6623 genes were found for organism Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 67    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rmet_0001  CDS  NC_007973  104  1843  +  1740  chromosomal replication initiation protein  YP_582156  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0002  CDS  NC_007973  2220  3335  +  1116  DNA polymerase III subunit beta  YP_582157  normal  0.453135  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0003  CDS  NC_007973  3521  6046  +  2526  DNA gyrase subunit B  YP_582158  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0004  CDS  NC_007973  6990  8099  +  1110  hypothetical protein  YP_582159  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0005  CDS  NC_007973  8367  10121  -  1755  twin-arginine translocation pathway signal  YP_582160  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0006  CDS  NC_007973  10260  11189  -  930  hypothetical protein  YP_582161  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0007  CDS  NC_007973  11295  12113  -  819  AraC family transcriptional regulator  YP_582162  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0008  CDS  NC_007973  12151  13038  -  888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_582163  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0009  CDS  NC_007973  13040  13972  -  933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_582164  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0010  CDS  NC_007973  13969  15006  -  1038  ABC transporter-related protein  YP_582165  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0011  CDS  NC_007973  15026  16420  -  1395  twin-arginine translocation pathway signal  YP_582166  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0012  CDS  NC_007973  16618  17277  -  660  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  YP_582167  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0013  CDS  NC_007973  17396  17752  +  357  hypothetical protein  YP_582168  normal  0.995444  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0014  CDS  NC_007973  17884  18834  +  951  hypothetical protein  YP_582169  normal  0.767606  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0015  CDS  NC_007973  18848  19531  +  684  DEAD/DEAH box helicase-like protein  YP_582170  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0016  CDS  NC_007973  19721  20161  +  441  signal-transduction protein  YP_582171  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0017  CDS  NC_007973  20369  21955  +  1587  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_582172  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0018  CDS  NC_007973  22066  22692  +  627  glutathione peroxidase  YP_582173  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0019  CDS  NC_007973  22853  23626  +  774  beta-lactamase-like protein  YP_582174  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0020  CDS  NC_007973  23692  24558  +  867  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  YP_582175  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0021  CDS  NC_007973  24791  26068  +  1278  peptidase M20D, amidohydrolase  YP_582176  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0022  CDS  NC_007973  26084  26902  -  819  AraC family transcriptional regulator  YP_582177  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0023  CDS  NC_007973  27028  28257  +  1230  major facilitator transporter  YP_582178  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0024  CDS  NC_007973  28320  29636  -  1317  glutamate carboxypeptidase  YP_582179  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0025  CDS  NC_007973  29809  30120  +  312  hypothetical protein  YP_582180  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0026  CDS  NC_007973  30161  31252  +  1092  hypothetical protein  YP_582181  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0027  CDS  NC_007973  31311  32078  -  768  two component transcriptional regulator  YP_582182  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0028  CDS  NC_007973  32264  33070  +  807  two component transcriptional regulator  YP_582183  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0029  CDS  NC_007973  33083  33877  -  795  porin  YP_582184  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0030  CDS  NC_007973  33977  34276  +  300  transposase IS3/IS911  YP_582185  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0031  CDS  NC_007973  34273  35166  +  894  integrase catalytic subunit  YP_582186  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0032  CDS  NC_007973  35163  35498  -  336  porin  YP_582187  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0033  CDS  NC_007973  35919  36173  -  255  cell division topological specificity factor MinE  YP_582188  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0034  CDS  NC_007973  36189  37001  -  813  septum site-determining protein MinD  YP_582189  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0035  CDS  NC_007973  37050  37898  -  849  septum formation inhibitor  YP_582190  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0036  CDS  NC_007973  37986  39068  +  1083  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  YP_582191  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0037  CDS  NC_007973  39303  39551  -  249  hypothetical protein  YP_582192  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0038  CDS  NC_007973  39542  41374  +  1833  potassium-transporting ATPase subunit A  YP_582193  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0039  CDS  NC_007973  41393  43624  +  2232  potassium-transporting ATPase subunit B  YP_582194  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0040  CDS  NC_007973  43646  44257  +  612  potassium-transporting ATPase subunit C  YP_582195  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0041  CDS  NC_007973  44406  47309  +  2904  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  YP_582196  normal  0.538382  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0042  CDS  NC_007973  47311  48006  +  696  two component transcriptional regulator  YP_582197  normal  0.189828  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0043  CDS  NC_007973  48145  48855  +  711  Sel1  YP_582198  normal  0.521433  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0044  CDS  NC_007973  48933  51581  +  2649  hypothetical protein  YP_582199  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0045  CDS  NC_007973  51578  52480  +  903  transglutaminase-like protein  YP_582200  normal  0.607602  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0046  CDS  NC_007973  52552  54006  -  1455  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B  YP_582201  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0047  CDS  NC_007973  54086  55156  -  1071  dienelactone hydrolase  YP_582202  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0048  CDS  NC_007973  55190  55663  -  474  hypothetical protein  YP_582203  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0049  CDS  NC_007973  55671  57170  -  1500  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  YP_582204  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0050  CDS  NC_007973  57222  57521  -  300  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  YP_582205  normal  0.15949  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0051  CDS  NC_007973  58487  59530  +  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_582206  normal  0.0766615  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0052  CDS  NC_007973  59673  60683  +  1011  rod shape-determining protein MreC  YP_582207  normal  0.0155006  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0053  CDS  NC_007973  60680  61192  +  513  rod shape-determining protein MreD  YP_582208  decreased coverage  0.00417177  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0054  CDS  NC_007973  61236  63617  +  2382  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_582209  normal  0.171257  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0055  CDS  NC_007973  63631  64773  +  1143  rod shape-determining protein RodA  YP_582210  decreased coverage  0.00692025  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0056  CDS  NC_007973  64826  65497  +  672  hypothetical protein  YP_582211  normal  0.0180096  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0057  CDS  NC_007973  65517  66626  +  1110  site-specific tyrosine recombinase XerC  YP_582212  normal  0.326798  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0058  CDS  NC_007973  66623  67516  -  894  DNA-binding transcriptional activator GcvA  YP_582213  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0059  CDS  NC_007973  67773  68141  +  369  hypothetical protein  YP_582214  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0060  CDS  NC_007973  68214  69008  +  795  lipoate-protein ligase B  YP_582215  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0061  CDS  NC_007973  69085  70077  +  993  lipoyl synthase  YP_582216  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0062  CDS  NC_007973  70418  71068  +  651  hypothetical protein  YP_582217  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0063  CDS  NC_007973  71065  72084  +  1020  allophanate hydrolase subunit 2  YP_582218  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0064  CDS  NC_007973  72161  72901  +  741  LamB/YcsF family protein  YP_582219  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0065  CDS  NC_007973  72969  73703  +  735  hypothetical protein  YP_582220  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0066  CDS  NC_007973  73707  74657  +  951  hypothetical protein  YP_582221  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0067  CDS  NC_007973  74671  75339  +  669  pyrrolidone-carboxylate peptidase  YP_582222  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0068  CDS  NC_007973  75351  76673  -  1323  VanZ like protein  YP_582223  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0069  CDS  NC_007973  76725  77372  -  648  hypothetical protein  YP_582224  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0070  CDS  NC_007973  77417  78358  -  942  hypothetical protein  YP_582225  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0071  CDS  NC_007973  78358  79197  -  840  ABC transporter-related protein  YP_582226  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0072  CDS  NC_007973  79194  80324  -  1131  hypothetical protein  YP_582227  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0073  CDS  NC_007973  80485  81342  +  858  biotin--protein ligase  YP_582228  normal  1  normal  0.702906  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0074  CDS  NC_007973  81339  82172  +  834  pantothenate kinase  YP_582229  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0075  CDS  NC_007973  82215  83009  +  795  hypothetical protein  YP_582230  normal  1  normal  0.496262  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0076  CDS  NC_007973  83133  83624  -  492  bifunctional ADP-heptose synthase  YP_582231  normal  1  normal  0.477783  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0077  CDS  NC_007973  83702  84562  -  861  hypothetical protein  YP_582232  normal  1  normal  0.490131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0078  CDS  NC_007973  84692  85948  -  1257  patatin  YP_582233  normal  1  normal  0.767923  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0079  CDS  NC_007973  85945  86844  -  900  hypothetical protein  YP_582234  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0080  CDS  NC_007973  86899  87726  -  828  enoyl-CoA hydratase  YP_582235  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0081  CDS  NC_007973  88108  89148  -  1041  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  YP_582236  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0082  CDS  NC_007973  89192  90049  +  858  IclR family transcriptional regulator  YP_582237  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0083  CDS  NC_007973  90102  91106  +  1005  hypothetical protein  YP_582238  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0084  CDS  NC_007973  91161  92009  +  849  3-oxoadipate enol-lactonase  YP_582239  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0085  CDS  NC_007973  92245  92502  +  258  hypothetical protein  YP_582240  normal  0.618842  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0086  CDS  NC_007973  92621  93013  -  393  rhodanese-like protein  YP_582241  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0087  CDS  NC_007973  93237  94304  +  1068  methionine synthase (B12-dependent)  YP_582242  normal  0.398145  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0088  CDS  NC_007973  94333  97080  +  2748  methionine synthase (B12-dependent)  YP_582243  normal  0.3983  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0089  CDS  NC_007973  97386  97724  +  339  cell wall surface anchor family protein  YP_582244  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0090  CDS  NC_007973  97974  98606  +  633  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_582245  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0091  CDS  NC_007973  98767  99174  +  408  response regulator receiver domain-containing protein  YP_582246  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0092  CDS  NC_007973  99240  100625  -  1386  histidine kinase  YP_582247  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0093  CDS  NC_007973  100777  101070  +  294  hypothetical protein  YP_582248  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0094  CDS  NC_007973  101101  101535  +  435  hypothetical protein  YP_582249  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0095  CDS  NC_007973  101947  102267  -  321  hypothetical protein  YP_582250  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0096  CDS  NC_007973  102445  104253  +  1809  arginyl-tRNA synthetase  YP_582251  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0097  CDS  NC_007973  104393  105133  +  741  hypothetical protein  YP_582252  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0098  CDS  NC_007973  105279  105917  +  639  DSBA oxidoreductase  YP_582253  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0099  CDS  NC_007973  106009  106806  +  798  short chain dehydrogenase  YP_582254  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_0100  CDS  NC_007973  106806  107648  +  843  hypothetical protein  YP_582255  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 67    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>