3052 genes were found for organism Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
MCA0001  CDS  NC_002977  44  1921  +  1878  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_112542  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0002  CDS  NC_002977  1936  2553  +  618  glucose-inhibited division protein B  YP_112543  normal  0.189717  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0003  CDS  NC_002977  2554  3342  +  789  ParA family protein  YP_112544  normal  0.458179  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0004  CDS  NC_002977  3364  4212  +  849  ParB family protein  YP_112545  normal  0.177803  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0005  CDS  NC_002977  4268  4639  +  372  ATP synthase protein I, putative  YP_112546  normal  0.0559665  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0006  CDS  NC_002977  4667  5446  +  780  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_112547  normal  0.219933  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0007  CDS  NC_002977  5502  5747  +  246  F0F1 ATP synthase subunit C  YP_112548  normal  0.316069  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0008  CDS  NC_002977  5810  6283  +  474  ATP synthase F0, B subunit  YP_112549  normal  0.320711  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0009  CDS  NC_002977  6290  6826  +  537  ATP synthase F1, delta subunit  YP_112550  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0010  CDS  NC_002977  6842  8383  +  1542  F0F1 ATP synthase subunit alpha  YP_112551  normal  0.768352  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0011  CDS  NC_002977  8394  9257  +  864  ATP synthase F1, gamma subunit  YP_112552  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0012  CDS  NC_002977  9293  10675  +  1383  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_112553  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0013  CDS  NC_002977  10701  11123  +  423  ATP synthase F1, epsilon subunit  YP_112554  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0014  CDS  NC_002977  11242  12627  +  1386  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  YP_112555  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0015  CDS  NC_002977  12615  14447  +  1833  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  YP_112556  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0016  CDS  NC_002977  14534  16618  +  2085  methionyl-tRNA synthetase  YP_112557  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0017  CDS  NC_002977  16626  17981  +  1356  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  YP_112558  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0018  CDS  NC_002977  17988  18719  +  732  hypothetical protein  YP_112559  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0019  CDS  NC_002977  18756  19217  +  462  hypothetical protein  YP_112560  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0020  CDS  NC_002977  19221  20051  -  831  Dna-J like membrane chaperone protein  YP_112561  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0021  CDS  NC_002977  20139  21032  +  894  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  YP_112562  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0022  CDS  NC_002977  21053  22330  -  1278  tRNA nucleotidyltransferase  YP_112563  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0023  CDS  NC_002977  22396  23280  +  885  hypothetical protein  YP_112564  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0024  CDS  NC_002977  23287  23994  -  708  6-phosphogluconolactonase  YP_112565  normal  0.77828  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0025  CDS  NC_002977  23996  25483  -  1488  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  YP_112566  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0026  CDS  NC_002977  25693  28341  -  2649  type III restriction-modification system, R subunit, putative  YP_112567  normal  0.352538  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0027  CDS  NC_002977  28538  29773  -  1236  ISMca5, transposase  YP_112568  normal  0.0677305  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0028  CDS  NC_002977  29878  30168  -  291  nucleotidyltransferase family protein  YP_112569  normal  0.422617  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0029  CDS  NC_002977  30165  30551  -  387  hypothetical protein  YP_112570  normal  0.510948  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0030    NC_002977  30697  32350  -  1654      normal  0.367954  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0031  CDS  NC_002977  32445  32984  +  540  ISMca6, transposase, OrfA  YP_112571  normal  0.212668  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0032  CDS  NC_002977  32956  33549  +  594  ISMca6, transposase, OrfB  YP_112572  normal  0.151257  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0033  CDS  NC_002977  33699  34586  -  888  DNA-damage-inducible protein D  YP_112573  normal  0.439015  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0034  CDS  NC_002977  34606  35553  -  948  hypothetical protein  YP_112574  normal  0.96497  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0035  CDS  NC_002977  35550  36155  -  606  hypothetical protein  YP_112575  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0036  CDS  NC_002977  36152  37243  -  1092  hypothetical protein  YP_112576  normal  0.922282  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0037  CDS  NC_002977  38085  39914  +  1830  phosphogluconate dehydratase  YP_112577  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0038  CDS  NC_002977  39904  40569  +  666  4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase/2-deydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase  YP_112578  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0039  CDS  NC_002977  40860  41498  +  639  dihydroxyacetone phosphatase family protein  YP_112579  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0040  CDS  NC_002977  41511  42500  -  990  dihydroxyacetone kinase family protein  YP_112580  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0041  CDS  NC_002977  42530  43546  -  1017  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  YP_112581  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0042  CDS  NC_002977  43745  44251  +  507  anti-oxidant AhpCTSA family protein  YP_112582  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0043  CDS  NC_002977  44293  44721  +  429  ribose 5-phosphate isomerase B  YP_112583  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0044  CDS  NC_002977  44934  45155  +  222  hypothetical protein  YP_112584  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0045  CDS  NC_002977  45165  45833  -  669  endonuclease V  YP_112585  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0046  CDS  NC_002977  45837  46625  -  789  MazG family protein  YP_112586  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0047  CDS  NC_002977  46628  47560  -  933  carbohydrate kinase  YP_112587  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0048  CDS  NC_002977  47616  47978  -  363  diacylglycerol kinase  YP_112588  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0049  CDS  NC_002977  48224  50446  +  2223  cellulose-binding domain-containing protein  YP_112589  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0050  CDS  NC_002977  50597  51697  -  1101  ISMca1, transposase  YP_112590  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0051  CDS  NC_002977  51863  52246  -  384  glycine cleavage system H protein  YP_112591  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0052  CDS  NC_002977  52436  53521  +  1086  mrP protein  YP_112592  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0053  CDS  NC_002977  53532  54098  +  567  deoxycytidine triphosphate deaminase  YP_112593  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0054  CDS  NC_002977  54127  55407  +  1281  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  YP_112594  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0055  CDS  NC_002977  55404  57329  +  1926  DedA family protein  YP_112595  normal  0.381333  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0056  CDS  NC_002977  57326  58582  -  1257  transcription termination factor Rho  YP_112596  normal  0.624347  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0057  CDS  NC_002977  58769  59098  -  330  thioredoxin  YP_112597  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0058  CDS  NC_002977  59262  60029  -  768  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  YP_112598  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0059  CDS  NC_002977  60004  60780  -  777  hypothetical protein  YP_112599  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0060  CDS  NC_002977  60908  61717  -  810  general secretion pathway protein B, putative  YP_112600  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0061  CDS  NC_002977  61739  63388  -  1650  general secretion pathway protein A  YP_112601  normal  0.71374  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0062  CDS  NC_002977  63501  64397  -  897  protoheme IX farnesyltransferase  YP_112602  normal  0.291941  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0063  CDS  NC_002977  64477  65856  +  1380  M16 family peptidase  YP_112603  normal  0.0261125  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0064  CDS  NC_002977  65846  67171  +  1326  hypothetical protein  YP_112604  normal  0.501208  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0065  CDS  NC_002977  67161  67727  +  567  methyltransferase, putative  YP_112605  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0066  CDS  NC_002977  67724  68212  +  489  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  YP_112606  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0067  CDS  NC_002977  68235  70733  -  2499  glycogen phosphorylase  YP_112607  normal  0.599908  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0068  CDS  NC_002977  70801  71184  -  384  polyphosphate kinase-related protein  YP_112608  normal  0.97524  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0069  CDS  NC_002977  71264  71794  +  531  hypothetical protein  YP_112609  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0070  CDS  NC_002977  71806  73416  +  1611  Na/Pi-cotransporter family protein  YP_112610  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0071  CDS  NC_002977  73668  74252  -  585  hypothetical protein  YP_112611  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0072  CDS  NC_002977  74221  75024  -  804  hypothetical protein  YP_112612  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0073  CDS  NC_002977  75126  76223  +  1098  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  YP_112613  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0074  CDS  NC_002977  76264  76875  +  612  glutathione S-transferase  YP_112614  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0075  CDS  NC_002977  76932  77942  +  1011  lipase family protein  YP_112615  normal  0.70378  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0076  CDS  NC_002977  78087  79778  +  1692  patatin family protein  YP_112616  normal  0.869707  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0077  CDS  NC_002977  79817  80146  +  330  hypothetical protein  YP_112617  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0079  CDS  NC_002977  80931  84017  -  3087  AcrB/AcrD/AcrF family protein  YP_112618  normal  0.60921  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0080  CDS  NC_002977  84017  84919  -  903  hypothetical protein  YP_112619  normal  0.523588  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0081  CDS  NC_002977  85182  85664  +  483  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  YP_112620  normal  0.81622  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0082  CDS  NC_002977  85707  87020  -  1314  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  YP_112621  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0083  CDS  NC_002977  87198  88115  +  918  UbiE/COQ5 family methlytransferase  YP_112622  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0084  CDS  NC_002977  88186  89226  +  1041  hypothetical protein  YP_112623  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0085  CDS  NC_002977  89266  89619  +  354  hypothetical protein  YP_112624  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0086  CDS  NC_002977  89664  90116  -  453  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  YP_112625  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0087  CDS  NC_002977  90123  93521  -  3399  hypothetical protein  YP_112626  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0088  CDS  NC_002977  93547  94095  -  549  hypothetical protein  YP_112627  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0089  CDS  NC_002977  94123  95196  -  1074  pilin-like protein  YP_112628  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0090  CDS  NC_002977  95226  95816  -  591  type IV fimbrial biogenesis protein PilV, putative  YP_112629  normal  0.662578  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0091  CDS  NC_002977  95813  96361  -  549  hypothetical protein  YP_112630  normal  0.152728  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0092  CDS  NC_002977  96425  97483  -  1059  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  YP_112631  normal  0.155967  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0093  CDS  NC_002977  97563  98783  +  1221  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_112632  normal  0.374709  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0094  CDS  NC_002977  98827  99231  +  405  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  YP_112633  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0095  CDS  NC_002977  99236  101890  -  2655  cation transporter E1-E2 family ATPase  YP_112634  normal  0.668682  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0096  CDS  NC_002977  102004  103104  +  1101  ISMca1, transposase  YP_112635  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0097  CDS  NC_002977  103385  104815  -  1431  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B  YP_112636  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0098  CDS  NC_002977  104842  106299  -  1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  YP_112637  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0099  CDS  NC_002977  106353  106640  -  288  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  YP_112638  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0100  CDS  NC_002977  106745  107788  +  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_112639  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA0101  CDS  NC_002977  107807  108709  +  903  rod shape-determining protein MreC  YP_112640  normal  1  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>