_011830  47673  49337  +  1665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_002456555  hitchhiker  0.000000022733  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0051  CDS  NC_011830  49360  49692  +  333  hypothetical protein  YP_002456556  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0052  CDS  NC_011830  49703  50299  +  597  recombination protein RecR  YP_002456557  hitchhiker  0.000000000011836  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0053  CDS  NC_011830  50389  50643  +  255  sigmaK-factor processing regulatory BofA  YP_002456558  hitchhiker  0.000000000000868234  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0054  CDS  NC_011830  51021  54551  +  3531  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  YP_002456559  decreased coverage  0.00219154  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0055  CDS  NC_011830  54726  56078  +  1353  ATPase  YP_002456560  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0056  CDS  NC_011830  56150  56626  +  477  hypothetical protein  YP_002456561  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0057  CDS  NC_011830  56825  58396  +  1572  GerA spore germination protein  YP_002456562  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0058  CDS  NC_011830  58397  59509  +  1113  spore germination protein  YP_002456563  normal  0.962325  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0059  CDS  NC_011830  59521  60717  +  1197  germination protein, Ger(x)C family  YP_002456564  normal  0.727397  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0060  CDS  NC_011830  60785  62203  +  1419  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  YP_002456565  normal  0.845817  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0061  CDS  NC_011830  62205  63053  +  849  DNA-directed DNA polymerase  YP_002456566  normal  0.639704  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0062  CDS  NC_011830  63067  63915  +  849  PSP1 domain protein  YP_002456567  normal  0.0293146  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0063  CDS  NC_011830  63912  64223  +  312  protein of unknown function DUF972  YP_002456568  hitchhiker  0.000705818  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0064  CDS  NC_011830  64244  65089  +  846  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  YP_002456569  hitchhiker  0.0000000000115759  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0065  CDS  NC_011830  65222  65491  -  270  transcriptional regulator, AbrB family  YP_002456570  unclonable  1.25498e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0066  CDS  NC_011830  66076  66294  +  219  hypothetical protein  YP_002456571  unclonable  1.15826e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0067  CDS  NC_011830  66426  68369  +  1944  methionyl-tRNA synthetase  YP_002456572  unclonable  0.00000000025899  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0068  CDS  NC_011830  68366  69127  +  762  hydrolase, TatD family  YP_002456573  hitchhiker  0.00105138  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0069  CDS  NC_011830  69345  70193  +  849  3D domain protein  YP_002456574  hitchhiker  0.000000000398521  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0070  CDS  NC_011830  70287  71456  +  1170  3D domain protein  YP_002456575  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0071  CDS  NC_011830  71668  72384  +  717  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_002456576  hitchhiker  0.000000157753  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0072  CDS  NC_011830  72606  73760  +  1155  glycoside hydrolase family 18  YP_002456577  hitchhiker  0.0000000514122  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0073  CDS  NC_011830  73896  74513  +  618  primase/topoisomerase like protein  YP_002456578  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0074  CDS  NC_011830  74476  75312  +  837  dimethyladenosine transferase  YP_002456579  hitchhiker  0.000000211917  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0075  CDS  NC_011830  75428  75775  +  348  hypothetical protein  YP_002456580  hitchhiker  0.000137551  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0076  CDS  NC_011830  75850  76251  +  402  hypothetical protein  YP_002456581  hitchhiker  0.000188412  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0077  CDS  NC_011830  76333  77904  -  1572  methylenetetrahydrofolate reductase  YP_002456582  normal  0.026551  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0078  CDS  NC_011830  78345  80111  +  1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  YP_002456583  normal  0.857462  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0079  CDS  NC_011830  80344  82110  +  1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  YP_002456584  normal  0.031352  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0080  CDS  NC_011830  82100  82813  -  714  protein of unknown function DUF1624  YP_002456585  hitchhiker  0.000683778  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0081  CDS  NC_011830  82899  83756  -  858  glycosyl transferase family 2  YP_002456586  normal  0.255502  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0082  CDS  NC_011830  83903  84736  +  834  sporulation peptidase YabG  YP_002456587  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0083  CDS  NC_011830  84790  85137  -  348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_002456588  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0084  CDS  NC_011830  85278  86099  +  822  cyanophycinase  YP_002456589  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0085  CDS  NC_011830  86219  88876  +  2658  cyanophycin synthetase  YP_002456590  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0086  CDS  NC_011830  89105  90019  +  915  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_002456591  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0087  CDS  NC_011830  90220  91092  +  873  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  YP_002456592  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0088  CDS  NC_011830  91085  91804  +  720  transcriptional regulator, GntR family  YP_002456593  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0089  CDS  NC_011830  91816  92652  +  837  pur operon repressor  YP_002456594  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0090  CDS  NC_011830  92900  93154  +  255  SpoVG family protein  YP_002456595  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0091  CDS  NC_011830  93342  94703  +  1362  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  YP_002456596  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0092  CDS  NC_011830  94718  95659  +  942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_002456597  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0093  CDS  NC_011830  95822  97681  -  1860  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_002456598  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0094  CDS  NC_011830  97887  98099  +  213  transcriptional regulator, XRE family  YP_002456599  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0095  CDS  NC_011830  98089  98526  +  438  hypothetical protein  YP_002456600  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0096  CDS  NC_011830  98530  99147  +  618  protein of unknown function DUF1121  YP_002456601  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0097  CDS  NC_011830  99529  99726  +  198  hypothetical protein  YP_002456602  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0098  CDS  NC_011830  99733  100689  +  957  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  YP_002456603  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0099  CDS  NC_011830  100670  103027  +  2358  histidine kinase  YP_002456604  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0100  CDS  NC_011830  103081  103767  +  687  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_002456605  normal  1  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>