3831 genes were found for organism Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mbar_A0001  CDS  NC_007355  429  1829  +  1401  hypothetical protein  YP_303575  normal  1  normal  0.355924  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0002    NC_007355  1882  2028  -  147      normal  1  normal  0.292792  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0003  CDS  NC_007355  2107  3381  -  1275  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  YP_303576  normal  1  normal  0.365888  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0004  CDS  NC_007355  3636  5111  -  1476  argininosuccinate lyase  YP_303577  normal  1  normal  0.52791  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0005  CDS  NC_007355  5621  6046  -  426  hypothetical protein  YP_303578  normal  0.586328  normal  0.302844  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0006  CDS  NC_007355  6080  6667  -  588  hypothetical protein  YP_303579  normal  0.799449  normal  0.210788  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0007  CDS  NC_007355  7051  7299  +  249  hypothetical protein  YP_303580  normal  0.64689  normal  0.198115  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0008  CDS  NC_007355  7472  8071  +  600  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  YP_303581  normal  0.257422  normal  0.214675  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0009  CDS  NC_007355  8181  8495  +  315  hypothetical protein  YP_303582  normal  0.205196  normal  0.125398  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0010  CDS  NC_007355  8845  10155  -  1311  thiazole biosynthesis protein  YP_303583  normal  0.0479704  normal  0.171831  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0011  CDS  NC_007355  10465  13881  -  3417  hypothetical protein  YP_303584  normal  0.41301  normal  0.0644501  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0012  CDS  NC_007355  14637  15467  +  831  hypothetical protein  YP_303585  normal  0.185355  normal  0.165808  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0013    NC_007355  15662  15868  -  207      normal  0.0302029  normal  0.144349  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0014  CDS  NC_007355  16069  16818  -  750  hypothetical protein  YP_303586  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0015  CDS  NC_007355  17373  18968  +  1596  hypothetical protein  YP_303587  normal  0.0181047  normal  0.128631  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0016  CDS  NC_007355  19391  20368  +  978  hypothetical protein  YP_303588  normal  0.054001  normal  0.0319641  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0017  CDS  NC_007355  20774  21610  -  837  transposase, putative  YP_303589  normal  0.0222637  normal  0.0337825  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0018  CDS  NC_007355  21634  21837  -  204  hypothetical protein  YP_303590  normal  0.0148317  normal  0.0289436  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0019  CDS  NC_007355  22195  23232  -  1038  hypothetical protein  YP_303591  normal  0.025798  normal  0.0389064  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0020  CDS  NC_007355  24336  25523  +  1188  hypothetical protein  YP_303592  normal  0.0791294  normal  0.122064  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0021  CDS  NC_007355  25559  26485  +  927  UDP-glucose 4-epimerase  YP_303593  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0022  CDS  NC_007355  26763  28019  +  1257  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  YP_303594  hitchhiker  0.00149727  normal  0.0105744  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0023  CDS  NC_007355  28012  28968  +  957  UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase  YP_303595  hitchhiker  0.0000486691  hitchhiker  0.0088423  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0024    NC_007355  29096  29501  +  406      hitchhiker  0.0000250777  hitchhiker  0.00720701  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0025  CDS  NC_007355  29515  30834  +  1320  hypothetical protein  YP_303596  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0026  CDS  NC_007355  31258  32436  -  1179  hypothetical protein  YP_303597  unclonable  0.00000000112198  hitchhiker  0.00859577  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
 
Mbar_A0027  CDS  NC_007355  32530  34323  -  1794  hypothetical protein  YP_303598  unclonable  0.0000000139812  decreased coverage  0.00503722  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0028  CDS  NC_007355  34516  35637  -  1122  LPS glycosyltransferase  YP_303599  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0029  CDS  NC_007355  35843  37021  -  1179  glycosyltransferase  YP_303600  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0030  CDS  NC_007355  36999  37709  -  711  hypothetical protein  YP_303601  normal  0.0213318  hitchhiker  0.00700368  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0031  CDS  NC_007355  37684  38850  -  1167  hypothetical protein  YP_303602  normal  0.569137  normal  0.0167749  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0032  CDS  NC_007355  38925  39170  -  246  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  YP_303603  normal  1  normal  0.0263982  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0033  CDS  NC_007355  39167  39910  -  744  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  YP_303604  normal  1  normal  0.0326174  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0034  CDS  NC_007355  41341  42462  +  1122  GDP-mannose 4,6 dehydratase  YP_303605  normal  1  normal  0.0188537  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0035  CDS  NC_007355  42516  43454  +  939  GDP-fucose synthetase  YP_303606  normal  1  normal  0.0178713  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0036  CDS  NC_007355  43682  44632  +  951  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  YP_303607  normal  1  normal  0.0174817  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0037  CDS  NC_007355  44947  45408  +  462  GDP-fucose synthetase  YP_303608  normal  0.147777  normal  0.0266748  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0038  CDS  NC_007355  46039  47103  +  1065  transposase, putative  YP_303609  hitchhiker  0.00111468  normal  0.0316372  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0039  CDS  NC_007355  48133  48615  +  483  hypothetical protein  YP_303610  hitchhiker  0.0000394953  normal  0.0123799  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0040  CDS  NC_007355  49408  50715  +  1308  polysaccharide biosynthesis protein  YP_303611  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0041  CDS  NC_007355  50775  52760  +  1986  hypothetical protein  YP_303612  decreased coverage  0.00000803916  normal  0.0100415  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0042  CDS  NC_007355  52987  53367  +  381  hypothetical protein  YP_303613  hitchhiker  0.00000215832  normal  0.0470147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0043  CDS  NC_007355  53358  53696  +  339  hypothetical protein  YP_303614  hitchhiker  0.00000166615  normal  0.0467802  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0044  CDS  NC_007355  53809  53997  -  189  transposase  YP_303615  hitchhiker  0.000000218219  normal  0.0439484  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0045  CDS  NC_007355  53994  54329  -  336  hypothetical protein  YP_303616  decreased coverage  0.0000000482488  normal  0.0447995  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0046  CDS  NC_007355  54551  55108  -  558  hypothetical protein  YP_303617  decreased coverage  0.000000164559  normal  0.0456795  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0047  CDS  NC_007355  55508  56194  -  687  transposase  YP_303618  hitchhiker  0.000000399191  normal  0.0497457  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0048    NC_007355  56266  57786  -  1521      hitchhiker  0.00000779585  normal  0.0579946  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0049  CDS  NC_007355  57944  58420  -  477  transposase  YP_303619  hitchhiker  0.000000288855  normal  0.0409208  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0050  CDS  NC_007355  58755  59837  -  1083  glycosyl transferase  YP_303620  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0051  CDS  NC_007355  59834  61033  -  1200  hypothetical protein  YP_303621  decreased coverage  0.000000151873  hitchhiker  0.00624496  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0052  CDS  NC_007355  61030  62115  -  1086  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  YP_303622  hitchhiker  0.0000167287  hitchhiker  0.0056305  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0053  CDS  NC_007355  62118  63209  -  1092  hypothetical protein  YP_303623  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0054  CDS  NC_007355  63786  65372  -  1587  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  YP_303624  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0055  CDS  NC_007355  66631  67821  +  1191  hypothetical protein  YP_303625  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0056  CDS  NC_007355  68576  68842  -  267  hypothetical protein  YP_303626  normal  0.0629986  normal  0.361701  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0057  CDS  NC_007355  69624  70223  -  600  indolepyruvate oxidoreductase subunit beta  YP_303627  normal  0.43091  normal  0.408867  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0058  CDS  NC_007355  70220  72022  -  1803  indolepyruvate oxidoreductase, subunit  YP_303628  normal  0.602223  normal  0.513175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0059  CDS  NC_007355  72388  73203  -  816  CODH nickel-insertion accessory protein  YP_303629  normal  1  normal  0.79352  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0060  CDS  NC_007355  73851  74516  -  666  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_303630  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0061  CDS  NC_007355  74535  75488  -  954  putative deoxyhypusine synthase  YP_303631  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0062  CDS  NC_007355  75721  76407  +  687  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_303632  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0063  CDS  NC_007355  76536  76886  +  351  transposase  YP_303633  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0064  CDS  NC_007355  77376  77669  -  294  hypothetical protein  YP_303634  normal  1  normal  0.963115  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0065    NC_007355  78249  78731  +  483      normal  0.687249  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0066    NC_007355  79679  79849  +  171      normal  0.692652  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0067  CDS  NC_007355  80478  81038  +  561  hypothetical protein  YP_303635  normal  0.250606  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0068  CDS  NC_007355  81485  81922  +  438  hypothetical protein  YP_303636  normal  0.550883  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0069  CDS  NC_007355  82489  86343  -  3855  hypothetical protein  YP_303637  normal  0.774464  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0070  CDS  NC_007355  86333  87601  -  1269  phosphoesterase  YP_303638  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0071  CDS  NC_007355  88012  88383  -  372  hypothetical protein  YP_303639  normal  0.974204  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0072    NC_007355  89275  90251  -  977      normal  0.736452  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0073  CDS  NC_007355  90290  90778  -  489  MutT/nudix family protein  YP_303640  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0074  CDS  NC_007355  91168  91938  +  771  hypothetical protein  YP_303641  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0075  CDS  NC_007355  92676  93476  -  801  DNA-directed RNA polymerase subunit D  YP_303642  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0076  CDS  NC_007355  93561  93941  -  381  30S ribosomal protein S11P  YP_303643  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0077  CDS  NC_007355  93944  94594  -  651  30S ribosomal protein S4P  YP_303644  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0078  CDS  NC_007355  94617  95105  -  489  30S ribosomal protein S13P  YP_303645  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0079  CDS  NC_007355  95498  96805  +  1308  transposase  YP_303646  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0080  CDS  NC_007355  97069  98637  -  1569  hypothetical protein  YP_303647  normal  1  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0081  CDS  NC_007355  98630  99337  -  708  gliding motility protein  YP_303648  normal  0.450143  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0082  CDS  NC_007355  100178  101194  -  1017  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  YP_303649  normal  0.576501  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0083  CDS  NC_007355  101663  102205  -  543  cytidylate kinase  YP_303650  normal  0.0396405  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0084  CDS  NC_007355  102205  102825  -  621  integral membrane protein  YP_303651  normal  0.0420165  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0085  CDS  NC_007355  103516  103794  -  279  hypothetical protein  YP_303652  hitchhiker  0.008388  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0086  CDS  NC_007355  103975  104622  -  648  adenylate kinase  YP_303653  hitchhiker  0.00306231  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0087  CDS  NC_007355  104707  106185  -  1479  preprotein translocase subunit SecY  YP_303654  normal  0.023527  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0088  CDS  NC_007355  106328  106750  -  423  50S ribosomal protein L15P  YP_303655  normal  0.0238604  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0089  CDS  NC_007355  106761  107222  -  462  50S ribosomal protein L30P  YP_303656  normal  0.0139632  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0090  CDS  NC_007355  107224  107850  -  627  30S ribosomal protein S5P  YP_303657  hitchhiker  0.00484292  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0091  CDS  NC_007355  107860  108384  -  525  50S ribosomal protein L18P  YP_303658  hitchhiker  0.000239035  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0092  CDS  NC_007355  108401  108853  -  453  50S ribosomal protein L19e  YP_303659  hitchhiker  0.00000444774  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0093  CDS  NC_007355  108856  109293  -  438  50S ribosomal protein L32e  YP_303660  decreased coverage  0.0000000176335  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0094  CDS  NC_007355  109304  109837  -  534  50S ribosomal protein L6P  YP_303661  decreased coverage  0.000000167517  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0095  CDS  NC_007355  109855  110247  -  393  30S ribosomal protein S8P  YP_303662  hitchhiker  0.00000305227  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0096  CDS  NC_007355  110258  110410  -  153  30S ribosomal protein S14P  YP_303663  hitchhiker  0.0000254546  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0097  CDS  NC_007355  110411  110920  -  510  50S ribosomal protein L5P  YP_303664  hitchhiker  0.000268421  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0098  CDS  NC_007355  110913  111620  -  708  30S ribosomal protein S4e  YP_303665  hitchhiker  0.00334877  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0099  CDS  NC_007355  111634  111984  -  351  50S ribosomal protein L24P  YP_303666  normal  0.0397567  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0100  CDS  NC_007355  111995  112393  -  399  50S ribosomal protein L14P  YP_303667  normal  0.280775  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>