3447 genes were found for organism Brucella suis 1330



Page 1 of 35    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BR0001  CDS  NC_004310  784  2274  1491  chromosomal replication initiation protein  NP_697044  decreased coverage  0.00276825  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0002  CDS  NC_004310  2503  3696  1194  DNA polymerase III subunit beta  NP_697045  normal  0.41342  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0003  CDS  NC_004310  3878  5032  1155  recombination protein F  NP_697046  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0004  CDS  NC_004310  5070  5852  783  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  NP_697047  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0005  CDS  NC_004310  5869  6825  957  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  NP_697048  normal  0.767745  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0006  CDS  NC_004310  6822  8447  1626  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_697049  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0007  CDS  NC_004310  8471  9610  1140  ABC transporter, permease protein  NP_697050  normal  0.295504  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0008  CDS  NC_004310  9610  10707  1098  ABC transporter, permease protein  NP_697051  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0009  CDS  NC_004310  10819  12633  1815  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  NP_697052  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0010  CDS  NC_004310  12680  14548  1869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  NP_697053  normal  0.427067  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0011  CDS  NC_004310  14779  15102  324  hypothetical protein  NP_697054  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0012  CDS  NC_004310  15148  15348  201  hypothetical protein  NP_697055  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0013  CDS  NC_004310  15388  15738  351  hypothetical protein  NP_697056  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0014  CDS  NC_004310  16003  17109  1107  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  NP_697057  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0015  CDS  NC_004310  17381  17581  201  hypothetical protein  NP_697058  normal  0.728298  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0016  CDS  NC_004310  17578  18372  795  enoyl-CoA hydratase  NP_697059  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0017    NC_004310  18369  19231  863      normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0018  CDS  NC_004310  19224  21245  2022  biotin carboxylase  NP_697060  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0019  CDS  NC_004310  21257  22864  1608  carboxyl transferase family protein  NP_697061  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0020  CDS  NC_004310  22864  24012  1149  isovaleryl-CoA dehydrogenase  NP_697062  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0021  CDS  NC_004310  24189  26177  1989  acetoacetyl-CoA synthetase  NP_697063  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0022  CDS  NC_004310  26362  26796  435  hypothetical protein  NP_697064  normal  0.0352588  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0023  CDS  NC_004310  26973  28094  1122  hypothetical protein  NP_697065  normal  0.280526  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0024  CDS  NC_004310  28617  29000  384  hypothetical protein  NP_697066  normal  0.0394198  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0025  CDS  NC_004310  29385  30737  1353  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  NP_697067  normal  0.0686684  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0026  CDS  NC_004310  30734  31393  660  cytidylate kinase  NP_697068  normal  0.404349  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0027  CDS  NC_004310  31609  33309  1701  30S ribosomal protein S1  NP_697069  normal  0.173864  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0028  CDS  NC_004310  33727  34737  1011  hypothetical protein  NP_697070  normal  0.47731  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0029  CDS  NC_004310  34853  35752  900  LysR family transcriptional regulator  NP_697071  normal  0.266984  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0030  CDS  NC_004310  35746  36321  576  hypothetical protein  NP_697072  normal  0.0594692  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0031  CDS  NC_004310  36357  37640  1284  transglycosylase, putative  NP_697073  normal  0.0704571  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0032  CDS  NC_004310  37656  38261  606  recombination protein RecR  NP_697074  normal  0.0840728  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0033  CDS  NC_004310  38392  38715  324  hypothetical protein  NP_697075  normal  0.0434672  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0034  CDS  NC_004310  38740  40548  1809  DNA polymerase III subunits gamma and tau  NP_697076  normal  0.0330154  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0035  CDS  NC_004310  40829  41233  405  hypothetical protein  NP_697077  normal  0.132487  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0036  CDS  NC_004310  41262  42209  948  MutT/nudix family protein  NP_697078  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0037  CDS  NC_004310  42210  43073  864  prephenate dehydratase  NP_697079  normal  0.51728  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0038  CDS  NC_004310  43162  43917  756  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  NP_697080  normal  0.538972  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0039  CDS  NC_004310  44295  44903  609  cytochrome c, membrane-bound  NP_697081  normal  0.450907  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0040  CDS  NC_004310  44948  45913  966  hypothetical protein  NP_697082  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0041  CDS  NC_004310  45969  46277  309  hypothetical protein  NP_697083  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0042  CDS  NC_004310  46440  47465  1026  ubiquinol oxidase, subunit II  NP_697084  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0043  CDS  NC_004310  47545  49524  1980  ubiquinol oxidase subunit I  NP_697085  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0044  CDS  NC_004310  49528  50157  630  ubiquinol oxidase subunit III  NP_697086  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0045  CDS  NC_004310  50157  50522  366  ubiquinol oxidase subunit IV  NP_697087  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0046  CDS  NC_004310  50519  50797  279  hypothetical protein  NP_697088  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0047  CDS  NC_004310  50973  51560  588  hypothetical protein  NP_697089  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0048  CDS  NC_004310  52156  54075  1920  hypothetical protein  NP_697090  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0049  CDS  NC_004310  54264  58811  4548  hypothetical protein  NP_697091  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0050  CDS  NC_004310  58956  59681  726  putative lipoprotein  NP_697092  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0051  CDS  NC_004310  59732  59947  216  hypothetical protein  NP_697093  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0052  CDS  NC_004310  60017  60520  504  hypothetical protein  NP_697094  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0053  CDS  NC_004310  60857  61063  207  hypothetical protein  NP_697095  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0054  CDS  NC_004310  61074  62078  1005  hypothetical protein  NP_697096  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0055  CDS  NC_004310  62213  62611  399  hypothetical protein  NP_697097  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0056  CDS  NC_004310  62864  63259  396  glyoxalase family protein  NP_697098  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0057  CDS  NC_004310  63456  64619  1164  mrp-related protein  NP_697099  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0058  CDS  NC_004310  64824  66455  1632  phosphoglucomutase  NP_697100  normal  0.557182  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0059  CDS  NC_004310  66511  66696  186  hypothetical protein  NP_697101  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0060  CDS  NC_004310  66671  67564  894  LysR family transcriptional regulator  NP_697102  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0061  CDS  NC_004310  67689  68612  924  dienelactone hydrolase domain-containing protein  NP_697103  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0062  CDS  NC_004310  68685  69383  699  putative fructose transport system kinase  NP_697104  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0063  CDS  NC_004310  69483  70172  690  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  NP_697105  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0064  CDS  NC_004310  70192  70383  192  hypothetical protein  NP_697106  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0065  CDS  NC_004310  70445  70660  216  hypothetical protein  NP_697107  normal  0.728298  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0066  CDS  NC_004310  70826  71014  189  hypothetical protein  NP_697108  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0067  CDS  NC_004310  71029  71892  864  transglycosylase SLT domain-containing protein  NP_697109  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0068  CDS  NC_004310  72078  72734  657  hemolysin III family channel protein  NP_697110  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0069  CDS  NC_004310  72875  76108  3234  error-prone DNA polymerase  NP_697111  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0070  CDS  NC_004310  76108  77559  1452  hypothetical protein  NP_697112  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0071  CDS  NC_004310  77585  78448  864  hypothetical protein  NP_697113  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0072  CDS  NC_004310  78967  81189  2223  outer membrane protein  NP_697114  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0073  CDS  NC_004310  81398  81946  549  hypothetical protein  NP_697115  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0074  CDS  NC_004310  82025  83245  1221  argininosuccinate synthase  NP_697116  normal  0.874295  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0075    NC_004310  83342  84091  750      normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0076  CDS  NC_004310  84095  84598  504  hypothetical protein  NP_697117  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0077  CDS  NC_004310  84632  85867  1236  hypothetical protein  NP_697118  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0078  CDS  NC_004310  85811  86002  192  hypothetical protein  NP_697119  normal  0.661021  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0079  CDS  NC_004310  85987  86181  195  hypothetical protein  NP_697120  normal  0.951223  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0080  CDS  NC_004310  86127  86630  504  hypothetical protein  NP_697121  normal  0.44123  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0081  CDS  NC_004310  87070  87453  384  hypothetical protein  NP_697122  normal  0.461887  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0082  CDS  NC_004310  87541  87834  294  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  NP_697123  normal  0.406903  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0083  CDS  NC_004310  88061  88666  606  phosphotyrosine protein phosphatase  NP_697124  normal  0.0422234  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0084  CDS  NC_004310  88576  89166  591  hypothetical protein  NP_697125  normal  0.514694  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0085  CDS  NC_004310  89347  90072  726  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  NP_697126  normal  0.68478  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0086  CDS  NC_004310  90219  90947  729  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_697127  normal  0.475163  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0087  CDS  NC_004310  90944  93493  2550  ABC transporter, permease protein  NP_697128  normal  0.320612  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0088  CDS  NC_004310  93727  94464  738  hypothetical protein  NP_697129  normal  0.695225  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0089  CDS  NC_004310  94579  95118  540  phosphinothricin N-acetyltransferase  NP_697130  normal  0.32151  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0090  CDS  NC_004310  95138  95539  402  hypothetical protein  NP_697131  normal  0.93975  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0091  CDS  NC_004310  96089  96823  735  hypothetical protein  NP_697132  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0092  CDS  NC_004310  96976  97116  141  hypothetical protein  NP_697133  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0093  CDS  NC_004310  97100  99787  2688  aconitate hydratase  NP_697134  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0094  CDS  NC_004310  100131  100778  648  cytochrome c biogenesis protein CcmA  NP_697135  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0095  CDS  NC_004310  100778  101443  666  heme exporter protein CcmB  NP_697136  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0096  CDS  NC_004310  101501  102286  786  heme exporter protein CcmC  NP_697137  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0097  CDS  NC_004310  102283  102456  174  heme exporter protein D  NP_697138  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0098  CDS  NC_004310  102453  103064  612  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  NP_697139  normal  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0099  CDS  NC_004310  103313  105148  1836  dihydroxy-acid dehydratase  NP_697140  normal  0.0324836  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
BR0100  CDS  NC_004310  105330  105467  138  hypothetical protein  NP_697141  normal  0.130725  n/a    Brucella suis 1330  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 35    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>