246 genes were found for organism Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CNN00010    NC_006683  2568  3638  +  1071      normal  0.631149  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00020  CDS  NC_006683  5099  7366  -  2268  transcription factor, putative  XP_568510  normal  0.155457  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00030  CDS  NC_006683  8205  10126  -  1922  hypothetical protein  XP_568511  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00040  CDS  NC_006683  10535  12981  +  2447  expressed protein  XP_568512  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00050  CDS  NC_006683  13815  15830  -  2016  Rds1 protein, putative  XP_568514  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00060  CDS  NC_006683  17778  21590  +  3813  RNA polymerase II transcription factor, putative  XP_568515  normal  0.0968509  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00070  CDS  NC_006683  21712  26823  -  5112  protein-nucleus import-related protein, putative  XP_568516  normal  0.134577  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00080  CDS  NC_006683  26996  29697  +  2702  glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase, putative  XP_568517  normal  0.286173  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00090  CDS  NC_006683  31594  32631  -  1038  ribosome biogenesis-related protein, putative  XP_568518  normal  0.0451949  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00100  CDS  NC_006683  33927  36072  -  2146  hypothetical protein  XP_568519  normal  0.519073  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00110    NC_006683  37176  39235  -  2060      normal  0.0901643  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00120  CDS  NC_006683  40939  45159  +  4221  ribosomal protein, putative  XP_568520  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00130  CDS  NC_006683  45699  48498  -  2800  hypothetical protein  XP_568521  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00140  CDS  NC_006683  48855  51385  +  2531  hydrolase, putative  XP_568522  normal  0.207981  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00150  CDS  NC_006683  54618  57143  -  2526  alpha-glucoside:hydrogen symporter, putative  XP_568523  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00160  CDS  NC_006683  63407  68404  +  4998  protein-histidine kinase, putative  XP_568524  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00170  CDS  NC_006683  69030  72826  +  3797  nuclear localization sequence binding protein, putative  XP_568525  normal  0.479397  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00180  CDS  NC_006683  75070  77241  +  2172  nucleus protein, putative  XP_568526  normal  0.110156  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00190  CDS  NC_006683  78797  83131  -  4335  conserved hypothetical protein  XP_568731  normal  0.619242  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00200  CDS  NC_006683  84012  86149  -  2138  nucleolus protein, putative  XP_568528  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00210  CDS  NC_006683  86375  88543  +  2169  hypothetical protein  XP_568529  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00220  CDS  NC_006683  91100  91954  -  855  glutathione peroxidase, putative  XP_568531  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00230  CDS  NC_006683  92737  93779  +  1043  RNA binding protein, putative  XP_568533  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00240  CDS  NC_006683  93908  96347  -  2440  expressed protein  XP_568535  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00250  tRNA  NC_006683  96725  96795  -  71  tRNA-Gly    normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00260  CDS  NC_006683  98447  101708  +  3262  sugar transporter, putative  XP_568537  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00270  CDS  NC_006683  102498  103567  -  1070  deacetylase, putative  XP_568540  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00280    NC_006683  104531  106651  -  2121      normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00290  CDS  NC_006683  107224  109297  +  2074  expressed protein  XP_568543  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00300  CDS  NC_006683  109297  111089  -  1793  conserved hypothetical protein  XP_568545  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00310  CDS  NC_006683  111763  113166  +  1404  cytoplasm protein, putative  XP_568547  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00320  CDS  NC_006683  113282  113764  -  483  hypothetical protein  XP_568549  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00330  CDS  NC_006683  114343  114956  -  614  expressed protein  XP_568551  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00340  CDS  NC_006683  115715  116340  +  626  expressed protein  XP_568554  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00350  CDS  NC_006683  116857  120160  -  3304  glutamate-cysteine ligase, putative  XP_568556  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00360  CDS  NC_006683  120922  124392  -  3471  protein kinase Sch9, putative  XP_568558  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00370  CDS  NC_006683  125184  126220  -  1037  conserved hypothetical protein  XP_568560  normal  0.316399  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00380  CDS  NC_006683  128189  129258  -  1070  expressed protein  XP_568735  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00390  CDS  NC_006683  129341  131181  +  1841  expressed protein  XP_568562  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00400  CDS  NC_006683  134174  138758  +  4585  conserved hypothetical protein  XP_568564  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00410  CDS  NC_006683  139139  142143  -  3005  cytoplasm protein, putative  XP_568566  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00420  CDS  NC_006683  144529  146704  +  2176  hypothetical protein  XP_568568  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00430  CDS  NC_006683  147922  150229  -  2308  phosphoglucomutase, putative  XP_568570  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00440  CDS  NC_006683  150460  153017  +  2558  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  XP_568572  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00450  CDS  NC_006683  153335  154293  +  959  conserved hypothetical protein  XP_568574  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00460  CDS  NC_006683  154539  155504  +  966  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  XP_568576  normal  0.528435  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00470  CDS  NC_006683  157894  160210  -  2317  conserved hypothetical protein  XP_568578  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00480  CDS  NC_006683  160485  162074  +  1590  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  XP_568580  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00490  CDS  NC_006683  162811  165441  +  2631  expressed protein  XP_568582  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00500  CDS  NC_006683  167857  170355  +  2499  conserved hypothetical protein  XP_568584  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00510  CDS  NC_006683  171127  174133  +  3007  L-fucose permease, putative  XP_568730  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00520  CDS  NC_006683  177883  178589  +  707  zinc finger protein, putative  XP_568585  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00530  CDS  NC_006683  178743  182128  -  3386  GTPase activator, putative  XP_568586  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00540  CDS  NC_006683  182603  185228  +  2626  conserved hypothetical protein  XP_568587  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00550  CDS  NC_006683  187237  189851  +  2615  DNA-binding protein cre-1, putative  XP_568732  normal  0.141726  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00560  CDS  NC_006683  190383  190826  -  444  hypothetical protein  XP_568588  normal  0.37783  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00570  CDS  NC_006683  191023  193360  -  2338  hypothetical protein  XP_568590  normal  0.0847196  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00580  CDS  NC_006683  193836  195602  +  1767  expressed protein  XP_568592  normal  0.0611679  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00590  CDS  NC_006683  195773  197768  -  1996  expressed protein  XP_568734  normal  0.358871  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00600  tRNA  NC_006683  198564  198634  +  71  tRNA-Gly    normal  0.0792661  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00610  CDS  NC_006683  198987  202553  -  3567  expressed protein  XP_568593  normal  0.430818  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00620  CDS  NC_006683  203122  203404  -  283  hypothetical protein  XP_568595  normal  0.597897  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00630  CDS  NC_006683  204548  206460  +  1913  DNA replication factor, putative  XP_568597  normal  0.853584  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00640  CDS  NC_006683  207494  209642  +  2149  hypothetical protein  XP_568733  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00650  CDS  NC_006683  209716  212927  -  3212  kinesin, putative  XP_568600  normal  0.802079  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00660  CDS  NC_006683  213138  214343  -  1206  glucan 1,3 beta-glucosidase protein putative  XP_568739  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00670  CDS  NC_006683  216190  218270  -  2081  expressed protein  XP_568602  normal  0.94962  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00680  CDS  NC_006683  219914  225234  -  5321  ABC transporter PMR5, putative  XP_568604  normal  0.284647  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00690  CDS  NC_006683  226416  229306  -  2891  expressed protein  XP_568606  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00700  CDS  NC_006683  229691  231433  +  1743  conserved hypothetical protein  XP_568608  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00710  CDS  NC_006683  231697  232700  -  1004  hypothetical protein  XP_568610  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00720  CDS  NC_006683  233092  234195  +  1104  SUMO activating enzyme, putative  XP_568612  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00730  CDS  NC_006683  234265  235303  -  1039  transcription from Pol II promoter-related protein, putative  XP_568738  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00740    NC_006683  235959  236587  +  629      normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00750  CDS  NC_006683  237941  240012  -  2072  MDM10, putative  XP_568737  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00760  CDS  NC_006683  244577  245071  -  495  hypothetical protein  XP_568614  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00770  CDS  NC_006683  249049  254466  -  5418  ABC transporter PMR5, putative  XP_568616  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00780  CDS  NC_006683  255549  257034  +  1486  expressed protein  XP_568618  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00790  CDS  NC_006683  257357  259500  -  2144  hypothetical protein  XP_568620  normal  0.988321  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00800  CDS  NC_006683  260213  260524  +  312  hypothetical protein  XP_568622  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00810  CDS  NC_006683  260692  264445  -  3754  ER to Golgi transport-related protein, putative  XP_568624  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00820  CDS  NC_006683  264612  266723  +  2112  pseudouridylate synthase, putative  XP_568627  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00830  CDS  NC_006683  271879  273693  +  1815  mitochondrion protein, putative  XP_568629  normal  0.671697  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00840  CDS  NC_006683  273677  275184  -  1508  hypothetical protein  XP_568631  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00850  CDS  NC_006683  275944  277866  -  1923  hydrolase, putative  XP_568633  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00860  CDS  NC_006683  277972  279745  -  1774  alcohol dehydrogenase, putative  XP_568635  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00870  CDS  NC_006683  280108  282117  -  2010  endopeptidase, putative  XP_568638  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00880  CDS  NC_006683  282493  282709  +  217  hypothetical protein  XP_568640  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00890  CDS  NC_006683  283569  289991  +  6423  hypothetical protein  XP_568642  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00900  CDS  NC_006683  290052  290701  +  650  hypothetical protein  XP_568644  normal  0.417625  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00910  CDS  NC_006683  290972  292683  +  1712  nucleolar protein, putative  XP_568646  normal  0.82059  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00920  CDS  NC_006683  293083  296591  +  3509  conserved hypothetical protein  XP_568648  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00930  CDS  NC_006683  296947  297943  +  997  endoplasmic reticulum protein, putative  XP_568655  normal  0.345863  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00940  CDS  NC_006683  298075  299646  -  1572  protein kinase, putative  XP_568656  normal  0.433033  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00950  CDS  NC_006683  300194  302647  +  2454  conserved hypothetical protein  XP_568530  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00960  CDS  NC_006683  302715  303666  -  952  hypothetical protein  XP_568532  normal  0.899806  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00970  CDS  NC_006683  304167  306109  +  1943  RAB-protein geranylgeranyltransferase, putative  XP_568534  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00980  CDS  NC_006683  306213  308147  +  1935  hypothetical protein  XP_568736  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN00990  CDS  NC_006683  308117  309975  -  1859  hydrolase, putative  XP_568536  normal  0.164651  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNN01000  CDS  NC_006683  310587  311149  +  563  hypothetical protein  XP_568539  decreased coverage  0.00403303  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>