2497 genes were found for organism Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mbur_0001  CDS  NC_007955  379  1392  +  1014  50S ribosomal protein L3P  YP_564775  normal  0.0115454  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0002  CDS  NC_007955  1398  2159  +  762  50S ribosomal protein L4P  YP_564776  hitchhiker  0.00000396442  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0003  CDS  NC_007955  2156  2404  +  249  50S ribosomal protein L23P  YP_564777  hitchhiker  0.0000000337619  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0004  CDS  NC_007955  2416  3129  +  714  50S ribosomal protein L2P  YP_564778  unclonable  0.00000000000000454303  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
 
Mbur_0005  CDS  NC_007955  3146  3559  +  414  30S ribosomal protein S19P  YP_564779  unclonable  1.96004e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0006  CDS  NC_007955  3570  4025  +  456  50S ribosomal protein L22P  YP_564780  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0007  CDS  NC_007955  4025  4939  +  915  30S ribosomal protein S3P  YP_564781  hitchhiker  0.00000000452289  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0008  CDS  NC_007955  4942  5145  +  204  50S ribosomal protein L29P  YP_564782  hitchhiker  0.000000000020631  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0009  CDS  NC_007955  5147  5452  +  306  ribonuclease P protein component 1  YP_564783  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0010  CDS  NC_007955  5458  5787  +  330  30S ribosomal protein S17P  YP_564784  hitchhiker  0.000000000332515  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0011  CDS  NC_007955  5784  6182  +  399  50S ribosomal protein L14P  YP_564785  hitchhiker  0.000000000740699  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0012  CDS  NC_007955  6193  6546  +  354  50S ribosomal protein L24P  YP_564786  hitchhiker  0.000000000112293  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0013  CDS  NC_007955  6551  7261  +  711  30S ribosomal protein S4e  YP_564787  hitchhiker  0.00000000026774  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0014  CDS  NC_007955  7254  7763  +  510  50S ribosomal protein L5P  YP_564788  unclonable  5.43993e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0015  CDS  NC_007955  7763  7915  +  153  30S ribosomal protein S14P  YP_564789  unclonable  1.67188e-17  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0016  CDS  NC_007955  7927  8319  +  393  30S ribosomal protein S8P  YP_564790  unclonable  1.66957e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0017  CDS  NC_007955  8338  8871  +  534  50S ribosomal protein L6P  YP_564791  unclonable  4.87132e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0018  CDS  NC_007955  8896  9342  +  447  50S ribosomal protein L32e  YP_564792  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0019  CDS  NC_007955  9344  9790  +  447  50S ribosomal protein L19e  YP_564793  hitchhiker  0.0000000000168936  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0020  CDS  NC_007955  9850  10371  +  522  50S ribosomal protein L18P  YP_564794  hitchhiker  0.00000000151629  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0021  CDS  NC_007955  10384  11019  +  636  30S ribosomal protein S5P  YP_564795  hitchhiker  0.00000032462  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0022  CDS  NC_007955  11022  11483  +  462  50S ribosomal protein L30P  YP_564796  hitchhiker  0.000000081539  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0023  CDS  NC_007955  11488  11931  +  444  50S ribosomal protein L15P  YP_564797  hitchhiker  0.000020439  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0024  CDS  NC_007955  12037  13515  +  1479  preprotein translocase subunit SecY  YP_564798  hitchhiker  0.00318334  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0025  CDS  NC_007955  13537  14184  +  648  adenylate kinase  YP_564799  hitchhiker  0.000000610793  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0026  CDS  NC_007955  14204  14824  +  621  hypothetical protein  YP_564800  decreased coverage  0.000000132729  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0027  CDS  NC_007955  14827  15354  +  528  cytidylate kinase  YP_564801  decreased coverage  0.00000000301148  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0028  CDS  NC_007955  15375  16370  +  996  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  YP_564802  hitchhiker  0.000488795  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0029  CDS  NC_007955  16763  17281  +  519  death-on-curing protein  YP_564803  normal  0.843806  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0030  CDS  NC_007955  17872  19089  +  1218  hypothetical protein  YP_564804  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0031  CDS  NC_007955  19141  19665  -  525  ThiJ/PfpI  YP_564805  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0032  CDS  NC_007955  19828  22650  +  2823  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  YP_564806  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0033  CDS  NC_007955  22656  23321  -  666  HAD family hydrolase  YP_564807  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0034  CDS  NC_007955  23343  23609  -  267  hypothetical protein  YP_564808  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0035  CDS  NC_007955  23792  24694  +  903  hypothetical protein  YP_564809  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0036  CDS  NC_007955  25003  25449  +  447  30S ribosomal protein S13P  YP_564810  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0037  CDS  NC_007955  25462  26016  +  555  30S ribosomal protein S4P  YP_564811  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0038  CDS  NC_007955  26030  26410  +  381  30S ribosomal protein S11P  YP_564812  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0039  CDS  NC_007955  26434  27237  +  804  DNA-directed RNA polymerase subunit D  YP_564813  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0040    NC_007955  27941  28288  -  348      normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0041  CDS  NC_007955  28589  29440  -  852  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  YP_564814  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0042  CDS  NC_007955  29584  29895  -  312  hypothetical protein  YP_564815  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0043  CDS  NC_007955  30002  31048  -  1047  radical SAM family Fe-S protein  YP_564816  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0044  CDS  NC_007955  31124  31315  +  192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  YP_564817  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0045    NC_007955  31351  32972  -  1622      normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0046  CDS  NC_007955  32951  33286  -  336  hypothetical protein  YP_564818  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0047  CDS  NC_007955  33307  34851  -  1545  type II secretion system protein E  YP_564819  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0048  CDS  NC_007955  35190  35618  -  429  hypothetical protein  YP_564820  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0049  CDS  NC_007955  35836  37266  -  1431  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  YP_564821  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0050  CDS  NC_007955  37648  37890  -  243  hypothetical protein  YP_564822  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0051  CDS  NC_007955  38209  38661  +  453  N-acetylglutamate synthase  YP_564823  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0052  CDS  NC_007955  38736  39665  +  930  hypothetical protein  YP_564824  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0053  CDS  NC_007955  39784  40095  -  312  hypothetical protein  YP_564825  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0054  CDS  NC_007955  40108  41061  -  954  GTP cyclohydrolase  YP_564826  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0055  CDS  NC_007955  41365  41661  +  297  nucleoid protein MC1  YP_564827  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0056  CDS  NC_007955  41796  42710  +  915  acetylglutamate kinase  YP_564828  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0057  CDS  NC_007955  42736  43779  -  1044  hypothetical protein  YP_564829  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0058  CDS  NC_007955  43780  44694  -  915  GMP synthase subunit B  YP_564830  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0059  CDS  NC_007955  45035  46369  +  1335  hypothetical protein  YP_564831  normal  0.291896  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0060  CDS  NC_007955  46778  48184  +  1407  hypothetical protein  YP_564832  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0061  CDS  NC_007955  48323  50266  +  1944  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_564833  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0062  CDS  NC_007955  50274  51032  -  759  peptidase A24B, FlaK-like  YP_564834  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0063    NC_007955  51033  52304  -  1272      normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0064  CDS  NC_007955  52556  52885  +  330  hypothetical protein  YP_564835  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0065  CDS  NC_007955  52974  53900  +  927  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  YP_564836  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0066  CDS  NC_007955  53897  54376  +  480  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  YP_564837  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0067  CDS  NC_007955  54490  55398  -  909  cell surface protein  YP_564838  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0068  CDS  NC_007955  55818  58265  -  2448  plasma-membrane proton-efflux P-type ATPase  YP_564839  normal  0.890371  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0069  CDS  NC_007955  58499  59800  -  1302  amino acid transporter  YP_564840  normal  0.266806  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0070  CDS  NC_007955  59813  60652  -  840  amino acid transporter  YP_564841  normal  0.462473  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0071  CDS  NC_007955  61225  61581  +  357  hypothetical protein  YP_564842  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0072  CDS  NC_007955  61749  62522  -  774  alpha/beta hydrolase  YP_564843  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0073  CDS  NC_007955  62500  63768  -  1269  radical SAM family Fe-S protein  YP_564844  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0074  CDS  NC_007955  63798  64532  -  735  hypothetical protein  YP_564845  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0075  CDS  NC_007955  65008  66039  +  1032  major facilitator transporter  YP_564846  normal  0.884221  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0076  CDS  NC_007955  66015  66233  +  219  class H tetracycline resistance efflux protein  YP_564847  normal  0.126523  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0077  CDS  NC_007955  66303  66785  -  483  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_564848  hitchhiker  0.00144896  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0078  CDS  NC_007955  66871  68085  -  1215  hypothetical protein  YP_564849  hitchhiker  0.00000923125  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0079  CDS  NC_007955  68101  69315  -  1215  cell division protein FtsX  YP_564850  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0080  CDS  NC_007955  69320  70567  -  1248  hypothetical protein  YP_564851  unclonable  0.000000000000412436  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0081  CDS  NC_007955  70587  71309  -  723  ABC transporter, ATPase subunit  YP_564852  unclonable  0.00000000000000360668  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0082    NC_007955  72198  72975  +  778      hitchhiker  0.00467368  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0083  CDS  NC_007955  73103  75394  +  2292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_564853  normal  0.172925  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0084  CDS  NC_007955  75833  76459  -  627  methyltransferase type 11  YP_564854  normal  0.559166  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0085  CDS  NC_007955  76519  77262  -  744  sugar fermentation stimulation protein  YP_564855  normal  0.675959  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0086  CDS  NC_007955  77293  77628  -  336  hypothetical protein  YP_564856  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0087    NC_007955  77846  78534  +  689      normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0088  CDS  NC_007955  78966  79487  +  522  hypothetical protein  YP_564857  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0089  CDS  NC_007955  79634  79855  +  222  SirA-like protein  YP_564858  normal  0.741748  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0090  CDS  NC_007955  79908  80288  +  381  hypothetical protein  YP_564859  normal  0.63908  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0091  CDS  NC_007955  80314  80475  +  162  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  YP_564860  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0092  CDS  NC_007955  80511  82001  +  1491  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  YP_564861  normal  0.554506  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0093  CDS  NC_007955  82022  82300  +  279  fumarate hydratase class II  YP_564862  normal  0.0224877  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0094  CDS  NC_007955  82356  82898  +  543  succinate dehydrogenase subunit B  YP_564863  hitchhiker  0.00229269  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0095  CDS  NC_007955  83208  85439  +  2232  DNA topoisomerase I  YP_564864  hitchhiker  0.0000000317173  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0096  CDS  NC_007955  85463  86698  +  1236  beta-lactamase-like  YP_564865  normal  0.619146  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0097    NC_007955  87125  87733  -  609      normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0098  CDS  NC_007955  87817  88362  +  546  hypothetical protein  YP_564866  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0099  CDS  NC_007955  88414  89301  -  888  serine/threonine protein kinase  YP_564867  normal  1  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0100  CDS  NC_007955  89360  89752  -  393  hypothetical protein  YP_564868  normal  0.90777  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>