4608 genes were found for organism Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 47    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bxe_A0001  CDS  NC_007951  4845684  4846889  1206  hypothetical protein  YP_560978  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0002  CDS  NC_007951  4844410  4845525  1116  carboxylate-amine ligase  YP_560977  normal  0.250295  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0003  CDS  NC_007951  4843234  4843872  639  MarR family transcriptional regulator  YP_560976  normal  0.0838682  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0004  CDS  NC_007951  4842393  4843106  714  glutamine amidotransferase  YP_560975  normal  0.829136  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0005  CDS  NC_007951  4841207  4842319  1113  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  YP_560974  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0006  CDS  NC_007951  4840465  4840989  525  hypothetical protein  YP_560973  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0007  CDS  NC_007951  4838896  4840398  1503  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  YP_560972  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0008  CDS  NC_007951  4838053  4838739  687  two component transcriptional regulator  YP_560971  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0009  CDS  NC_007951  4837589  4837813  225  hypothetical protein  YP_560970  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0010  CDS  NC_007951  4837195  4837485  291  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  YP_560969  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0011  CDS  NC_007951  4836081  4837091  1011  phenylalanine 4-monooxygenase  YP_560968  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0012  CDS  NC_007951  4835560  4836066  507  AsnC family transcriptional regulator  YP_560967  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0013  CDS  NC_007951  4834956  4835492  537  putative adenylate cyclase  YP_560966  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0014  CDS  NC_007951  4833706  4834605  900  LysR family transcriptional regulator  YP_560965  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0015  CDS  NC_007951  4832024  4833562  1539  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  YP_560964  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0016  CDS  NC_007951  4830181  4831896  1716  GMC family oxidoreductase  YP_560963  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0017  CDS  NC_007951  4829113  4829904  792  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  YP_560962  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0018  CDS  NC_007951  4828358  4829116  759  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  YP_560961  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0019  CDS  NC_007951  4827090  4828304  1215  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_560960  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0020  CDS  NC_007951  4826018  4826902  885  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  YP_560959  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0021  CDS  NC_007951  4825047  4826018  972  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  YP_560958  normal  0.901563  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0022  CDS  NC_007951  4824565  4824816  252  hypothetical protein  YP_560957  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0023  CDS  NC_007951  4823348  4824514  1167  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_560956  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0024  CDS  NC_007951  4821820  4822980  1161  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_560955  normal  0.471864  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0025  CDS  NC_007951  4820559  4821614  1056  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  YP_560954  normal  0.746489  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0026  CDS  NC_007951  4818770  4820554  1785  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  YP_560953  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0027  CDS  NC_007951  4818006  4818770  765  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  YP_560952  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0028  CDS  NC_007951  4815874  4817832  1959  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_560951  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0029  CDS  NC_007951  4815194  4815877  684  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_560950  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0030  CDS  NC_007951  4814318  4815109  792  chromosome segregation ATPase  YP_560949  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0031  CDS  NC_007951  4813412  4814299  888  chromosome segregation DNA-binding protein  YP_560948  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0032  CDS  NC_007951  4812690  4812962  273  hypothetical protein  YP_560947  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0033  CDS  NC_007951  4812023  4812568  546  putative ATP synthase protein I  YP_560946  normal  0.337462  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0034  CDS  NC_007951  4810995  4811846  852  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_560945  normal  0.0259709  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0035  CDS  NC_007951  4810642  4810911  270  F0F1 ATP synthase subunit C  YP_560944  decreased coverage  0.00371718  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0036  CDS  NC_007951  4810033  4810503  471  F0F1 ATP synthase subunit B  YP_560943  decreased coverage  0.00144365  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0037  CDS  NC_007951  4809491  4810030  540  F0F1 ATP synthase subunit delta  YP_560942  normal  0.0129228  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0038  CDS  NC_007951  4807891  4809432  1542  F0F1 ATP synthase subunit alpha  YP_560941  normal  0.266333  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0039  CDS  NC_007951  4806866  4807750  885  F0F1 ATP synthase subunit gamma  YP_560940  normal  0.0292882  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0040  CDS  NC_007951  4805371  4806765  1395  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_560939  normal  0.0581071  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0041  CDS  NC_007951  4804839  4805264  426  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  YP_560938  normal  0.952205  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0042  CDS  NC_007951  4802878  4804608  1731  AMP-binding domain protein  YP_560937  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0043  CDS  NC_007951  4801203  4802000  798  cyclohexadienyl dehydratase  YP_560936  normal  0.561569  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0044  CDS  NC_007951  4799885  4800985  1101  uroporphyrinogen decarboxylase  YP_560935  normal  0.629756  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0045  CDS  NC_007951  4797168  4799411  2244  primosome assembly protein PriA  YP_560934  normal  0.493665  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0046  CDS  NC_007951  4795576  4796997  1422  hypothetical protein  YP_560933  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0047  CDS  NC_007951  4795015  4795431  417  hypothetical protein  YP_560932  normal  0.725649  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0048  CDS  NC_007951  4794707  4795003  297  hypothetical protein  YP_560931  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0049  CDS  NC_007951  4790785  4794714  3930  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  YP_560930  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0050  CDS  NC_007951  4789550  4790698  1149  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_560929  normal  0.143388  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0051  CDS  NC_007951  4787687  4789411  1725  thiamine pyrophosphate protein  YP_560928  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0052  CDS  NC_007951  4786082  4787470  1389  L-serine ammonia-lyase  YP_560927  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0053  CDS  NC_007951  4784922  4786052  1131  hypothetical protein  YP_560926  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0054  CDS  NC_007951  4781846  4784782  2937  glycine dehydrogenase  YP_560925  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0055  CDS  NC_007951  4781390  4781770  381  glycine cleavage system protein H  YP_560924  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0056  CDS  NC_007951  4780171  4781325  1155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  YP_560923  normal  0.298733  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0057  CDS  NC_007951  4778915  4779718  804  hypothetical protein  YP_560922  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0058  CDS  NC_007951  4778474  4778824  351  putative lipoprotein  YP_560921  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0059  CDS  NC_007951  4777209  4778258  1050  putative oxidoreductase  YP_560920  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0060  CDS  NC_007951  4774793  4776883  2091  ATP-dependent DNA helicase Rep  YP_560919  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0061  CDS  NC_007951  4773782  4774678  897  cytochrome c family protein  YP_560918  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0062  CDS  NC_007951  4772515  4773210  696  hypothetical protein  YP_560917  normal  normal  0.713736  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0063  CDS  NC_007951  4772024  4772491  468  putative transposase  YP_560916  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0064    NC_007951  4771671  4772024  354      normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0065  CDS  NC_007951  4770001  4771581  1581  putative transposase  YP_560915  normal  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0066  CDS  NC_007951  4768887  4769984  1098  hypothetical protein  YP_560914  normal  normal  0.795882  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0067  CDS  NC_007951  4767825  4768454  630  putative transposase IS4  YP_560913  normal  normal  0.724266  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0068  CDS  NC_007951  4767287  4767658  372  hypothetical protein  YP_560912  normal  normal  0.437639  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0069  CDS  NC_007951  4766828  4767127  300  hypothetical protein  YP_560911  normal  normal  0.277595  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0070  CDS  NC_007951  4765039  4766550  1512  transposase  YP_560910  normal  normal  0.177477  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0071  CDS  NC_007951  4764240  4765049  810  putative insertion sequence ATP-binding protein  YP_560909  normal  normal  0.158557  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0072  CDS  NC_007951  4763445  4763978  534  hypothetical protein  YP_560908  normal  normal  0.25029  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0073  CDS  NC_007951  4762863  4763390  528  putative ISRSO11-transposase orfA protein  YP_560907  normal  normal  0.145721  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0074    NC_007951  4762243  4762836  594      normal  normal  0.140984  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0075    NC_007951  4762019  4762246  228      normal  normal  0.222144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0076  CDS  NC_007951  4761280  4761879  600  hypothetical protein  YP_560906  normal  normal  0.230149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0077  CDS  NC_007951  4759607  4761187  1581  putative ISPpu13, transposase Orf2  YP_560905  normal  normal  0.247033  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0079  CDS  NC_007951  4759164  4759517  354  hypothetical protein  YP_560904  normal  normal  0.191673  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0080  CDS  NC_007951  4758640  4759164  525  putative ISPpu14, transposase Orf1  YP_560903  normal  normal  0.195214  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0081  CDS  NC_007951  4757734  4758552  819  putative insertion sequence ATP-binding protein  YP_560902  normal  normal  0.35432  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0082  CDS  NC_007951  4756244  4757737  1494  transposase  YP_560901  normal  normal  0.370668  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0083  CDS  NC_007951  4754434  4755552  1119  hypothetical protein  YP_560900  normal  0.292809  normal  0.491458  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0084  CDS  NC_007951  4753691  4754428  738  hypothetical protein  YP_560899  normal  0.29324  normal  0.713215  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0085  CDS  NC_007951  4751120  4753669  2550  hypothetical protein  YP_560898  normal  0.0321951  normal  0.899584  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0086  CDS  NC_007951  4750031  4751038  1008  ATPase  YP_560897  normal  0.244566  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0087  CDS  NC_007951  4749663  4749935  273  hypothetical protein  YP_560896  normal  0.380232  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0088  CDS  NC_007951  4748153  4748674  522  hypothetical protein  YP_560895  normal  0.100893  normal  0.732362  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0089  CDS  NC_007951  4746767  4747777  1011  sodium/calcium antiporter  YP_560894  normal  normal  0.770977  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0090  CDS  NC_007951  4745608  4746684  1077  nonspecific acid phosphatase precursor  YP_560893  normal  normal  0.800809  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0091  CDS  NC_007951  4744960  4745466  507  hypothetical protein  YP_560892  normal  0.946921  normal  0.489141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0092  CDS  NC_007951  4743533  4744537  1005  hypothetical protein  YP_560891  normal  0.672977  normal  0.778879  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0093  CDS  NC_007951  4742254  4743345  1092  putative benzoate 1,2-dioxygenase alpha subunit  YP_560890  normal  0.353624  normal  0.340117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0094  CDS  NC_007951  4741620  4742252  633  putative acetyltransferase  YP_560889  normal  normal  0.315578  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0095  CDS  NC_007951  4740856  4741620  765  putative short chain dehydrogenase  YP_560888  normal  normal  0.750807  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0096  CDS  NC_007951  4739795  4740859  1065  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) synthase  YP_560887  normal  normal  0.795043  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0097  CDS  NC_007951  4739518  4739784  267  putative acyl carrier protein  YP_560886  normal  normal  0.713215  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0098  CDS  NC_007951  4738505  4739545  1041  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) synthase  YP_560885  normal  normal  0.795043  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0099  CDS  NC_007951  4737357  4738502  1146  putative transferase  YP_560884  normal  normal  0.816598  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0100  CDS  NC_007951  4734988  4737360  2373  TPR domain-containing protein  YP_560883  normal  normal  0.990506  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0101  CDS  NC_007951  4734408  4734722  315  hypothetical protein  YP_560882  normal  normal  0.732362  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 47    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>