39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0729 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0729  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  188  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0709  hypothetical protein  96.67 
 
 		 90 aa  165  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002085  putative signal peptide protein  49.09 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00352  hypothetical protein  47.27 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1619  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1614  hypothetical protein  50.98 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4791  hypothetical protein  52.94 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0705  hypothetical protein  43.02 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0725  hypothetical protein  43.02 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0945  putative signal peptide protein  44.07 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.461777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2687  signal peptide protein  38.2 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0845  hypothetical protein  34.12 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3132  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0812  hypothetical protein  36.36 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02371  signal peptide protein  48 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.352612  normal  0.0437387 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4402  signal peptide protein  48 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4292  putative signal peptide protein  48 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2358  putative signal peptide protein  37.5 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1005  putative signal peptide protein  47.06 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4385  hypothetical protein  34.62 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0150663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0119  hypothetical protein  35.44 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2534  putative signal peptide protein  44 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352088 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4776  hypothetical protein  31.65 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000854569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1558  hypothetical protein  46.94 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0381215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1243  hypothetical protein  35.44 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1608  integral membrane protein-like  44.68 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4646  integral membrane protein-like  32.63 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3131  hypothetical protein  36.49 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2191  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  normal  0.810634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2960  putative signal peptide protein  45.28 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1429  hypothetical protein  45.83 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411241  normal  0.655732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0758  hypothetical protein  44.9 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306085  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0774  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.754477  normal  0.205049 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5939  hypothetical protein  31.46 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.822986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2033  hypothetical protein  45.65 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.230623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0588  hypothetical protein  41.67 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147251  normal  0.641101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1030  hypothetical protein  45.65 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.89878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3391  hypothetical protein  32.53 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0993  hypothetical protein  45.65 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>