1388 genes were found for organism Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 14    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bxe_C0001  CDS  NC_007953  477  1370  +  894  hypothetical protein  YP_555279  normal  1  normal  0.840453  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0002  CDS  NC_007953  1472  2221  +  750  hypothetical protein  YP_555280  normal  1  normal  0.821198  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0003  CDS  NC_007953  2190  2561  -  372  hypothetical protein  YP_555281  normal  1  normal  0.803139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0004  CDS  NC_007953  2708  6364  +  3657  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  YP_555282  normal  1  normal  0.521135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0005  CDS  NC_007953  6440  7225  +  786  hypothetical protein  YP_555283  normal  1  normal  0.670577  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0006  CDS  NC_007953  7222  8178  +  957  hypothetical protein  YP_555284  normal  1  normal  0.686055  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0007  CDS  NC_007953  8232  9206  +  975  LysR family transcriptional regulator  YP_555285  normal  1  normal  0.702355  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0008  CDS  NC_007953  9459  10556  +  1098  OmpC family outer membrane porin  YP_555286  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0009  CDS  NC_007953  10717  12252  +  1536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_555287  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0010  CDS  NC_007953  12370  13275  -  906  LysR family transcriptional regulator  YP_555288  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0011  CDS  NC_007953  13396  14238  +  843  hypothetical protein  YP_555289  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0012  CDS  NC_007953  14332  15093  +  762  putative short-chain dehydrogenase  YP_555290  normal  1  normal  0.891592  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0013  CDS  NC_007953  15595  17154  +  1560  putative monooxygenase  YP_555291  normal  1  normal  0.738381  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0014    NC_007953  17213  17641  -  429      normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0015  CDS  NC_007953  17726  20269  +  2544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  YP_555292  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0016  CDS  NC_007953  20514  21803  +  1290  hypothetical protein  YP_555293  normal  1  normal  0.986681  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0017  CDS  NC_007953  21847  22848  -  1002  response regulator receiver domain-containing protein  YP_555294  normal  1  normal  0.93116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0018  CDS  NC_007953  22851  24080  -  1230  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_555295  normal  1  normal  0.702355  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0019  CDS  NC_007953  24930  26252  +  1323  putative transposase  YP_555296  normal  0.786306  normal  0.704407  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0020  CDS  NC_007953  26316  27263  +  948  hypothetical protein  YP_555297  normal  1  normal  0.315274  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0021  CDS  NC_007953  27563  28561  -  999  putative integrase  YP_555298  normal  1  normal  0.468061  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0022  CDS  NC_007953  28889  29749  +  861  hypothetical protein  YP_555299  normal  1  normal  0.436551  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0023  CDS  NC_007953  30007  30768  -  762  hypothetical protein  YP_555300  normal  1  normal  0.428755  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0024  CDS  NC_007953  30904  32124  +  1221  hypothetical protein  YP_555301  normal  1  normal  0.199967  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0025  CDS  NC_007953  32134  32820  +  687  hypothetical protein  YP_555302  normal  1  normal  0.276597  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0026  CDS  NC_007953  33148  33414  +  267  hypothetical protein  YP_555303  normal  1  normal  0.381607  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0027  CDS  NC_007953  33416  34015  +  600  hypothetical protein  YP_555304  normal  1  normal  0.389546  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0028  CDS  NC_007953  34233  35036  -  804  CO metabolism transcriptional regulator RcoM2  YP_555305  normal  1  normal  0.28119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0029  CDS  NC_007953  35467  36333  +  867  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  YP_555306  normal  1  normal  0.275591  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0030  CDS  NC_007953  36380  36901  +  522  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  YP_555307  normal  1  normal  0.263402  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0031  CDS  NC_007953  36918  39329  +  2412  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  YP_555308  normal  1  normal  0.392885  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0032  CDS  NC_007953  39430  40050  +  621  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  YP_555309  normal  1  normal  0.262475  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0033  CDS  NC_007953  40066  40959  +  894  putative ATPase  YP_555310  normal  1  normal  0.273348  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0034  CDS  NC_007953  40953  42155  +  1203  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  YP_555311  normal  1  normal  0.29775  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0035  CDS  NC_007953  42166  43206  +  1041  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  YP_555312  normal  1  normal  0.168888  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0036  CDS  NC_007953  43203  43880  +  678  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  YP_555313  normal  1  normal  0.251562  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0037  CDS  NC_007953  43906  44289  -  384  hypothetical protein  YP_555314  normal  1  normal  0.237773  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0038  CDS  NC_007953  44434  45498  -  1065  high-affinity nickel transporter  YP_555315  normal  1  normal  0.178689  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0039  CDS  NC_007953  45639  46097  +  459  CopG family transcriptional regulator  YP_555316  normal  1  normal  0.248709  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0040  CDS  NC_007953  46310  46687  +  378  hypothetical protein  YP_555317  normal  1  normal  0.233973  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0041  CDS  NC_007953  46777  49242  +  2466  putative TonB-dependent siderophore receptor  YP_555318  normal  1  normal  0.130227  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0042  CDS  NC_007953  49331  50182  -  852  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  YP_555319  normal  1  normal  0.147617  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0043  CDS  NC_007953  50251  51843  -  1593  F0F1 ATP synthase subunit alpha  YP_555320  normal  1  normal  0.112939  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0044  CDS  NC_007953  51824  52570  -  747  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  YP_555321  normal  1  normal  0.103527  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0045  CDS  NC_007953  52584  52832  -  249  F0F1 ATP synthase subunit C  YP_555322  normal  1  normal  0.0943976  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0046  CDS  NC_007953  52829  53527  -  699  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_555323  normal  0.959429  normal  0.103527  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0047  CDS  NC_007953  53801  54112  -  312  putative ATP synthesis-related protein  YP_555324  normal  1  normal  0.0553479  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0048  CDS  NC_007953  54109  54528  -  420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  YP_555325  normal  1  normal  0.0316883  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0049  CDS  NC_007953  54525  56006  -  1482  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_555326  normal  0.80814  normal  0.0410809  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0050  CDS  NC_007953  56010  56783  -  774  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  YP_555327  normal  1  normal  0.0341246  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0051  CDS  NC_007953  56780  57973  -  1194  acetate kinase  YP_555328  normal  0.942272  normal  0.0351432  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0052  CDS  NC_007953  57970  59376  -  1407  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  YP_555329  normal  0.70674  normal  0.03837  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0053  CDS  NC_007953  59386  61182  -  1797  putative poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  YP_555330  normal  1  normal  0.0213519  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0054  CDS  NC_007953  61363  61746  -  384  hypothetical protein  YP_555331  normal  0.764785  normal  0.0150082  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0055  CDS  NC_007953  61778  63175  +  1398  GntR family transcriptional regulator  YP_555332  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0056  CDS  NC_007953  63364  64398  +  1035  threonine dehydratase  YP_555333  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0057  CDS  NC_007953  64395  65396  +  1002  ectoine utilization protein EutC  YP_555334  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0058  CDS  NC_007953  65505  66554  +  1050  hypothetical protein  YP_555335  normal  0.630853  hitchhiker  0.00778397  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0059  CDS  NC_007953  66564  67055  +  492  AsnC family transcriptional regulator  YP_555336  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0060  CDS  NC_007953  67198  68721  +  1524  succinate semialdehyde dehydrogenase  YP_555337  normal  0.455704  hitchhiker  0.00355427  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0061  CDS  NC_007953  68762  70159  +  1398  hypothetical protein  YP_555338  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0062  CDS  NC_007953  70323  71417  -  1095  putative Zinc-binding dehydrogenase  YP_555339  normal  1  hitchhiker  0.00315671  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0063  CDS  NC_007953  71489  72709  -  1221  putative peptidase  YP_555340  normal  1  hitchhiker  0.00717092  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0064  CDS  NC_007953  73245  74030  +  786  polar amino acid ABC transporter ATPase  YP_555341  normal  1  hitchhiker  0.00684363  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0065  CDS  NC_007953  74087  74929  +  843  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_555342  normal  1  hitchhiker  0.00302085  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0066  CDS  NC_007953  75004  75663  +  660  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  YP_555343  normal  0.543633  hitchhiker  0.00283643  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0067  CDS  NC_007953  75668  76327  +  660  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  YP_555344  normal  0.142036  hitchhiker  0.00708692  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0068  CDS  NC_007953  76331  77110  +  780  putative isomerase  YP_555345  normal  0.0925133  hitchhiker  0.00725585  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0069  CDS  NC_007953  77191  78528  +  1338  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  YP_555346  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0070  CDS  NC_007953  78946  79629  +  684  hypothetical protein  YP_555347  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0071    NC_007953  79787  80197  +  411      normal  1  hitchhiker  0.00820265  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0072  CDS  NC_007953  80250  81956  -  1707  GAF sensor hybrid histidine kinase  YP_555348  normal  1  hitchhiker  0.00516402  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0073  CDS  NC_007953  82059  82310  -  252  hypothetical protein  YP_555349  normal  0.51571  hitchhiker  0.00271379  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0074  CDS  NC_007953  82361  82870  +  510  hypothetical protein  YP_555350  normal  0.809247  hitchhiker  0.00118298  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0075  CDS  NC_007953  82954  84057  +  1104  hypothetical protein  YP_555351  normal  0.652884  hitchhiker  0.00157318  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0076  CDS  NC_007953  84153  85403  +  1251  putative phosphatidylserine decarboxylase  YP_555352  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0077  CDS  NC_007953  85507  86643  -  1137  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  YP_555353  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0078  CDS  NC_007953  86964  87917  +  954  putative Zinc-binding dehydrogenase  YP_555354  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0079  CDS  NC_007953  88074  89102  +  1029  putative cytochrome c oxidase subunit II  YP_555355  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0080  CDS  NC_007953  89132  91174  +  2043  putative cytochrome c oxidase subunit I  YP_555356  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0081  CDS  NC_007953  91176  91829  +  654  putative cytochrome c oxidase subunit III  YP_555357  normal  0.379927  normal  0.0255884  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0082  CDS  NC_007953  91814  92239  +  426  hypothetical protein  YP_555358  normal  0.864683  normal  0.0238826  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0083  CDS  NC_007953  92242  93663  +  1422  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  YP_555359  normal  1  normal  0.0300779  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0084  CDS  NC_007953  93861  96155  -  2295  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  YP_555360  normal  0.061607  normal  0.113521  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0085  CDS  NC_007953  96282  97133  -  852  taurine ABC transporter inner membrane protein  YP_555361  normal  0.664827  normal  0.135193  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0086  CDS  NC_007953  97130  97924  -  795  ABC taurine transporter, ATPase subunit  YP_555362  normal  0.445597  normal  0.233394  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0087  CDS  NC_007953  97921  98943  -  1023  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  YP_555363  normal  0.191531  normal  0.368778  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0088  CDS  NC_007953  99417  100823  +  1407  putative selenium binding protein  YP_555364  normal  0.135423  normal  0.395764  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0089  CDS  NC_007953  100820  101497  +  678  hypothetical protein  YP_555365  normal  0.081156  normal  0.324813  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0090  CDS  NC_007953  101700  102887  -  1188  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_555366  normal  0.0960253  normal  0.350813  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0091  CDS  NC_007953  103004  103579  -  576  alkylhydroperoxidase-related  YP_555367  normal  0.336937  normal  0.314057  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0092  CDS  NC_007953  103576  104145  -  570  hypothetical protein  YP_555368  normal  1  normal  0.318998  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0093  CDS  NC_007953  104198  105694  -  1497  putative oxidoreductase  YP_555369  normal  1  normal  0.256628  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0094  CDS  NC_007953  105691  106671  -  981  LysR family transcriptional regulator  YP_555370  normal  1  normal  0.22128  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0095  CDS  NC_007953  107022  108221  +  1200  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_555371  normal  1  normal  0.237273  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0096  CDS  NC_007953  108268  110091  +  1824  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  YP_555372  normal  1  normal  0.26664  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0097  CDS  NC_007953  110102  111010  +  909  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  YP_555373  normal  1  normal  0.232532  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0098  CDS  NC_007953  111007  111795  +  789  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  YP_555374  normal  1  normal  0.359537  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0099  CDS  NC_007953  111916  112749  -  834  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  YP_555375  normal  0.291864  normal  0.355691  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_C0100  CDS  NC_007953  112742  113932  -  1191  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_555376  normal  0.227114  normal  0.537489  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 14    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>