3184 genes were found for organism Thermobifida fusca YX



Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Tfu_0001  CDS  NC_007333  195  2042  +  1848  chromosomal replication initiation protein  YP_288064  unclonable  0.000000000479277  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0002  CDS  NC_007333  2800  3942  +  1143  DNA polymerase III subunit beta  YP_288065  hitchhiker  0.000000143991  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0003  CDS  NC_007333  4002  4886  +  885  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_288066  hitchhiker  0.00130229  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0004  CDS  NC_007333  4988  6121  +  1134  recombination protein F  YP_288067  normal  0.0533102  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0005  CDS  NC_007333  6111  6632  +  522  hypothetical protein  YP_288068  normal  0.0499719  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0006  CDS  NC_007333  6950  8935  +  1986  DNA gyrase subunit B  YP_288069  normal  0.60604  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0007  CDS  NC_007333  8992  11538  +  2547  DNA gyrase subunit A  YP_288070  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0008  CDS  NC_007333  11738  12430  +  693  hypothetical protein  YP_288071  normal  0.327365  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0009  CDS  NC_007333  13759  14910  +  1152  putative transferase  YP_288072  normal  0.848658  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0010  CDS  NC_007333  14917  15828  +  912  n-acetylneuraminate synthase  YP_288073  normal  0.124512  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0011  CDS  NC_007333  15907  16869  +  963  putative glycosyltransferase  YP_288074  normal  0.171814  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0012  CDS  NC_007333  16874  18202  +  1329  hypothetical protein  YP_288075  normal  0.0758862  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0013  CDS  NC_007333  18230  18988  -  759  putative integral membrane protein  YP_288076  normal  0.287986  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0014  CDS  NC_007333  19163  20473  -  1311  hypothetical protein  YP_288077  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0015  CDS  NC_007333  20470  21501  -  1032  hypothetical protein  YP_288078  normal  0.409962  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0016  CDS  NC_007333  21573  22844  -  1272  mannose-6-phosphate isomerase  YP_288079  normal  0.976239  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0017  CDS  NC_007333  23403  24821  -  1419  cell envelope-related transcriptional attenuator  YP_288080  hitchhiker  0.00643877  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0018  CDS  NC_007333  24941  25561  -  621  hypothetical protein  YP_288081  decreased coverage  0.0000000227051  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0019  CDS  NC_007333  25692  27041  +  1350  primary replicative DNA helicase  YP_288082  hitchhiker  0.000143574  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0020  CDS  NC_007333  27533  28045  -  513  hypothetical protein  YP_288083  normal  0.715756  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0021  CDS  NC_007333  28061  28228  -  168  hypothetical protein  YP_288084  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0022  CDS  NC_007333  28370  28594  -  225  hypothetical protein  YP_288085  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0023    NC_007333  28987  29259  -  273      normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0024    NC_007333  29121  29639  -  519      normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0025  CDS  NC_007333  29947  30447  +  501  hypothetical protein  YP_288086  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0026  CDS  NC_007333  30506  31000  +  495  hypothetical protein  YP_288087  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0027  CDS  NC_007333  31030  31482  +  453  tRNA-adenosine deaminase  YP_288088  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0028  CDS  NC_007333  32519  33625  -  1107  hypothetical protein  YP_288089  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0029  CDS  NC_007333  33709  34626  +  918  LysR family transcriptional regulator  YP_288090  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0030  CDS  NC_007333  34593  34904  -  312  hypothetical protein  YP_288091  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0031  CDS  NC_007333  35195  36463  -  1269  seryl-tRNA synthetase  YP_288092  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0032  CDS  NC_007333  36945  37511  -  567  hypothetical protein  YP_288093  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0033  CDS  NC_007333  38112  38906  +  795  GntR family transcriptional regulator  YP_288094  normal  0.146741  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0034  CDS  NC_007333  38934  39296  -  363  hypothetical protein  YP_288095  normal  0.108328  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0035  CDS  NC_007333  39579  40034  -  456  hypothetical protein  YP_288096  normal  0.431004  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0036  CDS  NC_007333  40150  40398  -  249  hypothetical protein  YP_288097  normal  0.876487  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0037  CDS  NC_007333  40654  41022  -  369  hypothetical protein  YP_288098  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0038  CDS  NC_007333  41202  41438  -  237  hypothetical protein  YP_288099  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0039  CDS  NC_007333  41749  41982  -  234  hypothetical protein  YP_288100  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0040  CDS  NC_007333  42286  42519  -  234  hypothetical protein  YP_288101  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0041  CDS  NC_007333  42815  43180  +  366  hypothetical protein  YP_288102  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0042  CDS  NC_007333  43435  44493  -  1059  aspartate semialdehyde dehydrogenase  YP_288103  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0043  CDS  NC_007333  44490  45761  -  1272  aspartate kinase  YP_288104  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0044  CDS  NC_007333  45983  46582  -  600  recombination protein RecR  YP_288105  normal  0.118922  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0045  CDS  NC_007333  46682  47032  -  351  hypothetical protein  YP_288106  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0046  CDS  NC_007333  47324  49162  +  1839  hypothetical protein  YP_288107  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0047  CDS  NC_007333  49207  52773  -  3567  DNA polymerase III subunit alpha  YP_288108  normal  0.55181  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0048  CDS  NC_007333  53074  53409  -  336  hypothetical protein  YP_288109  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0049  CDS  NC_007333  53440  53640  -  201  hypothetical protein  YP_288110  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0050  CDS  NC_007333  53663  55018  -  1356  hypothetical protein  YP_288111  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0051  CDS  NC_007333  55183  57261  -  2079  DNA polymerase III subunits gamma and tau  YP_288112  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0052  CDS  NC_007333  58893  59519  +  627  hypothetical protein  YP_288113  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0053  CDS  NC_007333  59730  60761  +  1032  hypothetical protein  YP_288114  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0054  CDS  NC_007333  60758  62374  +  1617  hypothetical protein  YP_288115  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0055  CDS  NC_007333  62826  63449  +  624  hypothetical protein  YP_288116  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0056  CDS  NC_007333  63613  65841  -  2229  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  YP_288117  normal  0.718605  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0057  CDS  NC_007333  65942  67549  -  1608  putative regulatory protein  YP_288118  normal  0.0293617  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0058  CDS  NC_007333  67652  68626  +  975  agmatinase  YP_288119  normal  0.741294  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0059  CDS  NC_007333  68727  70235  +  1509  putative transporter  YP_288120  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0060  CDS  NC_007333  70512  71909  +  1398  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  YP_288121  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0061  CDS  NC_007333  71944  74154  -  2211  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  YP_288122  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0062  CDS  NC_007333  74123  75454  -  1332  hypothetical protein  YP_288123  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0063  CDS  NC_007333  75451  79521  -  4071  hypothetical protein  YP_288124  normal  0.80787  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0064  CDS  NC_007333  80214  82304  +  2091  putative DNA helicase  YP_288125  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0065  CDS  NC_007333  82337  84619  +  2283  hypothetical protein  YP_288126  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0066  CDS  NC_007333  85040  85276  -  237  hypothetical protein  YP_288127  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0067  CDS  NC_007333  85575  86345  +  771  enoyl-CoA hydratase  YP_288128  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0068  CDS  NC_007333  86404  87579  -  1176  putative acyl-CoA dehydrogenase  YP_288129  normal  0.544206  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0069  CDS  NC_007333  87664  88272  +  609  putative transcriptional regulator  YP_288130  normal  0.494217  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0070  CDS  NC_007333  88458  88919  -  462  hypothetical protein  YP_288131  normal  0.654871  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0071  CDS  NC_007333  90403  90963  -  561  hypothetical protein  YP_288132  normal  0.254747  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0072  CDS  NC_007333  91027  92013  -  987  putative quinone oxidoreductase  YP_288133  normal  0.419686  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0073  CDS  NC_007333  92245  94104  +  1860  chromosome partitioning ATPase  YP_288134  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0074  CDS  NC_007333  94397  95581  +  1185  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  YP_288135  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0075  CDS  NC_007333  95583  96356  +  774  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  YP_288136  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0076  CDS  NC_007333  96353  97099  +  747  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  YP_288137  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0077  CDS  NC_007333  97096  97992  +  897  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  YP_288138  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0078  CDS  NC_007333  97989  99113  +  1125  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  YP_288139  normal  0.17119  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0079  CDS  NC_007333  99258  100133  +  876  alpha/beta hydrolase superfamily protein  YP_288140  normal  0.0196412  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0080  CDS  NC_007333  100065  102011  -  1947  GAF domain-containing protein  YP_288141  normal  0.920818  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0081  CDS  NC_007333  101996  102811  -  816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  YP_288142  normal  0.243269  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0082  CDS  NC_007333  103048  104292  +  1245  esterase, PHB depolymerase  YP_288143  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0083  CDS  NC_007333  104784  106598  +  1815  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_288144  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0084  CDS  NC_007333  106919  107650  -  732  hypothetical protein  YP_288145  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0085  CDS  NC_007333  107759  108214  +  456  hypothetical protein  YP_288146  normal  0.623619  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0086  CDS  NC_007333  108704  109843  +  1140  DNA polymerase III subunit beta  YP_288147  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0087  CDS  NC_007333  110008  110298  -  291  hypothetical protein  YP_288148  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0088  CDS  NC_007333  110298  110726  -  429  hypothetical protein  YP_288149  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0089  CDS  NC_007333  110867  111697  +  831  hypothetical protein  YP_288150  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0090  CDS  NC_007333  112611  113462  +  852  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  YP_288151  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0091  CDS  NC_007333  113470  113661  +  192  hypothetical protein  YP_288152  normal  0.407205  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0092  CDS  NC_007333  113933  114925  +  993  malate dehydrogenase  YP_288153  normal  0.021843  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0093  CDS  NC_007333  115018  115446  -  429  hypothetical protein  YP_288154  hitchhiker  0.0000689515  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0094  CDS  NC_007333  115646  116503  -  858  hypothetical protein  YP_288155  hitchhiker  0.000060167  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0095  CDS  NC_007333  116630  117139  -  510  hypothetical protein  YP_288156  normal  0.0511348  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0096  CDS  NC_007333  117311  118114  +  804  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  YP_288157  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0097  CDS  NC_007333  118103  119002  -  900  hypothetical protein  YP_288158  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0098  CDS  NC_007333  119935  120546  +  612  hypothetical protein  YP_288159  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0099  CDS  NC_007333  120568  120924  +  357  hypothetical protein  YP_288160  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0100  CDS  NC_007333  121094  123427  +  2334  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  YP_288161  normal  1  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>