1642 genes were found for organism Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
DET0001  CDS  NC_002936  261  1598  +  1338  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_180756  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0002  CDS  NC_002936  1924  3198  +  1275  GTPase ObgE  YP_180757  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0003  CDS  NC_002936  3186  3800  +  615  nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase  YP_180758  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0004  CDS  NC_002936  3881  5809  -  1929  DNA gyrase, B subunit  YP_180759  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0005  CDS  NC_002936  6013  8199  -  2187  GTP pyrophosphokinase  YP_180760  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0006  CDS  NC_002936  8328  9584  +  1257  histidyl-tRNA synthetase  YP_180761  normal  0.14648  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0007  CDS  NC_002936  9581  10744  +  1164  hypothetical protein  YP_180762  normal  0.870936  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0008  CDS  NC_002936  10741  11367  -  627  membrane protein  YP_180763  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0009  CDS  NC_002936  11400  12320  -  921  branched-chain amino acid aminotransferase  YP_180764  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0010  CDS  NC_002936  12308  12463  +  156  hypothetical protein  YP_180765  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0011  CDS  NC_002936  12471  13643  -  1173  DNA polymerase IV, putative  YP_180766  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0012  CDS  NC_002936  13643  13831  -  189  hypothetical protein  YP_180767  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0013  CDS  NC_002936  13903  14715  -  813  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_180768  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0014  CDS  NC_002936  14863  15558  +  696  hypothetical protein  YP_180769  normal  0.151106  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0015  CDS  NC_002936  15597  16391  +  795  putative lipoprotein  YP_180770  normal  0.0890287  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0016  CDS  NC_002936  16437  17756  +  1320  folylpolyglutamate synthetase  YP_180771  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0017  CDS  NC_002936  17736  17951  -  216  hypothetical protein  YP_180772  normal  0.312172  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0018  CDS  NC_002936  17965  18228  -  264  hypothetical protein  YP_180773  normal  0.174466  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0019  CDS  NC_002936  18528  18989  +  462  D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase  YP_180774  normal  0.465093  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0020  CDS  NC_002936  19041  19469  +  429  FUR family transcriptional regulator  YP_180775  normal  0.147149  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0021  CDS  NC_002936  19524  20276  -  753  hypothetical protein  YP_180776  normal  0.195832  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0022  CDS  NC_002936  20379  20765  +  387  hypothetical protein  YP_180777  normal  0.0438869  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0023  CDS  NC_002936  20846  20986  -  141  hypothetical protein  YP_180778  normal  0.0515339  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0024  CDS  NC_002936  21043  23430  -  2388  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  YP_180779  normal  0.0591884  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0025  CDS  NC_002936  23427  23927  -  501  competence protein ComEA, putative  YP_180780  normal  0.13299  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0026  CDS  NC_002936  24098  24763  -  666  potassium uptake protein, putative  YP_180781  normal  0.311155  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0027  CDS  NC_002936  24768  25172  -  405  potassium uptake protein, putative  YP_180782  normal  0.248151  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0028  CDS  NC_002936  25176  25604  -  429  universal stress protein  YP_180783  normal  0.406249  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0029  CDS  NC_002936  25680  27125  -  1446  Trk system potassium uptake protein, putative  YP_180784  normal  0.725548  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0030  CDS  NC_002936  27129  28493  -  1365  potassium transporter peripheral membrane component  YP_180785  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0031  CDS  NC_002936  28497  28649  -  153  hypothetical protein  YP_180786  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0032  CDS  NC_002936  28782  29732  -  951  cation efflux family protein  YP_180787  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0033  CDS  NC_002936  29881  30510  +  630  hypothetical protein  YP_180788  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0034  CDS  NC_002936  30503  31504  +  1002  phosphate transporter  YP_180789  normal  0.81002  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0035  CDS  NC_002936  31501  32121  -  621  guanylate kinase  YP_180790  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0036  CDS  NC_002936  32099  32389  -  291  hypothetical protein  YP_180791  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0037  CDS  NC_002936  32598  33446  +  849  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  YP_180792  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0038  CDS  NC_002936  33439  34836  +  1398  putative oxidoreductase  YP_180793  normal  0.237423  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0039  CDS  NC_002936  34833  35045  -  213  hypothetical protein  YP_180794  hitchhiker  0.000632413  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0040  CDS  NC_002936  35156  35689  -  534  hypothetical protein  YP_180795  hitchhiker  0.0000134652  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0041  CDS  NC_002936  35760  36266  -  507  quinone methlytransferase  YP_180796  unclonable  0.00000105816  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0042  CDS  NC_002936  36271  36363  -  93  hypothetical protein  YP_180797  unclonable  0.000000126857  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0043  CDS  NC_002936  36374  36568  -  195  hypothetical protein  YP_180798  unclonable  0.000000220124  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0044  CDS  NC_002936  36711  37082  +  372  hypothetical protein  YP_180799  unclonable  0.000000336906  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0045  CDS  NC_002936  37216  37662  +  447  redox family protein  YP_180800  unclonable  0.000000553397  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0046  CDS  NC_002936  37659  38762  -  1104  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_180801  unclonable  0.00000860975  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0047  CDS  NC_002936  38985  40184  +  1200  DNA polymerase III delta subunit-related protein  YP_180802  hitchhiker  0.00913059  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0048  CDS  NC_002936  40186  40797  +  612  hypothetical protein  YP_180803  normal  0.0254936  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0049  CDS  NC_002936  40831  41841  +  1011  ROK family protein  YP_180804  normal  0.331576  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0050  CDS  NC_002936  41957  44572  +  2616  alanyl-tRNA synthetase  YP_180805  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0051  CDS  NC_002936  44619  45020  +  402  hypothetical protein  YP_180806  normal  0.673741  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0052  CDS  NC_002936  45042  46220  +  1179  queuine tRNA-ribosyltransferase  YP_180807  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0053  CDS  NC_002936  46311  47453  +  1143  alcohol dehydrogenase, iron-containing  YP_180808  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0056  CDS  NC_002936  50873  51034  +  162  hypothetical protein  YP_180809  decreased coverage  0.00237011  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0057  CDS  NC_002936  51068  53542  +  2475  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  YP_180810  unclonable  0.00724799  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0058  CDS  NC_002936  53762  55150  +  1389  DNA repair protein RadA  YP_180811  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0059  CDS  NC_002936  55137  55820  +  684  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  YP_180812  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0060  CDS  NC_002936  55826  56299  +  474  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_180813  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0061  CDS  NC_002936  56303  57679  +  1377  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_180814  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0063  CDS  NC_002936  57770  59398  -  1629  resolvase domain-containing protein  YP_180815  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0064  CDS  NC_002936  59395  60327  -  933  hypothetical protein  YP_180816  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0065  CDS  NC_002936  60943  61803  -  861  virulence-related protein  YP_180817  normal  0.902286  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0066  CDS  NC_002936  61934  63169  -  1236  DNA methylase  YP_180818  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0067  CDS  NC_002936  63144  64328  -  1185  S-adenosylmethionine synthetase  YP_180819  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0068  CDS  NC_002936  64901  64999  -  99  hypothetical protein  YP_180820  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0069  CDS  NC_002936  64990  65346  -  357  HNH endonuclease domain-containing protein  YP_180821  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0070  CDS  NC_002936  65454  65888  -  435  hypothetical protein  YP_180822  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0071  CDS  NC_002936  66131  67672  -  1542  SNF2 family helicase  YP_180823  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0072  CDS  NC_002936  67896  70169  -  2274  phage/plasmid DNA primase, putative  YP_180824  normal  0.612885  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0073  CDS  NC_002936  70495  70914  -  420  hypothetical protein  YP_180825  normal  0.494686  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0074  CDS  NC_002936  70995  72935  -  1941  family A DNA-dependent DNA polymerase  YP_180826  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0075  CDS  NC_002936  73164  74357  +  1194  hypothetical protein  YP_180827  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0076  CDS  NC_002936  75226  75843  +  618  resolvase domain-containing protein  YP_180828  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0077  CDS  NC_002936  76009  76266  +  258  hypothetical protein  YP_180829  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0078  CDS  NC_002936  76921  77205  -  285  trichloroethene reductive dehalogenase anchoring protein, putative  YP_180830  normal  0.239502  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0079  CDS  NC_002936  77229  78893  -  1665  trichloroethene reductive dehalogenase  YP_180831  decreased coverage  0.00164109  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0080  CDS  NC_002936  79177  79710  +  534  hypothetical protein  YP_180832  decreased coverage  0.0000124553  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0081  CDS  NC_002936  79906  80883  -  978  hypothetical protein  YP_180833  normal  0.0127352  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0082    NC_002936  80934  81706  -  773      normal  0.0195461  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0083  CDS  NC_002936  81781  82047  -  267  ISDet1, transposase orfA  YP_180834  normal  0.376944  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0084  CDS  NC_002936  82185  82475  +  291  hypothetical protein  YP_180835  normal  0.394115  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0085  CDS  NC_002936  82975  83436  -  462  hypothetical protein  YP_180836  normal  0.339433  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0086  CDS  NC_002936  83436  83621  -  186  hipB protein, putative  YP_180837  normal  0.288329  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0087  CDS  NC_002936  83691  85808  -  2118  hypothetical protein  YP_180838  normal  0.130469  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0088  CDS  NC_002936  85832  86293  +  462  reductive dehalogenase domain-containing protein  YP_180839  normal  0.0721794  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0089  CDS  NC_002936  86386  87237  +  852  radical SAM domain-containing protein  YP_180840  normal  0.110563  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0090  CDS  NC_002936  87234  88049  +  816  radical SAM domain-containing protein  YP_180841  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0091  CDS  NC_002936  88197  88715  +  519  hypothetical protein  YP_180842  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0092  CDS  NC_002936  88814  89524  +  711  LuxR family DNA-binding response regulator  YP_180843  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0093  CDS  NC_002936  89695  89820  +  126  hypothetical protein  YP_180844  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0094  CDS  NC_002936  89828  90022  -  195  hypothetical protein  YP_180845  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0095  CDS  NC_002936  90038  92068  -  2031  ferrous iron transport protein B  YP_180846  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0096  CDS  NC_002936  92065  92373  -  309  feoA family protein  YP_180847  normal  0.0639757  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0097  CDS  NC_002936  92373  93089  -  717  iron dependent repressor, putative  YP_180848  decreased coverage  0.0071213  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0098  CDS  NC_002936  93341  93646  -  306  hypothetical protein  YP_180849  normal  0.0221803  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0099  CDS  NC_002936  93748  94902  -  1155  mobA family protein  YP_180850  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0100  CDS  NC_002936  94903  95592  -  690  hypothetical protein  YP_180851  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0101  CDS  NC_002936  95615  98716  -  3102  molybdopterin oxidoreductase  YP_180852  normal  1  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0102  CDS  NC_002936  98820  100001  -  1182  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  YP_180853  normal  0.757619  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0103  CDS  NC_002936  100022  100960  -  939  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit, putative  YP_180854  hitchhiker  0.00173897  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>