4834 genes were found for organism Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 49    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Acid345_0001  CDS  NC_008009  33  1418  +  1386  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_589080  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0002  CDS  NC_008009  1811  2926  +  1116  DNA polymerase III, beta subunit  YP_589081  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0003  CDS  NC_008009  2996  3931  +  936  glucokinase  YP_589082  hitchhiker  0.000615827  normal  0.192124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0004  CDS  NC_008009  3928  4977  +  1050  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  YP_589083  hitchhiker  0.00308372  normal  0.212879  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0005  CDS  NC_008009  4984  6249  +  1266  major facilitator transporter  YP_589084  normal  0.0753564  normal  0.228788  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0006  CDS  NC_008009  6357  6773  +  417  large conductance mechanosensitive channel protein  YP_589085  normal  0.0404291  normal  0.33248  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0007  CDS  NC_008009  7066  7464  -  399  hypothetical protein  YP_589086  normal  0.042136  normal  0.325201  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0008  CDS  NC_008009  8277  10916  +  2640  DNA gyrase subunit B  YP_589087  normal  0.938168  normal  0.282222  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0009  CDS  NC_008009  11118  13151  +  2034  endothelin-converting protein 1  YP_589088  normal  1  normal  0.230717  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0010  CDS  NC_008009  13474  13911  +  438  hypothetical protein  YP_589089  normal  1  normal  0.482369  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0011  CDS  NC_008009  14112  15593  +  1482  hypothetical protein  YP_589090  normal  1  normal  0.578419  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0012  CDS  NC_008009  15673  16821  +  1149  hypothetical protein  YP_589091  normal  1  normal  0.85938  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0013  CDS  NC_008009  16925  17656  +  732  hypothetical protein  YP_589092  normal  1  normal  0.787584  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0014  CDS  NC_008009  17749  18162  -  414  hypothetical protein  YP_589093  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0015  CDS  NC_008009  18300  18869  -  570  TetR family transcriptional regulator  YP_589094  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0016  CDS  NC_008009  18980  19936  +  957  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  YP_589095  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0017  CDS  NC_008009  19887  20291  -  405  hypothetical protein  YP_589096  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0018  CDS  NC_008009  20559  20954  +  396  50S ribosomal protein L21  YP_589097  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0019  CDS  NC_008009  20966  21226  +  261  50S ribosomal protein L27  YP_589098  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0020  CDS  NC_008009  21328  22425  +  1098  GTPase ObgE  YP_589099  normal  1  normal  0.927019  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0021  CDS  NC_008009  22422  23198  +  777  nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  YP_589100  normal  1  normal  0.900072  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0022  CDS  NC_008009  23235  23726  +  492  Iojap-related protein  YP_589101  normal  1  normal  0.853245  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0023  CDS  NC_008009  23738  24697  +  960  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  YP_589102  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0024  CDS  NC_008009  24743  25183  +  441  hypothetical protein  YP_589103  normal  0.820161  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0025  CDS  NC_008009  25183  25749  +  567  hypothetical protein  YP_589104  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0026  CDS  NC_008009  25751  26500  -  750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_589105  normal  0.94443  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0027  CDS  NC_008009  26594  26917  -  324  ArsR family transcriptional regulator  YP_589106  normal  0.669383  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0028  CDS  NC_008009  27088  27312  +  225  50S ribosomal protein L31  YP_589107  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0029  CDS  NC_008009  27354  27635  -  282  hypothetical protein  YP_589108  normal  0.669383  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0030  CDS  NC_008009  27676  28788  +  1113  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  YP_589109  normal  0.405013  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0031  CDS  NC_008009  28785  29210  -  426  hypothetical protein  YP_589110  normal  0.115028  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0032  CDS  NC_008009  29312  29611  +  300  hypothetical protein  YP_589111  normal  0.151887  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0033  CDS  NC_008009  29683  30369  +  687  HAD family hydrolase  YP_589112  normal  0.144848  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0034  CDS  NC_008009  30366  30665  -  300  type I antifreeze protein  YP_589113  normal  0.080792  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0035  CDS  NC_008009  30752  31615  +  864  hypothetical protein  YP_589114  normal  0.0515864  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0036  CDS  NC_008009  31619  32092  -  474  L-asparaginase  YP_589115  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0037  CDS  NC_008009  32449  34701  +  2253  serine/threonine protein kinase  YP_589116  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0038  CDS  NC_008009  34756  35844  -  1089  TonB-like protein  YP_589117  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0039  CDS  NC_008009  35844  36707  -  864  beta-lactamase-like protein  YP_589118  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0040  CDS  NC_008009  36791  37687  -  897  chromosome segregation DNA-binding protein  YP_589119  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0041  CDS  NC_008009  37699  38520  -  822  chromosome segregation ATPase  YP_589120  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0042  CDS  NC_008009  38797  39456  -  660  methyltransferase GidB  YP_589121  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0043  CDS  NC_008009  39495  40175  +  681  hypothetical protein  YP_589122  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0044  CDS  NC_008009  40290  40745  +  456  hypothetical protein  YP_589123  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0045  CDS  NC_008009  40785  41849  -  1065  adenosine deaminase  YP_589124  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0046  CDS  NC_008009  41854  43299  -  1446  amino acid permease-associated region  YP_589125  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0047  CDS  NC_008009  43956  46505  -  2550  ATP-dependent DNA helicase Rep  YP_589126  normal  0.760315  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0048  CDS  NC_008009  46847  47653  -  807  hypothetical protein  YP_589127  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0049  CDS  NC_008009  47595  48029  -  435  hypothetical protein  YP_589128  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0050  CDS  NC_008009  48026  48958  -  933  polysaccharide deacetylase  YP_589129  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0051  CDS  NC_008009  49043  50599  +  1557  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  YP_589130  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0052  CDS  NC_008009  50853  51200  -  348  hypothetical protein  YP_589131  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0053  CDS  NC_008009  51200  51559  -  360  hypothetical protein  YP_589132  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0054  CDS  NC_008009  51556  51909  -  354  hypothetical protein  YP_589133  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0055  CDS  NC_008009  51930  52826  -  897  hypothetical protein  YP_589134  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0056  CDS  NC_008009  52837  55080  -  2244  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  YP_589135  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0057  CDS  NC_008009  55120  56361  -  1242  UvrB/UvrC protein  YP_589136  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0058  CDS  NC_008009  56939  57220  -  282  hypothetical protein  YP_589137  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0059  CDS  NC_008009  57238  58062  -  825  hypothetical protein  YP_589138  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0060  CDS  NC_008009  58072  58854  -  783  DNA replication protein, DNAC-like  YP_589139  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0061  CDS  NC_008009  59076  59360  +  285  hypothetical protein  YP_589140  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0062  CDS  NC_008009  59402  60796  +  1395  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  YP_589141  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0063  CDS  NC_008009  60793  61347  +  555  phosphoribosyltransferase  YP_589142  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0064  CDS  NC_008009  61544  63457  +  1914  FtsH peptidase  YP_589143  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0065  CDS  NC_008009  64148  64924  +  777  Crp/FNR family transcriptional regulator  YP_589144  normal  0.0605636  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0066  CDS  NC_008009  65299  66486  -  1188  histidine kinase  YP_589145  normal  0.126071  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0067  CDS  NC_008009  66467  68065  -  1599  putative circadian clock protein, KaiC  YP_589146  normal  0.643949  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0068  CDS  NC_008009  68435  68704  +  270  hypothetical protein  YP_589147  normal  0.686512  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0069  CDS  NC_008009  69030  70118  -  1089  beta-lactamase-like  YP_589148  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0070  CDS  NC_008009  70249  71427  +  1179  acyltransferase 3  YP_589149  normal  0.332625  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0071  CDS  NC_008009  71503  72429  +  927  hypothetical protein  YP_589150  normal  0.677177  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0072  CDS  NC_008009  72508  75312  -  2805  response regulator receiver protein  YP_589151  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0073  CDS  NC_008009  75499  76992  -  1494  DNA uptake lipoprotein-like  YP_589152  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0074  CDS  NC_008009  77217  77891  -  675  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  YP_589153  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0075  CDS  NC_008009  77989  78339  -  351  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_589154  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0076  CDS  NC_008009  78524  78910  +  387  hypothetical protein  YP_589155  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0077  CDS  NC_008009  79132  79584  +  453  TonB-like protein  YP_589156  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0078  CDS  NC_008009  79589  80269  -  681  TENA/THI-4 protein  YP_589157  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0079  CDS  NC_008009  80450  81193  +  744  PEGA domain-containing protein  YP_589158  normal  0.91478  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0080  CDS  NC_008009  81260  83209  +  1950  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_589159  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0081  CDS  NC_008009  83277  83771  +  495  DinB  YP_589160  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0082  CDS  NC_008009  83951  84247  -  297  histone-like DNA-binding protein  YP_589161  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0083  CDS  NC_008009  84580  85074  -  495  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  YP_589162  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0084  CDS  NC_008009  85148  85873  +  726  response regulator receiver protein  YP_589163  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0085  CDS  NC_008009  85870  86748  -  879  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_589164  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0086  CDS  NC_008009  87032  88573  +  1542  hypothetical protein  YP_589165  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0087  CDS  NC_008009  88570  89073  -  504  hypothetical protein  YP_589166  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0088  CDS  NC_008009  89263  89898  -  636  ribonuclease H  YP_589167  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0089  CDS  NC_008009  90498  90764  -  267  hypothetical protein  YP_589168  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0090  CDS  NC_008009  90769  91560  -  792  metallophosphoesterase  YP_589169  normal  0.681848  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0091  CDS  NC_008009  91563  92540  -  978  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_589170  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0092  CDS  NC_008009  93788  94216  -  429  hypothetical protein  YP_589171  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0093  CDS  NC_008009  94286  94981  -  696  ThiJ/PfpI  YP_589172  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0094  CDS  NC_008009  95369  96733  +  1365  parallel beta-helix repeat-containing protein  YP_589173  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0095  CDS  NC_008009  96748  97254  -  507  hypothetical protein  YP_589174  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0096  CDS  NC_008009  97525  98319  -  795  hypothetical protein  YP_589175  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0097  CDS  NC_008009  98433  98954  +  522  hypothetical protein  YP_589176  normal  1  normal  1  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0098  CDS  NC_008009  99032  102703  -  3672  protease-like  YP_589177  normal  1  normal  0.34808  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0099  CDS  NC_008009  103054  104016  +  963  selenophosphate synthase  YP_589178  normal  1  normal  0.574229  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Acid345_0100  CDS  NC_008009  104112  105413  +  1302  hypothetical protein  YP_589179  normal  0.807355  normal  0.588322  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 49    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>