2940 genes were found for organism Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 30    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mlg_0001  CDS  NC_008340  75  1430  +  1356  chromosomal replication initiation protein  YP_740850  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0002  CDS  NC_008340  1651  2751  +  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_740851  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0003  CDS  NC_008340  2816  3880  +  1065  DNA replication and repair protein RecF  YP_740852  hitchhiker  0.00180653  normal  0.423581  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0004  CDS  NC_008340  3952  6369  +  2418  DNA gyrase subunit B  YP_740853  normal  1  normal  0.477519  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0005  CDS  NC_008340  6397  7170  +  774  HAD family hydrolase  YP_740854  normal  1  normal  0.769052  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0006  CDS  NC_008340  7163  8950  +  1788  glycoside hydrolase 15-related  YP_740855  normal  1  normal  0.780753  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0007  CDS  NC_008340  9005  10393  +  1389  Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase (UDP-forming)  YP_740856  normal  1  normal  0.554922  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0008  CDS  NC_008340  10399  11340  +  942  glucokinase  YP_740857  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0009  CDS  NC_008340  11353  12114  -  762  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_740858  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0010  CDS  NC_008340  12111  12689  -  579  D-alpha,beta-D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  YP_740859  normal  1  normal  0.789749  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0011  CDS  NC_008340  12664  14745  -  2082  glycine--tRNA ligase  YP_740860  normal  1  normal  0.466423  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0012  CDS  NC_008340  14738  15691  -  954  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_740861  normal  1  normal  0.569318  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0013  CDS  NC_008340  16030  17445  +  1416  L-glutamine synthetase  YP_740862  normal  1  normal  0.778405  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0014  CDS  NC_008340  17555  18082  +  528  hypothetical protein  YP_740863  normal  0.997944  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0015  CDS  NC_008340  18231  19283  +  1053  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  YP_740864  normal  0.327507  normal  0.905375  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0016  CDS  NC_008340  19280  20686  +  1407  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  YP_740865  normal  0.0855054  normal  0.786337  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0017  CDS  NC_008340  20902  21531  -  630  radical SAM domain-containing protein  YP_740866  normal  0.015175  normal  0.941948  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0018  CDS  NC_008340  21528  22703  -  1176  hypothetical protein  YP_740867  normal  0.0100534  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0019  CDS  NC_008340  22813  24474  -  1662  chaperonin GroEL  YP_740868  normal  0.557028  normal  0.807584  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0020  CDS  NC_008340  24517  24804  -  288  co-chaperonin GroES  YP_740869  normal  0.436916  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0021  CDS  NC_008340  25024  25398  +  375  CutA1 divalent ion tolerance protein  YP_740870  normal  0.722189  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0022  CDS  NC_008340  25408  27252  +  1845  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  YP_740871  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0023  CDS  NC_008340  27249  27752  +  504  redoxin domain-containing protein  YP_740872  normal  0.239793  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0024  CDS  NC_008340  27880  28338  +  459  3-dehydroquinate dehydratase  YP_740873  normal  0.515923  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0025  CDS  NC_008340  28338  28802  +  465  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxyl carrier protein  YP_740874  normal  0.730316  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0026  CDS  NC_008340  28822  30165  +  1344  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  YP_740875  normal  0.512919  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0027  CDS  NC_008340  30213  30788  +  576  YfaZ family protein  YP_740876  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0028  CDS  NC_008340  30819  31628  -  810  hypothetical protein  YP_740877  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0029  CDS  NC_008340  31748  32710  +  963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_740878  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0030  CDS  NC_008340  32714  33955  +  1242  metal dependent phosphohydrolase  YP_740879  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0031  CDS  NC_008340  33968  35407  -  1440  hypothetical protein  YP_740880  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0032  CDS  NC_008340  35512  36552  -  1041  aldo/keto reductase  YP_740881  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0033  CDS  NC_008340  36586  37299  -  714  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_740882  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0034  CDS  NC_008340  37301  38089  -  789  thiazole synthase  YP_740883  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0035  CDS  NC_008340  38147  38368  -  222  thiamine biosynthesis protein ThiS  YP_740884  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0036    NC_008340  39211  39733  -  523      normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0037  CDS  NC_008340  39904  40293  -  390  hypothetical protein  YP_740885  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0038  CDS  NC_008340  40293  41309  -  1017  hypothetical protein  YP_740886  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0039  CDS  NC_008340  41312  41827  -  516  hypothetical protein  YP_740887  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0040  CDS  NC_008340  41926  43257  -  1332  hypothetical protein  YP_740888  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0041  CDS  NC_008340  43278  46577  -  3300  hypothetical protein  YP_740889  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0042  CDS  NC_008340  46574  47473  -  900  hypothetical protein  YP_740890  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0043  CDS  NC_008340  47470  48432  -  963  Rhs element Vgr protein  YP_740891  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0044    NC_008340  48480  48725  -  246      normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0045  CDS  NC_008340  49079  49588  +  510  hypothetical protein  YP_740892  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0046  CDS  NC_008340  49623  51101  +  1479  hypothetical protein  YP_740893  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0047  CDS  NC_008340  51108  51536  +  429  hypothetical protein  YP_740894  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0048  CDS  NC_008340  51556  53319  +  1764  hypothetical protein  YP_740895  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0049  CDS  NC_008340  53316  54302  +  987  hypothetical protein  YP_740896  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0050  CDS  NC_008340  54307  55017  +  711  FHA domain-containing protein  YP_740897  normal  0.824119  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0051  CDS  NC_008340  55014  55586  +  573  hypothetical protein  YP_740898  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0052  CDS  NC_008340  55586  56923  +  1338  hypothetical protein  YP_740899  normal  0.808473  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0053  CDS  NC_008340  56926  57741  +  816  hypothetical protein  YP_740900  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0054  CDS  NC_008340  57738  59315  +  1578  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  YP_740901  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0055  CDS  NC_008340  59312  59959  +  648  hypothetical protein  YP_740902  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0056  CDS  NC_008340  59947  61389  +  1443  ImpA domain-containing protein  YP_740903  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0057  CDS  NC_008340  61425  65042  +  3618  ImcF domain-containing protein  YP_740904  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0058  CDS  NC_008340  65285  65803  +  519  hypothetical protein  YP_740905  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0059  CDS  NC_008340  65890  66189  +  300  PAAR repeat-containing protein  YP_740906  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0060  CDS  NC_008340  66332  66931  +  600  hypothetical protein  YP_740907  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0061  CDS  NC_008340  67016  67855  +  840  diaminopimelate epimerase  YP_740908  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0062  CDS  NC_008340  67913  68611  +  699  hypothetical protein  YP_740909  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0063  CDS  NC_008340  68618  69532  +  915  tyrosine recombinase XerC  YP_740910  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0064  CDS  NC_008340  69593  70225  +  633  TetR family transcriptional regulator  YP_740911  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0065  CDS  NC_008340  70272  71252  +  981  alcohol dehydrogenase  YP_740912  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0066  CDS  NC_008340  71434  71985  +  552  ATP-dependent protease peptidase subunit  YP_740913  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0067  CDS  NC_008340  72000  73322  +  1323  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  YP_740914  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0068  CDS  NC_008340  73394  73765  +  372  hypothetical protein  YP_740915  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0069  CDS  NC_008340  73769  74545  +  777  demethylmenaquinone methyltransferase  YP_740916  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0070  CDS  NC_008340  74547  75176  +  630  hypothetical protein  YP_740917  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0071  CDS  NC_008340  75173  76834  +  1662  2-octaprenylphenol hydroxylase  YP_740918  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0072  CDS  NC_008340  76866  78752  -  1887  arginine decarboxylase  YP_740919  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0073  CDS  NC_008340  78872  79732  +  861  spermidine synthase  YP_740920  normal  0.116459  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0074  CDS  NC_008340  79807  82380  +  2574  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  YP_740921  normal  0.102755  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0075  CDS  NC_008340  82412  82969  +  558  RDD domain-containing protein  YP_740922  normal  0.0306278  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0076  CDS  NC_008340  82991  83800  -  810  hypothetical protein  YP_740923  normal  0.0298659  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0077  CDS  NC_008340  83797  84447  -  651  ABC transporter related  YP_740924  normal  0.0734436  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0078  CDS  NC_008340  84577  87321  +  2745  transcriptional activator domain-containing protein  YP_740925  normal  0.323405  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0079  CDS  NC_008340  87516  88766  -  1251  ammonium transporter  YP_740926  normal  0.376757  normal  0.798164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0080  CDS  NC_008340  88829  89167  -  339  nitrogen regulatory protein P-II  YP_740927  normal  0.416357  normal  0.780104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0081  CDS  NC_008340  89410  89724  +  315  hypothetical protein  YP_740928  normal  0.261842  normal  0.96148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0082  CDS  NC_008340  89788  91305  +  1518  Mg chelatase, subunit ChlI  YP_740929  normal  0.361038  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0083  CDS  NC_008340  91329  91883  -  555  putative cytochrome c  YP_740930  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0084  CDS  NC_008340  92052  92966  -  915  acetylglutamate kinase  YP_740931  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0085  CDS  NC_008340  93252  93461  -  210  hypothetical protein  YP_740932  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0086  CDS  NC_008340  93478  94143  -  666  ribose-5-phosphate isomerase A  YP_740933  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0087  CDS  NC_008340  94226  95740  +  1515  threonine dehydratase  YP_740934  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0088  CDS  NC_008340  95778  96449  +  672  TetR family transcriptional regulator  YP_740935  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0089  CDS  NC_008340  96485  97528  +  1044  membrane-bound metal-dependent hydrolase  YP_740936  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0090  CDS  NC_008340  98663  100147  +  1485  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  YP_740937  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0091  CDS  NC_008340  100152  101567  -  1416  major facilitator transporter  YP_740938  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0092  CDS  NC_008340  101600  102112  -  513  hypothetical protein  YP_740939  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0093  CDS  NC_008340  102228  102761  +  534  transcription antitermination protein nusG  YP_740940  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0094  CDS  NC_008340  103174  103569  -  396  invasion gene expression up-regulator, SirB  YP_740941  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0095  CDS  NC_008340  103675  104442  +  768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  YP_740942  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0096  CDS  NC_008340  104452  106131  -  1680  peptidoglycan binding domain-containing protein  YP_740943  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0097  CDS  NC_008340  106241  107095  +  855  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  YP_740944  normal  0.750805  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0098  CDS  NC_008340  107272  107970  +  699  PEP motif-containing protein  YP_740945  normal  0.317552  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0099  CDS  NC_008340  108329  109117  -  789  hypothetical protein  YP_740946  normal  0.145223  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0100  CDS  NC_008340  109155  110594  -  1440  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  YP_740947  normal  1  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 30    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>