1217 genes were found for organism Brucella suis 1330



Page 1 of 13    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BRA0001  CDS  NC_004311  155  1348  1194  replication initiation protein RepC  NP_699208  unclonable  0.0000780198  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0002  CDS  NC_004311  1413  1562  150  hypothetical protein  NP_699209  normal  0.0360428  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0003  CDS  NC_004311  1551  1814  264  hypothetical protein  NP_699210  normal  0.0889068  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0004  CDS  NC_004311  1963  2076  114  hypothetical protein  NP_699211  normal  0.114052  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0005  CDS  NC_004311  2092  3033  942  ribokinase, putative  NP_699212  normal  0.0831175  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0006  CDS  NC_004311  3110  4108  999  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  NP_699213  normal  0.194545  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0007  CDS  NC_004311  4131  5042  912  ABC transporter, permease protein  NP_699214  normal  0.785544  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0008  CDS  NC_004311  5039  6118  1080  ABC transporter, permease protein, putative  NP_699215  normal  0.451732  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0009  CDS  NC_004311  6180  7751  1572  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_699216  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0010  CDS  NC_004311  7754  8860  1107  Bmp family lipoprotein  NP_699217  normal  0.98305  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0011  CDS  NC_004311  9104  9712  609  hypothetical protein  NP_699218  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0012  CDS  NC_004311  9684  10316  633  enterobactin synthetase, component D, putative  NP_699219  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0013  CDS  NC_004311  10399  11175  777  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  NP_699220  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0014  CDS  NC_004311  11175  12047  873  isochorismatase  NP_699221  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0015  CDS  NC_004311  12099  13718  1620  enterobactin synthase subunit E  NP_699222  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0016  CDS  NC_004311  13825  15000  1176  isochorismate synthase  NP_699223  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0017  CDS  NC_004311  15072  16481  1410  enterobactin synthetase, component F, putative  NP_699224  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0018  CDS  NC_004311  16529  17317  789  oxidoreductase, molybdopterin-binding  NP_699225  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0019  CDS  NC_004311  17314  18123  810  HupC/HyaC/HydC family protein  NP_699226  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0020  CDS  NC_004311  18184  18423  240  hypothetical protein  NP_699227  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0021  CDS  NC_004311  18608  19132  525  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  NP_699228  normal  0.376729  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0022  CDS  NC_004311  19122  19757  636  hypothetical protein  NP_699229  normal  0.909042  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0023  CDS  NC_004311  19803  20543  741  GntR family transcriptional regulator  NP_699230  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0024  CDS  NC_004311  20661  22076  1416  branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  NP_699231  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0025  CDS  NC_004311  22118  23107  990  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  NP_699232  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0026  CDS  NC_004311  23111  24331  1221  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  NP_699233  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0027  CDS  NC_004311  24331  25083  753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  NP_699234  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0028  CDS  NC_004311  25083  25799  717  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  NP_699235  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0029  CDS  NC_004311  25851  26333  483  glyoxalase family protein  NP_699236  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0030  CDS  NC_004311  26337  27074  738  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  NP_699237  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0031  CDS  NC_004311  27092  27844  753  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  NP_699238  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0032  CDS  NC_004311  27954  30143  2190  acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit, putative  NP_699239  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0033  CDS  NC_004311  30162  31427  1266  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  NP_699240  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0034  CDS  NC_004311  31528  32313  786  shikimate dehydrogenase family protein  NP_699241  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0035  CDS  NC_004311  32593  32886  294  hypothetical protein  NP_699242  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0036  CDS  NC_004311  32840  33121  282  hypothetical protein  NP_699243  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0037  CDS  NC_004311  33239  35956  2718  magnesium ion-transporting ATPase E1-E2 family protein  NP_699244  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0038  CDS  NC_004311  36041  36391  351  hypothetical protein  NP_699245  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0039  CDS  NC_004311  36522  36725  204  hypothetical protein  NP_699246  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0040  CDS  NC_004311  36727  37443  717  MgtC family protein  NP_699247  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0041  CDS  NC_004311  37518  38588  1071  sensor histidine kinase  NP_699248  normal  0.708956  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0042  CDS  NC_004311  38585  39223  639  LuxR family DNA-binding response regulator  NP_699249  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0043  CDS  NC_004311  39609  39971  363  response regulator  NP_699250  normal  0.868286  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0044  CDS  NC_004311  40290  41180  891  formiminoglutamase, putative  NP_699251  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0045  CDS  NC_004311  41342  42118  777  inositol monophosphatase family protein  NP_699252  normal  0.51545  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0046  CDS  NC_004311  42169  43164  996  lysophospholipase L2, putative  NP_699253  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0047  CDS  NC_004311  43204  43419  216  hypothetical protein  NP_699254  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0048  CDS  NC_004311  43514  43912  399  hypothetical protein  NP_699255  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0049  CDS  NC_004311  43964  44173  210  hypothetical protein  NP_699256  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0050  CDS  NC_004311  44146  44397  252  hypothetical protein  NP_699257  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0051  CDS  NC_004311  44476  44946  471  16 kDa heat shock protein A  NP_699258  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0052  CDS  NC_004311  45084  46133  1050  threonine aldolase, low-specificity, putative  NP_699259  normal  0.753871  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0053  CDS  NC_004311  46402  46686  285  hypothetical protein  NP_699260  normal  0.873842  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0054  CDS  NC_004311  46776  51527  4752  glutamate synthase, large subunit  NP_699261  normal  0.673781  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0055  CDS  NC_004311  51609  53063  1455  glutamate synthase subunit beta  NP_699262  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0056  CDS  NC_004311  53108  54511  1404  amino acid permease family protein  NP_699263  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0057  CDS  NC_004311  54733  55884  1152  hypothetical protein  NP_699264  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0058  CDS  NC_004311  56135  56653  519  putative lipoprotein  NP_699265  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0059  CDS  NC_004311  56802  57887  1086  type IV secretion system protein VirB11  NP_699266  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0060  CDS  NC_004311  57868  59043  1176  type IV secretion system protein VirB10  NP_699267  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0061  CDS  NC_004311  59040  59909  870  type IV secretion system protein VirB9  NP_699268  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0062  CDS  NC_004311  59906  60625  720  type IV secretion system protein VirB8  NP_699269  normal  0.622511  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0063  CDS  NC_004311  60628  60801  174  type IV secretion system protein VirB7  NP_699270  normal  0.399534  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0064  CDS  NC_004311  60965  62008  1044  type IV secretion system protein VirB6  NP_699271  normal  0.375866  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0065  CDS  NC_004311  62192  62908  717  type IV secretion system protein VirB5  NP_699272  normal  0.0500304  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0066  CDS  NC_004311  62913  65408  2496  type IV secretion system protein VirB4  NP_699273  normal  0.0274973  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0067  CDS  NC_004311  65408  65758  351  type IV secretion system protein VirB3  NP_699274  decreased coverage  0.00447561  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0068  CDS  NC_004311  65772  66089  318  type IV secretion system protein VirB2  NP_699275  normal  0.0110509  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0069  CDS  NC_004311  66525  67241  717  type IV secretion system protein VirB1  NP_699276  normal  0.165878  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0070  CDS  NC_004311  67745  68971  1227  transglycosylase, putative  NP_699277  normal  0.18416  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0071  CDS  NC_004311  69383  70276  894  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  NP_699278  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0072  CDS  NC_004311  70329  71867  1539  hypothetical protein  NP_699279  normal  0.387574  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0073  CDS  NC_004311  72008  73009  1002  sugar isomerase, KpsF/GutQ  NP_699280  normal  0.462134  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0074  CDS  NC_004311  73148  73615  468  hypothetical protein  NP_699281  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0075  CDS  NC_004311  73636  74622  987  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  NP_699282  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0076  CDS  NC_004311  74755  75813  1059  ferrochelatase  NP_699283  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0077  CDS  NC_004311  75951  76331  381  lipoprotein Omp10  NP_699284  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0078  CDS  NC_004311  76473  77918  1446  homospermidine synthase  NP_699285  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0079  CDS  NC_004311  78030  78710  681  hypothetical protein  NP_699286  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0080  CDS  NC_004311  78644  79813  1170  aminodeoxychorismate synthase  NP_699287  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0081  CDS  NC_004311  79823  81685  1863  oligoendopeptidase F  NP_699288  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0082  CDS  NC_004311  82033  83523  1491  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  NP_699289  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0083  CDS  NC_004311  83864  85777  1914  hypothetical protein  NP_699290  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0084    NC_004311  85843  86479  637      normal  0.24642  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0085    NC_004311  86674  87249  576      normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0086  CDS  NC_004311  87371  88297  927  rhodanese family protein  NP_699291  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0087  CDS  NC_004311  88332  88538  207  hypothetical protein  NP_699292  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0088  CDS  NC_004311  88578  89333  756  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding protein  NP_699293  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0089  CDS  NC_004311  89344  90030  687  molybdate ABC transporter permease protein  NP_699294  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0090  CDS  NC_004311  90027  91106  1080  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  NP_699295  normal  0.508509  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0091  CDS  NC_004311  91176  91853  678  acetyltransferase  NP_699296  normal  0.476344  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0092  CDS  NC_004311  91840  92049  210  hypothetical protein  NP_699297  normal  0.188024  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0094  CDS  NC_004311  92101  92454  354  hypothetical protein  NP_699298  normal  0.160446  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0095  CDS  NC_004311  92511  92852  342  hypothetical protein  NP_699300  normal  0.140341  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0096  CDS  NC_004311  92994  94097  1104  hypothetical protein  NP_699301  normal  0.977897  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0097  CDS  NC_004311  94097  94801  705  hypothetical protein  NP_699302  normal  0.354271  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0098  CDS  NC_004311  94841  95734  894  LysR family transcriptional regulator  NP_699303  normal  0.48838  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0099  CDS  NC_004311  95738  96943  1206  amidase  NP_699304  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0100  CDS  NC_004311  97528  98661  1134  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  NP_699305  normal  0.938006  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BRA0101  CDS  NC_004311  98737  100455  1719  polysaccharide accessory transport protein, putative  NP_699306  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 13    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>