3635 genes were found for organism Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 37    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Gmet_0001  CDS  NC_007517  261  1613  +  1353  chromosomal replication initiation protein  YP_382976  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0002  CDS  NC_007517  1837  2958  +  1122  DNA polymerase III, beta subunit  YP_382977  normal  0.394263  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0003  CDS  NC_007517  3041  4138  +  1098  recombination protein F  YP_382978  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0004  CDS  NC_007517  4149  6536  +  2388  DNA gyrase subunit B  YP_382979  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0005  CDS  NC_007517  6570  9143  +  2574  DNA gyrase subunit A  YP_382980  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0006  CDS  NC_007517  9171  10790  +  1620  hypothetical protein  YP_382981  normal  0.18475  normal  0.198323  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0007  CDS  NC_007517  11025  11564  -  540  hypothetical protein  YP_382982  normal  1  normal  0.860463  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0008  CDS  NC_007517  12343  13350  +  1008  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_382983  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0009  CDS  NC_007517  13386  15677  +  2292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_382984  normal  0.508031  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0010  CDS  NC_007517  15674  17200  +  1527  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_382985  normal  0.0502065  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0011  CDS  NC_007517  17225  18676  +  1452  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_382986  normal  0.0404114  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0012  CDS  NC_007517  18680  20365  +  1686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_382987  normal  0.237401  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0013  CDS  NC_007517  20371  21297  +  927  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  YP_382988  normal  0.805584  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0014  CDS  NC_007517  21297  22052  +  756  ABC transporter permease  YP_382989  normal  0.189407  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0015  CDS  NC_007517  22139  23209  +  1071  radical SAM family protein  YP_382990  normal  0.0300598  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0016  CDS  NC_007517  23372  24394  +  1023  uroporphyrinogen decarboxylase  YP_382991  normal  0.87416  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0017  CDS  NC_007517  24472  24675  +  204  SlyX  YP_382992  normal  0.643938  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0018  CDS  NC_007517  24717  26162  -  1446  metal dependent phosphohydrolase  YP_382993  normal  0.161625  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0019  CDS  NC_007517  26344  27297  +  954  ferrochelatase  YP_382994  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0020  CDS  NC_007517  27303  27488  +  186  hypothetical protein  YP_382995  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0021  CDS  NC_007517  27495  28313  +  819  ATPase associated with various cellular activities  YP_382996  normal  0.954404  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0022  CDS  NC_007517  28317  30281  +  1965  hypothetical protein  YP_382997  normal  0.308944  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0023  CDS  NC_007517  30345  31571  +  1227  putative PAS/PAC sensor protein  YP_382998  normal  0.291981  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0024  CDS  NC_007517  31850  32884  -  1035  3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase  YP_382999  normal  0.14864  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0025  CDS  NC_007517  33046  33330  +  285  hypothetical protein  YP_383000  hitchhiker  0.00000995703  normal  0.852253  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0026  CDS  NC_007517  33361  33633  +  273  hypothetical protein  YP_383001  hitchhiker  0.00000000833751  normal  0.852253  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0027  CDS  NC_007517  33627  34214  +  588  hypothetical protein  YP_383002  hitchhiker  0.000000000000167556  normal  0.557217  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0028  CDS  NC_007517  34354  34641  +  288  co-chaperonin GroES  YP_383003  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0029  CDS  NC_007517  34748  36388  +  1641  chaperonin GroEL  YP_383004  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0030  CDS  NC_007517  36669  38729  +  2061  putative serine protein kinase, PrkA  YP_383005  normal  0.0714631  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0031  CDS  NC_007517  38780  40108  +  1329  hypothetical protein  YP_383006  normal  0.305172  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0032  CDS  NC_007517  40151  41821  +  1671  SpoVR-like family protein  YP_383007  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0033  CDS  NC_007517  41865  44129  +  2265  putative serine protein kinase, PrkA  YP_383008  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0034  CDS  NC_007517  44149  45276  -  1128  metallophosphoesterase  YP_383009  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0035  CDS  NC_007517  45698  46594  +  897  metal dependent phosphohydrolase  YP_383010  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0036  CDS  NC_007517  46634  47242  -  609  hypothetical protein  YP_383011  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0037  CDS  NC_007517  47308  47718  -  411  hypothetical protein  YP_383012  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0038  CDS  NC_007517  47802  49619  -  1818  K+ potassium transporter  YP_383013  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0039  CDS  NC_007517  49639  51459  -  1821  K+ potassium transporter  YP_383014  normal  1  normal  0.569614  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0040  CDS  NC_007517  51627  53999  +  2373  peptidase U32  YP_383015  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0041  CDS  NC_007517  54005  54910  +  906  Hsp33-like chaperonin  YP_383016  normal  1  normal  0.989456  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0042  CDS  NC_007517  54982  55662  +  681  putative cyclase  YP_383017  normal  1  normal  0.836357  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0043  CDS  NC_007517  55674  57416  +  1743  diguanylate cyclase  YP_383018  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0044  CDS  NC_007517  57520  58038  +  519  hypothetical protein  YP_383019  normal  1  normal  0.893023  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0045  CDS  NC_007517  58122  59078  -  957  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  YP_383020  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0046  CDS  NC_007517  59548  60504  +  957  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  YP_383021  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0047  CDS  NC_007517  60538  61425  -  888  pseudouridine synthase, RluD  YP_383022  normal  1  normal  0.816819  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0048  CDS  NC_007517  61422  61943  -  522  NUDIX hydrolase  YP_383023  normal  1  normal  0.642128  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0049    NC_007517  62201  62626  +  426      normal  0.481098  normal  0.612436  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0050  CDS  NC_007517  62682  63137  -  456  hypothetical protein  YP_383024  normal  0.460963  normal  0.607564  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0051  CDS  NC_007517  63328  64389  +  1062  hypothetical protein  YP_383025  normal  0.645365  normal  0.49777  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0052  CDS  NC_007517  64386  65684  +  1299  peptidase M16-like  YP_383026  normal  1  normal  0.430773  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0053  CDS  NC_007517  65819  67273  -  1455  transglutaminase-like  YP_383027  normal  1  normal  0.538035  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0054  CDS  NC_007517  67283  67489  -  207  hypothetical protein  YP_383028  normal  0.330344  normal  0.571523  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0055  CDS  NC_007517  67895  70165  +  2271  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  YP_383029  normal  1  normal  0.928801  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0056  CDS  NC_007517  70400  70591  +  192  CopG-like DNA-binding protein  YP_383030  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0057  CDS  NC_007517  70681  72138  -  1458  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_383031  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0058  CDS  NC_007517  72158  73819  -  1662  glutaminyl-tRNA synthetase  YP_383032  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0059  CDS  NC_007517  73856  74329  -  474  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_383033  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0060  CDS  NC_007517  74326  75024  -  699  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  YP_383034  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0061  CDS  NC_007517  75140  76528  -  1389  selenocysteine synthase  YP_383035  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0062  CDS  NC_007517  76634  77338  -  705  GntR family transcriptional regulator  YP_383036  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0063  CDS  NC_007517  77504  78559  +  1056  TrkA family potassium uptake protein  YP_383037  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0064  CDS  NC_007517  78552  79322  +  771  xylose isomerase-like TIM barrel  YP_383038  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0065  CDS  NC_007517  79368  80801  -  1434  cardiolipin synthetase 2  YP_383039  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0066  CDS  NC_007517  80968  82308  +  1341  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  YP_383040  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0067  CDS  NC_007517  82324  82989  +  666  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  YP_383041  normal  1  normal  1  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0068  CDS  NC_007517  83027  83611  +  585  NUDIX hydrolase  YP_383042  normal  1  normal  0.979316  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0069  CDS  NC_007517  83666  84610  +  945  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  YP_383043  normal  1  normal  0.840661  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0070  CDS  NC_007517  84643  85314  -  672  DNA-3-methyladenine glycosylase III  YP_383044  normal  1  normal  0.678566  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0071  CDS  NC_007517  85314  88505  -  3192  glutamate-ammonia ligase adenylyltransferase  YP_383045  normal  1  normal  0.605402  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0072  CDS  NC_007517  88502  89542  -  1041  translation initiation factor 2B subunit I  YP_383046  normal  1  normal  0.25912  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0073  CDS  NC_007517  89602  91041  -  1440  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B  YP_383047  normal  1  normal  0.228943  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0074  CDS  NC_007517  91103  91474  -  372  DNA-damage-inducible protein D  YP_383048  normal  1  normal  0.155764  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0075  CDS  NC_007517  91513  92970  -  1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  YP_383049  normal  1  normal  0.281052  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0076  CDS  NC_007517  93142  93429  -  288  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C  YP_383050  normal  1  normal  0.175672  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0077  CDS  NC_007517  93589  95574  -  1986  histidine kinase  YP_383051  normal  1  normal  0.131853  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0078  CDS  NC_007517  95728  97236  -  1509  phospholipase D/transphosphatidylase  YP_383052  normal  1  normal  0.0603365  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0079  CDS  NC_007517  97371  98261  -  891  hypothetical protein  YP_383053  normal  1  hitchhiker  0.00913842  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0080  CDS  NC_007517  98285  98665  -  381  hypothetical protein  YP_383054  normal  1  hitchhiker  0.00710157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0081  CDS  NC_007517  98843  100096  +  1254  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  YP_383055  normal  1  hitchhiker  0.00660659  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0082  CDS  NC_007517  100320  100994  -  675  hypothetical protein  YP_383056  hitchhiker  0.000628856  hitchhiker  0.00481938  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0083  CDS  NC_007517  101105  103597  -  2493  Band 7 protein  YP_383057  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0084  CDS  NC_007517  103670  105166  -  1497  hypothetical protein  YP_383058  hitchhiker  0.00246514  hitchhiker  0.000370561  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0085  CDS  NC_007517  105262  105870  -  609  protein tyrosine/serine phosphatase  YP_383059  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0086  CDS  NC_007517  105926  109312  -  3387  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  YP_383060  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0087  CDS  NC_007517  109309  110313  -  1005  amidohydrolase 2  YP_383061  hitchhiker  0.0000000655536  hitchhiker  0.0000125986  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0088  CDS  NC_007517  110601  112076  +  1476  sigma-54 factor, interaction region  YP_383062  hitchhiker  0.00217013  hitchhiker  0.0000044852  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0089  CDS  NC_007517  112218  114446  -  2229  ATP-dependent DNA helicase PcrA  YP_383063  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0090  CDS  NC_007517  114582  115091  +  510  methylated-DNA-(protein)-cysteine S-methyltransferase  YP_383064  hitchhiker  0.000000000019459  hitchhiker  0.00000048164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0091  CDS  NC_007517  115137  116111  +  975  lipid A biosynthesis acyltransferase  YP_383065  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0092  CDS  NC_007517  116108  116800  -  693  Crp/FNR family transcriptional regulator  YP_383066  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0093  CDS  NC_007517  116890  117429  -  540  hypothetical protein  YP_383067  hitchhiker  0.0000392722  hitchhiker  0.000145622  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0094  CDS  NC_007517  118485  119441  +  957  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  YP_383068  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0095  CDS  NC_007517  119490  120203  -  714  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  YP_383069  normal  0.129825  normal  0.194872  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0096  CDS  NC_007517  120200  121246  -  1047  peptidase M48, Ste24p  YP_383070  normal  0.220235  normal  0.168407  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0097  CDS  NC_007517  121243  122508  -  1266  hypothetical protein  YP_383071  normal  0.0128644  normal  0.289564  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0098  CDS  NC_007517  122523  122720  -  198  RNA-binding S4  YP_383072  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0099  CDS  NC_007517  122821  123384  +  564  elongation factor P  YP_383073  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Gmet_0100  CDS  NC_007517  123704  125560  -  1857  cytochrome c family protein  YP_383074  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 37    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>