69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1352 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1352  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  243  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1356  hypothetical protein  99.15 
 
 
118 aa  242  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1635  type IV pilus assembly PilZ  50.93 
 
 
118 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1653  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  47.66 
 
 
117 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25770  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  49.07 
 
 
118 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.961132  normal  0.553234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2201  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  49.07 
 
 
118 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1573  type IV pilus assembly PilZ  46.73 
 
 
116 aa  103  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1658  Type IV pilus assembly PilZ  47.66 
 
 
123 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0211682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4150  Type IV pilus assembly PilZ  47.22 
 
 
118 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440208  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1827  type IV pilus assembly PilZ  45.79 
 
 
113 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1414  type IV pilus assembly PilZ  41.67 
 
 
120 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.152869  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14990  type IV pilus assembly protein  45.79 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1654  Type IV pilus assembly PilZ  45.37 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  0.307598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3825  type IV pilus biogenesis protein PilZ  45.37 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0373515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02715  type IV fimbriae assembly protein  42.11 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450475  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2501  type IV pilus assembly PilZ  40.18 
 
 
121 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.313407  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1541  type IV pilus assembly protein PilZ  41.44 
 
 
123 aa  97.1  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0811165  normal  0.123076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1994  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  41.12 
 
 
118 aa  94  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0879  type IV pilus assembly PilZ  41.67 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2856  type IV pilus assembly PilZ  40.18 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1144  type IV pilus assembly PilZ  42.06 
 
 
113 aa  90.5  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.136177  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1985  type IV pilus assembly PilZ  37.82 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1719  type IV pilus assembly PilZ  37.82 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.137522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1498  type IV pilus assembly PilZ  36.75 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133421  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3390  type IV pilus assembly PilZ  37.82 
 
 
119 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0381125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3410  type IV pilus assembly PilZ  37.84 
 
 
119 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.595597  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1007  type IV pilus assembly PilZ  38.74 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2517  type IV pilus assembly PilZ  39.64 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.179103  hitchhiker  0.00950119 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2304  putative type IV pilus biogenesis protein pilZ  38.68 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1858  type IV pilus assembly protein  38.94 
 
 
129 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.595679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1950  type IV pilus assembly PilZ  39.64 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.700098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1880  type IV pilus assembly PilZ  37.17 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0639562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1423  type IV pilus assembly PilZ  37.84 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2257  type IV pilus assembly PilZ  38.14 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1464  type IV pilus assembly PilZ  37.84 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634618  normal  0.0114903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1786  putative type 4 fimbrial biogenesis protein  36.28 
 
 
129 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0774026  normal  0.113647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1436  Type IV pilus assembly PilZ  36.21 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1582  type IV fimbriae assembly protein  38.89 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0574097  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1639  type IV fimbriae assembly protein  38.89 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2195  Type IV pilus assembly PilZ  31.25 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.609234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2049  type IV pilus assembly PilZ  38.24 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1826  type IV pilus assembly PilZ  34.51 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0117521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1251  type IV pilus assembly PilZ  40.19 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1608  type IV pilus assembly PilZ  35.42 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0391991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2041  type IV pilus biogenesis protein pilZ  35.58 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307465  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1925  type IV pilus biogenesis protein PilZ  35.29 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2238  type IV pilus biogenesis protein pilZ  37.5 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2646  type IV pilus assembly PilZ  34.62 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.109453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2212  type IV pilus biogenesis protein PilZ  36.54 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2611  type IV pilus biogenesis protein pilZ  35.58 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1738  type IV pilus biogenesis protein pilZ  34.62 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254841  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2570  type IV pilus biogenesis protein PilZ  37.5 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.207839  normal  0.0806474 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2457  type IV pilus biogenesis protein PilZ  37.5 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0645818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1894  type IV pilus biogenesis protein PilZ  37.5 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0727827 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2450  type IV pilus biogenesis protein PilZ  37.5 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0971788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1768  type IV pilus biogenesis protein pilZ  34.62 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598238  normal  0.61176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1663  type IV pilus biogenesis protein pilZ  34.62 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1066  type IV pilus assembly PilZ  34.26 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0651699  normal  0.921742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1581  type IV pilus assembly PilZ  33.65 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.875524  normal  0.520302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1984  type IV pilus assembly PilZ  32.67 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.748677  normal  0.0111146 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1312  type IV fimbriae assembly protein  31.48 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.826043  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1590  type IV pilus assembly PilZ  32.94 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0382259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1915  type IV pilus assembly protein PilZ, putative  32.94 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1508  type IV pilus assembly PilZ  32 
 
 
131 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1598  type IV pilus assembly PilZ  28.24 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1503  type IV pilus assembly PilZ  34.43 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2361  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0772  type IV pilus assembly PilZ  29.55 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.618609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  32.2 
 
 
843 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>