5813 genes were found for organism Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 59    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ava_0001  CDS  NC_007413  119  1501  +  1383  chromosomal replication initiation protein  YP_320522  normal  0.831436  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0002  CDS  NC_007413  1919  3082  +  1164  DNA polymerase III subunit beta  YP_320523  normal  0.273248  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0003  CDS  NC_007413  3177  4118  -  942  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  YP_320524  normal  0.158402  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0004  CDS  NC_007413  4122  5084  -  963  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  YP_320525  normal  0.101832  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0005  CDS  NC_007413  5435  6238  -  804  methyltransferase  YP_320526  normal  0.168517  normal  0.967482  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0006  CDS  NC_007413  6463  6915  +  453  hypothetical protein  YP_320527  normal  0.755501  normal  0.930196  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0007  CDS  NC_007413  6923  7354  +  432  NUDIX hydrolase  YP_320528  normal  0.768142  normal  0.930196  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0008  CDS  NC_007413  7568  7861  +  294  hypothetical protein  YP_320529  normal  0.371533  normal  0.927124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0009  CDS  NC_007413  8217  8645  -  429  hypothetical protein  YP_320530  normal  0.572879  normal  0.938857  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0010  CDS  NC_007413  8850  9500  +  651  PadR family transcriptional regulator  YP_320531  normal  0.341135  normal  0.976075  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0011  CDS  NC_007413  9853  10281  +  429  hypothetical protein  YP_320532  normal  0.318623  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0012  CDS  NC_007413  10376  11389  -  1014  Serine/threonine protein kinase  YP_320533  normal  0.207373  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0013  CDS  NC_007413  11732  12634  -  903  Alpha/beta hydrolase fold  YP_320534  normal  0.798898  normal  0.992459  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0014  CDS  NC_007413  12845  13366  +  522  hypothetical protein  YP_320535  normal  0.933141  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0015  CDS  NC_007413  13677  13877  +  201  hypothetical protein  YP_320536  normal  0.411198  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0016  CDS  NC_007413  13928  15118  +  1191  Iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_320537  normal  0.537378  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0017  CDS  NC_007413  15115  16326  +  1212  aspartate aminotransferase  YP_320538  normal  1  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0018  CDS  NC_007413  16356  16682  +  327  ArsR family transcriptional regulator  YP_320539  normal  1  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0019  CDS  NC_007413  17049  17357  -  309  hypothetical protein  YP_320540  normal  1  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0020  CDS  NC_007413  17810  18580  +  771  TPR repeat-containing protein  YP_320541  normal  1  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0021  CDS  NC_007413  18581  19231  +  651  TenA family transcription regulator  YP_320542  normal  1  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0022  CDS  NC_007413  19248  20486  -  1239  glycosyl transferase family protein  YP_320543  normal  0.882894  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0023  CDS  NC_007413  20934  22625  +  1692  dihydroxy-acid dehydratase  YP_320544  normal  0.393007  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0024  CDS  NC_007413  23031  24203  -  1173  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  YP_320545  normal  0.114696  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0025  CDS  NC_007413  24781  25518  +  738  hypothetical protein  YP_320546  normal  0.1702  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0026  CDS  NC_007413  25498  26658  -  1161  FAD dependent oxidoreductase  YP_320547  normal  0.127901  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0027  CDS  NC_007413  26778  27077  -  300  RNA-binding region RNP-1  YP_320548  normal  0.128331  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0028  CDS  NC_007413  27274  27447  -  174  hypothetical protein  YP_320549  normal  0.20786  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0029  CDS  NC_007413  27463  27873  -  411  hypothetical protein  YP_320550  normal  0.157046  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0030  CDS  NC_007413  28254  30899  +  2646  DNA topoisomerase I  YP_320551  normal  1  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0031  CDS  NC_007413  31205  31342  +  138  hypothetical protein  YP_320552  normal  1  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0032  CDS  NC_007413  31362  31811  +  450  3-dehydroquinate dehydratase  YP_320553  normal  1  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0033  CDS  NC_007413  31992  32927  +  936  hypothetical protein  YP_320554  normal  1  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0034  CDS  NC_007413  33198  35723  +  2526  metal dependent phosphohydrolase  YP_320555  normal  0.82668  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0035  CDS  NC_007413  35758  36249  -  492  hypothetical protein  YP_320556  normal  0.306407  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0036  CDS  NC_007413  36622  38565  +  1944  UDP-galactopyranose mutase  YP_320557  normal  0.404508  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0037  CDS  NC_007413  38890  39180  -  291  hypothetical protein  YP_320558  normal  0.0433386  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0038  CDS  NC_007413  39537  39920  +  384  hypothetical protein  YP_320559  normal  0.0299987  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0039  CDS  NC_007413  40066  45126  -  5061  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  YP_320560  normal  0.0781722  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0040  CDS  NC_007413  45762  46496  +  735  hypothetical protein  YP_320561  normal  0.164292  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0041  CDS  NC_007413  46754  47752  -  999  hypothetical protein  YP_320562  normal  0.0997117  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0042  CDS  NC_007413  47745  49103  -  1359  radical SAM family protein  YP_320563  normal  0.467834  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0043  CDS  NC_007413  49261  49602  -  342  hypothetical protein  YP_320564  normal  0.35876  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0044  CDS  NC_007413  50145  51302  +  1158  thiosulphate-binding protein  YP_320565  normal  0.195735  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0045  CDS  NC_007413  51352  52353  +  1002  phosphate binding protein  YP_320566  normal  0.8362  normal  0.817382  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0046  CDS  NC_007413  52424  53365  +  942  phosphate ABC transporter permease  YP_320567  normal  0.640676  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0047  CDS  NC_007413  53372  54271  +  900  phosphate ABC transporter permease  YP_320568  normal  0.519128  normal  0.369042  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0048  CDS  NC_007413  54333  55160  +  828  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  YP_320569  normal  0.240899  normal  0.357685  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0049  CDS  NC_007413  55168  58002  -  2835  HEAT repeat-containing PBS lyase  YP_320570  normal  0.229879  normal  0.368167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0050  CDS  NC_007413  58205  58576  +  372  hypothetical protein  YP_320571  normal  1  normal  0.511576  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0051  CDS  NC_007413  58987  60417  +  1431  hypothetical protein  YP_320572  normal  1  normal  0.858955  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0052  CDS  NC_007413  60546  61724  +  1179  hypothetical protein  YP_320573  normal  1  normal  0.806604  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0053  CDS  NC_007413  61940  64375  +  2436  filamentous haemagglutinin-like protein  YP_320574  normal  1  normal  0.710253  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0054  CDS  NC_007413  64368  67025  +  2658  TPR repeat-containing protein  YP_320575  normal  1  normal  0.494605  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0055  CDS  NC_007413  67154  68929  +  1776  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  YP_320576  normal  1  normal  0.291296  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0056  CDS  NC_007413  68966  69448  -  483  peptidoglycan binding domain-containing protein  YP_320577  normal  1  normal  0.136219  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0057  CDS  NC_007413  70214  71530  +  1317  gamma-glutamyl phosphate reductase  YP_320578  normal  0.944563  normal  0.275371  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0058  CDS  NC_007413  72155  73198  +  1044  response regulator receiver domain-containing protein  YP_320579  normal  0.259686  normal  0.253815  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0059  CDS  NC_007413  73215  73592  +  378  response regulator receiver domain-containing protein  YP_320580  normal  0.157498  normal  0.212271  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0060  CDS  NC_007413  73597  74106  +  510  CheW protein  YP_320581  normal  0.202075  normal  0.220201  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0061  CDS  NC_007413  74149  76407  +  2259  chemotaxis sensory transducer  YP_320582  normal  0.691552  normal  0.30416  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0062  CDS  NC_007413  76513  79437  +  2925  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  YP_320583  normal  0.172563  normal  0.120258  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0063  CDS  NC_007413  79620  80324  -  705  serine/threonine protein kinase  YP_320584  normal  0.996934  normal  0.123989  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0064  CDS  NC_007413  80617  85761  -  5145  Signal transduction histidine kinase  YP_320585  normal  1  normal  0.274411  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0065  CDS  NC_007413  86470  87060  +  591  response regulator receiver domain-containing protein  YP_320586  normal  0.670969  normal  0.0252366  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0066  CDS  NC_007413  87086  88219  +  1134  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  YP_320587  normal  0.359193  normal  0.0132857  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0067  CDS  NC_007413  88691  91012  +  2322  signal transduction protein  YP_320588  normal  0.571466  normal  0.0199052  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0068  CDS  NC_007413  91211  93052  -  1842  AAA ATPase, central region  YP_320589  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0069  CDS  NC_007413  93095  95002  -  1908  anion-transporting ATPase  YP_320590  normal  0.127982  hitchhiker  0.00261779  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0070  CDS  NC_007413  95040  95723  -  684  hypothetical protein  YP_320591  normal  0.0872353  hitchhiker  0.00188887  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0071  CDS  NC_007413  95876  96190  +  315  hypothetical protein  YP_320592  normal  0.141605  hitchhiker  0.00162501  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0072  CDS  NC_007413  96315  96692  -  378  gas vesicle G  YP_320593  normal  0.310149  hitchhiker  0.00170872  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0073  CDS  NC_007413  96706  97440  -  735  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  YP_320594  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0074  CDS  NC_007413  97546  98019  -  474  gas vesicle protein GVPa  YP_320595  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0075  CDS  NC_007413  98163  98609  -  447  gas vesicle protein GVPa  YP_320596  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0076  CDS  NC_007413  98606  99862  -  1257  ATPase associated with various cellular activities  YP_320597  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0077  CDS  NC_007413  100289  100678  -  390  gas vesicle protein GVPc  YP_320598  normal  0.0476763  hitchhiker  0.00500426  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0078  CDS  NC_007413  100886  101101  -  216  gas vesicle synthesis protein GvpA  YP_320599  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0079  CDS  NC_007413  101206  101421  -  216  gas vesicle synthesis protein GvpA  YP_320600  normal  0.0130989  normal  0.0117948  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0080  CDS  NC_007413  101885  102151  +  267  hypothetical protein  YP_320601  decreased coverage  0.00889015  normal  0.0110811  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0081  CDS  NC_007413  102908  104155  +  1248  hypothetical protein  YP_320602  normal  0.203435  normal  0.0152048  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0082  CDS  NC_007413  104299  106608  +  2310  hypothetical protein  YP_320603  hitchhiker  0.00502388  hitchhiker  0.00904  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0083  CDS  NC_007413  106817  112159  +  5343  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  YP_320604  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0084  CDS  NC_007413  112628  114013  +  1386  Serine/threonine protein kinase  YP_320605  decreased coverage  0.00298009  normal  0.0808498  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0085  CDS  NC_007413  114051  114953  -  903  sensor protein  YP_320606  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0086  CDS  NC_007413  115396  115920  +  525  hypothetical protein  YP_320607  normal  0.0304385  normal  0.0585823  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0087  CDS  NC_007413  116031  116459  -  429  hypothetical protein  YP_320608  normal  0.233962  normal  0.0598733  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0088  CDS  NC_007413  116511  117380  -  870  heat shock protein HtpX  YP_320609  normal  0.565985  normal  0.068582  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0089  CDS  NC_007413  118326  119957  +  1632  Sodium/hydrogen exchanger  YP_320610  normal  1  normal  0.0828946  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0090  CDS  NC_007413  120064  121200  +  1137  glycosyl transferase, group 1  YP_320611  normal  1  normal  0.22562  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0091  CDS  NC_007413  121274  123853  +  2580  adenylate/guanylate cyclase  YP_320612  normal  1  normal  0.101175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0092  CDS  NC_007413  124058  124342  -  285  hypothetical protein  YP_320613  normal  1  normal  0.102024  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0093  CDS  NC_007413  125194  125931  +  738  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  YP_320614  normal  1  normal  0.117725  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0094  CDS  NC_007413  126211  128727  +  2517  surface antigen variable number  YP_320615  normal  0.39497  normal  0.155801  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0095  CDS  NC_007413  128861  129703  +  843  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_320616  normal  0.23635  normal  0.121635  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0096  CDS  NC_007413  129780  130295  +  516  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_320617  normal  0.37224  normal  0.111836  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0097  CDS  NC_007413  130544  131362  +  819  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  YP_320618  normal  0.227518  normal  0.120525  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0098  CDS  NC_007413  131492  132646  +  1155  lipid-A-disaccharide synthase  YP_320619  normal  0.540012  normal  0.212271  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0099  CDS  NC_007413  132913  133137  -  225  hypothetical protein  YP_320620  normal  0.808751  normal  0.173804  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0100  CDS  NC_007413  133254  133838  -  585  hypothetical protein  YP_320621  normal  0.637727  normal  0.188122  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 59    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>