20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2209 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2209  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  165  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2181  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  165  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3695  hypothetical protein  58.73 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3391  putative lipoprotein  55.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3295  putative lipoprotein  55.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1062  putative lipoprotein  55.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3516  putative lipoprotein  55.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.699478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0968  putative lipoprotein  51.56 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4399  hypothetical protein  54.9 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.95537  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3407  putative lipoprotein  41.3 
 
 
157 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0972  putative lipoprotein  48.44 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1010  putative lipoprotein  48.44 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0976  putative lipoprotein  48.44 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2832  hypothetical protein  55.36 
 
 
85 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4061  putative lipoprotein  41.86 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0905  putative lipoprotein  56 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2221  hypothetical protein  43.94 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.700232  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0736  hypothetical protein  45.24 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3399  hypothetical protein  46.43 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0815274  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0526  hypothetical protein  70 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>