2442 genes were found for organism Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Reut_B3464  CDS  NC_007348  127  2562  +  2436  aconitate hydratase  YP_297666  normal  0.292881  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3465  CDS  NC_007348  3139  4020  +  882  hypothetical protein  YP_297667  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3466  CDS  NC_007348  4017  4289  -  273  XRE family transcriptional regulator  YP_297668  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3467  CDS  NC_007348  4523  6124  -  1602  FAD dependent oxidoreductase  YP_297669  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3468  CDS  NC_007348  6222  6746  -  525  flavin reductase-like, FMN-binding  YP_297670  normal  0.235276  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3469  CDS  NC_007348  6820  8109  -  1290  putative oxygenase subunit protein  YP_297671  normal  0.0690233  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3470  CDS  NC_007348  8190  8978  -  789  short chain dehydrogenase  YP_297672  normal  0.698077  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3471  CDS  NC_007348  9260  10366  -  1107  AraC family transcriptional regulator  YP_297673  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3472  CDS  NC_007348  10512  11171  -  660  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  YP_297674  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3473  CDS  NC_007348  11550  12395  +  846  glycosyl transferase family protein  YP_297675  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3474  CDS  NC_007348  12491  12682  -  192  hypothetical protein  YP_297676  normal  0.566456  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3475  CDS  NC_007348  12917  13342  -  426  molybdenum-pterin binding protein  YP_297677  normal  0.703856  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3476  CDS  NC_007348  13551  14321  +  771  helix-turn-helix, AraC type  YP_297678  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3477  CDS  NC_007348  14340  14825  -  486  endoribonuclease L-PSP  YP_297679  normal  0.474814  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3478  CDS  NC_007348  14822  15691  -  870  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  YP_297680  normal  0.0695575  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3479  CDS  NC_007348  15684  16676  -  993  hypothetical protein  YP_297681  normal  0.0561712  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3480  CDS  NC_007348  16819  17283  +  465  cytochrome c, class I  YP_297682  normal  0.453541  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3481  CDS  NC_007348  17320  18258  -  939  hypothetical protein  YP_297683  normal  0.352755  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3482  CDS  NC_007348  18591  21032  -  2442  MscS mechanosensitive ion channel  YP_297684  normal  0.144458  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3483  CDS  NC_007348  21509  21865  +  357  hypothetical protein  YP_297685  normal  0.0262041  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3484  CDS  NC_007348  21862  22845  -  984  twin-arginine translocation pathway signal:ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  YP_297686  normal  0.0224965  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3485  CDS  NC_007348  22962  23450  -  489  hypothetical protein  YP_297687  normal  0.0617359  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3486  CDS  NC_007348  23745  24488  -  744  short chain dehydrogenase  YP_297688  normal  0.425497  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3487  CDS  NC_007348  24604  25527  +  924  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  YP_297689  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3488  CDS  NC_007348  25669  26106  +  438  DGPFAETKE  YP_297690  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3489  CDS  NC_007348  26223  26951  +  729  hypothetical protein  YP_297691  normal  0.969002  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3490  CDS  NC_007348  27010  27501  +  492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  YP_297692  normal  0.572882  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3491  CDS  NC_007348  27553  28206  +  654  glutathione S-transferase  YP_297693  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3492  CDS  NC_007348  28231  29184  -  954  prolyl aminopeptidase  YP_297694  normal  0.652932  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3493  CDS  NC_007348  29819  30553  +  735  glutathione S-transferase  YP_297695  normal  0.0558771  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3494  CDS  NC_007348  30692  32032  +  1341  L-sorbosone dehydrogenase  YP_297696  normal  0.0961281  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3495  CDS  NC_007348  32211  33038  +  828  UbiE/COQ5 methyltransferase  YP_297697  normal  0.0172261  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3496  CDS  NC_007348  33287  34636  +  1350  hypothetical protein  YP_297698  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3497  CDS  NC_007348  34868  35230  +  363  hypothetical protein  YP_297699  normal  0.674005  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3498  CDS  NC_007348  35323  36189  +  867  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  YP_297700  normal  0.30302  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3499  CDS  NC_007348  36205  36444  -  240  hypothetical protein  YP_297701  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3500  CDS  NC_007348  36808  37965  +  1158  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  YP_297702  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3501  CDS  NC_007348  38172  39641  +  1470  Outer membrane efflux protein  YP_297703  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3502  CDS  NC_007348  39625  40833  +  1209  secretion protein HlyD  YP_297704  normal  0.0531156  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3503  CDS  NC_007348  40847  43966  +  3120  heavy metal efflux pump CzcA  YP_297705  normal  0.0796424  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3504  CDS  NC_007348  44193  44771  +  579  hypothetical protein  YP_297706  hitchhiker  0.00345885  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3505  CDS  NC_007348  44786  45052  +  267  CsbD-like  YP_297707  hitchhiker  0.00399435  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3506  CDS  NC_007348  45178  46668  +  1491  ATP-binding region, ATPase-like  YP_297708  normal  0.0457672  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3507  CDS  NC_007348  46749  47246  -  498  hypothetical protein  YP_297709  hitchhiker  0.00249299  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3508  CDS  NC_007348  47478  49091  -  1614  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  YP_297710  normal  0.411289  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3509  CDS  NC_007348  49418  50248  +  831  GntR family transcriptional regulator  YP_297711  normal  0.393643  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3510  CDS  NC_007348  50232  51827  +  1596  hypothetical protein  YP_297712  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3511  CDS  NC_007348  51974  52369  +  396  hypothetical protein  YP_297713  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3512  CDS  NC_007348  52375  53547  +  1173  thiolase  YP_297714  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3513  CDS  NC_007348  53645  54646  -  1002  hypothetical protein  YP_297715  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3514  CDS  NC_007348  54676  56253  -  1578  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  YP_297716  normal  0.270509  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3515  CDS  NC_007348  56274  57554  -  1281  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  YP_297717  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3516  CDS  NC_007348  57555  57935  -  381  hypothetical protein  YP_297718  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3517  CDS  NC_007348  57935  58939  -  1005  aminoglycoside phosphotransferase  YP_297719  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3518  CDS  NC_007348  59111  59758  +  648  regulatory protein, TetR  YP_297720  normal  0.640434  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3519  CDS  NC_007348  59755  59967  -  213  hypothetical protein  YP_297721  normal  0.11152  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3520  CDS  NC_007348  59967  61535  -  1569  hypothetical protein  YP_297722  normal  0.0949443  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3521  CDS  NC_007348  61566  64133  -  2568  cellulose synthase (UDP-forming)  YP_297723  normal  0.0192109  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3522  CDS  NC_007348  64130  64921  -  792  hypothetical protein  YP_297724  normal  0.0227893  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3523  CDS  NC_007348  64918  65121  -  204  hypothetical protein  YP_297725  normal  0.0371813  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3524  CDS  NC_007348  65128  66843  -  1716  hypothetical protein  YP_297726  normal  0.224804  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3525  CDS  NC_007348  66852  70649  -  3798  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  YP_297727  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3526  CDS  NC_007348  70634  71812  -  1179  endo-1,4-D-glucanase  YP_297728  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3527  CDS  NC_007348  71814  74159  -  2346  cellulose synthase regulator protein  YP_297729  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3528  CDS  NC_007348  74709  74990  +  282  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  YP_297730  normal  0.937942  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3529  CDS  NC_007348  75051  76226  +  1176  Altronate dehydratase  YP_297731  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3530  CDS  NC_007348  76223  77161  +  939  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic region:D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  YP_297732  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3531  CDS  NC_007348  77158  78174  +  1017  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  YP_297733  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3532  CDS  NC_007348  78250  79275  +  1026  hypothetical protein  YP_297734  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3533  CDS  NC_007348  79413  80153  +  741  GntR family transcriptional regulator  YP_297735  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3534  CDS  NC_007348  80293  81426  -  1134  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  YP_297736  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3535  CDS  NC_007348  81440  82633  -  1194  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  YP_297737  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3536  CDS  NC_007348  82846  84438  +  1593  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_297738  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3537  CDS  NC_007348  84531  85499  +  969  hypothetical protein  YP_297739  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3538  CDS  NC_007348  86097  86960  -  864  hypothetical protein  YP_297740  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3539  CDS  NC_007348  86978  87817  -  840  HpcH/HpaI aldolase  YP_297741  normal  0.974431  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3540  CDS  NC_007348  87828  89201  -  1374  MmgE/PrpD  YP_297742  normal  0.10861  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3541  CDS  NC_007348  89265  90464  -  1200  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_297743  normal  0.685122  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3542  CDS  NC_007348  90473  91642  -  1170  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  YP_297744  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3543  CDS  NC_007348  92577  93062  +  486  hypothetical protein  YP_297745  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3544  CDS  NC_007348  93099  94001  -  903  LysR family transcriptional regulator  YP_297746  normal  0.816099  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3545  CDS  NC_007348  94195  95109  +  915  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_297747  normal  0.911419  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3546  CDS  NC_007348  95111  96346  +  1236  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_297748  normal  0.906288  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3547  CDS  NC_007348  96434  97582  -  1149  AraC family transcriptional regulator  YP_297749  normal  0.150501  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3548  CDS  NC_007348  97923  98927  +  1005  hypothetical protein  YP_297750  normal  0.0576712  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3549  CDS  NC_007348  98941  100668  +  1728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  YP_297751  normal  0.918334  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3550  CDS  NC_007348  100707  101687  +  981  hypothetical protein  YP_297752  normal  0.615423  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3551  CDS  NC_007348  101731  102510  +  780  short chain enoyl-CoA hydratase  YP_297753  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3552  CDS  NC_007348  102676  103866  +  1191  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  YP_297754  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3553  CDS  NC_007348  104270  106192  +  1923  putative serine protein kinase, PrkA  YP_297755  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3554  CDS  NC_007348  106230  107492  +  1263  hypothetical protein  YP_297756  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3555  CDS  NC_007348  107628  109181  +  1554  SpoVR family protein  YP_297757  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3556  CDS  NC_007348  109244  110236  -  993  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  YP_297758  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3557  CDS  NC_007348  110263  111423  -  1161  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  YP_297759  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3558  CDS  NC_007348  111444  112427  -  984  hypothetical protein  YP_297760  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3559  CDS  NC_007348  112491  112958  -  468  hypothetical protein  YP_297761  normal  0.331876  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3560  CDS  NC_007348  112955  114178  -  1224  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_297762  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3561  CDS  NC_007348  114281  115174  +  894  LysR family transcriptional regulator  YP_297763  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3562  CDS  NC_007348  115250  116431  -  1182  regulatory protein, LuxR  YP_297764  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_B3563  CDS  NC_007348  116826  119114  -  2289  MscS mechanosensitive ion channel  YP_297765  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>