2211 genes were found for organism Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Psyc_0001  CDS  NC_007204  520  1965  +  1446  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_263309  hitchhiker  0.0000000168448  unclonable  0.00000204804  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0002  CDS  NC_007204  2125  3300  +  1176  DNA polymerase III, beta subunit  YP_263310  hitchhiker  0.0000000000104576  unclonable  0.00000179673  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0003  CDS  NC_007204  3463  4677  +  1215  DNA replication and repair protein RecF  YP_263311  hitchhiker  0.00736355  unclonable  0.00000172391  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0004  CDS  NC_007204  5179  7794  +  2616  DNA gyrase subunit B  YP_263312  normal  0.0729554  hitchhiker  0.0000403413  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0005  CDS  NC_007204  7907  8500  +  594  hypothetical protein  YP_263313  normal  0.33307  hitchhiker  0.000135585  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0006  CDS  NC_007204  8586  9371  -  786  IS3 family transposase  YP_263314  normal  1  hitchhiker  0.000149374  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0007  CDS  NC_007204  9413  9931  -  519  IS3/IS911 family transposase orfA  YP_263315  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0008  CDS  NC_007204  10178  11215  -  1038  putative SAM-dependent methyltransferase  YP_263316  normal  1  hitchhiker  0.000868214  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0009  CDS  NC_007204  11806  13416  +  1611  GMP synthase  YP_263317  normal  1  hitchhiker  0.000958446  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0010  CDS  NC_007204  13573  14865  +  1293  hypothetical protein  YP_263318  normal  1  hitchhiker  0.000875965  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0011  CDS  NC_007204  14993  15997  -  1005  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  YP_263319  normal  1  hitchhiker  0.000787082  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0012  CDS  NC_007204  16221  17198  -  978  nuclear receptor binding factor related protein  YP_263320  normal  1  hitchhiker  0.000787082  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0013  CDS  NC_007204  17341  17595  -  255  hypothetical protein  YP_263321  normal  1  hitchhiker  0.00237209  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0014  CDS  NC_007204  18119  19162  -  1044  2-nitropropane dioxygenase protein  YP_263322  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0015  CDS  NC_007204  19335  20621  -  1287  hypothetical protein  YP_263323  normal  0.902002  hitchhiker  0.00321286  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0016  CDS  NC_007204  20634  20930  +  297  IS3/IS911 family transposase OrfA  YP_263324  normal  1  hitchhiker  0.0070986  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0017  CDS  NC_007204  20981  21799  +  819  IS30 family transposase  YP_263325  normal  0.701349  hitchhiker  0.00772607  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0018  CDS  NC_007204  21800  22450  -  651  hypothetical protein  YP_263326  normal  0.364832  normal  0.0206421  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0019  CDS  NC_007204  22443  22952  -  510  hypothetical protein  YP_263327  normal  0.34255  normal  0.0200658  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0020  CDS  NC_007204  22945  23997  -  1053  hypothetical protein  YP_263328  normal  0.247858  normal  0.0221694  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0021  CDS  NC_007204  24177  24554  -  378  hypothetical protein  YP_263329  normal  0.256356  normal  0.0439162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0022  CDS  NC_007204  24825  25877  -  1053  hypothetical protein  YP_263330  normal  0.380051  normal  0.0500502  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0023  CDS  NC_007204  26178  26774  -  597  hypothetical protein  YP_263331  normal  0.132491  normal  0.0840592  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0024  CDS  NC_007204  26978  27697  +  720  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  YP_263332  normal  0.0145109  normal  0.0845626  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0025  CDS  NC_007204  28179  29264  +  1086  hypothetical protein  YP_263333  normal  1  normal  0.27879  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0026  CDS  NC_007204  29409  30059  -  651  hypothetical protein  YP_263334  normal  1  normal  0.859068  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0027  CDS  NC_007204  30543  31667  +  1125  chaperone protein DnaJ  YP_263335  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0028  CDS  NC_007204  31996  32832  +  837  dihydrodipicolinate reductase  YP_263336  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0029  CDS  NC_007204  32915  34090  -  1176  ornithine decarboxylase  YP_263337  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0030  CDS  NC_007204  34198  34752  -  555  peptide deformylase  YP_263338  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0031  CDS  NC_007204  35124  35378  -  255  hypothetical protein  YP_263339  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0032  CDS  NC_007204  35713  37230  -  1518  putative UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso- diaminopimelate ligase  YP_263340  normal  0.600705  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0033  CDS  NC_007204  37523  38146  -  624  hypothetical protein  YP_263341  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0034  CDS  NC_007204  38341  38871  -  531  disulfide bond formation protein  YP_263342  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0035  CDS  NC_007204  38926  40509  -  1584  glutamate-cysteine ligase  YP_263343  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0036  CDS  NC_007204  40901  41281  -  381  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  YP_263344  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0037  CDS  NC_007204  41787  43805  +  2019  ABC transporter ATPase  YP_263345  normal  0.489009  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0038  CDS  NC_007204  43911  44279  -  369  putative lipoprotein A  YP_263346  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0039  CDS  NC_007204  44824  45822  +  999  heat shock protein DnaJ  YP_263347  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0040  CDS  NC_007204  45908  46231  +  324  hypothetical protein  YP_263348  normal  0.79338  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0041  CDS  NC_007204  46320  47522  -  1203  serine/threonine transporter SstT  YP_263349  normal  0.0606583  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0042  CDS  NC_007204  47861  48319  -  459  DNA polymerase III, chi subunit  YP_263350  normal  0.331022  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0043  CDS  NC_007204  48355  50013  -  1659  PepA aminopeptidase  YP_263351  normal  0.727266  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0044  CDS  NC_007204  50261  50866  -  606  isochorismatase hydrolase  YP_263352  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0045  CDS  NC_007204  51384  52634  +  1251  hypothetical protein  YP_263353  normal  0.402941  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0046  CDS  NC_007204  52634  53842  +  1209  hypothetical protein  YP_263354  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0047  CDS  NC_007204  53920  54528  -  609  hypothetical protein  YP_263355  normal  0.23937  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0048  CDS  NC_007204  55288  55752  -  465  hypothetical protein  YP_263356  normal  0.0915956  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0049  CDS  NC_007204  55758  56192  -  435  hypothetical protein  YP_263357  normal  0.0539536  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0050  CDS  NC_007204  56291  57226  +  936  LysR family transcriptional regulator  YP_263358  normal  0.142799  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0051  CDS  NC_007204  57548  59107  +  1560  hypothetical protein  YP_263359  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0052  CDS  NC_007204  59255  60193  -  939  phage integrase  YP_263360  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0053  CDS  NC_007204  60448  61662  -  1215  hypothetical protein  YP_263361  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0054  CDS  NC_007204  61869  62129  -  261  hypothetical protein  YP_263362  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0055  CDS  NC_007204  62205  62717  -  513  hypothetical protein  YP_263363  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0056  CDS  NC_007204  62796  63329  -  534  hypothetical protein  YP_263364  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0057  CDS  NC_007204  63380  63943  -  564  putative transcriptional regulator  YP_263365  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0058  CDS  NC_007204  64062  65741  -  1680  DNA repair protein  YP_263366  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0059  CDS  NC_007204  66427  66762  +  336  hypothetical protein  YP_263367  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0060  CDS  NC_007204  66968  67738  +  771  RNA methyltransferase  YP_263368  normal  0.024169  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0061  CDS  NC_007204  67701  68393  -  693  dephospho-CoA kinase  YP_263369  hitchhiker  0.000202187  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0062  CDS  NC_007204  68477  69376  -  900  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  YP_263370  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0063  CDS  NC_007204  69402  70625  -  1224  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  YP_263371  hitchhiker  0.00000657868  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0064  CDS  NC_007204  70862  72637  -  1776  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  YP_263372  normal  0.978792  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0065  CDS  NC_007204  73127  73936  +  810  triosephosphate isomerase  YP_263373  normal  0.914052  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0066  CDS  NC_007204  74165  74473  +  309  preprotein translocase subunit SecG  YP_263374  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0067  CDS  NC_007204  75377  75877  +  501  hypothetical protein  YP_263375  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0068  CDS  NC_007204  76010  77494  +  1485  transcription elongation factor NusA  YP_263376  normal  0.272639  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0069  CDS  NC_007204  77646  80372  +  2727  translation initiation factor IF-2  YP_263377  decreased coverage  0.00377162  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0070  CDS  NC_007204  80587  80991  +  405  ribosome-binding factor A  YP_263378  normal  0.196892  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0071  CDS  NC_007204  81008  82150  +  1143  tRNA pseudouridine synthase B  YP_263379  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0072  CDS  NC_007204  82492  82677  +  186  hypothetical protein  YP_263380  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0073  CDS  NC_007204  83015  83281  +  267  30S ribosomal protein S15  YP_263381  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0074  CDS  NC_007204  83907  86009  +  2103  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  YP_263382  normal  0.983734  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0075  CDS  NC_007204  86116  86397  -  282  hypothetical protein  YP_263383  normal  0.152567  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0076  CDS  NC_007204  86461  87066  -  606  hypothetical protein  YP_263384  normal  0.0165296  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0077  CDS  NC_007204  87218  87472  -  255  hypothetical protein  YP_263385  normal  0.145209  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0078  CDS  NC_007204  87473  89698  -  2226  oligopeptidase A  YP_263386  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0079  CDS  NC_007204  90323  91435  +  1113  hypothetical protein  YP_263387  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0080  CDS  NC_007204  91496  92404  +  909  hypothetical protein  YP_263388  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0081  CDS  NC_007204  92464  93462  +  999  hypothetical protein  YP_263389  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0082  CDS  NC_007204  93498  94115  -  618  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  YP_263390  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0083  CDS  NC_007204  94165  96078  -  1914  eflux ABC transporter inner membrane protein  YP_263391  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0084  CDS  NC_007204  96361  97209  +  849  hypothetical protein  YP_263392  normal  0.773078  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0085  CDS  NC_007204  97383  98273  +  891  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  YP_263393  normal  0.249059  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0086  CDS  NC_007204  98385  100460  -  2076  thiamine biosynthesis protein ThiC  YP_263394  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0087  CDS  NC_007204  100903  101193  -  291  hypothetical protein  YP_263395  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0088  CDS  NC_007204  101502  102875  -  1374  argininosuccinate lyase  YP_263396  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0089  CDS  NC_007204  103385  104422  +  1038  hydroxymethylbilane synthase  YP_263397  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0090  CDS  NC_007204  104539  105522  +  984  uroporphyrinogen-III synthase  YP_263398  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0091  CDS  NC_007204  105653  106612  +  960  hypothetical protein  YP_263399  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0092  CDS  NC_007204  106671  107156  +  486  hypothetical protein  YP_263400  normal  0.190576  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0093  CDS  NC_007204  107401  108513  -  1113  GTP cyclohydrolase II / 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  YP_263401  normal  0.0678299  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0094  CDS  NC_007204  108765  110054  -  1290  recombination factor protein RarA  YP_263402  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0095  CDS  NC_007204  110387  110878  +  492  hypothetical protein  YP_263403  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0096  CDS  NC_007204  110986  111837  +  852  hypothetical protein  YP_263404  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0097  CDS  NC_007204  111902  113182  -  1281  citrate synthase  YP_263405  normal  0.0802276  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0098  CDS  NC_007204  114223  114609  +  387  succinate dehydrogenase subunit C  YP_263406  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0099  CDS  NC_007204  114609  115013  +  405  succinate dehydrogenase subunit D  YP_263407  normal  1  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0100  CDS  NC_007204  115192  117042  +  1851  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  YP_263408  normal  0.576611  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>