3920 genes were found for organism Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rru_A0001  CDS  NC_007643  228  1757  +  1530  chromosomal replication initiation protein  YP_425093  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0002  CDS  NC_007643  1992  3110  +  1119  DNA polymerase III subunit beta  YP_425094  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0003  CDS  NC_007643  3170  4297  +  1128  recombination protein F  YP_425095  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0004  CDS  NC_007643  4362  6770  +  2409  DNA gyrase subunit B  YP_425096  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0005  CDS  NC_007643  7184  7528  +  345  killer suppression protein HigA, putative  YP_425097  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0006  CDS  NC_007643  7515  8657  +  1143  plasmid maintenance system antidote protein  YP_425098  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0007  CDS  NC_007643  8763  9104  -  342  hypothetical protein  YP_425099  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0008  CDS  NC_007643  9208  9414  -  207  hypothetical protein  YP_425100  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0009  CDS  NC_007643  9673  10137  -  465  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  YP_425101  normal  0.963845  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0010  CDS  NC_007643  10527  12029  -  1503  RNA polymerase factor sigma-54  YP_425102  normal  0.608534  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0011  CDS  NC_007643  12047  12913  -  867  ABC transporter component  YP_425103  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0012  CDS  NC_007643  12910  13881  -  972  hypothetical protein  YP_425104  normal  0.541863  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0013  CDS  NC_007643  13878  14702  -  825  hypothetical protein  YP_425105  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0014  CDS  NC_007643  14699  15799  -  1101  KpsF/GutQ  YP_425106  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0015  CDS  NC_007643  16232  16852  -  621  3'-5' exonuclease  YP_425107  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0016  CDS  NC_007643  17356  18378  +  1023  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  YP_425108  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0017  CDS  NC_007643  18493  19341  -  849  undecaprenyl-diphosphatase  YP_425109  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0018  CDS  NC_007643  19695  21152  +  1458  putative oxidoreductase  YP_425110  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0019  CDS  NC_007643  21176  25750  +  4575  glutamate synthase (NADPH) large subunit  YP_425111  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0020  CDS  NC_007643  25849  26355  -  507  glutathione peroxidase  YP_425112  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0021  CDS  NC_007643  26352  26888  -  537  MarR family transcriptional regulator  YP_425113  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0022  CDS  NC_007643  27098  27766  +  669  glutathione S-transferase-like protein  YP_425114  normal  0.428941  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0023  CDS  NC_007643  27937  28329  +  393  hypothetical protein  YP_425115  normal  0.121849  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0024  CDS  NC_007643  28454  29599  +  1146  peptidase  YP_425116  normal  0.02023  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0025  CDS  NC_007643  29722  30261  +  540  hypothetical protein  YP_425117  normal  0.0157838  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0026  CDS  NC_007643  30276  31619  +  1344  hypothetical protein  YP_425118  normal  0.154235  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0027  CDS  NC_007643  31626  32333  +  708  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  YP_425119  normal  0.685571  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0028  CDS  NC_007643  32913  33752  -  840  Beta-lactamase-like  YP_425120  normal  0.739364  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0029  CDS  NC_007643  33773  34099  -  327  hypothetical protein  YP_425121  normal  0.935887  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0030  CDS  NC_007643  34106  34651  -  546  hypothetical protein  YP_425122  normal  0.948453  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0031  CDS  NC_007643  34821  35720  +  900  LysR family transcriptional regulator  YP_425123  normal  0.213809  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0032  CDS  NC_007643  35787  37271  -  1485  TPR repeat-containing protein  YP_425124  normal  0.949797  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0033  CDS  NC_007643  37268  37780  -  513  cytochrome C biogenesis protein  YP_425125  decreased coverage  0.00807478  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0034  CDS  NC_007643  37777  38364  -  588  periplasmic protein thiol-disulfide oxidoreductase DsbE  YP_425126  normal  0.0247203  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0035  CDS  NC_007643  38390  40405  -  2016  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  YP_425127  normal  0.836519  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0036  CDS  NC_007643  40491  40952  -  462  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  YP_425128  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0037  CDS  NC_007643  41073  41228  -  156  Heme exporter protein D (CcmD)  YP_425129  normal  0.987653  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0038  CDS  NC_007643  41257  41976  -  720  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  YP_425130  normal  0.56272  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0039  CDS  NC_007643  42142  42810  -  669  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  YP_425131  normal  0.46619  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0040  CDS  NC_007643  42807  43508  -  702  cytochrome c biogenesis protein CcmA  YP_425132  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0041  CDS  NC_007643  43838  44293  -  456  cytochrome c, class II  YP_425133  normal  0.417622  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0042  CDS  NC_007643  44634  45131  +  498  hypothetical protein  YP_425134  normal  0.982405  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0043  CDS  NC_007643  45342  46511  +  1170  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  YP_425135  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0044  CDS  NC_007643  46548  46799  +  252  acyl carrier protein  YP_425136  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0045  CDS  NC_007643  46946  48160  +  1215  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  YP_425137  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0046  CDS  NC_007643  48174  48683  +  510  hypothetical protein  YP_425138  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0047  CDS  NC_007643  48770  50377  -  1608  ABC transporter component  YP_425139  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0048  CDS  NC_007643  50520  51146  -  627  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_425140  normal  0.075881  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0049  CDS  NC_007643  51225  51629  -  405  biotin/lipoyl attachment  YP_425141  normal  0.0152138  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0050  CDS  NC_007643  51626  52033  -  408  hypothetical protein  YP_425142  normal  0.0397716  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0051  CDS  NC_007643  52046  53599  -  1554  carboxyl transferase  YP_425143  normal  0.253581  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0052  CDS  NC_007643  53905  55893  -  1989  biotin carboxylase  YP_425144  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0053  CDS  NC_007643  55947  57479  -  1533  carboxyl transferase  YP_425145  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0054  CDS  NC_007643  58117  60054  +  1938  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  YP_425146  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0055  CDS  NC_007643  60139  61011  -  873  VacJ-like lipoprotein  YP_425147  normal  0.743056  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0056  CDS  NC_007643  61427  62065  +  639  toluene tolerance  YP_425148  normal  0.171728  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0057  CDS  NC_007643  62231  64900  -  2670  hypothetical protein  YP_425149  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0058  CDS  NC_007643  64954  65955  -  1002  dihydrokaempferol 4-reductase  YP_425150  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0059  CDS  NC_007643  66362  67372  +  1011  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  YP_425151  normal  0.174791  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0060  CDS  NC_007643  67641  68804  +  1164  radical SAM family protein  YP_425152  normal  0.0850532  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0061  CDS  NC_007643  68790  69518  -  729  purine phosphorylases family protein 1  YP_425153  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0062  CDS  NC_007643  69560  71530  -  1971  terpene synthase, squalene cyclase  YP_425154  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0063  CDS  NC_007643  71633  72931  -  1299  amine oxidase  YP_425155  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0064  CDS  NC_007643  72940  75003  -  2064  squalene-phytoene synthase  YP_425156  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0065  CDS  NC_007643  75000  75893  -  894  squalene/phytoene synthase  YP_425157  normal  0.114754  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0066  CDS  NC_007643  76073  78394  +  2322  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  YP_425158  normal  0.712477  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0067  CDS  NC_007643  78397  78834  +  438  hypothetical protein  YP_425159  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0068  CDS  NC_007643  78818  79945  -  1128  Alpha/beta hydrolase fold  YP_425160  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0069  CDS  NC_007643  79942  80952  -  1011  ABC transporter component  YP_425161  normal  0.248175  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0070  CDS  NC_007643  81316  82311  -  996  hypothetical protein  YP_425162  normal  0.215988  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0071  CDS  NC_007643  82639  82902  +  264  hypothetical protein  YP_425163  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0072  CDS  NC_007643  83004  84884  -  1881  heat shock protein 90  YP_425164  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0073  CDS  NC_007643  85297  85677  +  381  ribosomal subunit interface protein, putative  YP_425165  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0074  CDS  NC_007643  85794  88994  +  3201  helicase-like  YP_425166  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0075  CDS  NC_007643  88991  89425  +  435  RNA-binding S4  YP_425167  normal  0.0548587  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0076  CDS  NC_007643  89581  90036  +  456  hypothetical protein  YP_425168  normal  0.193644  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0077  CDS  NC_007643  90214  90552  +  339  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  YP_425169  normal  0.278987  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0078  CDS  NC_007643  90639  90914  +  276  hypothetical protein  YP_425170  normal  0.564889  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0079  CDS  NC_007643  91210  91707  +  498  CarD family transcriptional regulator  YP_425171  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0080  CDS  NC_007643  91792  92880  -  1089  chemotaxis sensory transducer  YP_425172  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0081  CDS  NC_007643  93164  94252  -  1089  chemotaxis sensory transducer  YP_425173  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0082  CDS  NC_007643  95041  96120  -  1080  chemotaxis sensory transducer  YP_425174  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0083  CDS  NC_007643  96304  97128  +  825  nuclease, SNase-like  YP_425175  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0084  CDS  NC_007643  97229  98185  +  957  prolyl aminopeptidase  YP_425176  normal  0.826118  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0085  CDS  NC_007643  98274  99635  +  1362  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  YP_425177  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0086  CDS  NC_007643  99635  100087  +  453  hypothetical protein  YP_425178  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0087  CDS  NC_007643  100089  101330  +  1242  hypothetical protein  YP_425179  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0088  CDS  NC_007643  101509  102531  +  1023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  YP_425180  normal  0.211102  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0089  CDS  NC_007643  102652  104541  +  1890  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_425181  normal  0.0181751  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0090  CDS  NC_007643  104817  105059  +  243  prevent-host-death protein  YP_425182  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0091  CDS  NC_007643  105063  105497  +  435  PilT protein-like  YP_425183  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0092  CDS  NC_007643  105873  107150  +  1278  extracellular solute-binding protein  YP_425184  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0093  CDS  NC_007643  107196  108065  +  870  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  YP_425185  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0094  CDS  NC_007643  108062  109000  +  939  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  YP_425186  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0095  CDS  NC_007643  109007  110125  +  1119  ABC transporter component  YP_425187  normal  0.0263152  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0096  CDS  NC_007643  110136  111101  -  966  secretion protein HlyD  YP_425188  normal  0.305304  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0097  CDS  NC_007643  111258  111680  -  423  class I peptide chain release factor  YP_425189  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0098  CDS  NC_007643  111737  112948  -  1212  cystathionine gamma-synthase  YP_425190  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0099  CDS  NC_007643  113029  115020  -  1992  Serine phosphatase  YP_425191  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_A0100  CDS  NC_007643  115035  115379  -  345  hypothetical protein  YP_425192  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>