25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2150 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  96.86 
 
 
509 aa  1029    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1058    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  26.36 
 
 
559 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  24.88 
 
 
586 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  25 
 
 
581 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  22.95 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  22.56 
 
 
526 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  23.21 
 
 
547 aa  67.4  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  22.76 
 
 
417 aa  64.3  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  22.91 
 
 
557 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  28.21 
 
 
532 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  22.59 
 
 
514 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  22.82 
 
 
530 aa  54.7  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  21.99 
 
 
521 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  22.6 
 
 
527 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  31.01 
 
 
504 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  20.9 
 
 
500 aa  50.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  23.59 
 
 
539 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  22.05 
 
 
562 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  30.51 
 
 
502 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  28.21 
 
 
484 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  29.66 
 
 
502 aa  44.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  27.69 
 
 
507 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  20.12 
 
 
497 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  23.89 
 
 
522 aa  43.5  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>