260 genes were found for organism Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CNL02210  tRNA  NC_006682  679249  679341  +  93  tRNA-Tyr    normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL02220  tRNA  NC_006682  679351  679469  +  119  tRNA-Lys    normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00010  CDS  NC_006682  213  2368  -  2156  transporter, putative  XP_568395  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00020  CDS  NC_006682  2815  4183  -  1369  expressed protein  XP_568392  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00030  CDS  NC_006682  5545  7531  +  1987  multidrug transporter, putative  XP_568393  normal  0.678764  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00040  CDS  NC_006682  8086  10450  -  2365  expressed protein  XP_568390  normal  0.865941  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00050  CDS  NC_006682  12166  15364  +  3199  amino acid transporter, putative  XP_568372  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00060  CDS  NC_006682  15414  16757  -  1344  expressed protein  XP_568445  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00070  CDS  NC_006682  17330  18820  +  1491  Rho GTPase, putative  XP_568391  normal  0.261976  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00080  CDS  NC_006682  19042  19928  -  887  peptide alpha-N-acetyltransferase, putative  XP_568389  normal  0.0749508  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00090  CDS  NC_006682  20341  22384  +  2044  glycoprotein, putative  XP_568387  normal  0.107254  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00100  CDS  NC_006682  22713  24782  +  2070  expressed protein  XP_568385  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00110  CDS  NC_006682  24854  26967  -  2114  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase, putative  XP_568380  normal  0.0438668  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00120  CDS  NC_006682  27665  28685  +  1021  hypothetical protein  XP_568383  decreased coverage  0.000239174  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00130  CDS  NC_006682  28831  30494  -  1664  hypothetical protein  XP_568381  hitchhiker  0.00163838  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00140  CDS  NC_006682  30656  33816  +  3161  hypothetical protein  XP_568379  decreased coverage  0.00124325  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00150  CDS  NC_006682  33993  35629  -  1637  hypothetical protein  XP_568388  normal  0.10641  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00160  CDS  NC_006682  35860  36899  +  1040  conserved hypotetical protein  XP_568377  normal  0.0544501  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00170  CDS  NC_006682  37127  38875  +  1749  asparaginase, putative  XP_568375  decreased coverage  0.000410367  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00180  CDS  NC_006682  39092  41755  +  2664  cyclohydrolase, putative  XP_568373  normal  0.0672332  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00190  CDS  NC_006682  42058  43884  -  1827  expressed protein  XP_568371  normal  0.159383  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00200  CDS  NC_006682  43899  45234  -  1336  hypothetical protein  XP_568443  normal  0.183417  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00210    NC_006682  48300  49806  +  1507      normal  0.0886676  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00220  CDS  NC_006682  48468  50981  -  2514  conserved hypothetical protein  XP_568386  normal  0.339373  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00230  CDS  NC_006682  52163  54041  +  1879  hypothetical protein  XP_568370  normal  0.616426  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00240  CDS  NC_006682  54172  55701  -  1530  NADH-cytochrome b5 reductase, putative  XP_568369  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00250  CDS  NC_006682  55852  58015  +  2164  vacuole protein, putative  XP_568436  normal  0.131555  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00260  CDS  NC_006682  62225  64610  -  2386  conserved hypothetical protein  XP_568384  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00270  CDS  NC_006682  65651  67450  -  1800  expressed protein  XP_568378  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00280  CDS  NC_006682  67850  69601  +  1752  expressed protein  XP_568452  normal  0.249261  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00290  CDS  NC_006682  70504  73052  +  2549  conserved hypothetical protein  XP_568438  normal  0.787141  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00300  CDS  NC_006682  73459  79246  +  5788  hypothetical protein  XP_568368  normal  0.212573  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00310  CDS  NC_006682  79669  81297  -  1629  conserved hypothetical protein  XP_568376  decreased coverage  0.00875379  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00320  CDS  NC_006682  81460  84727  +  3268  Rab GTPase activator, putative  XP_568367  normal  0.0237243  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00330  CDS  NC_006682  84712  86474  -  1763  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  XP_568382  normal  0.10395  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00340  CDS  NC_006682  86541  87227  +  687  hypothetical protein  XP_568489  normal  0.124277  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00350  CDS  NC_006682  87261  88683  -  1423  conserved hypothetical protein  XP_568374  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00360  CDS  NC_006682  89595  91849  +  2255  aspartate transaminase, putative  XP_568366  normal  0.0699842  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00370  CDS  NC_006682  91630  93739  -  2110  Aryl-alcohol dehydrogenase, putative  XP_568365  normal  0.406444  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00380  CDS  NC_006682  95075  96502  -  1428  hypothetical protein  XP_568364  normal  0.526682  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00390  CDS  NC_006682  96605  97377  +  773  expressed protein  XP_568363  normal  0.370664  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00400  CDS  NC_006682  97443  99405  -  1963  expressed protein  XP_568441  normal  0.596318  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00410  CDS  NC_006682  100707  103660  +  2954  beta-glucan synthesis-associated protein, putative  XP_568362  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00420  CDS  NC_006682  104373  106098  +  1726  expressed protein  XP_568361  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00430  CDS  NC_006682  106173  107282  -  1110  hypothetical protein  XP_568490  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00440  CDS  NC_006682  107599  108448  +  850  ADP-ribosylation-like factor, putative  XP_568360  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00450  CDS  NC_006682  108534  111417  -  2884  expressed protein  XP_568456  normal  0.98204  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00460  CDS  NC_006682  113368  116986  +  3619  allantoin permease, putative  XP_568358  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00470  CDS  NC_006682  117222  119107  -  1886  conserved hypothetical protein  XP_568357  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00480  CDS  NC_006682  119293  122411  +  3119  conserved hypothetical protein  XP_568356  normal  0.823432  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00490  CDS  NC_006682  128864  129597  -  734  hypothetical protein  XP_568354  normal  0.195793  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00500    NC_006682  130508  134872  +  4365      normal  0.118626  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00510    NC_006682  134929  138054  -  3126      normal  0.0721861  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00520    NC_006682  138096  138629  -  534      decreased coverage  0.0038147  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00530    NC_006682  138627  143360  +  4734      normal  0.0903388  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00540    NC_006682  147714  158351  -  10638      normal  0.271423  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00550    NC_006682  159328  161070  +  1743      normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00560    NC_006682  161121  170552  -  9432      normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00570    NC_006682  174116  174700  +  585      normal  0.112431  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00580  CDS  NC_006682  182012  183433  -  1422  conserved hypothetical protein  XP_568491  normal  0.347896  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00590  CDS  NC_006682  183649  184920  +  1272  conserved hypothetical protein  XP_568353  normal  0.0238603  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00600  CDS  NC_006682  186282  187890  -  1609  galactose metabolism-related protein, putative  XP_568352  normal  0.111789  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00610  CDS  NC_006682  188362  190561  +  2200  galactokinase, putative  XP_568351  normal  0.707982  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00620  CDS  NC_006682  191194  192943  +  1750  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  XP_568349  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00630  CDS  NC_006682  194567  196533  -  1967  trehalose transport-related protein, putative  XP_568347  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00640  CDS  NC_006682  197049  199874  +  2826  conserved hypothetical protein  XP_568345  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00650  CDS  NC_006682  201284  202360  -  1077  hypothetical protein  XP_568343  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00660  CDS  NC_006682  202580  205790  +  3211  hypothetical protein  XP_568341  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00670  CDS  NC_006682  205854  207998  -  2145  conserved hypothetical protein  XP_568448  normal  0.511297  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00680  CDS  NC_006682  207931  209644  +  1714  cytoplasm protein, putative  XP_568339  normal  0.822893  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00690  CDS  NC_006682  209209  213282  -  4074  hypothetical protein  XP_568337  normal  0.218688  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00700  CDS  NC_006682  214306  215974  +  1669  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 6, putative  XP_568335  normal  0.0896667  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00710  CDS  NC_006682  216024  216938  +  915  hypothetical protein  XP_568333  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00720  CDS  NC_006682  217269  218811  -  1543  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  XP_568331  normal  0.564736  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00730  CDS  NC_006682  218952  219967  -  1016  hypothetical protein  XP_568329  normal  0.534073  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00740  CDS  NC_006682  220161  223572  +  3412  conserved hypothetical protein  XP_568327  normal  0.125639  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00750    NC_006682  222830  223550  -  721      normal  0.407923  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00760  CDS  NC_006682  223557  224597  -  1041  conserved hypothetical protein  XP_568494  normal  0.041622  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00770  CDS  NC_006682  225252  226658  -  1407  expressed protein  XP_568426  normal  0.0695551  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00780  CDS  NC_006682  229515  232266  -  2752  chromatin remodeling-related protein, putative  XP_568325  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00790  CDS  NC_006682  233217  236926  +  3710  expressed protein  XP_568323  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00800  CDS  NC_006682  238486  241064  +  2579  amino acid transporter, putative  XP_568394  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00810  CDS  NC_006682  241677  242682  +  1006  expressed protein  XP_568454  normal  0.365414  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00820  CDS  NC_006682  242488  243857  -  1370  chorismate mutase, putative  XP_568424  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00830  CDS  NC_006682  245188  246481  -  1294  cytoplasm protein, putative  XP_568422  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00840  CDS  NC_006682  246956  247871  -  916  expressed protein  XP_568420  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00850  CDS  NC_006682  249446  251366  -  1921  cytoplasm protein, putative  XP_568418  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00860  CDS  NC_006682  251513  253465  +  1953  conserved hypothetical protein  XP_568396  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00870  CDS  NC_006682  254754  255779  -  1026  conserved hypothetical protein  XP_568493  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00880  CDS  NC_006682  256724  258338  -  1615  DNA polymerase processivity factor, putative  XP_568321  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00890  CDS  NC_006682  258565  261321  +  2757  inositol/phosphatidylinositol phosphatase, putative  XP_568319  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00900  CDS  NC_006682  262479  266217  +  3739  conserved hypothetical protein  XP_568317  normal  0.317293  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00910  CDS  NC_006682  272831  274411  +  1581  delayed-type hypersensitivity antigen - related  XP_568398  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00920  CDS  NC_006682  275338  277942  +  2605  lysophospholipase, putative  XP_568399  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00930  CDS  NC_006682  277860  279961  -  2102  cyclin-dependent protein kinase, putative  XP_568416  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00940  CDS  NC_006682  280600  283922  +  3323  hypothetical protein  XP_568492  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00950  CDS  NC_006682  284106  286314  -  2209  Aspartate aminotransferase, mitochondrial precursor, putative  XP_568414  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00960  CDS  NC_006682  286902  287091  +  190  hypothetical protein  XP_568315  normal  0.0563621  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00970  CDS  NC_006682  287278  289759  +  2482  expressed protein  XP_568401  normal  0.594107  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNM00980  CDS  NC_006682  290521  290877  +  357  hypothetical protein  XP_568313  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>