3060 genes were found for organism Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
VEA_001610  CDS  NC_013456  17  325  +  309  hypothetical protein  YP_003284238  decreased coverage  0.00000183596  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001611  CDS  NC_013456  417  2147  -  1731  gamma-glutamyltranspeptidase  YP_003284239  hitchhiker  0.00725831  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001612  CDS  NC_013456  2422  3105  -  684  general secretion pathway protein B  YP_003284240  normal  0.33696  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001613  CDS  NC_013456  3105  4721  -  1617  general secretion pathway protein A  YP_003284241  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001614  CDS  NC_013456  4860  6080  +  1221  tRNA nucleotidyltransferase  YP_003284242  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001615  CDS  NC_013456  6310  7113  -  804  undecaprenyl-diphosphatase  YP_003284243  normal  0.754191  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001616  CDS  NC_013456  7123  7611  -  489  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  YP_003284244  normal  0.194869  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001617  CDS  NC_013456  7608  7967  -  360  dihydroneopterin aldolase  YP_003284245  normal  0.156687  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001618  CDS  NC_013456  8218  8829  +  612  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  YP_003284246  normal  0.0411697  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001619  CDS  NC_013456  8864  9679  -  816  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  YP_003284247  hitchhiker  0.00597314  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001620  CDS  NC_013456  9853  10914  -  1062  endopeptidase  YP_003284248  unclonable  0.00000013528  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001621  CDS  NC_013456  11100  11315  +  216  SSU ribosomal protein S21p  YP_003284249  hitchhiker  0.000000157507  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001622  CDS  NC_013456  11343  11786  +  444  hypothetical protein  YP_003284250  hitchhiker  0.0000215544  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001623  CDS  NC_013456  11936  13702  +  1767  DNA primase  YP_003284251  hitchhiker  0.00199304  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001624  CDS  NC_013456  13802  15664  +  1863  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_003284252  normal  0.294566  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001625  CDS  NC_013456  16179  16982  +  804  methionine ABC transporter substrate-binding protein  YP_003284253  normal  0.653614  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001626  CDS  NC_013456  17076  17351  -  276  hypothetical protein  YP_003284254  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001627  CDS  NC_013456  17581  18630  +  1050  putative lipoprotein  YP_003284255  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001628  CDS  NC_013456  18684  19403  -  720  putative periplasmic protein  YP_003284256  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001629  CDS  NC_013456  19645  19833  +  189  hypothetical protein  YP_003284257  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001630  CDS  NC_013456  19971  21719  +  1749  putative hemolysin  YP_003284258  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001631  CDS  NC_013456  21755  21880  -  126  hypothetical protein  YP_003284259  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001632  CDS  NC_013456  22323  24275  +  1953  phosphotransferase system mannitol-specific  YP_003284260  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001633  CDS  NC_013456  24388  25536  +  1149  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  YP_003284261  normal  0.917395  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001634  CDS  NC_013456  25594  26124  +  531  mannitol operon repressor  YP_003284262  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001635  CDS  NC_013456  26450  28198  +  1749  glycerol metabolism operon regulatory protein  YP_003284263  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001636  CDS  NC_013456  28279  30678  -  2400  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  YP_003284264  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001637  CDS  NC_013456  30680  31315  -  636  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  YP_003284265  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001638  CDS  NC_013456  31331  32389  -  1059  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  YP_003284266  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001639  CDS  NC_013456  32743  33825  +  1083  glycerol dehydrogenase  YP_003284267  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001640  CDS  NC_013456  33880  35265  -  1386  signal transduction histidine kinase  YP_003284268  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001641  CDS  NC_013456  35258  35950  -  693  putative two component response regulator transcription regulator protein  YP_003284269  normal  0.170142  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001642  CDS  NC_013456  36053  36430  -  378  hypothetical protein  YP_003284270  normal  0.0616566  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001643  CDS  NC_013456  36635  38467  -  1833  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  YP_003284271  normal  0.0244363  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001644  CDS  NC_013456  38582  39343  -  762  transcriptional regulator of GlmS, DeoR family  YP_003284272  hitchhiker  0.00296274  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001645  CDS  NC_013456  39777  41189  +  1413  pyruvate kinase  YP_003284273  decreased coverage  0.0000413201  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001646  CDS  NC_013456  41389  42033  +  645  transcriptional regulator LuxZ  YP_003284274  decreased coverage  0.00000706033  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001647  CDS  NC_013456  42098  43978  -  1881  sensory box/GGDEF family protein  YP_003284275  hitchhiker  0.00111686  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001648  CDS  NC_013456  44088  44582  -  495  acetolactate synthase small subunit  YP_003284276  hitchhiker  0.00890505  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001649  CDS  NC_013456  44584  46308  -  1725  acetolactate synthase large subunit  YP_003284277  normal  0.546971  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001650  CDS  NC_013456  46758  48566  -  1809  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  YP_003284278  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001651  CDS  NC_013456  48861  49820  -  960  transcriptional regulator LysR family  YP_003284279  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001652  CDS  NC_013456  50377  51423  -  1047  glycosyltransferase  YP_003284280  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001653  CDS  NC_013456  51427  51975  -  549  membrane-associated phospholipid phosphatase  YP_003284281  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001654  CDS  NC_013456  52124  52921  -  798  hypothetical protein  YP_003284282  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001655  CDS  NC_013456  53028  53159  +  132  hypothetical protein  YP_003284283  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001656  CDS  NC_013456  53436  54983  +  1548  2-isopropylmalate synthase  YP_003284284  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001657  CDS  NC_013456  55066  56157  +  1092  3-isopropylmalate dehydrogenase  YP_003284285  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001658  CDS  NC_013456  56268  57668  +  1401  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  YP_003284286  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001659  CDS  NC_013456  57680  58282  +  603  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  YP_003284287  normal  0.57325  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001660  CDS  NC_013456  58625  59407  +  783  hypothetical protein  YP_003284288  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001661  CDS  NC_013456  59508  60362  -  855  DnaJ-like protein DjlA  YP_003284289  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001662  CDS  NC_013456  60629  62974  +  2346  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  YP_003284290  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001663  CDS  NC_013456  63035  64318  +  1284  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  YP_003284291  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001664  CDS  NC_013456  64308  65303  +  996  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  YP_003284292  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001665  CDS  NC_013456  65303  66112  +  810  dimethyladenosine transferase  YP_003284293  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001666  CDS  NC_013456  66188  66568  +  381  ApaG protein  YP_003284294  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001667  CDS  NC_013456  66584  67390  +  807  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  YP_003284295  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001668  CDS  NC_013456  67659  68138  -  480  dihydrofolate reductase  YP_003284296  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001669  CDS  NC_013456  68148  68621  -  474  hypothetical protein  YP_003284297  normal  0.811357  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001670  CDS  NC_013456  68621  69421  -  801  hypothetical protein  YP_003284298  normal  0.131782  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001671  CDS  NC_013456  69617  70792  -  1176  GTP-binding protein Obg  YP_003284299  hitchhiker  0.0000343056  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001672  CDS  NC_013456  70999  71256  -  258  LSU ribosomal protein L27p  YP_003284300  hitchhiker  0.00000226464  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001673  CDS  NC_013456  71277  71588  -  312  LSU ribosomal protein L21p  YP_003284301  hitchhiker  0.000000280256  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001674  CDS  NC_013456  71845  72816  +  972  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  YP_003284302  unclonable  0.00000010929  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001675  CDS  NC_013456  72901  73092  -  192  hypothetical protein  YP_003284303  hitchhiker  0.00000194026  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001676  CDS  NC_013456  73206  74141  -  936  malate dehydrogenase  YP_003284304  hitchhiker  0.0000765273  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001677  CDS  NC_013456  74495  74971  +  477  arginine pathway regulatory protein ArgR repressor of arg regulon  YP_003284305  hitchhiker  0.00162702  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001678  CDS  NC_013456  75377  76345  +  969  TRAP transporter solute receptor TAXI family precursor  YP_003284306  normal  0.150837  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001679  CDS  NC_013456  76402  76626  +  225  hypothetical protein  YP_003284307  normal  0.912109  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001680  CDS  NC_013456  76641  79220  +  2580  TRAP-type uncharacterized transport system fused permease component  YP_003284308  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001681  CDS  NC_013456  79265  79702  +  438  universal stress protein family 3  YP_003284309  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001682  CDS  NC_013456  79766  80842  -  1077  NADH:flavin oxidoreductases Old Yellow Enzyme family  YP_003284310  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001683  CDS  NC_013456  80935  81882  +  948  transcriptional regulator  YP_003284311  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001684  CDS  NC_013456  81901  82605  -  705  thiamin ABC transporter ATPase component  YP_003284312  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001685  CDS  NC_013456  82605  84155  -  1551  thiamin ABC transporter transmembrane component  YP_003284313  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001686  CDS  NC_013456  84233  85225  -  993  thiamin ABC transporter substrate-binding component  YP_003284314  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001687  CDS  NC_013456  85471  86106  -  636  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase UbiX  YP_003284315  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001688  CDS  NC_013456  86111  87469  -  1359  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  YP_003284316  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001689  CDS  NC_013456  87782  88798  +  1017  fructose-1,6-bisphosphatase type I  YP_003284317  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001690  CDS  NC_013456  88926  89456  +  531  inorganic pyrophosphatase  YP_003284318  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001691  CDS  NC_013456  89527  89892  -  366  hypothetical protein  YP_003284319  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001692  CDS  NC_013456  89942  90289  -  348  hypothetical protein  YP_003284320  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001693  CDS  NC_013456  90335  94099  -  3765  uncharacterized protein YtfN  YP_003284321  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001694  CDS  NC_013456  94096  95808  -  1713  uncharacterized protein YtfM precursor  YP_003284322  normal  0.534051  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001695  CDS  NC_013456  95976  96614  +  639  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  YP_003284323  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001696  CDS  NC_013456  96701  96901  -  201  hypothetical protein  YP_003284324  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001697  CDS  NC_013456  97116  97667  +  552  protein YtfJ precursor  YP_003284325  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001698  CDS  NC_013456  97904  98203  +  300  hypothetical protein  YP_003284326  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001699  CDS  NC_013456  98338  99003  +  666  predicted zinc-binding protein  YP_003284327  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001700  CDS  NC_013456  99056  99784  +  729  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  YP_003284328  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001701  CDS  NC_013456  99781  101040  +  1260  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  YP_003284329  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001702  CDS  NC_013456  101045  101539  +  495  hypothetical protein  YP_003284330  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001703  CDS  NC_013456  101862  102767  +  906  hypothetical protein  YP_003284331  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001704  CDS  NC_013456  102857  103474  -  618  adenylylsulfate kinase  YP_003284332  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001705  CDS  NC_013456  103499  105223  -  1725  sulfate permease Trk-type  YP_003284333  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001706  CDS  NC_013456  105476  106906  -  1431  sulfate adenylyltransferase subunit 1  YP_003284334  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001707  CDS  NC_013456  106925  107833  -  909  sulfate adenylyltransferase subunit 2  YP_003284335  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001708  CDS  NC_013456  107893  108780  -  888  uroporphyrinogen-III methyltransferase  YP_003284336  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001709  CDS  NC_013456  109044  111005  +  1962  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  YP_003284337  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>