25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2176 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1058    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  96.86 
 
 		 509 aa  1029    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  25.34 
 
 		 559 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  24.06 
 
 		 586 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  24.23 
 
 		 581 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  24.65 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  24.58 
 
 		 526 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  23.32 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  24.15 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  23.65 
 
 		 557 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  28.32 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  23.3 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  22.27 
 
 		 514 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  22.68 
 
 		 527 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  22.19 
 
 		 521 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  22.09 
 
 		 562 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  24.49 
 
 		 539 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  31.01 
 
 		 504 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  20.83 
 
 		 500 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  30.51 
 
 		 502 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  24.51 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  28.21 
 
 		 484 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  29.91 
 
 		 502 aa  44.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  24.68 
 
 		 522 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  27.69 
 
 		 507 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>