538 genes were found for organism Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CNE00010  CDS  NC_006687  1  871  -  871  hypothetical protein  XP_571125  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00020  CDS  NC_006687  1785  3474  +  1690  conserved hypothetical protein  XP_570691  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00030    NC_006687  1957  3506  -  1550      normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00040  CDS  NC_006687  4245  6105  -  1861  enolase 1, putative  XP_570692  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00050  CDS  NC_006687  6398  9319  +  2922  expressed protein  XP_571077  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00060  CDS  NC_006687  9579  10168  +  590  expressed protein  XP_570693  normal  0.0199126  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00070  CDS  NC_006687  10241  11704  -  1464  hypothetical protein  XP_571103  normal  0.344967  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00080  CDS  NC_006687  11882  14659  +  2778  hypothetical protein  XP_570694  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00090  CDS  NC_006687  15989  16370  -  382  hypothetical protein  XP_570696  normal  0.0429581  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00100  CDS  NC_006687  16399  18264  +  1866  retrotransposable element slacs 132 kda protein (orf2), putative  XP_570697  normal  0.21893  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00110  CDS  NC_006687  18342  21324  -  2983  conserved hypothetical protein  XP_571101  normal  0.441864  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00120  CDS  NC_006687  22402  24692  -  2291  sugar transporter, putative  XP_570698  normal  0.891292  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00130  CDS  NC_006687  25005  26115  +  1111  conserved hypothetical protein  XP_571079  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00140  CDS  NC_006687  26666  29748  +  3083  transketolase, putative  XP_570699  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00150  CDS  NC_006687  31376  32170  +  795  hypothetical protein  XP_570700  normal  0.0703811  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00160  CDS  NC_006687  32227  34506  -  2280  expressed protein  XP_570707  normal  0.377444  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00170  CDS  NC_006687  35382  37922  +  2541  cobalamin synthesis protein, putative  XP_570709  normal  0.488231  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00180  tRNA  NC_006687  38007  38114  +  108  tRNA-Lys    normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00190  CDS  NC_006687  38780  45692  -  6913  structural constituent of nuclear pore, putative  XP_570713  normal  0.357579  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00200  CDS  NC_006687  45749  46882  +  1134  transferase, putative  XP_570715  normal  0.0163416  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00210  CDS  NC_006687  47584  49264  +  1681  inorganic diphosphatase, putative  XP_571083  hitchhiker  0.000104648  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00220  CDS  NC_006687  49265  49834  -  570  hypothetical protein  XP_570717  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00230  CDS  NC_006687  49959  51490  +  1532  conserved hypothetical protein  XP_571085  normal  0.231233  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00240    NC_006687  52352  53768  -  1417      normal  0.112014  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00250  CDS  NC_006687  54086  58851  +  4766  cyclin-dependent protein kinase inhibitor, putative  XP_570719  normal  0.928368  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00260  CDS  NC_006687  59485  61710  -  2226  hypothetical protein  XP_570723  hitchhiker  0.00951238  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00270  CDS  NC_006687  63622  66221  +  2600  amino acid transporter, putative  XP_571087  normal  0.102961  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00280  CDS  NC_006687  66354  68138  +  1785  expressed protein  XP_571090  normal  0.142378  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00290  CDS  NC_006687  69197  71079  -  1883  hypothetical protein  XP_570725  normal  0.202198  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00300  CDS  NC_006687  71184  72252  +  1069  conserved hypothetical protein  XP_570727  normal  0.0612393  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00310  CDS  NC_006687  72244  73600  -  1357  tRNA 2'-phosphotransferase, putative  XP_570729  normal  0.0508161  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00320  CDS  NC_006687  73819  75885  +  2067  expressed protein  XP_570731  normal  0.0336655  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00330  CDS  NC_006687  76299  77711  +  1413  conserved hypothetical protein  XP_570733  hitchhiker  0.00932753  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00340  CDS  NC_006687  78065  80751  -  2687  hypothetical protein  XP_571098  normal  0.0166262  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00350  CDS  NC_006687  82280  84858  +  2579  Mitogen-activated protein kinase CPK1, putative  XP_571094  normal  0.0732962  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00360  CDS  NC_006687  85353  87956  +  2604  hypothetical protein  XP_570735  normal  0.0784899  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00370  CDS  NC_006687  88188  88687  -  500  hypothetical protein  XP_570737  normal  0.0233929  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00380  CDS  NC_006687  88984  92106  +  3123  hypothetical protein  XP_570741  normal  0.259998  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00390  CDS  NC_006687  92414  95249  -  2836  multidrug transporter, putative  XP_570743  normal  0.177552  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00400  CDS  NC_006687  99551  100626  -  1076  expressed protein  XP_571096  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00410  CDS  NC_006687  102496  105820  +  3325  expressed protein  XP_571106  normal  0.202532  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00420  CDS  NC_006687  106244  109830  -  3587  conserved hypothetical protein  XP_571126  normal  0.0686503  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00430  CDS  NC_006687  110485  115456  +  4972  expressed protein  XP_570747  normal  0.0643474  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00440  CDS  NC_006687  116091  117721  +  1631  carrier, putative  XP_571108  normal  0.0869971  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00450  CDS  NC_006687  119326  121016  -  1691  conserved hypothetical protein  XP_570749  normal  0.128943  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00460  CDS  NC_006687  121133  122210  +  1078  mitochondrial fission-related protein, putative  XP_570752  normal  0.12337  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00470  CDS  NC_006687  122984  125945  +  2962  conserved hypothetical protein  XP_571110  normal  0.177859  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00480  CDS  NC_006687  126961  128359  +  1399  expressed protein  XP_571112  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00490  CDS  NC_006687  128576  129970  +  1395  expressed protein  XP_571115  normal  0.365163  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00500  CDS  NC_006687  130042  132360  -  2319  cop9 signalosome complex subunit 1, putative  XP_570755  normal  0.278053  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00510  CDS  NC_006687  132574  136701  +  4128  DNA repair protein rad16, putative  XP_570757  normal  0.17517  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00520  CDS  NC_006687  137221  139756  +  2536  mitogen-activated protein (MAP) kinase  XP_570760  normal  0.211579  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00530  CDS  NC_006687  142222  144557  +  2336  hypothetical protein  XP_570762  normal  0.0364167  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00540  CDS  NC_006687  146957  148092  +  1136  expressed protein  XP_570764  normal  0.187547  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00550  CDS  NC_006687  148042  149581  -  1540  conserved hypothetical protein  XP_570766  normal  0.187264  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00560  CDS  NC_006687  149724  150887  -  1164  3,4 dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase, putative  XP_570768  normal  0.145417  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00570  CDS  NC_006687  151210  153530  +  2321  conserved hypothetical protein  XP_570770  normal  0.351381  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00580  CDS  NC_006687  155264  156255  -  992  glutathione peroxidase, putative  XP_570772  normal  0.256439  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00590  CDS  NC_006687  156697  158941  -  2245  conserved hypothetical protein  XP_571165  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00600  CDS  NC_006687  159512  160549  -  1038  hypothetical protein  XP_570774  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00610  CDS  NC_006687  160886  163251  +  2366  ER-associated protein catabolism-related protein, putative  XP_570776  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00620  CDS  NC_006687  164107  168708  -  4602  conserved hypothetical protein  XP_570778  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00630  CDS  NC_006687  168869  170898  -  2030  conserved hypothetical protein  XP_570780  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00640  CDS  NC_006687  172850  173958  +  1109  conserved hypothetical protein  XP_570783  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00650  CDS  NC_006687  173949  175352  -  1404  cytoplasm protein, putative  XP_570785  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00660  CDS  NC_006687  176797  179610  +  2814  KEX1 protein precursor, putative  XP_570787  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00670  CDS  NC_006687  179678  181083  -  1406  conserved hypothetical protein  XP_571164  normal  0.78575  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00680  CDS  NC_006687  183135  183968  +  834  conserved hypothetical protein  XP_570789  normal  0.310644  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00690  CDS  NC_006687  184157  185633  -  1477  nucleus protein, putative  XP_570791  normal  0.507637  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00700  CDS  NC_006687  185835  189214  +  3380  meiotic DNA double-strand break processing-related protein, putative  XP_571170  normal  0.880608  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00710  CDS  NC_006687  189209  190678  -  1470  mannitol-1-phosphate dehydrogenase, putative  XP_570793  normal  0.797192  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00720  CDS  NC_006687  194173  197489  +  3317  conserved hypothetical protein  XP_570795  normal  0.107944  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00730  CDS  NC_006687  197575  198783  -  1209  conserved hypothetical protein  XP_570797  normal  0.0133776  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00740  CDS  NC_006687  199052  200185  -  1134  translation initiation factor, putative  XP_571127  normal  0.15304  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00750  CDS  NC_006687  200571  201920  +  1350  ATP synthase gamma chain, mitochondrial precursor, putative  XP_570799  normal  0.30729  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00760  CDS  NC_006687  202246  203234  +  989  conserved hypothetical protein  XP_571163  normal  0.549708  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00770  CDS  NC_006687  203281  206961  -  3681  plasma membrane protein, putative  XP_570801  normal  0.867124  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00780  CDS  NC_006687  207174  208876  -  1703  expressed protein  XP_571128  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00790  CDS  NC_006687  209103  210078  -  976  conserved hypothetical protein  XP_570804  normal  0.578069  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00800  CDS  NC_006687  210286  212057  +  1772  vacuole protein, putative  XP_570806  normal  0.714607  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00810  CDS  NC_006687  213006  215384  +  2379  expressed protein  XP_571166  normal  0.888251  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00820  CDS  NC_006687  216968  218316  +  1349  glycerol dehydrogenase, putative  XP_570808  normal  0.0845066  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00830  CDS  NC_006687  218637  220015  +  1379  hypothetical protein  XP_570810  normal  0.293944  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00840  CDS  NC_006687  220470  224673  +  4204  hypothetical protein  XP_570812  normal  0.515012  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00850  CDS  NC_006687  224795  227164  -  2370  flavin-containing monooxygenase, putative  XP_570814  normal  0.13103  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00860  CDS  NC_006687  229044  230503  +  1460  conserved hypothetical protein  XP_570816  normal  0.0324614  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00870  CDS  NC_006687  232034  233674  +  1641  endoplasmic reticulum protein, putative  XP_570818  normal  0.174287  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00880  CDS  NC_006687  233665  235901  -  2237  conserved hypothetical protein  XP_570821  normal  0.225651  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00890  CDS  NC_006687  238235  240190  -  1956  phosphoric monoester hydrolase, putative  XP_570823  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00900  CDS  NC_006687  241391  242939  +  1549  cytoplasm protein, putative  XP_571167  normal  0.957355  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00910  CDS  NC_006687  244558  247792  -  3235  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  XP_570825  normal  0.752282  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00920  CDS  NC_006687  247974  252007  +  4034  conserved hypothetical protein  XP_570827  normal  0.491475  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00930  CDS  NC_006687  251980  254931  -  2952  expressed protein  XP_570829  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00940  CDS  NC_006687  255676  258297  +  2622  conserved hypothetical protein  XP_570831  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00950  CDS  NC_006687  258927  263684  +  4758  cytoplasm protein, putative  XP_570835  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00960  CDS  NC_006687  264188  266058  -  1871  conserved hypothetical protein  XP_570837  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00970  CDS  NC_006687  267190  272706  +  5517  conserved hypothetical protein  XP_571168  normal  0.895196  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00980  CDS  NC_006687  272674  273818  -  1145  coproporphyrinogen oxidase, putative  XP_571169  hitchhiker  0.00531403  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE00990  CDS  NC_006687  274311  276458  +  2148  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  XP_570839  normal  0.0509253  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNE01000  CDS  NC_006687  276279  280533  -  4255  GTPase activating protein, putative  XP_570841  normal  0.318481  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>