3047 genes were found for organism Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bxe_B0001  CDS  NC_007952  3358239  3358523  -  285  hypothetical protein  YP_555273  hitchhiker  0.00000000106232  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0002  CDS  NC_007952  3357958  3358239  -  282  hypothetical protein  YP_555272  hitchhiker  0.000000000070274  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0003  CDS  NC_007952  3357414  3357788  -  375  hypothetical protein  YP_555271  decreased coverage  0.00000000000454563  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0004  CDS  NC_007952  3356632  3357186  -  555  hypothetical protein  YP_555270  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0005  CDS  NC_007952  3355536  3356534  +  999  hypothetical protein  YP_555269  hitchhiker  0.0000000781712  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0006  CDS  NC_007952  3353019  3355298  +  2280  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  YP_555268  normal  0.0137592  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0007  CDS  NC_007952  3351936  3352304  -  369  response regulator receiver domain-containing protein  YP_555267  normal  0.0579548  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0008  CDS  NC_007952  3351320  3351943  -  624  CheC, inhibitor of MCP methylation  YP_555266  normal  0.0503368  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0009  CDS  NC_007952  3350385  3351323  -  939  diguanylate cyclase  YP_555265  normal  0.214527  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0010  CDS  NC_007952  3349264  3350184  -  921  putative squalene/phytoene synthase  YP_555264  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0011  CDS  NC_007952  3347991  3349259  -  1269  hypothetical protein  YP_555263  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0012  CDS  NC_007952  3345958  3347994  -  2037  Terpene synthase  YP_555262  normal  0.131219  normal  0.786968  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0013  CDS  NC_007952  3345223  3345954  -  732  hypothetical protein  YP_555261  normal  0.520406  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0014  CDS  NC_007952  3344104  3345120  +  1017  putative VacJ-like lipoprotein  YP_555260  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0015  CDS  NC_007952  3341486  3344101  +  2616  hypothetical protein  YP_555259  normal  1  normal  0.676074  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0016  CDS  NC_007952  3340668  3341273  -  606  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  YP_555258  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0017  CDS  NC_007952  3339392  3340546  +  1155  MoaA/NifB/PqqE family protein  YP_555257  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0018  CDS  NC_007952  3338437  3339381  +  945  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  YP_555256  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0019  CDS  NC_007952  3337230  3338096  -  867  putative squalene/phytoene synthase  YP_555255  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0020  CDS  NC_007952  3336058  3337230  -  1173  glycosyl transferase family protein  YP_555254  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0021    NC_007952  3335452  3335997  +  546      normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0022  CDS  NC_007952  3334304  3335314  +  1011  hypothetical protein  YP_555253  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0023  CDS  NC_007952  3333798  3334091  -  294  acylphosphatase  YP_555252  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0024  CDS  NC_007952  3332716  3333696  +  981  hypothetical protein  YP_555251  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0025  CDS  NC_007952  3331252  3332148  -  897  RarD protein  YP_555250  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0026  CDS  NC_007952  3330662  3331201  +  540  hypothetical protein  YP_555249  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0027  CDS  NC_007952  3329857  3330570  -  714  Crp/FNR family transcriptional regulator  YP_555248  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0028  CDS  NC_007952  3329076  3329702  -  627  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  YP_555247  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0029  CDS  NC_007952  3328146  3329030  +  885  putative dihydrodipicolinate synthase  YP_555246  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0030  CDS  NC_007952  3327622  3328143  +  522  hypothetical protein  YP_555245  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0031  CDS  NC_007952  3327158  3327538  +  381  hypothetical protein  YP_555244  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0032  CDS  NC_007952  3326748  3327008  +  261  hypothetical protein  YP_555243  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0033    NC_007952  3326342  3326755  +  414      normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0034  CDS  NC_007952  3325360  3326055  +  696  hypothetical protein  YP_555242  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0035  CDS  NC_007952  3322304  3325360  +  3057  putative Phage integrase  YP_555241  normal  1  normal  0.972071  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0036  CDS  NC_007952  3320919  3322307  +  1389  hypothetical protein  YP_555240  normal  1  normal  0.693269  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0037  CDS  NC_007952  3319276  3320106  +  831  putative alpha/beta hydrolase  YP_555239  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0038  CDS  NC_007952  3318681  3319154  -  474  hypothetical protein  YP_555238  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0039  CDS  NC_007952  3318102  3318620  -  519  hypothetical protein  YP_555237  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0040  CDS  NC_007952  3316870  3318105  -  1236  major facilitator transporter  YP_555236  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0041  CDS  NC_007952  3315933  3316799  -  867  IclR family transcriptional regulator  YP_555235  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0042  CDS  NC_007952  3314773  3315504  +  732  hypothetical protein  YP_555234  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0043  CDS  NC_007952  3313744  3314040  -  297  XRE family transcriptional regulator  YP_555233  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0044  CDS  NC_007952  3313436  3313729  -  294  hypothetical protein  YP_555232  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0045  CDS  NC_007952  3313091  3313330  -  240  hypothetical protein  YP_555231  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0046  CDS  NC_007952  3312654  3312920  -  267  hypothetical protein  YP_555230  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0047  CDS  NC_007952  3311766  3312557  +  792  hypothetical protein  YP_555229  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0048  CDS  NC_007952  3310918  3311421  -  504  hypothetical protein  YP_555228  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0049  CDS  NC_007952  3310515  3310790  -  276  hypothetical protein  YP_555227  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0050  CDS  NC_007952  3309247  3310506  -  1260  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  YP_555226  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0051  CDS  NC_007952  3308858  3309166  -  309  hypothetical protein  YP_555225  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0052  CDS  NC_007952  3307756  3308778  +  1023  putative transposase  YP_555224  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0053    NC_007952  3306984  3307724  +  741      normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0054  CDS  NC_007952  3305582  3306793  -  1212  major facilitator transporter  YP_555223  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0055  CDS  NC_007952  3304952  3305554  -  603  undecaprenyl-diphosphatase  YP_555222  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0056  CDS  NC_007952  3303376  3304356  +  981  transcriptional activator FtrA  YP_555221  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0057  CDS  NC_007952  3302307  3303254  -  948  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  YP_555220  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0058  CDS  NC_007952  3300706  3302241  -  1536  histidine ammonia-lyase  YP_555219  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0059  CDS  NC_007952  3299028  3300533  -  1506  hypothetical protein  YP_555218  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0060  CDS  NC_007952  3298594  3298950  -  357  hypothetical protein  YP_555217  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0061  CDS  NC_007952  3297424  3298563  -  1140  OmpC family outer membrane porin  YP_555216  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0062  CDS  NC_007952  3295692  3297227  -  1536  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  YP_555215  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0063  CDS  NC_007952  3294706  3295653  -  948  ABC nickel transporter, inner membrane subunit  YP_555214  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0064  CDS  NC_007952  3293808  3294704  -  897  ABC nickel transporter, inner membrane subunit  YP_555213  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0065  CDS  NC_007952  3292780  3293808  -  1029  ABC nickel transporter, ATPase subunit  YP_555212  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0066  CDS  NC_007952  3291830  3292747  -  918  ABC nickel transporter, ATPase subunit  YP_555211  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0067    NC_007952  3291083  3291508  -  426      normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0068  CDS  NC_007952  3290657  3291181  +  525  hypothetical protein  YP_555210  normal  0.739419  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0069  CDS  NC_007952  3289044  3290198  +  1155  peptidase M20D, amidohydrolase  YP_555209  normal  0.53846  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0070  CDS  NC_007952  3288646  3288975  +  330  hypothetical protein  YP_555208  normal  0.382879  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0071  CDS  NC_007952  3287475  3288617  +  1143  OmpC family outer membrane porin  YP_555207  normal  0.192485  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0072  CDS  NC_007952  3286647  3287387  +  741  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  YP_555206  normal  0.766775  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0073  CDS  NC_007952  3285758  3286660  +  903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  YP_555205  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0074  CDS  NC_007952  3283394  3285742  +  2349  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  YP_555204  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0075  CDS  NC_007952  3282898  3283401  +  504  putative carbon monoxide dehydrogenase, small chain CutC  YP_555203  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0076  CDS  NC_007952  3282025  3282885  +  861  putative carbon monoxide dehydrogenase medium subunit  YP_555202  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0077  CDS  NC_007952  3280924  3282021  +  1098  ABC sugar transporter, ATPase subunit  YP_555201  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0078  CDS  NC_007952  3280032  3280913  +  882  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  YP_555200  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0079  CDS  NC_007952  3279114  3280028  +  915  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  YP_555199  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0080  CDS  NC_007952  3277783  3279111  +  1329  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  YP_555198  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0081  CDS  NC_007952  3276727  3277422  +  696  TetR family transcriptional regulator  YP_555197  normal  0.672358  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0082  CDS  NC_007952  3275154  3276623  -  1470  L-serine ammonia-lyase  YP_555196  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0083  CDS  NC_007952  3274220  3274885  -  666  hypothetical protein  YP_555195  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0084  CDS  NC_007952  3273413  3274030  -  618  TetR family transcriptional regulator  YP_555194  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0085  CDS  NC_007952  3272286  3273332  -  1047  putative norsolorinic acid reductase  YP_555193  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0086  CDS  NC_007952  3271425  3272276  -  852  hypothetical protein  YP_555192  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0087    NC_007952  3270873  3271262  -  390      normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0088  CDS  NC_007952  3270015  3270791  -  777  hypothetical protein  YP_555191  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0089  CDS  NC_007952  3269819  3269950  -  132  hypothetical protein  YP_555190  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0090  CDS  NC_007952  3268966  3269316  -  351  flagellar hook-basal body complex protein FliE  YP_555189  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0091  CDS  NC_007952  3268650  3268910  -  261  hypothetical protein  YP_555188  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0092  CDS  NC_007952  3267064  3268302  -  1239  chromate transporter  YP_555187  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0093  CDS  NC_007952  3266445  3266711  +  267  hypothetical protein  YP_555186  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0094  CDS  NC_007952  3266004  3266402  +  399  hypothetical protein  YP_555185  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0095  CDS  NC_007952  3265590  3265835  -  246  hypothetical protein  YP_555184  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0096    NC_007952  3264974  3265195  +  222      normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0097    NC_007952  3263814  3265043  +  1230      normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0098  CDS  NC_007952  3262940  3263515  -  576  putative cytochrome B561  YP_555183  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0099  CDS  NC_007952  3262389  3262871  -  483  putative nodulin-related protein  YP_555182  normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B0100    NC_007952  3262240  3262410  -  171      normal  1  normal  1  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>