3503 genes were found for organism Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
RS00235  tRNA  NC_003295  3099357  3099433  -  77  tRNA-Ile    hitchhiker  0.00686486  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00236  tRNA  NC_003295  3036735  3036811  +  77  tRNA-Pro    decreased coverage  0.000000448409  normal  0.197612  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00327  tRNA  NC_003295  3156294  3156369  -  76  tRNA-Thr    normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00330  tRNA  NC_003295  3099245  3099320  -  76  tRNA-Ala    hitchhiker  0.00649993  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00481  rRNA  NC_003295  3099500  3101012  -  1513  16S ribosomal RNA    hitchhiker  0.000211663  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00482  rRNA  NC_003295  3096173  3098990  -  2818  23S ribosomal RNA    normal  0.0128279  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00484  tRNA  NC_003295  3322311  3322386  +  76  tRNA-Arg    normal  0.0490424  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00493  rRNA  NC_003295  3095880  3095993  -  114  5S ribosomal RNA    normal  0.0275686  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS01162  tRNA  NC_003295  2534639  2534728  -  90  tRNA-Ser    normal  1  normal  0.16947  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS01505  tRNA  NC_003295  2399619  2399694  -  76  tRNA-Met    normal  0.946328  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS01506  tRNA  NC_003295  2306303  2306378  +  76  tRNA-Thr    normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS01507  tRNA  NC_003295  2335078  2335154  +  77  tRNA-Arg    unclonable  0.0000000147856  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS01508  tRNA  NC_003295  2344958  2345047  +  90  tRNA-Ser    normal  0.162951  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS01509  tRNA  NC_003295  751241  751314  -  74  tRNA-Gly    normal  0.555954  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS02241  tRNA  NC_003295  90731  90806  +  76  tRNA-Phe    hitchhiker  0.0000057797  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS02400  tRNA  NC_003295  3508439  3508514  -  76  tRNA-Ala    normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS02662  tRNA  NC_003295  2634813  2634897  +  85  tRNA-Leu    normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS02876  tRNA  NC_003295  1386404  1386479  +  76  tRNA-His    normal  0.0313769  normal  0.542312  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS02877  tRNA  NC_003295  1298061  1298145  -  85  tRNA-Leu    hitchhiker  0.0000533754  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS02886  tRNA  NC_003295  1833444  1833519  +  76  tRNA-Val    normal  0.96324  normal  0.0580057  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS02887  tRNA  NC_003295  1833565  1833641  +  77  tRNA-Asp    normal  0.691799  normal  0.0580057  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS03325  tRNA  NC_003295  423052  423128  -  77  tRNA-Gln    hitchhiker  0.0000226692  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS03460  tRNA  NC_003295  2084367  2084457  +  91  tRNA-Ser    normal  0.12073  normal  0.877748  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS03461  tRNA  NC_003295  2236103  2236187  -  85  tRNA-Leu    normal  0.0132208  normal  0.375056  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS03462  tRNA  NC_003295  2056202  2056276  -  75  tRNA-Val    decreased coverage  0.000504437  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS03760  tRNA  NC_003295  1645665  1645741  +  77  tRNA-Pro    normal  1  normal  0.0394187  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS03937  tRNA  NC_003295  1700427  1700503  +  77  tRNA-Pro    normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS03938  tRNA  NC_003295  1781710  1781796  +  87  tRNA-Leu    normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS03939  tRNA  NC_003295  1737601  1737677  -  77  tRNA-Met    normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS03940  tRNA  NC_003295  1737456  1737532  -  77  tRNA-Met    normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04000  tRNA  NC_003295  1170259  1170334  -  76  tRNA-Asn    unclonable  0.0000000234259  normal  0.180711  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04001  tRNA  NC_003295  1170090  1170180  -  91  tRNA-Leu    hitchhiker  0.00000386269  normal  0.176082  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04002  tRNA  NC_003295  1166558  1166633  -  76  tRNA-Lys    hitchhiker  0.0000208325  normal  0.100759  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04003  tRNA  NC_003295  1126367  1126442  +  76  tRNA-Gly    hitchhiker  0.0000136534  normal  0.315468  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04004  tRNA  NC_003295  1126237  1126312  +  76  tRNA-Gly    hitchhiker  0.000000202158  normal  0.305986  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04005  tRNA  NC_003295  1126534  1126607  +  74  tRNA-Cys    hitchhiker  0.0000662406  normal  0.319269  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04383  tRNA  NC_003295  1018649  1018723  -  75  tRNA-Arg    normal  1  normal  0.867935  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04526  tRNA  NC_003295  1241767  1241842  +  76  tRNA-Glu    decreased coverage  0.000000165609  normal  0.307347  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04527  tRNA  NC_003295  1242236  1242311  +  76  tRNA-Glu    hitchhiker  0.00000178572  normal  0.319269  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04528  tRNA  NC_003295  1230833  1230926  +  94  tRNA-Ser    normal  0.0104134  normal  0.589043  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04529  tRNA  NC_003295  1241575  1241650  +  76  tRNA-Ala    unclonable  0.00000000942406  normal  0.305986  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04530  tRNA  NC_003295  1241907  1241983  +  77  tRNA-Asp    hitchhiker  0.00000141295  normal  0.307347  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04531  tRNA  NC_003295  1242044  1242119  +  76  tRNA-Ala    hitchhiker  0.00000151858  normal  0.305986  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04532  tRNA  NC_003295  1242376  1242452  +  77  tRNA-Asp    decreased coverage  0.000000147754  normal  0.326987  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04716  tRNA  NC_003295  3271694  3271769  -  76  tRNA-Trp    normal  1  normal  0.0715561  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04829  tRNA  NC_003295  828199  828274  -  76  tRNA-Cys    normal  0.927375  normal  0.141722  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04831  tRNA  NC_003295  786391  786466  +  76  tRNA-Lys    normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04914  tRNA  NC_003295  591327  591403  -  77  tRNA-Met    normal  0.42096  normal  0.919777  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05228  tRNA  NC_003295  1671069  1671145  -  77  tRNA-Arg    normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05580  rRNA  NC_003295  3277704  3279237  -  1534  16S ribosomal RNA    unclonable  0.00000356691  normal  0.21036  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05581  rRNA  NC_003295  3274322  3277200  -  2879  23S ribosomal RNA    normal  0.0577053  normal  0.256398  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05582  rRNA  NC_003295  3274090  3274203  -  114  5S ribosomal RNA    hitchhiker  0.00903863  normal  0.193951  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05583  tRNA  NC_003295  3277567  3277643  -  77  tRNA-Ala    hitchhiker  0.00137885  normal  0.131541  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05584  tRNA  NC_003295  3277455  3277530  -  76  tRNA-Ile    hitchhiker  0.00134136  normal  0.130887  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05585  tRNA  NC_003295  3273319  3273404  -  86  tRNA-Tyr    hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05586  tRNA  NC_003295  3273188  3273261  -  74  tRNA-Gly    hitchhiker  0.000136136  normal  0.200305  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05587  tRNA  NC_003295  3273093  3273167  -  75  tRNA-Thr    hitchhiker  0.000149657  normal  0.0701364  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05732  tRNA  NC_003295  1534293  1534369  +  77  tRNA-Ile    normal  0.0705135  normal  0.420987  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05733  tRNA  NC_003295  1534406  1534481  +  76  tRNA-Ala    normal  0.0746893  normal  0.61314  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05737  rRNA  NC_003295  1532714  1534226  +  1513  16S ribosomal RNA    unclonable  0.00000227304  normal  0.62291  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05738  rRNA  NC_003295  1534736  1537553  +  2818  23S ribosomal RNA    decreased coverage  0.00792768  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05739  rRNA  NC_003295  1537733  1537846  +  114  5S ribosomal RNA    normal  0.0893083  normal  0.824943  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05795  tRNA  NC_003295  1692085  1692161  +  77  tRNA-OTHER    normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0001  CDS  NC_003295  486  620  +  135  50S ribosomal protein L34  NP_518122  normal  0.549372  normal  0.504139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0002  CDS  NC_003295  718  1113  +  396  ribonuclease P protein component  NP_518123  normal  0.699533  normal  0.546638  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0003  CDS  NC_003295  1110  1424  +  315  hypothetical protein  NP_518124  normal  0.296608  normal  0.77875  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0004  CDS  NC_003295  1431  3092  +  1662  putative inner membrane protein translocase component YidC  NP_518125  normal  0.9905  normal  0.344368  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0005  CDS  NC_003295  3222  4667  +  1446  tRNA modification GTPase TrmE  NP_518126  normal  0.75194  normal  0.209412  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0006  CDS  NC_003295  4757  5080  +  324  hypothetical protein  NP_518127  normal  0.0720243  normal  0.140515  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0007  CDS  NC_003295  5188  5721  +  534  hypothetical protein  NP_518128  normal  1  normal  0.145458  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0008  CDS  NC_003295  6204  6416  -  213  30S ribosomal protein S21  NP_518129  normal  1  normal  0.334489  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0009  CDS  NC_003295  6899  8443  -  1545  drug efflux lipoprotein  NP_518130  normal  0.347699  normal  0.0645676  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0010  CDS  NC_003295  8446  11595  -  3150  putative acriflavin resistance transmembrane protein  NP_518131  normal  0.461171  normal  0.0539399  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0011  CDS  NC_003295  11621  12817  -  1197  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  NP_518132  normal  0.511373  normal  0.0259122  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0012  CDS  NC_003295  13346  14005  +  660  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  NP_518133  normal  0.631075  normal  0.0464367  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0013  CDS  NC_003295  14002  14895  +  894  hypothetical protein  NP_518134  normal  0.822335  normal  0.137415  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0014  CDS  NC_003295  14967  16412  +  1446  glutathione reductase oxidoreductase protein  NP_518135  normal  1  normal  0.288559  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0015  CDS  NC_003295  16566  17456  +  891  hypothetical protein  NP_518136  normal  1  normal  0.245081  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0016  CDS  NC_003295  17482  18543  -  1062  putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase oxidoreductase protein  NP_518137  normal  1  normal  0.258004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0017  CDS  NC_003295  18932  20800  +  1869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  NP_518138  normal  0.982063  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0018  CDS  NC_003295  21645  22484  +  840  response regulator transcription regulator protein  NP_518139  normal  0.0928383  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0019  CDS  NC_003295  22608  23075  +  468  hypothetical protein  NP_518140  normal  0.222969  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0020  CDS  NC_003295  23149  23937  -  789  hypothetical protein  NP_518141  normal  0.138735  normal  0.842888  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0021  CDS  NC_003295  24619  26082  -  1464  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  NP_518142  normal  0.130425  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0022  CDS  NC_003295  26383  28443  +  2061  carbon starvation A transmembrane protein  NP_518143  normal  0.0699392  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0023  CDS  NC_003295  28493  28687  +  195  hypothetical protein  NP_518144  normal  0.104955  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0024  CDS  NC_003295  28773  29531  -  759  putative signal peptide protein  NP_518145  normal  0.0407866  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0025  CDS  NC_003295  29697  30218  -  522  hypothetical protein  NP_518146  normal  0.157214  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0026  CDS  NC_003295  30445  31092  -  648  hypothetical protein  NP_518147  normal  0.366115  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0027  CDS  NC_003295  31089  32300  -  1212  homoserine O-acetyltransferase  NP_518148  normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0028  CDS  NC_003295  32580  34073  -  1494  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  NP_518149  normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0029  CDS  NC_003295  34078  35358  -  1281  4-aminobutyrate aminotransferase protein  NP_518150  normal  1  normal  0.717101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0030  CDS  NC_003295  35476  37005  +  1530  putative transcription regulator protein  NP_518151  normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0031  CDS  NC_003295  37200  37856  -  657  nucleoid occlusion protein  NP_518152  normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0032  CDS  NC_003295  37895  38758  -  864  hypothetical protein  NP_518153  normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0033  CDS  NC_003295  38758  39690  -  933  acetylglutamate kinase  NP_518154  normal  1  normal  1  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0034  CDS  NC_003295  39866  40459  +  594  RNA polymerase sigma factor  NP_518155  normal  1  normal  0.797187  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0035  CDS  NC_003295  40490  40687  +  198  hypothetical protein  NP_518156  normal  1  normal  0.698407  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0036  CDS  NC_003295  40687  40929  +  243  putative signal peptide protein  NP_518157  normal  1  normal  0.990614  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc0037  CDS  NC_003295  40971  41186  -  216  hypothetical protein  NP_518158  normal  1  normal  0.955285  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>